Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
QKIGILGAMREEITPILELFGVDFEEIPLGGNVFHKGVYHNKEIIVAYSKIGKVHSTLTTTSMILAFGVQKVLFSGVAGS
LVKDLKINDLLVATQLVQHDVDLSAFDHPLGFIPESAIFIETSGSLNALAKKIANEQHIALKEGVIASGDQFVHSKERKE
FLVSEFKASAVEMEGASVAFVCQKFGVPCCVLRSISDNADEKAGMSFDEFLEKSAHTSAKFLKSMVDEL

The query sequence (length=229) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4yo8:B 242 229 1.0000 0.9463 1.0000 1.51e-166 4bmx:B, 4bmz:A, 4bmz:B, 5ccd:A, 5cce:A, 6dyu:A, 6dyu:B, 6dyv:A, 6dyv:B, 6dyw:A, 6dyw:B, 6dyy:A, 6dyy:B, 6dyy:C, 6dyy:D, 4ffs:A, 5jpc:A, 5k1z:A, 5kb3:A, 3nm5:A, 3nm5:B, 3nm6:B, 4ojt:A, 4oy3:A, 4p54:A, 4wkn:A, 4wko:A, 4wkp:A, 4wkp:B, 4wkp:C, 4wkp:D, 4ynb:A, 4yo8:A
2 4jwt:A 245 228 0.5066 0.4735 0.5088 4.53e-80
3 6ayo:A 229 228 0.4978 0.4978 0.5000 4.68e-74 6ayo:B, 6ayq:A, 6ayq:B, 6ayr:A, 6ayr:B, 6ayr:C, 6ayr:D, 6ays:A, 6ays:B, 6ays:C, 6ays:G, 6ays:D, 6ays:H, 6ays:E, 6ays:F, 6ayt:A, 6ayt:B, 6ayt:C, 6ayt:D
4 4jos:B 230 229 0.5066 0.5043 0.5066 2.01e-72 4jos:A
5 3bl6:A 230 228 0.3537 0.3522 0.3553 2.49e-41
6 6po4:A 233 229 0.3450 0.3391 0.3450 5.83e-39 6po4:B, 6po4:C, 6po4:D, 6po4:E, 6po4:F
7 3eei:A 231 235 0.3755 0.3723 0.3660 2.65e-38 3eei:B
8 5ue1:A 233 234 0.3450 0.3391 0.3376 4.69e-37 5ue1:B
9 4wkb:A 237 230 0.3231 0.3122 0.3217 2.92e-36 3dp9:A, 3dp9:C, 4wkb:B, 4x24:A, 4x24:B
10 1zos:A 230 229 0.3188 0.3174 0.3188 4.59e-36 3mms:A, 1zos:B, 1zos:C, 1zos:D, 1zos:E, 1zos:F
11 6if8:B 228 233 0.3406 0.3421 0.3348 1.58e-33 6if8:A, 6if8:C, 6if8:D, 6k2q:A, 6k2q:B, 6k2q:C, 6k2q:D
12 4f2p:B 239 233 0.3493 0.3347 0.3433 1.01e-32 3df9:A, 3df9:B, 4f1w:A, 4f1w:B, 4f2p:A, 4f2w:A, 4f2w:B, 4f3c:A, 4f3c:B, 4f3k:A, 4f3k:B, 1jys:A, 1jys:B, 1nc1:A, 1nc1:B, 1nc3:A, 1nc3:B, 3o4v:A, 3o4v:B, 4wkc:A, 1y6q:A, 1y6q:B, 1y6r:A, 1y6r:B, 4yml:A, 1z5n:A, 1z5n:B, 1z5o:A, 1z5o:B
13 4g89:A 233 233 0.3319 0.3262 0.3262 1.10e-32 4g89:B
14 5dk6:A 242 231 0.3406 0.3223 0.3377 6.54e-32
15 4qez:B 231 229 0.3362 0.3333 0.3362 2.90e-29 4qez:A, 4qez:C
16 4g41:B 236 229 0.3144 0.3051 0.3144 1.35e-28
17 4l0m:A 237 237 0.3275 0.3165 0.3165 2.34e-26
18 3bsf:A 244 233 0.2707 0.2541 0.2661 4.72e-10 3bsf:B
