BioLiP

>protein
QKQPISKLTRATPGSAGLDLCSTSHTVLTPEMGPQALSTGIYGPLPPNTFGLILGRSSITMKGLQVYPGVIDNDYTGEIK
IMAKAVNNIVTVSQGNRIAQLILLPLIETDNKVQ

The query sequence (length=114) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3tp1:A	114	114	1.0000	1.0000	1.0000	7.43e-80	2d4n:A, 3tpn:A, 3tps:A, 3tpw:A, 3tpy:A, 3tq3:A, 3tq4:A, 3tq5:A, 3trl:A, 3trn:A, 3ts6:A, 3tsl:A, 3tta:A
2	3f4f:A	138	102	0.3158	0.2609	0.3529	6.27e-14	3f4f:B, 3f4f:C, 3p48:A, 3p48:C, 3p48:B
3	1f7r:A	133	92	0.3421	0.2932	0.4239	4.91e-13	1f7k:A, 1f7k:B, 1f7n:A, 1f7n:B, 1f7p:A, 1f7p:C, 1f7p:B, 1f7q:A, 1f7q:C, 1f7q:B
4	2ol1:C	125	98	0.3333	0.3040	0.3878	1.78e-12	2oke:A, 2oke:C, 2oke:B, 2ol1:A, 2ol1:B
5	5y5p:D	171	108	0.3509	0.2339	0.3704	8.41e-12	5y5p:A, 5y5p:B, 5y5p:C, 5y5p:E, 5y5p:F, 5y5q:A, 5y5q:B, 5y5q:C
6	5f9k:B	130	100	0.2807	0.2462	0.3200	3.20e-10	5f9k:A, 5f9k:C
7	7n6s:C	147	98	0.3333	0.2585	0.3878	1.78e-09	7n6s:A, 7n6s:B, 7n6s:F, 7n6s:D, 7n6s:E
8	4gcy:A	163	104	0.3509	0.2454	0.3846	4.98e-09	8cga:A, 5ect:A, 5edd:A, 3h6d:A, 3hza:A, 3i93:A, 3loj:A, 2py4:A, 1six:A, 1sjn:A, 1sjn:C, 1sjn:B, 1sm8:A, 1sm8:B, 1sm8:C, 1smc:A, 1smc:B, 1smc:C, 1snf:A, 1snf:C, 1snf:B
9	4oop:B	142	104	0.3158	0.2535	0.3462	3.02e-08	4oop:A, 4oop:C
10	6mao:A	137	110	0.3596	0.2993	0.3727	5.88e-08
11	6mjk:A	144	110	0.2632	0.2083	0.2727	2.08e-07
12	6ljj:A	150	106	0.3070	0.2333	0.3302	3.50e-07	3ara:A, 3ara:C, 3ara:B, 3arn:A, 3arn:C, 3arn:B, 3ehw:A, 3ehw:B, 3ehw:C, 3ehw:X, 3ehw:Y, 3ehw:Z, 5h4j:A, 2hqu:A, 2hqu:B, 2hqu:C
13	6hde:B	152	111	0.3246	0.2434	0.3333	2.38e-06	1eu5:A, 1euw:A, 6hde:A, 6hde:C, 2hrm:A, 1rn8:A, 1rnj:A, 1seh:A, 1syl:A
14	8hrv:B	145	94	0.2807	0.2207	0.3404	1.68e-04	8hrv:A, 8hrv:C
15	2ilu:A	477	52	0.1754	0.0419	0.3846	0.30	2imp:A, 2opx:A
16	2bt1:A	254	57	0.1667	0.0748	0.3333	0.47	2bsy:A, 2we0:A, 2we1:A, 2we2:A, 2we3:A
17	2bt1:A	254	95	0.2281	0.1024	0.2737	0.78	2bsy:A, 2we0:A, 2we1:A, 2we2:A, 2we3:A
18	3gf0:A	199	72	0.1930	0.1106	0.3056	1.7	2hxd:A, 1pkj:B, 1pkk:B
19	8aaf:a	848	20	0.1053	0.0142	0.6000	2.8	8agt:a, 8agu:a, 8agv:a, 8agw:a, 8agx:a, 8agz:a
20	4b8t:A	106	49	0.1491	0.1604	0.3469	3.9
21	6uhx:B	254	45	0.1228	0.0551	0.3111	4.6	6uhx:A
22	8dt3:H	123	56	0.1579	0.1463	0.3214	8.2
23	7a9j:A	503	53	0.1579	0.0358	0.3396	9.3	7a9i:A

[Back]