Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QPAQTIPWGIERVKAPSVWSITDGSVSVIQVAVLDTGVDYDHPDLAANIAWCVSTLRGKVSTKLRDCADQNGHGTHVIGT
IAALNNDIGVVGVAPGVQIYSVRVLDARGSGSYSDIAIGIEQAILGPDGVADKDGDGIIAGDPDDDAAEVISMSLGGPAD
DSYLYDMIIQAYNAGIVIVAASGNEGAPSPSYPAAYPEVIAVGAIDSNDNIASFSNRQPEVSAPGVDILSTYPDDSYETL
MGTAMATPHVSGVVALIQAAYYQKYGKILPVGTFDDISKNTVRGILHITADDLGPTGWDADYGYGVVRAALAVQAALG

The query sequence (length=318) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3wiv:C 397 318 0.9969 0.7985 0.9969 0.0 3a3n:A, 3a3n:B, 3a3o:A, 3a3o:B, 3a3p:A, 3a3p:B, 2e1p:A, 4jp8:A, 3vhq:A, 3vv2:A, 3vv2:B, 3wiu:A, 3wiu:B, 3wiu:C, 3wiv:A, 3wiv:B, 2z2x:A, 2z2y:A, 2z2y:B, 2z2y:C, 2z2y:D, 2z2z:A, 2z30:A, 2z30:B, 2z56:A, 2z56:B, 2z57:A, 2z57:B, 2z58:A, 2z58:B, 2zrq:A, 2zwo:A, 2zwo:B, 2zwo:C, 2zwp:A, 2zwp:B
2 1bh6:A 274 318 0.4057 0.4708 0.4057 3.95e-60
3 3whi:A 355 323 0.4182 0.3746 0.4118 1.55e-58 4dww:A, 5gl8:B, 1mee:A, 6o44:A, 6o44:B, 6pak:A, 6pak:B, 1scj:A, 3vyv:A, 3vyv:B, 3whi:B
4 5aqe:A 269 316 0.4308 0.5093 0.4335 3.95e-58 5arb:A, 5arc:A, 5ard:A, 3bx1:A, 3bx1:B, 1c9j:A, 1c9m:A, 1c9n:A, 4cfy:A, 4cfz:A, 4cg0:A, 1gci:A, 1iav:A, 1jea:A, 1mpt:A, 1ndq:A, 1ndu:A, 1q5p:A, 1st3:A, 1svn:A, 1tk2:A, 1wsd:A, 6y5s:A, 6y5t:A
5 2xrm:A 301 261 0.3396 0.3588 0.4138 1.29e-49
6 7y6m:C 290 296 0.3616 0.3966 0.3885 1.77e-49 7y6m:D
7 1af4:A 274 318 0.4151 0.4818 0.4151 1.15e-47 1be6:A, 1be8:A, 1bfk:A, 1bfu:A, 1c3l:A, 4c3u:A, 4c3v:A, 1cse:E, 6dwq:A, 4hx2:A, 4hx2:C, 1oyv:A, 1oyv:B, 1r0r:E, 1sbc:A, 1sca:A, 1scb:A, 1scd:A, 1scn:E, 1sel:A, 1sel:B, 2sec:E, 3unx:A, 2wuv:A, 2wuw:E, 1yu6:A, 1yu6:B
8 1tec:E 279 312 0.3742 0.4265 0.3814 2.56e-46 2tec:E, 3tec:E, 1thm:A
9 8h7o:A 281 312 0.3931 0.4448 0.4006 5.03e-44 1a2q:A, 1ak9:A, 7am6:C, 7am7:C, 7am8:A, 1aqn:A, 1au9:A, 3bgo:S, 3cnq:S, 1dui:A, 8h7p:A, 1lw6:E, 5ox2:A, 1s01:A, 1s02:A, 1sbh:A, 1sbi:A, 1sbn:E, 1sib:E, 2sic:E, 3sic:E, 5sic:E, 2sni:E, 1st2:A, 2st1:A, 1sua:A, 1sub:A, 1sud:A, 1sue:A, 1sup:A, 1tm1:E, 1tm3:E, 1tm4:E, 1tm5:E, 1tm7:E, 1tmg:E, 1to1:E, 1to2:E, 1ubn:A, 1v5i:A, 1y1k:E, 1y33:E, 1y34:E, 1y3b:E, 1y3c:E, 1y3d:E, 1y3f:E, 1y48:E, 1y4a:E, 1y4d:E, 1yja:A, 1yjb:A, 1yjc:A
