Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QPAAIEAFINSPEFQKNIRMRDIEKNKIGSGSYGTVYRLHDDFVVKIPVNEGIEHRNSHPDRVSKYLNMANDDKNFSRSA
IMNINGKDVTVLVSKYIQGQEFDVEDEDNYRMAEALLKSRGVYMHDINILGNILVKEGVLFFVDGDQIVLSQE

The query sequence (length=153) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8jbi:C 157 157 1.0000 0.9745 0.9745 2.94e-107 8jbi:D, 8jbi:A, 8jbi:B
2 8chf:A 280 133 0.2092 0.1143 0.2406 0.086 9ay7:A, 8chf:B, 3omv:A, 3omv:B
3 5u4i:w 47 30 0.0915 0.2979 0.4667 0.38 6c4i:w, 5h5u:3, 5mdv:6, 5mdw:6, 5mdy:6, 5mgp:w, 7oj0:6, 5u4j:w, 5u9f:Y, 5u9g:Y
4 4gcj:A 304 30 0.0850 0.0428 0.4333 0.79 2a0c:X, 5a14:A, 2a4l:A, 7ack:A, 7ack:C, 5ane:A, 5ang:A, 5ani:A, 5anj:A, 1b38:A, 1b39:A, 2b52:A, 2b53:A, 2b54:A, 8b54:A, 8b54:C, 7b7s:A, 7b7s:C, 4bck:A, 4bck:C, 4bcm:A, 4bcm:C, 4bcn:A, 4bcn:C, 4bco:A, 4bcp:A, 4bcq:A, 4bcq:C, 3bht:A, 3bhu:A, 3bhv:A, 2bkz:A, 2bkz:C, 2bpm:A, 2bpm:C, 2c4g:A, 2c4g:C, 2c5n:A, 2c5n:C, 2c5o:A, 2c5o:C, 2c5v:A, 2c5v:C, 2c5x:A, 2c5x:C, 2c5y:A, 2c68:A, 2c69:A, 2c6i:A, 2c6k:A, 2c6l:A, 2c6m:A, 2c6o:A, 2c6t:A, 2c6t:C, 2cch:A, 2cch:C, 2cci:A, 2cci:C, 4cfm:A, 4cfn:A, 4cfn:C, 4cfu:A, 4cfv:A, 4cfw:A, 4cfw:C, 4cfx:A, 4cfx:C, 2cjm:A, 2cjm:C, 1ckp:A, 2clx:A, 5cyi:A, 5cyi:C, 4d1x:A, 4d1z:A, 5d1j:A, 3ddp:A, 3ddp:C, 3ddq:A, 1di8:A, 3dog:A, 2ds1:A, 1e1v:A, 1e1x:A, 7e34:A, 1e9h:A, 1e9h:C, 3eid:A, 3ej1:A, 3ej1:C, 4ek4:A, 4ek5:A, 4ek8:A, 3eoc:A, 3eoc:C, 4eoi:A, 4eoi:C, 4eoj:A, 4eoj:C, 4eok:A, 4eok:C, 4eol:A, 4eol:C, 4eom:A, 4eon:A, 4eon:C, 4eoo:A, 4eoo:C, 4eop:A, 4eop:C, 4eoq:A, 4eor:A, 4eos:A, 4eos:C, 4erw:A, 8erd:A, 8ern:A, 2exm:A, 4ez3:A, 4ez7:A, 3f5x:A, 3f5x:C, 1fin:A, 1fin:C, 4fkg:A, 4fki:A, 4fkl:A, 4fko:A, 4fkp:A, 4fkq:A, 4fkr:A, 4fkt:A, 4fku:A, 4fkv:A, 4fkw:A, 8fow:A, 5fp6:A, 8fp5:A, 1fq1:B, 9fr2:A, 1fvt:A, 1fvv:A, 1fvv:C, 2fvd:A, 4fx3:A, 4fx3:C, 3fz1:A, 2g9x:A, 1gii:A, 6gub:A, 6gub:C, 6guc:A, 6guc:C, 6gue:A, 6gue:C, 6guf:A, 6guf:C, 6guh:A, 6gva:A, 1gy3:A, 1gy3:C, 1gz8:A, 1h00:A, 1h01:A, 1h07:A, 1h08:A, 1h0v:A, 1h0w:A, 1h1p:A, 1h1p:C, 1h1q:A, 1h1q:C, 1h1r:A, 1h1r:C, 1h1s:A, 1h1s:C, 8h6p:A, 8h6t:A, 1hck:A, 4i3z:A, 4i3z:C, 2i40:A, 2i40:C, 5iev:A, 5iex:A, 5iey:A, 3igg:A, 4ii5:A, 4ii5:C, 2iw6:A, 2iw6:C, 2iw8:A, 2iw9:A, 6jgm:A, 5jq5:A, 5jq8:A, 1jst:A, 1jst:C, 1jsv:A, 1jvp:P, 5k4j:A, 4kd1:A, 1ke5:A, 1ke6:A, 