BioLiP

>protein
QLPDFIQNKIDHYIENYFDINKNGKHLVLGKQASPDDIILQSNDYLALANHPLIKARLAKSLLEEQQSLFMSASFLQNDY
DKPMIEKRLAKFTGFDECLLSQSGWNANVGLLQTICQPNTNVYIDFFAHMSLWEGARYANAQAHPFMHNNCDHLRMLIQR
HGPGIIVVDSIYSTLGTIAPLAELVNISKEFGCALLVDESHSLGTHGPNGAGLLAELGLTREVHFMTASLAKTFAYRAGA
IWCNNEVNRCVPFISYPAIFSSTLLPYEAAGLETTLEIIESADNRRQHLDRMARKLRIGLSQLGLTIRSESQIIGLETGD
ERNTEKVRDYLESNGVFGSVFCRPATSKNKNIIRLSLNSDVNDEQIAKIIEVCSDAVNYGDFYFR

The query sequence (length=385) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3hqt:B	386	385	1.0000	0.9974	1.0000	0.0	3hqt:A, 3kki:A, 3kki:B, 2wk8:A, 2wk9:A, 2wk9:B, 2wka:A, 2wka:B
2	2wk8:B	364	384	0.9455	1.0000	0.9479	0.0
3	4bmk:A	398	342	0.2416	0.2337	0.2719	1.41e-38	4bmk:B, 2jg2:A, 2w8j:A, 2w8t:A, 2w8u:A, 2w8v:A, 2w8w:A, 2xbn:A
4	2x8u:A	399	365	0.2494	0.2406	0.2630	1.74e-38	2x8u:B
5	8guh:A	394	352	0.2571	0.2513	0.2812	1.19e-34	3a2b:A, 8h1q:A, 8h1y:A, 8h20:A, 8h21:A, 8h29:A, 8iyp:A, 8iyt:A
6	2bwo:B	399	354	0.2571	0.2481	0.2797	3.57e-34	2bwn:A, 2bwn:B, 2bwn:D, 2bwn:E, 2bwo:A, 2bwo:D, 2bwo:E, 2bwp:A, 2bwp:B, 2bwp:D, 2bwp:E
7	6hrh:A	429	376	0.2442	0.2191	0.2500	2.00e-32	6hrh:B, 5qqq:B, 5qqq:A, 5qqr:B, 5qqr:A, 5qqs:B, 5qqs:A, 5qqt:B, 5qqt:A, 5qqu:B, 5qqu:A, 5qqv:B, 5qqv:A, 5qqw:B, 5qqw:A, 5qqx:B, 5qqx:A, 5qqy:B, 5qqy:A, 5qqz:B, 5qqz:A, 5qr0:B, 5qr0:A, 5qr1:B, 5qr1:A, 5qr2:B, 5qr2:A, 5qr3:B, 5qr3:A, 5qr4:B, 5qr4:A, 5qr5:B, 5qr5:A, 5qr6:B, 5qr6:A, 5qr7:B, 5qr7:A, 5qr8:B, 5qr8:A, 5qr9:B, 5qr9:A, 5qra:B, 5qra:A, 5qrb:B, 5qrb:A, 5qrc:B, 5qrc:A, 5qrd:B, 5qrd:A, 5qre:B, 5qre:A, 5qt3:B, 5qt3:A
8	1fc4:A	401	341	0.2468	0.2369	0.2786	2.82e-32	1fc4:B
9	3tqx:A	396	340	0.2338	0.2273	0.2647	1.15e-30	3tqx:B
10	7poa:A	398	338	0.2468	0.2387	0.2811	1.66e-30	7poa:B, 7pob:A, 7pob:D, 7pob:B, 7pob:C, 7poc:A, 7poc:D, 7poc:B, 7poc:C
11	1dj9:A	383	336	0.2286	0.2298	0.2619	7.16e-30	1dje:A, 8dle:A, 2g6w:A