10 3d43:B 310 282 0.3239 0.3323 0.3652 3.00e-41 3d43:A, 1ea7:A, 2ixt:A, 2ixt:B
11 1dbi:A 271 285 0.3459 0.4059 0.3860 7.57e-41
12 5ffn:A 311 284 0.3333 0.3408 0.3732 1.06e-36
13 6uai:S 266 318 0.3585 0.4286 0.3585 1.36e-33 6uao:S, 6ube:S
14 1r6v:A 671 340 0.3616 0.1714 0.3382 1.57e-32
15 3vv3:A 329 281 0.3333 0.3222 0.3772 1.68e-30 3vv3:B
16 3lpa:A 340 348 0.3836 0.3588 0.3506 4.24e-30 3lpc:A, 3lpd:A
17 7a9f:A 279 268 0.2987 0.3405 0.3545 4.75e-30 7a9k:A, 7a9m:A, 3aj8:A, 3aj9:A, 5avj:A, 5b1d:A, 5b1e:A, 4b5l:A, 1bjr:E, 7c0p:A, 1cnm:A, 5cw1:A, 3d9q:X, 3ddz:X, 3de0:X, 3de1:X, 3de2:X, 3de5:X, 3de6:X, 3de7:X, 2dp4:E, 2dqk:A, 2duj:A, 3dvq:X, 3dvr:X, 3dvs:X, 3dw1:X, 3dw3:X, 3dwe:X, 3dyb:A, 8e52:AAA, 8e53:AAA, 1egq:A, 8f05:A, 8f06:A, 8f07:A, 6fjs:A, 4fon:A, 8fyo:A, 8fyp:A, 8fyq:A, 8fyr:A, 8fys:A, 2g4v:A, 3gt3:A, 3gt4:A, 2hd4:A, 2hpz:A, 1ht3:A, 3i2y:X, 3i30:X, 3i34:X, 3i37:X, 1ic6:A, 2id8:A, 6j43:A, 7jsy:A, 6k2p:A, 6k2r:A, 6k2s:A, 6k2t:A, 6k2v:A, 6k2w:A, 5k7s:A, 6k8m:E, 6kkf:A, 5kxu:A, 5kxv:A, 3l1k:A, 7ln7:A, 7lpt:A, 7lpu:A, 7lpv:A, 7lq8:A, 7lq9:A, 7lqa:A, 7lqb:A, 7lqc:A, 7ltd:A, 7lti:A, 7ltv:A, 7lu0:A, 7lu1:A, 7lu2:A, 7lu3:A, 6mh6:A, 5mjl:A, 6n4u:A, 7nuz:A, 3osz:A, 1oyo:A, 1p7v:A, 1p7w:A, 1pek:E, 1pfg:A, 1pj8:A, 2pq2:A, 6pq0:A, 6pq4:A, 2prk:A, 3prk:E, 1ptk:A, 3ptl:A, 6pu4:A, 6pu5:A, 2pwa:A, 2pwb:A, 2pyz:A, 3q40:A, 3q5g:A, 6qf1:A, 3qmp:A, 6qxv:A, 5rof:A, 5rol:A, 5ron:A, 5rop:A, 5roq:A, 5ror:A, 5row:A, 5rp6:A, 5rp7:A, 5rp9:A, 5rpa:A, 5rpc:A, 5rpd:A, 5rpg:A, 5rph:A, 5rpj:A, 5rpk:A, 5rpm:A, 6rug:A, 6ruh:A, 6ruk:A, 6run:A, 6ruw:A, 6rve:A, 6rvg:A, 6rzp:A, 7s4z:A, 8sdk:A, 7skx:C, 8sog:A, 8sou:A, 8sov:A, 8spl:A, 8sqv:A, 6txg:A, 5uvl:A, 2v8b:A, 6v8r:A, 5whw:A, 5wjg:A, 5wjh:A, 5wrc:A, 4zar:A, 6zet:AAA, 6zeu:AAA, 6zev:AAA
18 2gko:A 309 280 0.3176 0.3269 0.3607 1.05e-29
19 7w2a:A 354 301 0.3522 0.3164 0.3721 6.50e-29 7w2a:B
20 1v6c:B 436 233 0.2547 0.1858 0.3476 3.02e-28 1v6c:A, 1wvm:A, 1wvm:B, 1y9z:A, 1y9z:B