19 2qtt:A 248 228 0.2402 0.2218 0.2412 2.69e-08 2h8g:A, 2h8g:B, 3lgs:A, 3lgs:B, 3lgs:C, 3lgs:D, 2qtg:A, 2qtg:B, 2qtt:B
20 3uaw:A 233 184 0.1703 0.1674 0.2120 1.21e-06 2ac7:A, 2ac7:B, 3uav:A, 3uax:A, 3uay:A, 3uaz:A
21 3occ:F 238 186 0.1921 0.1849 0.2366 8.88e-06 1a69:A, 1a69:B, 1a69:C, 5i3c:A, 5i3c:B, 5i3c:C, 5iu6:A, 5iu6:B, 5iu6:C, 1k9s:A, 1k9s:D, 1k9s:B, 1k9s:E, 1k9s:C, 1k9s:F, 3occ:A, 3occ:B, 3occ:C, 3occ:D, 3occ:E, 3ooe:A, 3ooe:B, 3ooe:C, 3ooe:D, 3ooe:E, 3ooe:F, 3opv:A, 3opv:B, 3opv:C, 3opv:D, 3opv:E, 3opv:F, 3opv:G, 3opv:H, 3opv:I, 3opv:J, 3opv:K, 3opv:L, 1oty:A, 1oty:B, 1oty:C, 1ou4:A, 1ou4:B, 1ou4:C, 1oum:A, 1oum:B, 1oum:C, 1ov6:A, 1ov6:B, 1ov6:C, 1ovg:A, 1ovg:B, 1ovg:C, 1pk7:A, 1pk7:B, 1pk7:C, 1pk9:A, 1pk9:B, 1pk9:C, 1pke:A, 1pke:B, 1pke:C, 1pr0:A, 1pr0:B, 1pr0:C, 1pr1:A, 1pr1:B, 1pr1:C, 1pr2:A, 1pr2:B, 1pr2:C, 1pr4:A, 1pr4:B, 1pr4:C, 1pr5:A, 1pr5:B, 1pr5:C, 1pr6:A, 1pr6:B, 1pr6:C, 1pw7:A, 1pw7:B, 1pw7:C, 4ts3:A, 4ts3:D, 4ts3:B, 4ts3:C, 4ts3:E, 4ts3:F, 4ts9:A, 4ts9:C, 4ts9:B, 4tta:A, 4tta:B, 4tta:C, 4tta:F, 4tta:D, 4tta:E, 4tti:A, 4tti:B, 4tti:C, 4tti:F, 4tti:D, 4tti:E, 4ttj:A, 4ttj:D, 4ttj:B, 3ut6:A, 3ut6:B, 3ut6:C, 6xz2:B, 6xz2:C
22 5b7g:A 249 216 0.1965 0.1807 0.2083 1.39e-05 5b7g:B, 5b7n:A, 5b7n:B, 5b7p:A, 5b7p:B
23 6f4w:A 233 205 0.2183 0.2146 0.2439 2.10e-04 6f4w:D, 6f4w:B, 6f4w:E, 6f4w:C, 6f4w:F, 6f4x:A, 6f4x:D, 6f4x:B, 6f4x:E, 6f4x:C, 6f4x:F, 5lu0:A, 5lu0:B, 5lu0:C, 5lu0:E, 5mx4:C, 5mx6:A, 5mx6:B, 5mx6:C, 5mx6:D, 5mx6:F, 5mx8:A, 7ooy:B, 7ooz:B, 7op9:A, 7op9:B, 7op9:C, 7op9:D, 7op9:E, 7op9:F, 7op9:G, 7op9:H, 7op9:I, 7op9:J, 7op9:K, 7op9:L, 7opa:C, 7opa:H
24 4lna:A 269 160 0.1921 0.1636 0.2750 4.86e-04
25 1odi:A 234 166 0.1441 0.1410 0.1988 0.005 1odi:B, 1odi:C, 1odi:D, 1odi:E, 1odi:F, 1odj:A, 1odj:B, 1odj:C, 1odj:D, 1odj:E, 1odj:F, 1odl:A, 1odl:F, 1odl:B, 1odl:C, 1odl:D, 1odl:E
26 3of3:A 240 191 0.1790 0.1708 0.2147 0.005 3of3:B, 3of3:C, 3of3:D, 3of3:E, 3of3:F, 3of3:G, 3of3:H, 3of3:I, 3of3:J, 3of3:K, 3of3:L, 1vhw:A, 1vhw:D, 1vhw:B, 1vhw:F, 1vhw:C, 1vhw:E
27 3qpb:C 254 168 0.1834 0.1654 0.2500 0.045 3qpb:A, 3qpb:B, 3qpb:D, 3qpb:E, 3qpb:F, 3qpb:G, 3qpb:H, 3qpb:I, 3qpb:J, 3qpb:K, 3qpb:L, 3qpb:M, 3qpb:N, 3qpb:O, 3qpb:P, 3qpb:Q, 3qpb:R
