BioLiP

>protein
QPKLYVMDNGRMRMDKNWMIAMHNPATIANPNAPTEFIEFPIYTVLIDHPEGKILFDTSCNPDSMGAQGRWGEATQSMFP
WTASEECYLHNRLEQLKVRPEDIKFVIASHLHLDHAGCLEMFTNATIIVHEDEFSGALQTYARNQTEGAYIWGDIDAWIK
NNLNWRTIKRDEDNIVLAEGIKILNFGSGHAWGMLGLHVQLPEKGGIILASDAVYSAESYGPPIKPPGIIYDSLGFVRSV
EKIKRIAKETNSEVWFGHDSEQFKRFRKSTEGYYE

The query sequence (length=275) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6cgy:A	276	275	1.0000	0.9964	1.0000	0.0	6cgy:H, 6cgy:L, 6cgz:A, 6cgz:B, 6cgz:C, 6ch0:C, 6ch0:F, 6ch0:I
2	6n9q:P	277	275	0.8618	0.8556	0.8618	0.0	6n9i:A, 6n9i:B, 6n9i:C, 6n9q:D, 6n9r:A, 6n9r:P, 6n9r:X
3	2r2d:A	276	273	0.4291	0.4275	0.4322	1.52e-85	2r2d:B, 2r2d:C, 2r2d:D, 2r2d:E, 2r2d:F
4	3dha:A	254	266	0.2655	0.2874	0.2744	7.97e-27	2a7m:A, 2br6:A, 2btn:A, 3dhb:A, 3dhc:A, 5eh9:A, 5eht:A, 4j5f:A, 4j5h:A, 7l5f:A
5	3aj3:A	273	284	0.2691	0.2711	0.2606	1.44e-22	4kep:A, 4keq:A
6	2i7t:A	404	160	0.1455	0.0990	0.2500	3.33e-04
7	2i7v:A	433	165	0.1455	0.0924	0.2424	0.002	8t1q:A, 8t1r:A
8	6e0s:A	264	91	0.0909	0.0947	0.2747	0.005
9	4v0h:D	223	53	0.0691	0.0852	0.3585	0.006	4v0h:A, 4v0h:B, 4v0h:C
10	4awy:B	270	34	0.0545	0.0556	0.4412	0.008	4awz:A, 4awz:B, 4awz:C, 4ax0:B, 4ax1:B, 4p62:A
11	6v4x:H	499	174	0.1491	0.0822	0.2356	0.022	6m8q:A, 6m8q:B
12	6k4t:A	260	91	0.0800	0.0846	0.2418	0.057	5axo:A, 5axr:A, 5aya:A, 5b15:A, 5b1u:A, 6k4x:A, 3vpe:A, 3vqz:A
13	6nc5:A	259	91	0.0800	0.0849	0.2418	0.12	6dqh:A, 6dr8:A
14	6r79:A	220	83	0.0764	0.0955	0.2530	0.14	6r73:A, 6r73:B, 6r78:A, 6r78:B, 6r79:D, 6r79:B, 6r79:C, 6rzr:A, 6rzr:B, 6rzs:A, 6rzs:B, 6s0h:A, 6s0h:B, 4ubq:A, 6yi4:AAA, 6yi4:BBB, 6yi4:CCC
15	7luu:A	266	47	0.0545	0.0564	0.3191	0.17
16	6t5k:C	224	51	0.0727	0.0893	0.3922	0.18
17	4xuk:A	291	156	0.1491	0.1409	0.2628	0.24	4xuk:B
18	8hxi:B	268	76	0.0691	0.0709	0.2500	0.26	7a63:A, 7afz:A, 2aio:A, 7bj8:A, 5dpx:A, 5dpx:B, 5evb:A, 5evd:A, 5evk:A, 2fm6:A, 2fm6:B, 2fu7:A, 2fu7:B, 2fu8:A, 2fu8:B, 2fu9:A, 2fu9:B, 2gfj:A, 2gfj:B, 2gfk:A, 2gfk:B, 2h6a:A, 2h6a:B, 2hb9:A, 5hh5:A, 5hh6:A, 8hxe:A, 8hxe:B, 8hxi:A, 7o0o:A, 2qdt:A, 2qin:A, 2qin:B, 2qin:C, 2qin:D, 2qjs:A, 2qjs:B, 2qjs:C, 2qjs:D, 1sml:A, 7zo2:A, 7zo3:A, 7zo4:A, 7zo5:A, 7zo6:A, 7zo7:A
19	6q55:A	461	140	0.1236	0.0738	0.2429	0.33	6q5a:A
20	5iqk:B	270	78	0.0764	0.0778	0.2692	0.38	5iqk:A
21	6u10:A	269	28	0.0436	0.0446	0.4286	0.44	7l52:A, 7l91:A, 6u0y:A, 6u0y:B, 6u0y:C, 6u0y:D, 6u0z:A, 6u13:A, 6u2y:A, 6u2z:A, 6uac:A, 6uaf:A, 6uah:A, 7uhh:A, 7uhi:A, 7uhj:A, 7uhk:A, 7uhl:A, 7uhm:A, 7uhn:A, 7uho:A, 7uhp:A, 7uhq:A, 7uhr:A, 7uht:A
22	6auf:B	273	34	0.0436	0.0440	0.3529	0.57
23	2zo4:A	301	151	0.1127	0.1030	0.2053	0.62
24	2xr1:B	611	77	0.0727	0.0327	0.2597	0.81	2xr1:A
25	5ngg:A	274	160	0.1309	0.1314	0.2250	0.89	2gmn:A, 2gmn:B, 3lvz:A, 3lvz:B, 5ngg:B, 5njw:A, 5njw:B, 5wcm:A, 5wcm:B
