Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QNTIERFTFPHKYKKTDEKCTICLSMLEDGEDVRRLPCMHLFHQLCVDQWLAMSKKCPICRVDIETQL

The query sequence (length=68) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7r70:A 150 71 1.0000 0.4533 0.9577 1.04e-45 5d0i:A, 5d0i:B, 5d0k:C, 5d0k:F, 5d0k:I, 5d0k:L, 7r70:B, 7r71:A
2 5d0m:C 60 65 0.8676 0.9833 0.9077 2.31e-36 5ulh:C, 5ulk:C
3 2kiz:A 69 50 0.6324 0.6232 0.8600 7.09e-28 5lg0:A, 5lg7:A, 7p2k:A
4 5zbu:A 74 54 0.4265 0.3919 0.5370 3.08e-13 5zbu:D, 5zc4:A, 5zc4:D
5 7bvw:A 79 68 0.4265 0.3671 0.4265 9.60e-13 7bvw:B
6 1iym:A 55 47 0.3529 0.4364 0.5106 2.20e-12
7 1x4j:A 75 58 0.3529 0.3200 0.4138 7.84e-12
8 4v3k:C 75 58 0.3529 0.3200 0.4138 1.10e-11 7ojx:A, 4v3k:F, 4v3l:C
9 6w7z:B 71 42 0.2647 0.2535 0.4286 3.56e-11 6w9a:B, 6w9a:D, 6w9d:B, 6w9d:E, 6w9d:H
10 2ect:A 78 49 0.3088 0.2692 0.4286 2.89e-10
11 6a3z:A 56 55 0.2941 0.3571 0.3636 3.00e-09
12 2lxh:C 58 56 0.2794 0.3276 0.3393 9.87e-09 2lxp:C
13 5ywr:B 87 44 0.2500 0.1954 0.3864 2.00e-08
14 2l0b:A 91 42 0.2941 0.2198 0.4762 3.39e-08
15 4lad:B 69 45 0.2647 0.2609 0.4000 4.66e-07
16 1chc:A 68 50 0.2794 0.2794 0.3800 4.71e-07
17 2ecn:A 70 48 0.2941 0.2857 0.4167 6.89e-07 5xek:A
18 6f98:A 78 58 0.2794 0.2436 0.3276 2.41e-06
19 2ep4:A 74 47 0.2353 0.2162 0.3404 3.15e-06
20 7t92:C 317 49 0.2500 0.0536 0.3469 1.06e-05
21 4orh:H 142 32 0.1912 0.0915 0.4062 2.94e-04 4ayc:A, 4ayc:B, 4orh:C, 4orh:G, 4orh:K, 4orh:L, 4whv:C, 4whv:D, 4whv:I, 4whv:J
22 2ecm:A 55 48 0.2353 0.2909 0.3333 6.78e-04
23 7zj3:A 86 51 0.2206 0.1744 0.2941 0.001 8a38:A, 8a38:B, 8a38:C, 8ams:C, 8ams:D, 7zj3:D, 7zj3:G, 7zj3:J
24 7ynx:A 188 46 0.2353 0.0851 0.3478 0.006 2jrj:A, 7ynx:B
25 5d1l:B 111 53 0.2206 0.1351 0.2830 0.006 5d1k:B, 5d1m:B
26 6wi7:A 206 45 0.2206 0.0728 0.3333 0.006 2ckl:A, 8grm:M, 2h0d:A, 7nd1:H, 8pp7:K, 8pp7:M, 4r8p:K, 4r8p:M, 3rpg:B, 6wi8:A, 6wi8:B
27 2d8t:A 71 63 0.3088 0.2958 0.3333 0.010
28 4qpl:A 153 29 0.1912 0.0850 0.4483 0.025 4qpl:C, 3v3l:A, 3v3l:B
29 7oni:R 86 30 0.1618 0.1279 0.3667 0.027 2ecl:A, 6v9i:R
30 3zni:A 390 64 0.3088 0.0538 0.3281 0.035 4a49:A, 5axi:B, 5axi:A, 5axi:C, 9fqh:A, 9fqi:A, 9fqj:A, 9fqj:B, 8gcy:A, 2ldr:A, 3pfv:A, 3pfv:B, 8qng:A, 8qnh:A, 8qni:A, 8qtg:A, 8qth:A, 8qtj:A, 8qtk:A, 8vw4:A, 8vw4:B, 8vw5:A, 8vw5:B, 3zni:E, 3zni:I, 3zni:M
