Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
QLRKAIGEMDNQVSQLTSELKFIKNAVAGVRETESKIYLLVKEEKRYADAQLSCQGRGGTLSMPKDEAANGLMAAYLAQA
GLARVFIGINDLEKEGAFVYSDHSPMRTFNKWRSGEPNNAYDEEDCVEMVASGGWNDVACHTTMYFMCEFDKE

The query sequence (length=153) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4yli:D 155 153 1.0000 0.9871 1.0000 2.14e-115 4yli:A, 4yli:B, 4yli:C, 4yli:E, 4yli:F, 4ymd:A, 4ymd:B, 4ymd:D, 4ymd:F, 4ymd:C, 4ymd:E
2 6bbe:A 155 154 0.3137 0.3097 0.3117 8.98e-19 6bbd:A, 4dn8:A
3 2ric:C 158 157 0.3072 0.2975 0.2994 4.53e-18 1b08:A, 1b08:B, 1b08:C, 3dbz:A, 3dbz:B, 3dbz:C, 4e52:B, 4e52:C, 4e52:A, 3g81:A, 3g81:B, 3g81:C, 3g83:A, 3g83:B, 3g83:C, 3g84:A, 3g84:B, 3g84:C, 2ggu:A, 2ggu:B, 2ggu:C, 2ggx:A, 2ggx:B, 2ggx:C, 3ikn:A, 3ikn:B, 3ikn:C, 3ikp:A, 3ikp:B, 3ikp:C, 3ikq:A, 3ikq:B, 3ikq:C, 3ikr:A, 3ikr:B, 3ikr:C, 4m17:A, 4m17:B, 4m17:C, 4m17:D, 4m17:E, 4m17:F, 4m17:G, 4m17:H, 4m17:I, 4m17:J, 4m17:K, 4m17:L, 4m18:A, 4m18:E, 4m18:B, 4m18:C, 4m18:D, 4m18:L, 4m18:F, 4m18:G, 4m18:H, 4m18:I, 4m18:J, 4m18:K, 2orj:A, 2orj:B, 2orj:C, 2ork:A, 2ork:B, 2ork:C, 2os9:A, 2os9:B, 2os9:C, 5oxr:B, 5oxr:C, 5oxr:A, 5oxs:A, 5oxs:B, 5oxs:C, 1pw9:A, 1pw9:B, 1pw9:C, 1pwb:A, 1pwb:B, 1pwb:C, 2ria:A, 2ria:B, 2ria:C, 2rib:A, 2rib:B, 2rib:C, 2ric:B, 2ric:A, 2rid:A, 2rid:B, 2rid:C, 2rie:A, 2rie:B, 2rie:C
4 1hup:A 141 121 0.2614 0.2837 0.3306 1.80e-17
5 6ryj:A 122 118 0.2614 0.3279 0.3390 1.83e-17 6ryg:A, 6rym:A, 6ryn:A
6 6pwr:A 129 118 0.2418 0.2868 0.3136 2.73e-14 6pws:A, 6pwt:A
7 1afa:1 154 152 0.2418 0.2403 0.2434 5.47e-14 1afa:2, 1afa:3, 1afb:1, 1afb:2, 1afb:3, 1afd:1, 1afd:2, 1afd:3, 1bch:1, 1bch:2, 1bch:3, 1bcj:1, 1bcj:2, 1bcj:3, 1fif:A, 1fif:B, 1fif:C, 1fih:A, 1fih:B, 1fih:C, 1kmb:1, 1kmb:2, 1kmb:3, 2kmb:1, 2kmb:2, 2kmb:3, 3kmb:1, 3kmb:3, 3kmb:2, 4kmb:1, 4kmb:2, 4kmb:3, 1kwt:A, 1kwt:B, 1kwt:C, 1kwu:A, 1kwu:B, 1kwu:C, 1kwv:A, 1kwv:B, 1kwv:C, 1kww:A, 1kww:B, 1kww:C, 1kwx:A, 1kwx:B, 1kwx:C, 1kwy:A, 1kwy:B, 1kwy:C, 1kwz:A, 1kwz:B, 1kwz:C, 1kx0:A, 1kx0:B, 1kx0:C, 1kx1:C, 1kx1:F, 1kx1:A, 1kx1:B, 1kx1:D, 1kx1:E, 2msb:B, 2msb:A, 1rtm:1, 1rtm:2, 1rtm:3