1ke7:A, 1ke8:A, 1ke9:A, 7kjs:A, 5l2w:A, 3le6:A, 3lfn:A, 3lfq:A, 3lfs:A, 5lmk:A, 4lyn:A, 7m2f:A, 5mhq:A, 7mkx:A, 7mkx:C, 3my5:A, 5nev:A, 5nev:C, 3ns9:A, 7nvq:A, 1ogu:A, 1oi9:A, 1oi9:C, 1oiq:A, 1oir:A, 1oit:A, 1oiu:A, 1oiy:A, 1oiy:C, 5oo0:A, 5oo1:A, 5oo3:A, 6oqi:A, 5osj:A, 5osm:A, 1p5e:A, 1p5e:C, 1pf8:A, 3pj8:A, 1pkd:A, 1pkd:C, 1pxi:A, 1pxj:A, 1pxk:A, 1pxl:A, 1pxm:A, 1pxn:A, 1pxo:A, 1pxp:A, 3pxf:A, 3pxq:A, 3pxy:A, 3pxz:A, 3py0:A, 3py1:A, 6q3b:A, 6q3c:A, 6q3f:A, 6q48:A, 6q49:A, 6q4a:A, 6q4b:A, 6q4c:A, 6q4d:A, 6q4e:A, 6q4f:A, 6q4g:A, 6q4h:A, 6q4i:A, 6q4j:A, 6q4k:A, 3qhr:C, 3qhr:A, 3qhw:A, 3qhw:C, 7qhl:A, 7qhl:C, 3ql8:A, 1qmz:A, 1qmz:C, 3qqf:A, 3qqg:A, 3qqh:A, 3qqj:A, 3qqk:A, 3qql:A, 3qrt:A, 3qru:A, 3qtq:A, 3qtr:A, 3qts:A, 3qtu:A, 3qtw:A, 3qtx:A, 3qtz:A, 3qu0:A, 3qwj:A, 3qwk:A, 3qx2:A, 3qx4:A, 3qxo:A, 3qxp:A, 3qzf:A, 3qzg:A, 3qzh:A, 3qzi:A, 3r1q:A, 3r1s:A, 3r1y:A, 3r28:A, 2r3f:A, 2r3g:A, 2r3h:A, 2r3i:A, 2r3j:A, 2r3m:A, 2r3o:A, 2r3p:A, 2r3q:A, 2r3r:A, 2r64:A, 3r6x:A, 3r71:A, 3r73:A, 3r7e:A, 3r7i:A, 3r7u:A, 3r7v:A, 3r7y:A, 3r83:A, 3r8l:A, 3r8m:A, 3r8p:A, 3r8u:A, 3r8v:A, 3r8z:A, 3r9d:A, 3r9h:A, 3r9n:A, 3r9o:A, 3rah:A, 3rai:A, 6rij:A, 6rij:C, 3rjc:A, 4rj3:A, 3rk5:A, 3rk7:A, 3rk9:A, 3rkb:A, 3rm6:A, 3rm7:A, 3rni:A, 3roy:A, 3rpo:A, 3rpr:A, 3rpv:A, 7rwe:A, 7rwf:A, 7rxo:A, 3rzb:A, 3s00:A, 3s0o:A, 3s2p:A, 7s4t:A, 7s7a:A, 7s84:A, 7s85:A, 7s9x:A, 7sa0:A, 3sqq:A, 3sw4:A, 3ti1:A, 3tiy:A, 3tiz:A, 3tnw:A, 3tnw:C, 7ug1:A, 3uli:A, 3unj:A, 3unk:A, 2uue:A, 2uue:C, 8uv0:A, 7uxi:A, 2uzb:A, 2uzb:C, 2uzd:A, 2uzd:C, 2uze:A, 2uze:C, 2uzl:A, 2uzl:C, 2uzn:A, 2uzo:A, 2v0d:A, 7vdu:A, 8vq3:A, 8vq4:A, 2vti:A, 2vtl:A, 2vtm:A, 2vto:A, 2vtp:A, 2vtr:A, 2vts:A, 2vu3:A, 2vv9:A, 1vyw:A, 1vyw:C, 1vyz:A, 1w0x:C, 2w06:A, 2w17:A, 2w1h:A, 1w8c:A, 3wbl:A, 1wcc:A, 2wev:A, 2wev:C, 2wih:A, 2wih:C, 2wip:A, 2wip:C, 2wmb:A, 2wpa:A, 2wpa:C, 2wxv:A, 2wxv:C, 2x1n:A, 2x1n:C, 2xmy:A, 2xnb:A, 1y8y:A, 1y91:A, 1ykr:A, 6yl1:A, 6ylk:A, 7zpc:A