31 5j3x:B 389 51 0.2647 0.0463 0.3529 0.045 4a4b:A, 4a4c:A, 1b47:A, 1b47:B, 1b47:C, 3bum:B, 3bun:B, 3buo:B, 3buo:D, 3buw:B, 3buw:D, 3bux:B, 3bux:D, 2cbl:A, 1fbv:A, 4gpl:B, 5hkx:A, 5hky:A, 5hkz:A, 5hl0:A, 5j3x:A, 5j3x:C, 5j3x:D, 5j3x:E, 5j3x:F, 2k4d:A, 5o76:A, 5o76:C, 3ob1:B, 3ob2:B, 3plf:B, 3plf:D, 7siy:A, 6xar:A, 6xar:B, 2y1m:A, 2y1m:B, 2y1m:C, 2y1m:D, 2y1m:E, 2y1m:F, 2y1n:A, 2y1n:C, 1yvh:A
32 2djb:A 72 46 0.1912 0.1806 0.2826 0.078
33 2lgv:A 100 58 0.2206 0.1500 0.2586 0.21 4a0c:D, 8b3g:R, 8b3i:R, 7b5l:R, 7b5m:R, 7b5n:R, 7b5s:R, 8cdk:R, 3dpl:R, 3dqv:R, 3dqv:Y, 4f52:B, 4f52:D, 8gq6:E, 8gq6:D, 8h33:D, 8h33:K, 8h33:L, 8h33:E, 8h34:R, 8h34:Q, 8h34:E, 8h34:D, 8h34:L, 8h34:K, 8h35:E, 8h35:D, 8h35:L, 8h35:K, 8h35:R, 8h35:Q, 8h35:W, 8h35:X, 8h36:E, 8h36:D, 8h37:E, 8h37:D, 8h37:R, 8h37:Q, 8h38:R, 8h3a:R, 8h3f:R, 8h3q:E, 8h3r:E, 8h3r:D, 2hye:D, 8jaq:R, 8jaq:V, 8jas:R, 8jas:V, 8jav:R, 8jav:V, 1ldj:B, 1ldk:C, 5n4w:R, 8or0:B, 8or2:B, 8or3:B, 4p5o:B, 4p5o:D, 7plo:T, 8pql:K, 8q7h:C, 8q7h:D, 8q7r:R, 8qu8:E, 8r5h:R, 6r7i:R, 6r7n:R, 8rhz:C, 8rhz:D, 3rtr:B, 3rtr:D, 3rtr:F, 3rtr:H, 8rwz:R, 8rx0:R, 6ttu:R, 1u6g:B, 8wqa:J, 8wqa:I, 8wqb:I, 8wqb:E, 8wqc:F, 8wqc:J, 8wqe:J, 8wqe:I, 8wqf:I, 8wqf:E, 8wqg:F, 8wqg:J, 8wqh:J, 8wqh:B, 7z8b:R, 7z8r:R, 7z8t:R, 7z8v:R, 7zbz:R
34 2ea6:A 69 51 0.2059 0.2029 0.2745 0.27
35 3j92:0 36 26 0.1618 0.3056 0.4231 0.38
36 6y5p:B 229 68 0.3235 0.0961 0.3235 0.39 6y5n:A, 6y5n:B, 6y5p:A
37 5ait:A 129 51 0.2059 0.1085 0.2745 0.44 5aiu:A, 4ap4:A, 3ng2:A, 3ng2:B, 4ppe:A, 4ppe:B, 2xeu:A
38 5ait:A 129 51 0.2059 0.1085 0.2745 0.44 5aiu:A, 4ap4:A, 3ng2:A, 3ng2:B, 4ppe:A, 4ppe:B, 2xeu:A
39 6otu:A 517 39 0.1618 0.0213 0.2821 0.48
40 5o6c:A 252 62 0.2500 0.0675 0.2742 0.49 6t7f:A
41 5a31:B 84 62 0.2647 0.2143 0.2903 0.77 5g04:B, 5g05:B, 9gaw:C, 5jg6:A, 5jg6:D, 2mt5:A, 7qe7:C, 4r2y:A, 4r2y:B, 4r2y:C, 4r2y:D, 8s4g:C, 6tm5:B, 6tnt:B, 4ui9:B
42 5h7r:D 124 55 0.2647 0.1452 0.3273 1.0 5h7s:D, 5h7s:B
43 4s3o:C 95 48 0.2353 0.1684 0.3333 1.0 4s3o:F
44 3v00:C 353 28 0.1618 0.0312 0.3929 1.1 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
45 4a0c:F 80 30 0.1618 0.1375 0.3667 1.2 8ij1:R, 7shk:R
46 8adl:A 633 47 0.2206 0.0237 0.3191 1.2 8adl:I
47 7yui:B 232 41 0.1765 0.0517 0.2927 1.5 3b08:K, 3b08:B, 3b08:E, 3b08:H, 3b0a:B
48 2y43:A 88 46 0.1765 0.1364 0.2609 1.8 2y43:B
49 7oik:A 4426 48 0.2353 0.0036 0.3333 2.0 7oim:A, 6tax:A, 6tay:A
50 8a3t:U 114 33 0.1765 0.1053 0.3636 2.3 8a5y:U