8 4c9f:D 134 116 0.2418 0.2761 0.3190 4.39e-12 4c9f:A, 4c9f:B, 4c9f:C, 4caj:A, 4caj:B, 4caj:C, 4caj:D, 3zhg:A, 3zhg:B, 3zhg:C, 3zhg:D
9 1kza:1 115 101 0.2026 0.2696 0.3069 9.54e-12 1kza:2, 1kzb:1, 1kzb:2, 1kzc:1, 1kzc:2, 1kzd:1, 1kzd:2, 1kze:1, 1kze:2, 1rdi:1, 1rdi:2, 1rdj:1, 1rdj:2, 1rdk:1, 1rdk:2, 1rdl:1, 1rdl:2, 1rdm:1, 1rdm:2, 1rdn:1, 1rdn:2, 1rdo:1, 1rdo:2
10 1sl6:A 168 118 0.2222 0.2024 0.2881 1.46e-11 1k9j:A, 1sl6:B, 1sl6:C, 1sl6:D, 1sl6:E, 1sl6:F, 1xph:A
11 6ghv:D 133 118 0.2092 0.2406 0.2712 3.61e-11 6ghv:A, 6ghv:B, 6ghv:C, 6ghv:E, 6ghv:F, 2it5:A, 2it6:A, 1k9i:A, 1k9i:C, 1k9i:D, 1k9i:E, 1k9i:H, 1k9i:B, 1k9i:F, 1k9i:G, 1k9i:I, 1k9i:J, 7nl6:A, 7nl7:A, 1sl4:A, 1sl5:A, 2xr5:A, 2xr6:A
12 2ox9:C 131 122 0.2157 0.2519 0.2705 6.06e-11 2ox9:A, 2ox9:B, 2ox9:D
13 5e4l:A 428 109 0.2157 0.0771 0.3028 6.63e-11
14 5e4l:A 428 112 0.2222 0.0794 0.3036 3.00e-08
15 1htn:A 156 157 0.2614 0.2564 0.2548 6.86e-11 1tn3:A
16 3wh2:A 132 121 0.2157 0.2500 0.2727 6.94e-11 3wh3:A
17 5e4k:A 424 109 0.2157 0.0778 0.3028 7.28e-11
18 5e4k:A 424 118 0.2288 0.0825 0.2966 2.86e-09
19 5e4l:B 386 109 0.2157 0.0855 0.3028 1.05e-10
20 5e4l:B 386 64 0.1634 0.0648 0.3906 3.10e-07
21 1tdq:B 126 126 0.2353 0.2857 0.2857 2.08e-10
22 4gko:L 136 107 0.2026 0.2279 0.2897 2.64e-10 4g9a:A, 4g9a:B, 4g9a:C, 4g9a:D, 4gko:G, 4gko:H, 4gko:I, 4gko:J, 4gko:K, 2h2t:B
23 3kqg:A 169 157 0.2680 0.2426 0.2611 7.09e-10 4ak8:A, 4ak8:B, 4ak8:C, 4ak8:D, 3c22:A, 3c22:B, 3c22:C, 3c22:D, 5g6u:A, 5g6u:B, 5g6u:D, 5g6u:C, 3kqg:B, 3kqg:C, 3kqg:D, 3kqg:E, 3kqg:F, 4n32:A, 4n32:B, 4n32:C, 4n32:D, 4n33:A, 4n33:B, 4n33:C, 4n33:D, 4n34:A, 4n34:B, 4n34:C, 4n34:D, 4n35:A, 4n35:B, 4n35:C, 4n35:D, 4n36:A, 4n36:B, 4n36:C, 4n36:D, 4n37:A, 4n37:B, 4n37:C, 4n37:D, 4n38:A, 4n38:B, 4n38:C, 4n38:D, 3p5d:A, 3p5d:B, 3p5d:C, 