BioLiP

>protein
QPCYLYVIGMVLTTPLPDELNFRRRKLYPPEDTTRCFGILTAKPIPQIPHFPVYTRSGEVTISIELKKSGFMLSLQMLEL
ITRLHQYIFSHILRYCVLPLNVVSTLDIDFKFMEDIEKSETKETPFVFKLEDYQDAVIIPRYRNFDQPHRFYVADVYTDL
TPLSKFPSPEYETFAEYYKTKYNLDLTNLNQPLLDVDHTSSRLNLLTPRPLSSAEKRKAKWESLQNKQILVPELCAIHPI
PASLWRKAVCLPSILYRLHC

The query sequence (length=260) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4ngf:A	260	260	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4ngf:B, 4ngf:C, 4ngf:D, 4nha:A
2	7xw2:A	725	298	1.0000	0.3586	0.8725	6.18e-178
3	5zal:A	1314	298	1.0000	0.1979	0.8725	5.64e-173	2eb1:A, 2eb1:B, 2eb1:C, 4ngd:A, 5zam:A
4	7yym:A	1281	289	0.9077	0.1842	0.8166	1.48e-152	4ngb:A, 4ngc:A, 4ngg:A, 4nh3:A, 4nh5:A, 4nh6:A, 7yyn:A, 7zpi:A, 7zpj:A, 7zpk:A
5	8dfv:A	1664	296	0.5231	0.0817	0.4595	3.54e-75
6	8dg5:A	1635	296	0.5231	0.0832	0.4595	3.81e-75	8dg7:A
7	8dga:A	1629	296	0.5231	0.0835	0.4595	4.57e-75
8	8hf0:A	1561	267	0.2462	0.0410	0.2397	1.25e-13	8hf0:D, 8hf1:A, 8hf1:D, 8hf1:G, 7w0a:A, 7w0a:E, 7w0c:A, 7w0d:A, 7w0e:A, 7w0f:A
9	7w0b:A	1586	267	0.2462	0.0404	0.2397	1.27e-13	7w0d:F
10	7v6c:A	1540	267	0.2308	0.0390	0.2247	3.01e-11
11	7eld:A	1137	116	0.1538	0.0352	0.3448	1.25e-09	7ele:A
12	7vg3:A	860	108	0.1231	0.0372	0.2963	4.15e-06	7vg2:A
13	2l5d:A	134	101	0.1077	0.2090	0.2772	3.70e-05	3o3i:X, 3o6e:X, 3o7v:X, 2xfm:A
14	7kx9:A	734	95	0.1115	0.0395	0.3053	0.001	7kx7:A, 7yfq:A, 7yg6:A
15	6kr6:A	713	61	0.0846	0.0309	0.3607	0.019
16	5guh:A	759	77	0.1038	0.0356	0.3506	0.037
17	4lna:A	269	222	0.1923	0.1859	0.2252	0.15
18	7yfx:A	746	60	0.0731	0.0255	0.3167	0.68	7yfy:A, 7ygn:A
19	8r3z:A	755	32	0.0538	0.0185	0.4375	0.93
20	4eb4:B	301	89	0.0962	0.0831	0.2809	1.2	4e5o:A, 4e5o:B, 4e5o:C, 4e5o:D, 4e5o:E, 4e5o:F, 4eb4:A, 4eb4:C, 4eb4:D, 4ein:A, 4ein:B, 3ejl:C, 3ejl:D, 4ez8:A, 6f6z:A, 6f6z:B, 5fct:A, 5fct:B, 4fgt:A, 4g2o:X, 4g6w:X, 4gd7:A, 6gko:A, 6gko:B, 6gyj:A, 3h9k:A, 3h9k:B, 3h9k:D, 3h9k:E, 3hb8:A, 3hb8:B, 3hb8:C, 3hb8:D, 3hb8:E, 5hs3:A, 5hs3:B, 5hs3:C, 5hs3:D, 5hs3:E, 5hs3:F, 1hvy:A, 1hvy:B, 1hvy:C, 1hvy:D, 1i00:A, 1i00:B, 1ju6:A, 1ju6:B, 1ju6:C, 1ju6:D, 1juj:A, 1juj:B, 1juj:C, 1juj:D, 3ob7:A, 3ob7:B, 3ob7:D, 3ob7:E, 6oju:B, 6oju:A, 6oju:C, 6oju:D, 6ojv:B, 6ojv:A, 6ojv:D, 6ojv:C, 6pf3:A, 6pf3:B, 6pf3:C, 6pf3:D, 6pf4:B, 6pf4:D, 6pf4:A, 6pf4:C, 6pf5:A, 6pf5:B, 6pf5:C, 6pf5:D, 6pf6:B, 6pf6:A, 6pf6:C, 6pf6:D, 6qxg:A, 6qxg:B, 6qxg:C, 6qxh:A, 6qxh:B, 6qxh:C, 6qyq:B, 6qyq:D, 6r2e:A, 6r2e:C, 6r2e:D, 6r2e:B, 6r2e:F, 6r2e:H, 6r2e:E, 6r2e:G, 2rd8:B, 2rda:C, 2rda:D, 2rda:E, 1rts:A, 1rts:B, 2tsr:A, 2tsr:B, 2tsr:C, 2tsr:D, 4up1:A, 4up1:B, 4up1:D, 4up1:C, 5wrn:B, 5wrn:A, 5wrn:C, 5wrn:D, 5wrn:E, 5wrn:F, 5x5d:A, 5x5d:D, 5x5d:B, 5x5d:E, 5x5d:C, 5x5d:F, 5x5q:A, 5x5q:D, 5x5q:B, 5x5q:E, 5x5q:C, 5x5q:F, 5x66:A, 5x66:D, 5x66:B, 5x66:E, 5x66:C, 5x66:F, 5x67:A, 5x67:B, 5x69:A, 5x69:D, 5x69:B, 5x69:E, 5x69:C, 5x69:F, 6y08:A, 6y08:B, 6zxo:A, 6zxo:B, 6zxo:C, 6zxo:D, 6zxo:E, 6zxo:F
21	2p4s:A	282	56	0.0654	0.0603	0.3036	5.3	2p4s:B, 2p4s:C
22	2onb:A	264	92	0.0885	0.0871	0.2500	5.5	4e28:A, 3n5e:A, 3n5e:B

[Back]