51 8eaz:A 254 41 0.1765 0.0472 0.2927 2.4 8bvl:A, 8bvl:B, 8eaz:B, 7yuj:A, 7yuj:B
52 7z36:B 446 44 0.1912 0.0291 0.2955 3.1 6h3a:A, 6h3a:F, 6qaj:A, 6qaj:B, 6qu1:A, 2yvr:A, 2yvr:B, 7z36:A
53 8adl:C 782 21 0.1029 0.0090 0.3333 3.6 8adl:Q
54 2yho:E 70 54 0.2206 0.2143 0.2778 4.0 2yhn:A, 2yhn:B, 2yho:A, 2yho:C, 2yho:G
55 2d8s:A 80 51 0.2500 0.2125 0.3333 4.0
56 7w0b:A 1586 32 0.1618 0.0069 0.3438 5.9 7w0d:F
57 8hf0:A 1561 32 0.1618 0.0070 0.3438 6.1 8hf0:D, 8hf1:A, 8hf1:D, 8hf1:G, 7w0a:A, 7w0a:E, 7w0c:A, 7w0d:A, 7w0e:A, 7w0f:A
58 7v6c:A 1540 32 0.1618 0.0071 0.3438 6.1
59 5mac:A 473 36 0.1912 0.0275 0.3611 6.2 5mac:B, 5mac:D, 5mac:C, 5mac:E
60 3k1l:A 376 66 0.2059 0.0372 0.2121 7.4 3k1l:B
61 4w8f:B 2609 38 0.1471 0.0038 0.2632 7.6 220l:A, 223l:A, 225l:A, 227l:A, 148l:E, 258l:A, 259l:A, 260l:A, 182l:A, 183l:A, 184l:A, 185l:A, 186l:A, 187l:A, 188l:A, 2a4t:A, 1c61:A, 1c62:A, 1c65:A, 1c66:A, 1c67:A, 1c68:A, 1c6a:A, 1c6b:A, 1c6d:A, 1c6e:A, 1c6g:A, 1c6h:A, 1c6j:A, 1c6k:A, 1c6m:A, 1c6n:A, 1c6q:A, 1c6t:A, 2cuu:A, 3dmx:A, 3dmz:A, 3dn0:A, 3dn1:A, 3dn2:A, 3dn3:A, 3dn4:A, 3dn6:A, 3dn8:A, 3dna:A, 1epy:A, 5g27:A, 3g3v:A, 3g3w:A, 3g3x:A, 3guj:A, 3guk:A, 3gul:A, 3gul:B, 3gum:A, 3gum:B, 3gun:A, 3gun:B, 3guo:A, 3guo:B, 3gup:A, 3gup:B, 3hh3:A, 3hh5:A, 3hh6:A, 3ht6:A, 3ht7:A, 3ht8:A, 3ht9:A, 3htb:A, 3htd:A, 3htf:A, 3htg:A, 3hu8:A, 3hu9:A, 3hua:A, 3huk:A, 3huq:A, 3hwl:A, 2igc:A, 5jdt:A, 5jgn:A, 5jgr:A, 5jgv:A, 5jgz:A, 5jws:A, 5jwt:A, 5jwu:A, 5jwv:A, 5jww:A, 3k2r:A, 3l2x:A, 7l3b:A, 7l3c:A, 7l3d:A, 7l3e:A, 7l3f:A, 7l3g:A, 7l3h:A, 7l3i:A, 7l3j:A, 7l3k:A, 1l83:A, 1l84:A, 1lgw:A, 1lgx:A, 1li3:A, 1li6:A, 7loa:A, 7lob:A, 7loc:A, 7lod:A, 7loe:A, 7lof:A, 7log:A, 7loj:A, 5lwo:A, 7lx6:A, 7lx7:A, 7lx8:A, 7lx9:A, 7lxa:A, 4lzm:A, 5lzm:A, 6lzm:A, 7lzm:A, 1nhb:A, 2ntg:A, 2nth:A, 2oty:X, 2otz:X, 2ou0:X, 2ou8:A, 2ou9:A, 1ov5:A, 1ov7:A, 1ovh:A, 1ovj:A, 1ovk:A, 1owy:A, 1owz:A, 6pgy:A, 6pgz:A, 6pgz:B, 4pjz:A, 4pk0:A, 2q9d:A, 2q9e:B, 2q9e:C, 2ray:X, 2raz:X, 2rb0:X, 2rb1:X, 2rb2:X, 2rbn:A, 2rbo:A, 2rbp:A, 2rbq:A, 2rbr:A, 2rbs:A, 3run:A, 3sb5:B, 3sb5:A, 3sb5:C, 3sb5:D, 3sb6:A, 3sb6:B, 3sb8:A, 3sb8:B, 3sb9:A, 3sb9:B, 3sba:B, 3sba:C, 3sba:F, 8tat:A, 6v51:A, 4w52:A, 4w53:A, 4w54:A, 4w55:A, 4w56:A, 4w57:A, 4w58:A, 4w59:A, 4w8f:A, 1xep:A, 1zur:A, 1zwn:A, 1zyt:A
62 7mgm:A 2274 38 0.1471 0.0044 0.2632 7.7
63 8dzz:A 2363 38 0.1471 0.0042 0.2632 7.8 8dzz:D, 8e00:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218