Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
QPLSVGIVGGGIIGVILAAGLVRRGIDVKVFEQARGFREAGMAFTANAVRCMEMLDPAIVWALRSSGAVPQAEARDYLRW
VDGYHESSKRLYQLDAGIRGFEACRRDQFLEALVKVLPEGIVECQKRLQKIHEKNETEKVTLEFADGTFAHVDCVIGADG
IRSRVRQHLFGEDSPYSHPHYSHKFAFRGLITMENAISALGEDKARTLNMHVGPNAHLIHYPVANETMVNIAAFVSDPEE
WPKLSLVGPATREEAMGYFANWNPGLRAVLGFMPENIDRWAMFDTYDYPAPFFSRGKICLVGDAAHAAVPHHGAGACIGI
EDALCATVLLAEVFVSTRGKSSIVRNRAIAAAFGSFNAVRRVRAQWFVDSSRRVCDLYQQPEWADPQKRIKAENCFEEIK
DRSHKIWHFDYNSMLQEAIEKYRHNMGS

The query sequence (length=428) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6nes:A 431 431 0.9953 0.9884 0.9884 0.0 6nes:B, 6net:A, 6net:B, 6neu:A, 6neu:B, 6nev:A, 6nev:B
2 7lo1:A 422 434 0.3808 0.3863 0.3756 5.95e-84 7lo1:B
3 5evy:X 411 434 0.3107 0.3236 0.3065 2.58e-42
4 8rqh:B 382 330 0.2523 0.2827 0.3273 3.91e-29 8rqh:A
5 8uiv:A 375 369 0.2383 0.2720 0.2764 5.98e-26 5eow:A, 8uiq:A
6 8gsm:G 439 449 0.2640 0.2574 0.2517 1.35e-24 8gsm:I
7 3rp6:A 392 374 0.2220 0.2423 0.2540 2.70e-18 3rp7:A, 3rp8:A
8 8x38:A 430 432 0.2407 0.2395 0.2384 9.48e-17
9 4bjz:A 395 412 0.2453 0.2658 0.2549 2.98e-16 4bjy:A, 4bk1:A, 4bk2:A, 4bk3:A, 5hym:A
10 3c96:A 381 419 0.2430 0.2730 0.2482 2.84e-13 2rgj:A
11 5x68:B 354 338 0.1846 0.2232 0.2337 1.65e-09 5x68:A
12 5tum:A 369 378 0.2033 0.2358 0.2302 5.80e-09 5tum:B
13 8twg:B 385 418 0.2220 0.2468 0.2273 2.38e-08
14 8twf:C 385 379 0.2033 0.2260 0.2296 5.34e-08 8twf:D, 8twf:A, 8twf:B
15 2vou:A 393 398 0.2126 0.2316 0.2286 7.64e-08 2vou:B, 2vou:C
16 6pvg:A 445 412 0.2336 0.2247 0.2427 3.74e-07 6pvf:A, 6pvh:A, 6pvi:A, 6pvj:A
17 6lke:A 428 183 0.1145 0.1145 0.2678 5.90e-07 6lkd:A, 6lkd:B, 6lke:B
18 6n04:B 366 243 0.1495 0.1749 0.2634 3.16e-06 6n04:A
19 8aq8:AAA 344 379 0.2173 0.2703 0.2454 3.17e-06 8aq8:BBB, 8aq8:CCC, 8aq8:DDD
20 3all:B 371 329 0.1869 0.2156 0.2432 4.56e-06 3alj:A, 3all:A, 3alm:A, 3alm:B, 4gf7:A, 3gmb:A, 3gmb:B, 3gmc:A, 3gmc:B, 4h2n:A, 4h2p:A, 4h2p:B, 4h2p:C, 4h2p:D, 4h2q:A, 4h2r:A, 4h2r:B, 5hxi:A, 4jy2:A, 4jy2:B, 4jy3:A, 4jy3:B
21 6fho:A 368 351 0.2103 0.2446 0.2564 5.96e-06 6sw1:A, 6sw2:A, 2x3n:A
