BioLiP

>protein
QLKTPKNVILLISDGAGLSQISSTFYFKSGTPNYTQFKNIGLIKTSSSREDVTDSASGATAFSCGIKTYNAAIGVADDST
AVKSIVEIAALNSIKTGVVATSSITHATPASFYAHALNRGLEEEIAMDMTESDLDFFAGGGLNYFTSRSDSKDVLAILKG
NQFTINTTGLTDFSSIASNRKMGFLLADEAMPTMEKGRGNFLSAATDLAIQFLSKDNSAFFIMSEGSQIDWGGHANNASY
LISEINDFDDAIGTALAFAKSDGNTLVIVTSDHETGGFTLAAKSNKSEYSDYTEIGPTFSTGGHSATLIPVFAYGPGSEE
FIGIYENNEIFHKILKVTKWNQ

The query sequence (length=342) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2w5v:A	346	346	0.9766	0.9653	0.9653	0.0	2iuc:A, 2iuc:B, 2w5v:B, 2w5w:A, 2w5w:B, 2w5x:A, 2w5x:B
2	7qow:B	505	329	0.3216	0.2178	0.3343	1.09e-41	3e2d:A, 3e2d:B, 7qow:A, 7qp8:A, 7qp8:B, 6qsq:A, 6t26:A, 6t26:B, 7yzz:A, 7yzz:B, 7z00:B
3	3wbh:A	497	321	0.3012	0.2072	0.3209	1.37e-40	3wbh:B
4	7tm9:A	441	400	0.3450	0.2676	0.2950	1.77e-38	7tm9:B, 7tm9:C, 7tm9:D, 7tm9:E, 7tm9:F, 7tm9:G, 7tm9:H
5	3a52:A	400	285	0.2807	0.2400	0.3368	4.72e-38	3a52:B
6	3a52:A	400	39	0.0380	0.0325	0.3333	0.54	3a52:B
7	1ajb:A	449	403	0.3363	0.2561	0.2854	5.11e-38	1ajb:B, 1ajc:A, 1ajc:B, 1ajd:A, 1ajd:B, 1alh:A, 1alh:B, 1ali:A, 1ali:B, 1alj:A, 1alj:B, 1alk:A, 1alk:B, 1ani:A, 1ani:B, 1anj:A, 1anj:B, 2anh:A, 2anh:B, 1b8j:A, 1b8j:B, 3bdh:A, 3bdh:B, 5c66:A, 5c66:B, 3cmr:A, 3cmr:B, 3dpc:B, 3dpc:A, 3dyc:A, 3dyc:B, 1ed8:A, 1ed8:B, 1ed9:A, 1ed9:B, 1elx:A, 1elx:B, 1ely:A, 1ely:B, 1elz:A, 1elz:B, 1ew8:A, 1ew8:B, 1ew9:A, 1ew9:B, 2g9y:A, 2g9y:B, 2ga3:A, 2ga3:B, 1hjk:A, 1hjk:B, 1hqa:A, 1hqa:B, 1kh4:A, 1kh4:B, 1kh5:A, 1kh5:B, 1kh7:A, 1kh7:B, 1kh9:A, 1kh9:B, 1khj:A, 1khj:B, 1khk:A, 1khk:B, 1khl:A, 1khl:B, 1khn:A, 1khn:B, 4km4:A, 4km4:B, 3tg0:A, 3tg0:B, 3tg0:C, 3tg0:D, 5tpq:A, 5tpq:B, 1ura:A, 1ura:B, 1urb:A, 1urb:B, 1y6v:A, 1y6v:B, 1y7a:A, 1y7a:B, 4yr1:A, 4yr1:B
8	4kjg:A	486	428	0.3333	0.2346	0.2664	5.62e-25	4kjd:A, 4kjd:B, 4kjg:B
9	7yiv:A	484	435	0.3275	0.2314	0.2575	1.25e-24	7yiv:D, 7yiv:C, 7yiv:B, 7yiv:G, 7yiv:H, 7yiv:F, 7yiv:E, 7yiw:A, 7yiw:D, 7yiw:C, 7yiw:B, 7yiw:G, 7yiw:H, 7yiw:F, 7yiw:E, 7yix:A, 7yix:B
10	1k7h:A	476	447	0.3304	0.2374	0.2528	2.04e-22	1k7h:B, 1shn:A, 1shn:B, 1shq:A, 1shq:B
11	3mk0:A	481	342	0.2719	0.1933	0.2719	2.78e-22	1ew2:A, 2glq:A, 3mk1:A, 3mk2:A, 1zeb:A, 1zed:A, 1zef:A
12	7kwd:A	473	243	0.2251	0.1628	0.3169	4.83e-22	7kwd:B
13	2x98:A	430	313	0.2778	0.2209	0.3035	2.94e-18	2x98:B
14	2x98:A	430	32	0.0409	0.0326	0.4375	0.16	2x98:B
15	1ofh:A	309	62	0.0556	0.0615	0.3065	0.64	1ofh:B, 1ofh:C, 1ofi:A, 1ofi:B, 1ofi:C
16	5ta9:A	369	24	0.0351	0.0325	0.5000	2.2	5ta9:B, 5ta9:C, 5ta9:D
17	4n7t:A	402	84	0.0585	0.0498	0.2381	2.2	3m7v:A, 3m7v:B, 4n7t:B
18	5zl6:A	372	56	0.0409	0.0376	0.2500	4.6	5zl6:B, 5zl6:C, 5zl6:D
19	5z34:A	361	27	0.0351	0.0332	0.4444	7.3
20	1jtd:B	273	86	0.0673	0.0842	0.2674	7.4
21	1im2:A	346	59	0.0497	0.0491	0.2881	8.1	1g3i:T, 1g41:A

[Back]