21 1v6c:B 436 84 0.0975 0.0711 0.3690 1.23e-06 1v6c:A, 1wvm:A, 1wvm:B, 1y9z:A, 1y9z:B
22 3f7o:A 284 258 0.2956 0.3310 0.3643 2.93e-27 3f7o:B
23 3ti9:A 341 346 0.3805 0.3548 0.3497 3.03e-26 3ti7:A
24 3afg:B 507 247 0.2925 0.1834 0.3765 4.36e-26 3afg:A
25 8c4z:B 282 274 0.2987 0.3369 0.3467 8.17e-26
26 5wsl:A 282 295 0.3113 0.3511 0.3356 2.58e-23 5wsl:B, 5wsl:C
27 8pol:B 479 286 0.2579 0.1712 0.2867 3.52e-23 4lvn:A, 4lvo:A, 8pol:A
28 2b6n:A 278 271 0.2925 0.3345 0.3432 3.45e-22
29 4dzt:A 276 259 0.2862 0.3297 0.3514 5.30e-22
30 5z6o:A 282 249 0.2516 0.2837 0.3213 6.84e-20
31 8c4x:A 276 261 0.2642 0.3043 0.3218 9.30e-20
32 4tr2:B 474 291 0.2421 0.1624 0.2646 6.43e-19 8coy:A, 8coy:B, 8coz:A, 8coz:B, 8cp0:A, 8qke:A, 8qke:B, 8qkg:A, 8qkg:B, 8qkj:A, 8qkj:B, 4tr2:A
33 1s2n:A 281 246 0.2673 0.3025 0.3455 1.12e-18 1s2n:B, 1sh7:A, 1sh7:B
34 8ehe:A 353 351 0.3239 0.2918 0.2934 1.04e-17
35 8gkp:C 282 257 0.2547 0.2872 0.3152 1.09e-17 8gkp:D, 8gkq:C, 8u45:C
36 5yl7:A 339 292 0.3365 0.3156 0.3664 2.85e-15
37 6u26:B 479 243 0.2075 0.1378 0.2716 6.08e-13 7kev:B, 7kfa:B, 6u2n:B
38 8uw8:A 738 250 0.2138 0.0921 0.2720 2.58e-12
39 3t41:A 423 301 0.2421 0.1820 0.2558 2.81e-12 3t41:B
40 6u2f:A 582 223 0.1887 0.1031 0.2691 1.40e-09 7kev:A, 7kfa:A, 4ne9:B, 4nmx:B, 5oca:A, 3p5b:A, 3p5c:A, 2qtw:B, 7s5g:B, 7s5h:B, 6u2p:B, 6u36:B, 6u38:B, 6u3i:A, 6u3x:B, 5vla:A, 5vlh:A, 5vlk:A, 5vll:A, 5vlp:A, 2w2m:A, 2w2n:A, 2w2q:A, 6xib:B, 6xic:B, 6xid:B, 6xie:B, 6xif:B, 2xtj:A
41 1wmd:A 434 276 0.2390 0.1751 0.2754 1.66e-09 5fax:A, 5fax:B, 5fbz:A, 5fbz:C, 1wme:A, 1wmf:A
42 7bj3:A 936 60 0.0755 0.0256 0.4000 1.51e-07 8bty:A, 3eif:A, 1xf1:A, 1xf1:B, 7yzx:A
43 6vjb:A 1346 65 0.0849 0.0201 0.4154 5.18e-07
44 6vjb:A 1346 125 0.1132 0.0267 0.2880 0.22
45 4akt:A 330 127 0.1164 0.1121 0.2913 6.88e-07
46 8e7f:A 614 293 0.2516 0.1303 0.2730 8.55e-07
47 7edd:A 1394 65 0.0818 0.0187 0.4000 1.17e-06 5xyr:A
48 7edd:A 1394 137 0.1164 0.0265 0.2701 0.075 5xyr:A
49 5xya:A 1358 65 0.0818 0.0191 0.4000 1.19e-06 5xxz:A
50 5xya:A 1358 125 0.1132 0.0265 0.2880 0.18 5xxz:A