22 4j34:B 390 359 0.1776 0.1949 0.2117 1.20e-05 4j2w:A, 4j2w:B, 4j31:A, 4j31:B, 4j33:A, 4j33:B, 4j34:A, 4j36:A, 4j36:B, 5x6r:A, 5x6r:B
23 5tue:A 388 211 0.1308 0.1443 0.2654 1.41e-05 5tue:B, 5tuf:A, 5tuf:B, 5tui:A, 5tui:B
24 4hb9:A 376 345 0.1893 0.2154 0.2348 7.10e-05
25 5tuk:B 373 199 0.1005 0.1153 0.2161 1.30e-04 5tuk:A, 5tuk:C, 5tuk:D
26 7kpt:A 412 260 0.1285 0.1335 0.2115 7.97e-04 7kpq:A
27 6j0z:C 488 333 0.1776 0.1557 0.2282 0.001
28 7epw:A 373 348 0.1799 0.2064 0.2213 0.003 4a6n:A, 4a6n:B, 4a6n:C, 4a6n:D, 4a99:A, 4a99:C, 4a99:B, 4a99:D, 7epv:A, 4guv:A, 4guv:B, 4guv:C, 4guv:D, 3p9u:A, 3p9u:B, 3p9u:C, 3p9u:D, 3v3n:A, 3v3n:B, 3v3n:C, 3v3n:D, 3v3o:A, 3v3o:B, 3v3o:C, 3v3o:D, 2xdo:A, 2xdo:B, 2xdo:C, 2xdo:D, 2xyo:A, 2xyo:B, 2xyo:C, 2xyo:D, 2y6q:A, 2y6q:B, 2y6q:C, 2y6q:D, 2y6r:A, 2y6r:B, 2y6r:C, 2y6r:D
29 5kow:A 474 191 0.1145 0.1034 0.2565 0.003 6c7s:A, 5kox:A
30 5xgv:A 461 378 0.2126 0.1974 0.2407 0.010 5xgv:B
31 8er0:A 371 342 0.1636 0.1887 0.2047 0.012 8er0:B, 8er1:A, 6wg9:A, 6wg9:B
32 7vwp:B 491 230 0.1425 0.1242 0.2652 0.024 7vwp:D, 7vwp:A, 7vwp:C
33 4x4j:A 482 45 0.0444 0.0394 0.4222 0.051 4x4j:B
34 7ouc:AAA 527 224 0.1308 0.1063 0.2500 0.063 7oud:AAA
35 5fn0:A 455 30 0.0350 0.0330 0.5000 0.075 5fn0:B, 5fn0:C, 5fn0:D, 6fox:A, 6fox:B, 6foy:A, 6foy:B, 6foz:A, 6foz:B, 6fp0:A, 6fp0:B, 6fp1:A, 6fp1:B, 6fph:A, 6fph:B, 5mzc:A, 5mzc:B, 5mzi:A, 5mzi:B, 5mzk:A, 5mzk:B, 5n7t:A, 5n7t:B, 5na5:A, 5na5:B, 5nab:A, 5nab:B, 5nae:A, 5nae:B, 5nag:A, 5nag:B, 5nah:A, 5nah:B, 5nak:A, 5nak:B, 5x6p:A, 5x6p:B, 5x6q:A, 5y66:A, 5y77:A, 5y77:B, 5y7a:A
36 6brd:A 474 332 0.1682 0.1519 0.2169 0.092 6brd:B, 6brd:C, 5vqb:A, 5vqb:B, 5vqb:C
37 7fdz:A 417 142 0.0794 0.0815 0.2394 0.10
38 7cp7:A 430 222 0.1238 0.1233 0.2387 0.14 7cp6:A, 7cp6:B
39 2qa2:A 489 55 0.0561 0.0491 0.4364 0.14
40 2qa2:A 489 52 0.0397 0.0348 0.3269 0.44
41 7ouj:AAA 540 336 0.1986 0.1574 0.2530 0.15
42 8uy6:A 244 102 0.0678 0.1189 0.2843 0.49 3nka:A, 2o9e:A, 8uy6:C, 8uy6:E, 8uy6:G, 8uy6:I, 8uy6:K, 8uy6:M, 8uy6:O
43 2h59:A 246 40 0.0350 0.0610 0.3750 0.51 4buz:A, 4bv2:A, 4bv2:B, 3d4b:A, 3d81:A, 2h2d:A, 2h2f:A, 2h2g:A, 2h2h:A, 2h2i:A, 2h4f:A, 2h4h:A, 2h4j:A, 2h59:B, 3jr3:A, 3pdh:A, 1yc5:A