3p5d:D, 3p5e:A, 3p5e:B, 3p5e:C, 3p5e:D, 3p5f:B, 3p5f:C, 3p5f:A, 3p5f:D, 3p5g:A, 3p5g:B, 3p5g:C, 3p5g:D, 3p5h:B, 3p5h:D, 3p5h:A, 3p5h:C, 3p5i:A, 3p5i:B, 3p5i:C, 3p5i:D, 3p7f:A, 3p7f:B, 3p7f:C, 3p7f:D, 3p7g:A, 3p7g:B, 3p7g:C, 3p7g:D, 3p7h:A, 3p7h:B, 3p7h:C, 3p7h:D, 7ytq:A, 7ytq:B, 7ytq:C, 7ytq:D
24 8h4v:A 148 121 0.2092 0.2162 0.2645 7.81e-10 8h4v:B, 8hb5:A, 5kth:A, 5kti:A, 4kzv:A, 4kzv:B, 4kzw:A, 4kzw:B, 4zrv:A, 4zrv:C, 4zrv:B, 4zrw:A
25 5xts:A 460 109 0.2222 0.0739 0.3119 1.74e-09 5xtw:A, 5xtw:C, 5xtw:D, 5xtw:E, 5xtw:F, 5xtw:H
26 5xts:A 460 105 0.1699 0.0565 0.2476 0.021 5xtw:A, 5xtw:C, 5xtw:D, 5xtw:E, 5xtw:F, 5xtw:H
27 5vyb:A 143 130 0.2288 0.2448 0.2692 1.98e-09
28 2vuv:A 129 114 0.2092 0.2481 0.2807 2.08e-09 2vuz:A
29 3pak:A 145 97 0.1961 0.2069 0.3093 3.87e-09 5ffr:A, 5ffs:A, 5fft:A, 3paq:A, 3par:A, 3pbf:A, 1r13:A, 1r14:A, 4wr9:A, 4wrc:A, 4wre:A, 4wrf:A, 4wuw:A, 4wux:A
30 2ox8:A 129 122 0.2157 0.2558 0.2705 4.41e-09 2ox8:B, 2ox8:C, 2ox8:D
31 1qdd:A 144 128 0.2288 0.2431 0.2734 5.64e-09
32 5k8y:A 136 129 0.2353 0.2647 0.2791 7.43e-09 5k8y:B, 5m62:A, 5m62:B
33 5f2q:B 135 120 0.2092 0.2370 0.2667 3.22e-08 5f2q:A, 5f2q:C, 5f2q:D, 5f2q:E, 5f2q:F, 5f2q:G, 5f2q:H, 5f2q:I, 5f2q:J, 1jzn:A, 1jzn:B, 1jzn:C, 1jzn:D, 1jzn:E, 1muq:B, 1muq:A, 1muq:C, 1muq:D, 1muq:E
34 6py1:A 130 124 0.2092 0.2462 0.2581 3.98e-08 6puv:A, 6w12:A, 6xiy:A
35 1egg:B 144 122 0.2222 0.2361 0.2787 1.71e-07 1egg:A, 1egi:A, 1egi:B, 7jub:A, 7juc:A, 7jud:A, 7jud:B, 7jue:A, 7juf:A, 7juf:B, 7jug:A, 7juh:A, 7l61:A, 7l62:A, 7l63:A, 7l64:A, 7l65:A, 7l66:A, 7l67:A, 7l68:A, 7l68:B
36 4wqq:A 141 78 0.1765 0.1915 0.3462 1.83e-06 1wmy:A, 1wmy:B, 1wmz:A, 1wmz:B, 1wmz:C, 1wmz:D, 4wqq:B, 4wqq:C, 4wqq:D
37 5jq1:A 130 124 0.1961 0.2308 0.2419 2.69e-06 1dv8:A, 5jpv:A, 5jpv:B, 5jq1:B, 8ts0:A, 6yau:A
38 3cfw:A 156 68 0.1569 0.1538 0.3529 7.11e-06 5vc1:A
39 4zes:A 147 124 0.1961 0.2041 0.2419 8.03e-06 4zes:B, 4zet:A, 4zet:B
