BioLiP

>protein
QLPPDLRRVHMVGIGGAGMSGIARILLDRGGLVSGSDAKESRGVHALRARGALIRIGHDASSLDLLPGGATAVVTTHAAI
PKTNPELVEARRRGIPVVLRPAVLAKLMAGRTTLMVTGTHGKTTTTSMLIVALQHCGLDPSFAVGGELGEAGTNAHHGSG
DCFVAEADESDGSLLQYTPHVAVITNIESDHLDFYGSVEAYVAVFDSFVERIVPGGALVVCTDDPGGAALAQRATELGIR
VLRYGSVPGETMAATLVSWQQQGVGAVAHIRLASELGPRVMRLSVPGRHMALNALGALLAAVQIGAPADEVLDGLAGFEG
VRRRFELVGTCGVGKASVRVFDDYAHHPTEISATLAAARMVLEQGDGGRCMVVFQPHLYSRTKAFAAEFGRALNAADEVF
VLDVYGAREQPLAGVSGASVAEHVTVPMRYVPDFSAVAQQVAAAASPGDVIVTMGAGDVTLLGPEILTALRVRAN

The query sequence (length=475) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7bva:A	480	479	1.0000	0.9896	0.9916	0.0	7bva:B, 7bvb:A, 7bvb:B
2	1gqy:B	469	471	0.3811	0.3859	0.3843	7.45e-88	1gqy:A, 1p31:A, 1p31:B, 1p3d:A, 1p3d:B
3	4hv4:A	465	468	0.3726	0.3806	0.3782	6.35e-73	4hv4:B
4	8egn:A	309	317	0.2674	0.4110	0.4006	1.70e-57	9d9k:A, 8dof:A, 8egm:A, 8egm:B, 8egm:C, 8egm:D, 8egm:E, 8egm:F, 8egm:G, 8egm:H, 8egn:B, 8ewa:A, 8ewa:B, 6x9f:A, 6x9f:B, 6x9f:C, 6x9f:D, 6x9f:E, 6x9f:F, 6x9f:G, 6x9f:H, 6x9n:A, 6x9n:B, 6x9n:C, 6x9n:D, 6x9n:E, 6x9n:F, 6x9n:G, 6x9n:H
5	6cau:A	307	318	0.2505	0.3876	0.3742	5.86e-44
6	7ti7:A	442	360	0.2084	0.2240	0.2750	2.13e-11
7	6vr8:I	482	432	0.1832	0.1805	0.2014	1.15e-07	7ufp:I
8	4qf5:A	459	269	0.1474	0.1525	0.2602	5.69e-07	4qdi:A, 4qf5:B, 4ziy:A
9	1e8c:B	497	181	0.1095	0.1046	0.2873	1.12e-06	7b60:A, 7b60:B, 7b61:A, 7b61:B, 7b68:A, 7b68:B, 7b6g:BBB, 7b6i:B, 7b6j:A, 7b6j:B, 7b6k:A, 7b6k:B, 7b6l:A, 7b6l:B, 7b6m:B, 7b6n:B, 7b6p:A, 7b6p:B, 7b6q:B, 7b9e:A, 7b9e:B, 7b9w:BBB, 1e8c:A
10	4c12:A	493	278	0.1221	0.1176	0.2086	5.92e-06	4c13:A
11	4buc:A	427	255	0.1242	0.1382	0.2314	4.50e-05	4buc:B
12	3zl8:A	427	360	0.1916	0.2131	0.2528	5.64e-05
13	8dp2:A	446	349	0.1811	0.1928	0.2464	1.42e-04	7u35:A, 7u35:B, 7u35:C
14	4bub:B	483	197	0.1158	0.1139	0.2792	2.27e-04	4bub:A
15	6vr7:A	485	525	0.2611	0.2557	0.2362	4.97e-04
16	8g6p:A	508	235	0.1495	0.1398	0.3021	0.006
17	4cvm:A	443	274	0.1579	0.1693	0.2737	0.054	4cvk:A, 4cvl:A
18	2am1:A	454	234	0.1158	0.1211	0.2350	0.25	2am2:A, 3zm5:A, 3zm6:A
19	2jfg:A	439	218	0.1221	0.1321	0.2661	0.29	5a5f:A, 9bn8:A, 9bn9:A, 1eeh:A, 2jff:A, 2jfh:A, 1uag:A, 2uag:A, 3uag:A, 4uag:A, 2uuo:A, 2uup:A, 2vtd:A, 2vte:A, 8vw0:A, 8vw1:A, 8vw2:A, 2wjp:A, 2x5o:A, 2xpc:A, 2y1o:A, 2y66:A, 2y67:A, 2y68:A
20	7q8e:A	397	124	0.0716	0.0856	0.2742	0.58	6gs2:B, 6gs2:D, 6h5e:B, 6h5e:D, 7q8e:C
21	8ipr:C	515	120	0.0716	0.0660	0.2833	2.1	8ipr:E
22	5gqc:D	583	25	0.0274	0.0223	0.5200	2.3	5gqc:B, 5gqc:C, 5gqc:E, 5gqc:F, 5gqc:G, 5gqc:H, 5gqf:A, 5gqf:B, 5gqg:A, 5gqg:B
23	7v6i:A	597	25	0.0274	0.0218	0.5200	3.3
24	3j79:S	186	37	0.0253	0.0645	0.3243	3.3	3jbn:AS, 3jbo:AS, 3jbp:AS, 8tpu:AS, 5umd:S
25	3qdt:A	142	25	0.0211	0.0704	0.4000	3.9	3qdt:B, 3qdx:A, 3qdx:B, 3qdy:A, 3qdy:B
26	6szs:y	54	61	0.0400	0.3519	0.3115	3.9
27	8p94:B	394	53	0.0358	0.0431	0.3208	4.2	6dec:B, 3dxk:B, 4jd2:B, 7jpn:B, 2p9n:B, 2p9p:B, 2p9s:B, 2p9u:B, 7t5q:B, 8tah:B, 7tpt:B, 1tyq:B, 1u2v:B, 6uhc:B, 3ukr:B, 3ule:B
28	4ob6:A	319	56	0.0421	0.0627	0.3571	5.5	4ou4:A
29	7nhc:B	717	24	0.0253	0.0167	0.5000	7.2	8rmr:B, 8rms:B
30	7nha:B	735	24	0.0253	0.0163	0.5000	7.8	8bek:B, 7nhx:B, 7nik:B, 7nil:B, 7nir:B, 7nis:B, 7nj3:B, 7nj4:B, 7nj5:B, 7nj7:B, 7nk1:B, 7nk2:B, 7nk4:B, 7nk6:B, 7nk8:B, 7nka:B, 7nkc:B, 7nki:B, 7nkr:B, 8pm0:B, 8pnp:B, 8poh:F, 7qtl:B, 6qx3:B, 6qx8:B, 6qx8:F, 6qxe:B, 6qxe:F, 7r0e:B, 8r60:B, 8r65:B, 7z4o:EEE, 7z4o:BBB, 7zpl:B, 7zpl:E
31	3nd1:B	249	44	0.0358	0.0683	0.3864	7.9	3nd1:A
32	8h69:B	754	24	0.0253	0.0159	0.5000	8.0	7ni0:B, 8pnq:B, 8r3k:B, 8r3l:B, 6rr7:B
33	7yjm:B	471	46	0.0337	0.0340	0.3478	8.4	7yjk:B, 7yjk:F, 7yjn:B, 7yjo:B

[Back]