12	7v58:B	400	351	0.2416	0.2325	0.2650	9.64e-30	7v58:A, 7v5i:A, 7v5i:B, 7v5i:C, 7v5i:D
13	7bxq:A	399	336	0.2494	0.2406	0.2857	1.05e-28	7bxq:B, 7bxr:A, 7bxr:B, 7bxs:A, 7bxs:B
14	7u7h:A	423	330	0.2182	0.1986	0.2545	1.22e-27	7u7h:B
15	5txr:A	479	382	0.2156	0.1733	0.2173	1.12e-20	8eim:A, 8eim:B, 5txr:B
16	8c81:C	561	312	0.1922	0.1319	0.2372	3.40e-19	8c80:C, 8c82:C, 8c82:G, 8iaj:B, 8iaj:F, 8iak:B, 8iak:F, 8iam:B, 8iam:F, 8qof:C, 8qof:G, 8qog:C
17	7yj1:B	502	290	0.2000	0.1534	0.2655	8.11e-19	7cqi:T, 7cqk:T, 7k0i:B, 7k0i:E, 7k0j:B, 7k0k:B, 7k0l:B, 7k0m:B, 7k0m:F, 7k0n:B, 7k0n:F, 7k0o:B, 7k0o:F, 7k0p:B, 7k0p:F, 7k0q:B, 6m4n:B, 6m4n:F, 6m4o:T, 7yiu:B, 7yiy:B, 7yj2:B
18	8xha:A	401	399	0.2675	0.2569	0.2581	6.86e-16	8i7u:C, 8i7u:F, 8i7u:A, 8i7u:E, 8i7u:B, 8i7u:D, 8xha:B, 8xhd:A, 8xhd:B, 8xhk:C, 8xhk:A, 8xhk:B, 8xhk:E, 8xhk:D, 8xhk:F
19	7yjm:B	471	253	0.1714	0.1401	0.2609	1.33e-15	7yjk:B, 7yjk:F, 7yjn:B, 7yjo:B
20	7yjk:A	445	259	0.1662	0.1438	0.2471	1.37e-15	7yjk:E, 7yjn:A, 7yjo:A
21	7k0n:A	464	246	0.1558	0.1293	0.2439	1.32e-10	7cqi:S, 7cqk:S, 7k0i:A, 7k0i:D, 7k0j:A, 7k0k:A, 7k0l:A, 7k0n:E, 7k0o:A, 7k0o:E, 7k0p:A, 7k0p:E, 7k0q:A, 6m4n:A, 6m4n:E, 7yiy:A, 7yj2:A
22	8qog:B	500	271	0.1506	0.1160	0.2140	5.72e-09	8iaj:A, 8iaj:E, 8iak:A, 8iak:E, 8qof:F, 8qof:B
23	1vjo:A	377	55	0.0468	0.0477	0.3273	0.049
24	7cep:A	414	70	0.0494	0.0459	0.2714	0.68	7ceo:A, 7cer:A, 7ces:A, 7e6b:A, 7e6c:A, 7e6e:A, 7e6f:A, 5j8q:A, 6kfz:A, 7xej:A, 7xek:A, 7xen:A, 7xep:A, 7xet:A, 5xt5:A, 5xt5:B, 5xt6:A, 5xt6:B, 5zsk:A, 5zso:A
25	1j04:A	387	70	0.0494	0.0491	0.2714	0.76	4cbr:A, 4cbs:A, 5f9s:A, 5f9s:B, 1h0c:A, 5hhy:A, 5hhy:B, 5luc:A, 5luc:B, 5luc:E, 5luc:G, 5luc:M, 5luc:N, 5luc:S, 5luc:T, 5ofy:A, 5og0:A, 6rv0:A, 6rv1:A, 2yob:A, 2yob:B
26	5x6b:J	377	163	0.0857	0.0875	0.2025	0.99	5x6b:I
27	3kgw:B	388	70	0.0494	0.0490	0.2714	1.1	3kgw:A, 3kgx:A