40 6jjj:A 151 120 0.1699 0.1722 0.2167 3.05e-05 6jjj:B, 6jjj:C, 6jjj:D, 6jjj:E, 6jjj:F
41 8urf:A 128 124 0.1895 0.2266 0.2339 6.49e-05
42 3vyk:A 128 123 0.2026 0.2422 0.2520 2.22e-04
43 1g1q:A 160 68 0.1438 0.1375 0.3235 7.29e-04 1g1q:B, 1g1q:C, 1g1q:D, 1g1r:A, 1g1r:B, 1g1r:D, 1g1r:C, 1g1s:B, 1g1s:A
44 2py2:A 127 107 0.1765 0.2126 0.2523 0.001 2py2:B, 2py2:C, 2py2:D, 2py2:E, 2py2:F
45 4c16:A 280 116 0.1961 0.1071 0.2586 0.002 4c16:B, 4csy:A, 4csy:B, 1esl:A, 6eyi:A, 6eyj:A, 6eyj:B, 6eyk:A, 1g1t:A
46 6jk4:A 126 109 0.1765 0.2143 0.2477 0.005
47 1byf:A 123 117 0.2157 0.2683 0.2821 0.007 1byf:B, 1tlg:A, 1tlg:B
48 5b1w:A 130 126 0.1961 0.2308 0.2381 0.012 5b1w:B, 5b1w:C, 5b1w:D, 5b1x:A, 5b1x:B, 5b1x:C, 5b1x:D
49 6lfj:A 133 75 0.1438 0.1654 0.2933 0.015 6kzr:A, 6kzr:B, 6lfj:B, 6lkr:A, 6lkr:B
50 1bj3:B 123 121 0.1961 0.2439 0.2479 0.020 1ixx:B, 1ixx:D, 1ixx:F, 1j34:B, 1j35:B, 1x2t:B, 1x2t:D
51 4mth:A 139 133 0.2157 0.2374 0.2481 0.021 1uv0:A
52 3alu:A 157 137 0.2026 0.1975 0.2263 0.26 3als:A, 3als:B, 3als:C, 3als:D, 3alt:A, 3alt:B, 3alt:C, 3alt:D, 3alu:B, 3alu:C, 3alu:D
53 1iod:B 123 121 0.1765 0.2195 0.2231 1.2 1wt9:B, 1y17:B
54 2cml:A 389 46 0.0980 0.0386 0.3261 1.4 2cml:C, 2cml:B, 2cml:D, 6hfy:C, 6hfy:A, 6hfy:D, 6hfy:B, 6hg5:C, 6hg5:A, 6hg5:D, 6hg5:B, 6hgb:C, 6hgb:A, 6hgb:D, 6hgb:B, 5hum:A, 5hum:B, 5hum:C, 5hum:D, 4qn4:A, 4qn4:B, 4qn6:A, 4qn6:B, 1v0z:A, 1v0z:C, 1v0z:B, 1v0z:D, 1w1x:A, 1w1x:B, 1w1x:C, 1w1x:D, 1w20:C, 1w20:A, 1w20:B, 1w20:D, 1w21:C, 1w21:A, 1w21:B, 1w21:D
55 5dar:B 160 67 0.1307 0.1250 0.2985 2.2
56 6gg2:A 494 104 0.1830 0.0567 0.2692 4.4
57 4m3m:A 390 72 0.1438 0.0564 0.3056 5.8 4d8s:A, 4gb1:A, 2ht5:A, 2ht7:A, 2ht8:A, 2htq:A, 2htr:A, 2htu:A, 5hun:A, 4ks1:A, 4ks2:A, 4ks3:A, 4ks4:A, 4ks5:A, 4mju:A, 4mjv:A, 3o9j:A, 3o9k:A
58 8p5d:MD1 151 33 0.0980 0.0993 0.4545 7.9 8p60:MD1, 8p60:MD2
59 3mcx:A 459 34 0.0784 0.0261 0.3529 9.1

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218