44 6u0p:C 585 186 0.1005 0.0735 0.2312 0.65 6u0p:A, 6u0p:B, 6u0p:D, 6u0p:E, 6u0p:F, 6u0s:A, 6u0s:B, 6u0s:C, 6u0s:D, 6u0s:E, 6u0s:F
45 5hxw:A 433 45 0.0374 0.0370 0.3556 0.76 5hxw:B, 5hxw:C, 5hxw:D, 5hxw:E, 5hxw:F
46 4k5r:B 491 77 0.0514 0.0448 0.2857 0.96 3fmw:A, 3fmw:B, 3fmw:C, 4k5r:A, 4k5s:A
47 4icy:A 462 32 0.0304 0.0281 0.4062 1.1
48 2qa1:A 488 32 0.0304 0.0266 0.4062 1.2
49 5i39:A 383 45 0.0374 0.0418 0.3556 1.3
50 3ic9:C 483 30 0.0350 0.0311 0.5000 1.3 3ic9:A, 3ic9:B, 3ic9:D
51 8jqo:A 391 30 0.0397 0.0435 0.5667 1.4 8jqo:B, 8jqo:C, 8jqp:A, 8jqp:B, 8jqq:A, 8jqq:B
52 7zaz:AAA 727 66 0.0467 0.0275 0.3030 1.9 7zaz:BBB, 7zaz:DDD, 7zb0:A, 7zb0:B, 7zb0:C, 7zb0:D, 7zb1:A, 7zb1:B, 7zb1:C, 7zb1:D, 7zb2:CCC, 7zb2:FFF
53 7zaz:CCC 690 66 0.0467 0.0290 0.3030 1.9
54 3aov:A 404 88 0.0654 0.0693 0.3182 1.9 3aov:C, 3aow:A, 3aow:C, 3ath:A, 3ath:C, 3av7:A, 3av7:C, 3wx9:A, 3wx9:C
55 5buk:A 434 37 0.0374 0.0369 0.4324 2.0 5buk:B
56 7yj0:D 622 54 0.0421 0.0289 0.3333 2.0 7yj0:A, 7yj0:B, 7yj0:C
57 6c6r:A 451 386 0.2196 0.2084 0.2435 2.4 6c6n:A, 6c6n:B, 6c6p:A, 6c6p:B, 6c6r:B
58 6ui5:A 497 32 0.0280 0.0241 0.3750 2.5 6ui5:B
59 2r0g:A 522 31 0.0350 0.0287 0.4839 2.6 4eip:A, 4eip:B, 4eiq:A, 4eiq:B, 3ept:A, 3ept:B, 2r0c:A, 2r0g:B, 2r0p:A
60 3ict:A 557 34 0.0327 0.0251 0.4118 2.8 3icr:A, 3icr:B, 3ics:A, 3ics:B, 3ict:B
61 2dki:A 615 105 0.0607 0.0423 0.2476 3.4 2dkh:A
62 7xr4:A 425 42 0.0350 0.0353 0.3571 4.4 7vr7:A, 7vr8:A, 7xr4:B, 7xr4:C, 7xr6:A, 7xr6:B, 7xr6:C
63 4k2x:B 490 32 0.0280 0.0245 0.3750 4.5 4k2x:A
64 4qsm:A 332 48 0.0327 0.0422 0.2917 5.7 4aj1:A, 4aj1:B, 4aj1:C, 4aj1:D, 4aj2:A, 4aj2:B, 4aj2:C, 4aj2:D, 4aj4:A, 4aj4:B, 4aj4:C, 4aj4:D, 4aje:A, 4aje:B, 4aje:C, 4aje:D, 4ajh:A, 4ajh:B, 4ajh:C, 4ajh:D, 4aji:A, 4aji:B, 4aji:C, 4aji:D, 4ajj:A, 4ajj:B, 4ajj:C, 4ajj:D, 4ajk:A, 4ajk:B, 4ajk:C, 4ajk:D, 4ajl:A, 4ajl:B, 4ajl:C, 4ajl:D, 4ajn:A, 4ajn:B, 4ajn:C, 4ajn:D, 4ajo:A, 4ajo:B, 4ajo:C, 4ajo:D, 4ajp:A, 4ajp:B, 4ajp:C, 4ajp:D, 4al4:A, 4al4:B, 4al4:C, 4al4:D, 6bad:A, 6bad:B, 6bad:C, 6bad:D, 6bag:A, 6bag:B, 6bag:C, 6bag:D, 6bax:A, 6bax:B, 6bax:C, 6bax:D, 6baz:A, 6baz:B, 6baz:C, 6baz:D, 