5 8dgt:A 431 24 0.0850 0.0302 0.5417 0.89 9axx:B, 9axy:A, 6b8u:A, 9bfb:A, 3c4c:A, 3c4c:B, 8c7x:A, 8c7x:B, 8c7y:A, 8c7y:B, 5c9c:A, 5csw:A, 5csx:A, 5ct7:A, 5ct7:B, 3d4q:A, 3d4q:B, 4dbn:A, 4dbn:B, 8dgs:A, 4e26:A, 4e26:B, 4e4x:A, 4e4x:B, 4ehe:A, 4ehe:B, 4ehg:A, 4ehg:B, 8f7o:A, 8f7o:B, 8f7p:A, 8f7p:B, 2fb8:A, 2fb8:B, 4fc0:B, 5fd2:A, 4g9c:A, 4g9c:B, 4g9r:A, 4g9r:B, 4h58:A, 5hid:A, 5hid:B, 5hie:A, 5hie:B, 3idp:B, 3idp:A, 3ii5:A, 3ii5:B, 5j18:A, 5j2r:A, 5jrq:A, 5jsm:A, 5jsm:B, 5jsm:C, 5jsm:D, 5jt2:A, 4jvg:B, 4jvg:A, 4jvg:C, 4jvg:D, 7k0v:A, 7k0v:B, 7k0v:C, 7k0v:D, 4ksp:A, 4ksp:B, 4ksq:A, 4ksq:B, 7m0t:A, 7m0u:A, 7m0v:A, 7m0w:A, 7m0x:A, 7m0y:A, 7m0z:A, 4mbj:A, 4mbj:B, 7mfd:A, 7mfe:A, 7mff:A, 7mff:B, 4mnf:A, 4mnf:B, 6n0p:A, 6n0p:B, 6n0q:A, 6nsq:A, 6nyb:A, 6p3d:A, 7p3v:A, 7p3v:B, 6p7g:A, 6p7g:B, 6p7g:C, 6p7g:D, 3ppj:A, 3ppj:B, 3ppk:A, 3ppk:B, 4pp7:A, 4pp7:B, 6pp9:A, 3prf:A, 3prf:B, 3pri:A, 3pri:B, 3psb:A, 3psb:B, 3psd:A, 3psd:B, 3q4c:A, 3q96:B, 8qqg:A, 8qqg:B, 8qqg:C, 4r5y:A, 4r5y:B, 4rzv:A, 4rzv:B, 7shv:A, 7shv:B, 3skc:A, 3skc:B, 3tv4:A, 3tv4:B, 3tv6:A, 3tv6:B, 6u2g:B, 6u2h:C, 6u2h:D, 6uuo:A, 1uwh:A, 1uwh:B, 1uwj:A, 1uwj:B, 6v2u:A, 6v2w:A, 6v34:A, 5vam:A, 5vam:B, 4wo5:A, 4wo5:B, 6xfp:A, 6xlo:A, 4xv9:A, 4yht:A, 4yht:B
6 4fc0:A 254 24 0.0850 0.0512 0.5417 1.0 6b8u:B, 5c9c:B, 6cad:A, 6cad:B, 4cqe:A, 4cqe:B, 5csw:B, 5fd2:B, 4fk3:A, 5hi2:A, 5hie:C, 5hie:D, 5ita:A, 5ita:B, 5jrq:B, 5jt2:B, 5jt2:C, 5jt2:D, 6n0q:B, 6nsq:B, 3og7:A, 3q96:A, 4rzw:A, 4rzw:B, 6uuo:B, 6v2u:B, 6v34:B, 5val:A, 5val:B, 6xlo:B, 4xv1:A, 4xv2:A, 4xv2:B, 4xv3:A
7 8u8x:A 308 36 0.0980 0.0487 0.4167 1.2 7jxh:B, 7jxh:A, 7jxh:C, 7jxh:D, 7jxh:E, 7jxh:F, 7jxh:G, 7jxh:H, 7pcd:A, 3pp0:A, 3pp0:B
8 9axm:B 254 24 0.0784 0.0472 0.5000 1.3
9 2ct8:A 465 67 0.1242 0.0409 0.2836 1.8 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
10 4ubt:A 396 37 0.0654 0.0253 0.2703 2.0 4ubt:B, 4ubt:C, 4ubt:D, 4ubu:A, 4ubu:B, 4ubu:C, 4ubu:D, 4ubu:E, 4ubu:F, 4ubu:G, 4ubu:H, 4ubv:A, 4ubv:B
11 3ppz:A 267 26 0.0915 0.0524 0.5385 2.4 3p86:A
12 3qwb:A 330 93 0.1373 0.0636 0.2258 2.6 3qwb:B, 3qwb:C, 3qwb:D
13 7rpx:E 590 82 0.1634 0.0424 0.3049 3.6 2hix:A, 7rpo:E, 7rpw:E
14 7wh1:A 499 47 0.0980 0.0301 0.3191 4.4
15 8ulg:A 827 67 0.1438 0.0266 0.3284 6.1 7jsn:A, 6mzb:A, 8ufi:A, 8ugb:A, 8ugs:A
16 2r4b:A 292 49 0.1176 0.0616 0.3673 6.4 3bbt:B, 3bbt:D, 2r4b:B
17 1unl:A 292 66 0.1242 0.0651 0.2879 6.9 4au8:A, 4au8:B, 3o0g:B, 1ung:A, 1ung:B, 1unh:A, 1unh:B, 7vdp:A, 7vdp:B, 7vdq:A, 7vdq:B, 7vdr:A, 7vdr:B, 7vds:A
18 5g6v:A 308 57 0.1046 0.0519 0.2807 8.9 5g6v:B, 3mtl:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218