BioLiP

>protein
QKSVLEQLKQVTMVVADTGDFELIKKYKPVDATTNPSLILKAVKEQKYSNLVAETISKVKANNPDLNSDDLVKEIAIEIL
VSFGIKILDVIEGKVSSEVDARVSFNSATTIDYAKRIIARYESNGIPKDRVLIMIAATWEGIKAAKLLQKEGINCNLTLI
FDKAQAKACAEAGVYLVSPFVGRITDWQMQQNNLKTFPAIADDDGVNSVKAIYKLYKSHGFKTIVMGASFRNVEQVIALA
GCDALTISPVLLEELKNRDEHLEVKLTQISEADFRWLMNENAMATHKLAEGIRLFTKDTIELENIIKQNL

The query sequence (length=310) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3tk7:A	320	320	0.9968	0.9656	0.9656	0.0	3te9:A, 3te9:B, 3tk7:B, 3tkf:A, 3tkf:B, 3tno:A, 3tno:B, 3upb:A, 3upb:B
2	3kof:A	316	312	0.4774	0.4684	0.4744	3.00e-98	3kof:B, 4s2b:A, 4s2b:B, 4s2c:A, 4s2c:B
3	2e1d:A	321	323	0.5129	0.4953	0.4923	3.61e-98	2e1d:B
4	3s1u:C	223	226	0.2194	0.3049	0.3009	7.31e-17	3s1u:A, 3s1u:B, 3s1u:D, 3s1u:E, 3s1v:A, 3s1v:B, 3s1v:C, 3s1v:D, 3s1v:E, 3s1x:A, 3s1x:B, 3s1x:C, 3s1x:D, 3s1x:E, 4xz9:B, 4xz9:C, 6yr3:A, 6yr3:B, 6yr3:C, 6yr3:D, 6yr3:E, 6yrh:A, 6yrh:B, 6yrh:C, 6yrh:D, 6yrh:E, 6yrm:A, 6yrm:B, 6yrm:C, 6yrm:D, 6yrm:E, 6yrt:A, 6yrt:B, 6yrt:C, 6yrt:D, 6yrt:E, 6ys0:A, 6ys0:B, 6ys0:C, 6ys0:D, 6ys0:E
5	5zol:A	222	119	0.1194	0.1667	0.3109	5.71e-10	4s1f:B, 4s1f:G, 4s1f:H, 4s1f:K, 4s1f:P, 5zol:B, 5zol:C, 5zol:D, 5zol:E, 5zol:F, 5zol:G, 5zol:H, 5zol:I, 5zol:J
6	8bc3:A	217	131	0.1387	0.1982	0.3282	1.05e-09	8bc3:H, 8bc3:B, 8bc3:C, 8bc3:D, 8bc3:E, 8bc3:F, 8bc3:G, 8bc3:I, 8bc3:J, 8bc4:A, 8bc4:B, 8bc4:C, 8bc4:D, 8bc4:E, 8bc4:F, 8bc4:G, 8bc4:H, 8bc4:J
7	6zwf:A	352	73	0.0839	0.0739	0.3562	2.72e-04
8	3gk0:A	252	116	0.1000	0.1230	0.2672	0.032	3gk0:C, 3gk0:H, 3gk0:D, 3gk0:F, 3gk0:G
9	1pvw:A	219	80	0.0710	0.1005	0.2750	0.52	1pvw:B, 1pvy:A, 1pvy:B, 1snn:A, 1snn:B
10	5csl:A	2050	71	0.0677	0.0102	0.2958	2.0
11	4jnj:A	115	60	0.0484	0.1304	0.2500	5.2	4jnj:C, 4jnj:B, 4jnj:D, 6zyt:BBB, 6zyt:AAA, 6zyt:CCC, 6zyt:FFF, 6zyt:DDD, 6zyt:EEE
12	8htr:A	140	66	0.0516	0.1143	0.2424	6.1	5agw:B, 5agw:A, 4aq3:A, 4aq3:E, 4aq3:B, 4aq3:D, 4aq3:C, 4aq3:F, 8hoi:A, 8hoi:B, 8hoi:C, 8hoi:D, 4ieh:A, 7lhb:A, 7lhb:B, 7lhb:C, 4man:A, 4man:B, 6o0o:A, 6o0o:C, 2o2f:A, 5vax:C, 5vax:D, 5vay:D, 2xa0:A, 2xa0:B, 7y90:A
13	4p5f:A	355	89	0.0903	0.0789	0.3146	6.3	7jlu:B, 4kl0:A, 4p5f:B
14	5ffj:B	1232	82	0.0645	0.0162	0.2439	7.4
15	8u27:A	177	66	0.0516	0.0904	0.2424	9.1	5agx:B, 5agx:A, 5fcg:A, 8fy1:D, 8fy2:D, 6gl8:A, 8hog:A, 8hoh:A, 8hts:A, 8iql:C, 8iql:A, 4lvt:A, 4lvt:B, 4lxd:A, 6o0k:A, 6o0l:A, 6o0l:C, 6o0m:A, 6o0p:A, 2o21:A, 2o22:A, 5vau:A, 5vau:C, 5vau:B, 5vau:D, 5vax:A, 5vax:B, 5vay:A, 5vay:C, 5vay:B, 2w3l:A, 2w3l:B, 7ya5:A, 1ysw:A
16	5yh8:A	510	48	0.0419	0.0255	0.2708	9.5	5yhe:A, 5yhe:B, 5yhg:A

[Back]