6bb0:A, 6bb0:B, 6bb0:C, 6bb0:D, 6bb1:A, 6bb1:B, 6bb1:C, 6bb1:D, 6bb1:E, 6bb1:F, 6bb1:G, 6bb1:H, 6bb2:A, 6bb2:B, 6bb2:C, 6bb2:D, 6bb2:E, 6bb2:F, 6bb2:G, 6bb2:H, 6bb3:A, 6bb3:B, 6bb3:C, 6bb3:D, 9bk2:A, 9bk2:D, 9bk3:D, 8fw6:A, 8fw6:B, 3h3f:A, 3h3f:B, 3h3f:C, 3h3f:D, 3h3f:E, 3h3f:F, 3h3f:G, 3h3f:H, 1i10:A, 1i10:B, 1i10:C, 1i10:D, 1i10:E, 1i10:F, 1i10:G, 1i10:H, 4i8x:A, 4i8x:B, 4i8x:C, 4i8x:D, 4i8x:E, 4i8x:F, 4i8x:G, 4i8x:H, 4i9h:A, 4i9h:B, 4i9h:C, 4i9h:D, 4i9h:E, 4i9h:F, 4i9h:G, 4i9h:H, 4i9n:A, 4i9n:B, 4i9n:C, 4i9n:D, 4i9n:E, 4i9n:F, 4i9n:G, 4i9n:H, 4i9u:A, 4i9u:B, 4i9u:C, 4i9u:D, 4i9u:E, 4i9u:F, 4i9u:G, 4i9u:H, 5ixs:A, 5ixs:B, 5ixs:C, 5ixs:D, 5ixy:A, 5ixy:B, 5ixy:C, 5ixy:D, 4jnk:A, 4jnk:B, 4jnk:C, 4jnk:D, 5kkc:A, 5kkc:B, 5kkc:C, 5kkc:D, 4l4s:H, 4l4s:A, 9ldb:A, 9ldb:B, 9ldt:A, 9ldt:B, 7m2n:A, 7m2n:B, 7m2n:C, 7m2n:D, 4m49:A, 4m49:B, 4m49:C, 4m49:D, 6mv8:A, 6mv8:B, 6mv8:C, 6mv8:D, 6mva:A, 6mva:B, 6mva:C, 6mva:D, 5nqq:A, 5nqq:B, 5nqq:C, 5nqq:D, 4okn:A, 4okn:B, 4okn:C, 4okn:D, 4okn:E, 4okn:F, 4okn:G, 4okn:H, 6p6u:C, 6p6u:E, 6q0d:A, 6q0d:B, 6q0d:C, 6q0d:D, 6q0d:E, 6q0d:F, 6q13:A, 6q13:B, 6q13:C, 6q13:D, 4qo7:A, 4qo7:B, 4qo7:C, 4qo7:D, 4qo8:A, 4qo8:B, 4qo8:C, 4qo8:D, 4qsm:B, 4qsm:C, 4qsm:D, 4qsm:E, 4qsm:F, 4qsm:G, 4qsm:H, 4qt0:A, 4qt0:B, 4qt0:C, 4qt0:D, 4qt0:E, 4qt0:F, 4qt0:G, 4qt0:H, 4r68:A, 4r68:B, 4r68:C, 4r68:D, 4r69:A, 4r69:B, 4r69:C, 4r69:D, 4rls:A, 4rls:B, 4rls:C, 4rls:D, 6sbu:A, 6sbu:B, 6sbu:C, 6sbu:D, 6sbu:E, 6sbu:F, 6sbu:G, 6sbu:H, 6sbv:A, 6sbv:B, 6sbv:C, 6sbv:D, 6sbv:E, 6sbv:F, 6sbv:G, 6sbv:H, 5w8h:A, 5w8h:B, 5w8h:C, 5w8i:A, 5w8i:C, 5w8i:D, 5w8j:A, 5w8j:B, 5w8j:C, 5w8j:D, 5w8k:A, 5w8k:B, 5w8k:C, 5w8k:D, 5w8l:A, 5w8l:B, 5w8l:C, 5w8l:D, 5zjd:A, 5zjd:B, 5zjd:C, 5zjd:D, 5zjd:E, 5zjd:F, 5zjd:G, 5zjd:H, 5zjf:A, 5zjf:C, 4zvv:A, 4zvv:B, 4zvv:C, 4zvv:D
65 6ain:B 395 59 0.0467 0.0506 0.3390 6.1
66 7fco:A 433 75 0.0584 0.0577 0.3333 6.9 7fco:B
67 1wst:A 403 88 0.0678 0.0720 0.3295 8.0
68 3pvc:A 635 27 0.0257 0.0173 0.4074 8.3 3sgl:A
69 3zfd:A 340 44 0.0374 0.0471 0.3636 9.8 3zfc:A
70 6enz:A 487 19 0.0280 0.0246 0.6316 9.8 6enz:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218