51 3wqb:A 597 79 0.0943 0.0503 0.3797 8.71e-05 3hjr:A
52 8b4x:A 473 318 0.2579 0.1734 0.2579 1.70e-04 8b4v:A, 8b4w:A, 6eqv:A, 6eqw:A, 6eqx:A, 6hlb:A, 6hld:A, 6hle:A, 6hza:A, 6hzb:A, 6hzc:A, 6hzd:A, 5jmo:A, 5jmo:B, 5jxg:A, 5jxh:A, 5jxi:A, 5jxj:A, 7lcu:A, 5mim:A, 7o1u:A, 7o1w:A, 7o1y:A, 7o20:A, 7o22:A, 4omc:A, 4omc:B, 4omc:C, 4omc:D, 4omc:E, 4omc:F, 4omd:A, 4omd:B, 4omd:C, 4omd:D, 4omd:E, 4omd:F, 8oyh:A, 1p8j:A, 1p8j:D, 1p8j:B, 1p8j:C, 1p8j:E, 1p8j:F, 1p8j:G, 1p8j:H, 7qxy:A, 7qxz:A, 7qy0:A, 7qy1:A, 7qy2:A, 4ryd:A, 4ryd:B, 4ryd:C, 4ryd:D, 4ryd:E, 4ryd:F, 6yd2:A, 6yd3:A, 6yd4:A, 6yd7:A, 4z2a:A
53 4yn3:A 596 142 0.1289 0.0688 0.2887 0.002 3vta:A, 3vta:B
54 4yn3:A 596 68 0.0566 0.0302 0.2647 0.013 3vta:A, 3vta:B
55 4m1z:A 317 309 0.2390 0.2397 0.2460 0.014 4m1z:B
56 1r64:A 481 79 0.0786 0.0520 0.3165 0.24 2id4:A, 2id4:B, 1ot5:A, 1ot5:B, 1r64:B
57 8a45:F 573 167 0.1321 0.0733 0.2515 0.76 8a29:A, 8a29:B, 8a29:C, 8a29:D, 8a29:E, 8a29:F, 8a45:A, 8a45:B, 8a45:C, 8a45:D, 8a45:E, 8a4d:A, 8a4d:B, 8a4d:C, 8a4d:D, 8a4d:E, 8a4d:F, 8a5k:A, 8a5k:B, 8a5k:C, 8a5k:D, 8a5k:E, 8a5k:F
58 7aqq:N 488 36 0.0377 0.0246 0.3333 1.1 7a23:I, 7a24:I, 7ar7:N, 7ar8:N, 8bef:N, 8bpx:N
59 5xxz:B 1310 188 0.1635 0.0397 0.2766 1.2
60 5xxz:B 1310 65 0.0629 0.0153 0.3077 1.3
61 4hvl:A 369 328 0.2484 0.2141 0.2409 2.5
62 6djz:B 221 94 0.0786 0.1131 0.2660 3.7 6djz:A, 6djz:C, 6dk0:A, 6dk0:B, 6dk0:C, 6dk1:A, 6dk1:B, 6dk1:C, 5hk1:A, 5hk1:B, 5hk1:C, 5hk2:A, 5hk2:B, 5hk2:C
63 3i74:A 642 26 0.0377 0.0187 0.4615 4.4 3i74:B
64 4pev:A 370 118 0.1006 0.0865 0.2712 5.4 4pev:B, 4pev:C
65 1isg:A 250 66 0.0535 0.0680 0.2576 5.8 1isg:B, 1ish:A, 1ish:B, 1isi:A, 1isi:B, 1isj:A, 1isj:B, 1ism:A, 1ism:B
66 2x24:B 667 71 0.0692 0.0330 0.3099 6.9 2x24:A
67 5e26:B 362 83 0.0660 0.0580 0.2530 7.8 5e26:A, 5e26:C, 5e26:D
68 4crm:P 608 75 0.0660 0.0345 0.2800 7.8 7a1g:x, 8cah:x, 3j16:B
69 8cas:k 579 75 0.0660 0.0363 0.2800 8.6 5ll6:h, 6zce:k, 6zu9:k
70 8w5k:F 307 137 0.0943 0.0977 0.2190 8.7 6jnf:A, 6jnf:F, 8w5k:I

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218