28 5efo:B 253 184 0.1790 0.1621 0.2228 0.082 5c80:A, 5c80:B, 5c80:C, 5c80:D, 5c80:E, 5c80:F, 5efo:A, 5efo:C, 5efo:D, 5efo:E, 5efo:F, 5epu:A, 5epu:B, 5epu:C, 5epu:D, 5epu:E, 5epu:F, 4k6o:A, 4k6o:B, 4k6o:C, 4k6o:D, 4k6o:E, 4k6o:F, 5lhv:A, 5lhv:B, 5lhv:C, 5lhv:D, 5lhv:E, 5lhv:F, 5lok:A, 5lok:B, 5lok:C, 5lok:D, 5lok:E, 5lok:F, 5m2t:A, 5m2t:B, 5m2t:C, 5m2t:D, 5m2t:E, 5m2t:F, 5miw:A, 5miw:B, 5miw:C, 5miw:D, 5miw:E, 5miw:F, 4oeh:A, 4oeh:B, 4oeh:E, 4oeh:F, 4ogl:A, 4ogl:B, 4ogl:C, 4ogl:D, 4ogl:E, 4ogl:F, 3pns:B, 3pns:C, 3pns:D, 3pns:E, 3pns:F, 3pns:G, 3pns:H, 3pns:I, 3pns:J, 3pns:K, 3pns:L, 6rca:A, 6rca:B, 6rca:C, 6rca:D, 6rca:E, 6rca:F, 4u2k:B, 4u2k:D, 4u2k:F
29 2isc:D 238 166 0.1659 0.1597 0.2289 0.086 2i4t:A, 2i4t:B, 2i4t:C, 2isc:A, 2isc:B, 2isc:C, 2isc:E, 2isc:F, 1z34:A, 1z35:A, 1z36:A, 1z37:A, 1z38:A, 1z39:A
30 4pr3:A 205 65 0.0961 0.1073 0.3385 0.20 4pr3:B
31 6e0w:A 602 75 0.1092 0.0415 0.3333 1.1 6e0w:B
32 1t8y:F 461 134 0.1485 0.0738 0.2537 1.3 1t8s:A, 1t8s:B, 1t8s:C, 1t8s:D, 1t8s:E, 1t8s:F, 1t8y:C, 1t8y:B, 1t8y:E, 1t8y:A
33 4quw:A 223 86 0.1092 0.1121 0.2907 1.4 6jzu:B, 6jzy:B, 6jzz:B, 4rc5:A, 4rc5:B, 4rc6:A, 4rc6:B, 4rc7:A, 4rc7:B, 4rc8:A
34 3t94:A 270 100 0.1092 0.0926 0.2500 1.5 2a8y:A, 2a8y:B, 2a8y:C, 2a8y:D, 2a8y:E, 2a8y:F, 2a8y:G, 2a8y:H, 2a8y:I, 2a8y:J, 2a8y:K, 2a8y:L, 3t94:B, 3t94:C, 3t94:D, 3t94:E, 3t94:F
35 6jj7:A 465 49 0.0742 0.0366 0.3469 3.0 6jj7:C, 6jj7:E, 6jj8:C, 6jj8:A, 6jj8:B, 6jj9:C, 6jj9:A, 6jj9:E, 5zqt:A, 5zqt:B, 5zqt:C
36 3rg2:C 613 46 0.0699 0.0261 0.3478 4.0 6iyk:A, 6iyk:B, 6iyl:A, 6iyl:B, 4iz6:A, 4iz6:B, 8k5s:A, 8k5s:B, 8k5t:A, 8k5t:B, 3rg2:A, 3rg2:B, 3rg2:H, 3rg2:D, 3rg2:E, 3rg2:F, 3rg2:I, 3rg2:G, 3rg2:J
37 6k0v:A 562 60 0.0699 0.0285 0.2667 5.5 6k0m:A, 6k0n:A, 6k0p:A, 6k0q:A, 6k0s:A, 6k0u:A, 6k0v:B, 6k0v:C, 6k0v:D
38 6kns:A 246 59 0.0655 0.0610 0.2542 6.9 6kns:B, 6kns:C, 6kns:D, 6knt:A, 6knt:B, 6knt:C, 6knt:D
39 3lnl:A 307 103 0.1223 0.0912 0.2718 8.2 2nyd:A
40 8swu:A 269 171 0.1659 0.1413 0.2222 9.1 8swu:B, 8swu:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218