28	6ndn:A	406	42	0.0312	0.0296	0.2857	1.3	1c0n:A, 5db5:A, 5db5:B, 1i29:A, 1jf9:A, 1kmj:A, 1kmk:A, 6mr2:A, 6mr6:A, 6mre:A, 6mrh:A, 6mri:A, 6o10:A, 6o11:A, 6o12:A, 6o13:A, 7rrn:A, 7ruj:A, 7rw3:A, 6uy5:A, 6uy5:B
29	4ao9:A	433	182	0.1091	0.0970	0.2308	1.8	4ao9:B, 4aoa:A, 4aoa:B
30	2dvn:A	186	35	0.0312	0.0645	0.3429	1.8	2dvn:B, 2dvo:A, 2e5x:A, 2zti:A
31	5o5c:B	468	93	0.0727	0.0598	0.3011	2.0	5o5c:A, 5o5c:C, 5o5c:D, 5o5c:E, 5o5c:F
32	4ztc:A	385	73	0.0545	0.0545	0.2877	2.0	1o61:A, 1o61:B, 1o69:A, 1o69:B
33	6fyq:A	443	38	0.0364	0.0316	0.3684	2.1
34	1t3i:A	406	87	0.0623	0.0591	0.2759	2.7	1t3i:B
35	2zsm:A	425	72	0.0545	0.0494	0.2917	3.2	2epj:A, 2zsl:A, 2zsm:B, 2zsm:C
36	6mfb:D	386	46	0.0442	0.0440	0.3696	3.3	6mfb:A, 6mfb:B, 6mfb:C
37	6fqb:E	247	34	0.0364	0.0567	0.4118	4.6	6fqb:F, 6fqb:G, 6fqb:H
38	4zno:A	318	37	0.0364	0.0440	0.3784	4.6	4zno:B, 4znq:A, 4znq:B, 4znr:A, 4znr:B
39	8a1r:A	593	54	0.0442	0.0287	0.3148	4.7	8a1r:B, 7b02:A, 6fmu:A, 6fmz:A, 6fp4:A, 6ftc:A, 3h4k:A, 4la1:A, 4la1:B, 7npx:A, 7npx:B, 8pdd:A, 8pdd:B, 8pl0:A, 8pl0:B, 8pl1:A, 8pl1:B, 8pl2:A, 8pl2:B, 8pl3:A, 8pl3:B, 8pl4:A, 8pl4:B, 8pl5:A, 8pl5:B, 8pl6:A, 8pl7:A, 8pl7:B, 8pl8:A, 8pl9:A, 8pl9:B, 8pla:A, 8pla:B, 8plb:A, 8plb:B, 8plc:A, 8plc:B, 8pld:A, 8pld:B, 8ple:A, 8ple:B, 8plf:A, 8plf:B, 8plg:A, 8plh:A, 8pli:A, 8pli:B, 8plj:A, 8plj:B, 8plk:A, 8plk:B, 8pll:A, 8plm:A, 8pln:A, 8plo:A, 8plo:B, 8plp:A, 8plp:B, 8plq:A, 8plq:B, 8plr:A, 8plr:B, 8pls:A, 8pls:B, 8plt:A, 8plt:B, 8plu:A, 8plu:B, 8plv:A, 8plv:B, 8plw:A, 8plw:B, 8plx:A, 8plx:B, 8ply:A, 8ply:B, 6rtj:A, 6rtm:A, 6rto:A, 2v6o:A, 2x8c:A, 2x8c:B, 2x8g:A, 2x8h:A, 2x99:A, 6zlb:A, 6zlp:A, 6zp3:A, 6zst:A
40	4qr8:A	441	71	0.0571	0.0499	0.3099	6.6	4qr8:B
41	3x17:B	548	44	0.0390	0.0274	0.3409	8.3	3x17:A
42	8jb1:A	468	61	0.0468	0.0385	0.2951	9.3	8jb1:B

[Back]