26	2bib:A	540	56	0.0618	0.0315	0.3036	0.93	1wra:A, 1wra:B
27	6l3s:A	218	78	0.0764	0.0963	0.2692	0.94	6l3s:B
28	6n36:A	265	91	0.0727	0.0755	0.2198	1.1
29	3k8d:A	246	99	0.0982	0.1098	0.2727	2.0	3k8d:B, 3k8d:C, 3k8d:D
30	4le6:A	257	64	0.0655	0.0700	0.2812	2.2	4le6:B, 4le6:C, 4le6:D, 4le6:E
31	4o98:B	307	64	0.0655	0.0586	0.2812	2.3	4o98:A
32	1b8g:B	425	82	0.0800	0.0518	0.2683	2.4	1b8g:A, 1m4n:A, 1m7y:A, 3piu:A, 1ynu:A
33	4zes:A	147	29	0.0400	0.0748	0.3793	3.8	4zes:B, 4zet:A, 4zet:B
34	6o0e:A	799	46	0.0509	0.0175	0.3043	3.9
35	1e5d:A	401	28	0.0400	0.0274	0.3929	3.9	1e5d:B
36	5k0w:B	271	45	0.0473	0.0480	0.2889	4.9	5k0w:A
37	7dt0:H	241	115	0.1018	0.1162	0.2435	4.9
38	6mfi:A	264	63	0.0655	0.0682	0.2857	5.5
39	8gyg:B	305	28	0.0400	0.0361	0.3929	6.5	8gyg:A
40	3adr:A	259	186	0.1382	0.1467	0.2043	6.5	3adr:B
41	7d5s:RO	525	20	0.0400	0.0210	0.5500	7.0	7ajt:US, 6ke6:RO, 6lqp:RO, 6lqu:RO, 7suk:SU, 6zqb:US, 6zqc:US
42	6jka:C	228	59	0.0618	0.0746	0.2881	7.7	4c1f:A, 4c1f:B, 4c1g:A, 4c1g:B, 1dd6:A, 1dd6:B, 1ddk:A, 2doo:A, 2doo:B, 7dtm:A, 7dtm:B, 7dtm:C, 7dtm:D, 7dtn:A, 7dtn:B, 7dtn:C, 7dtn:D, 5ev6:A, 5ev6:B, 5ev6:C, 5ev6:D, 5ev8:A, 5ev8:C, 5ev8:B, 5ev8:D, 5ewa:A, 5ewa:B, 5ewa:C, 5ewa:D, 4f6h:A, 4f6z:A, 5hh4:A, 5hh4:B, 5hh4:C, 5hh4:D, 8hyb:A, 8hyb:B, 8hyb:C, 8hyb:D, 8jao:A, 8jao:B, 6jed:A, 1jje:A, 1jje:B, 1jjt:A, 1jjt:B, 6jka:A, 6jka:B, 6jka:D, 6lbl:A, 4uam:A, 4uam:B, 4uam:C, 4uam:D, 1vgn:A, 1vgn:B, 1wuo:A, 1wuo:B, 1wuo:C, 1wuo:D, 1wup:A, 1wup:B, 1wup:C, 1wup:D, 3wxc:A, 3wxc:B, 7wzu:A, 7wzu:B, 7wzu:C, 7wzu:D, 7xhw:A, 7xhw:B, 7xhw:C, 7xhw:D, 7xhx:A, 7xhx:B, 7xhx:C, 7xhx:D, 8y0s:A, 8y0s:B, 8y0s:C, 8y0s:D, 5y5b:A, 7yh9:A, 7yh9:B, 7yh9:C, 7yh9:F, 7yh9:D, 7yh9:E, 7yha:A, 7yha:B, 7yha:C, 7yha:D, 8z5l:A, 8z5l:B, 8z5l:C, 8z5l:D, 6zyr:A, 6zyr:B, 6zyr:C, 6zyr:D, 6zys:A, 6zys:B, 6zys:C, 6zys:D
43	1l9y:A	263	49	0.0545	0.0570	0.3061	8.0	1jt1:A, 1k07:A, 1k07:B, 1l9y:B, 5w90:A, 5wck:A, 5wck:B
44	4bvp:A	365	62	0.0618	0.0466	0.2742	8.6	3aaq:A, 3aar:A, 4br7:A, 4bra:A, 4bra:B, 4brc:A, 4brc:B, 4brd:A, 4brd:B, 4bre:A, 4bre:B, 4brf:A, 4brf:B, 4brg:A, 4brg:B, 4brh:A, 4brh:B, 4bri:A, 4bri:B, 4brk:A, 4brk:B, 4brl:A, 4brl:B, 4brn:A, 4brn:B, 4brq:A, 4brq:B, 4bvo:A, 4bvp:B
45	8u00:A	242	33	0.0473	0.0537	0.3939	8.7	8u00:B
46	5wlc:SU	526	20	0.0400	0.0209	0.5500	8.9
47	2bpe:A	128	47	0.0545	0.1172	0.3191	9.1	2bpe:B, 2bph:A, 2bph:B, 2cl8:A, 2cl8:B
48	7xgt:B	275	52	0.0655	0.0655	0.3462	9.1	7xgt:A
49	1y44:A	269	180	0.1600	0.1636	0.2444	9.5
50	2zyj:A	397	44	0.0400	0.0277	0.2500	9.5	3cbf:A, 3cbf:B, 2egy:A, 2egy:B, 2egy:C, 2egy:D, 2z1y:A, 2z1y:B, 2zp7:A, 2zp7:C, 2zp7:B, 2zp7:D, 2zp7:E, 2zp7:F, 2zyj:B
51	5k55:A	290	55	0.0545	0.0517	0.2727	9.7	5et8:A

[Back]