BioLiP

>protein
QIWLKVCAASDMQPGTIRRVNRVGAAPLAVYRVGDQFYATEDTCTHGIASLSEGTLDGDVIECPFHGGAFNVCTGMPASS
PCTVPLGVFEVEVKEGEVYVAGEKKLE

The query sequence (length=107) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4nbb:E	114	107	1.0000	0.9386	1.0000	3.53e-77	7buh:A, 7bui:D, 7bui:E, 2de5:D, 2de5:E, 2de5:F, 2de6:D, 2de6:E, 2de6:F, 2de7:D, 2de7:E, 2de7:F, 6llf:D, 6llf:E, 6llf:F, 6llh:D, 6llh:E, 6llh:F, 4nb8:D, 4nb8:E, 4nb8:F, 4nb9:D, 4nb9:E, 4nb9:F, 4nba:D, 4nba:E, 4nba:F, 4nbb:D, 4nbb:F, 4nbc:D, 4nbc:E, 4nbc:F, 4nbd:D, 4nbd:E, 4nbe:D, 4nbe:E, 4nbf:D, 4nbf:E, 4nbf:F, 4nbg:D, 4nbg:E, 4nbg:F, 4nbh:D, 4nbh:E, 4nbh:F, 1vck:A, 3vmg:D, 3vmg:E, 3vmg:F, 3vmh:D, 3vmh:E, 3vmh:F, 3vmi:D, 3vmi:E, 3vmi:F
2	2i7f:A	102	95	0.3364	0.3529	0.3789	2.13e-21	2i7f:B
3	3dqy:A	106	98	0.3738	0.3774	0.4082	1.64e-20	4emj:B
4	5bok:A	102	98	0.3458	0.3627	0.3776	4.96e-20
5	2qpz:A	103	98	0.3551	0.3689	0.3878	1.45e-19
6	2e4p:A	108	99	0.3832	0.3796	0.4141	3.10e-18	2e4p:B, 2e4q:A, 2e4q:C, 2yvj:B
7	1fqt:A	109	102	0.3551	0.3486	0.3725	9.67e-16	1fqt:B
8	3gce:A	104	100	0.3178	0.3269	0.3400	1.08e-12
9	6icn:A	344	115	0.2804	0.0872	0.2609	6.94e-10	6ick:A, 6ick:B, 6ick:C, 6icm:A, 6icm:B, 6icm:C, 6icn:B, 6icn:C, 6ico:A, 6ico:B, 6ico:C, 6icp:A, 6icp:B, 6icp:C, 6icq:A, 6icq:B, 6icq:C
10	8jng:A	147	86	0.2243	0.1633	0.2791	2.10e-06
11	7sze:B	329	89	0.2523	0.0821	0.3034	2.13e-05	7sze:A, 7sze:C, 7szf:A, 7szf:B, 7szf:C, 7szg:A, 7szg:B, 7szg:C, 6wnc:A, 6wnc:B, 6wnc:C, 6wnd:A, 6wnd:B, 6wnd:C
12	6icl:A	338	120	0.2991	0.0947	0.2667	2.34e-05
13	6vsh:C	320	81	0.2336	0.0781	0.3086	5.34e-05	3gke:C, 3gl0:C, 3gl2:C
14	3gob:A	342	81	0.2336	0.0731	0.3086	5.52e-05	3gb4:A, 3gb4:B, 3gb4:C, 3gke:A, 3gke:B, 3gl0:A, 3gl0:B, 3gl2:A, 3gl2:B, 3gob:B, 3gob:C, 3gte:A, 3gte:B, 3gte:C, 3gts:A, 3gts:B, 3gts:C, 6vsh:A, 6vsh:B
15	6wn3:B	328	89	0.2523	0.0823	0.3034	5.97e-05	7szh:A, 7szh:B, 7szh:C, 6wn3:A, 6wn3:C, 6wnb:A, 6wnb:B, 6wnb:C
16	1sjg:A	112	98	0.2897	0.2768	0.3163	1.51e-04	4p1b:H, 4p1b:I, 4p1c:H, 4p1c:I, 2q3w:A, 1vm9:A
17	8hn2:A	110	101	0.2710	0.2636	0.2871	2.00e-04	8hn2:B
18	4qdc:A	369	98	0.2336	0.0678	0.2551	3.50e-04	4qdd:A, 4qdf:A
19	4qdf:B	357	78	0.2150	0.0644	0.2949	4.99e-04
20	7q05:E	409	73	0.1963	0.0513	0.2877	0.002	7q04:D, 7q04:E, 7q04:F, 7q05:D, 7q05:F, 7q06:D, 7q06:E, 7q06:F, 7vju:A, 7vju:C, 7vju:E
21	2zyl:A	359	23	0.1215	0.0362	0.5652	0.006	4qck:A
22	7qwt:A	352	60	0.1869	0.0568	0.3333	0.006	7qwt:B, 7qwt:C, 7qwt:D, 7qwt:E, 7qwt:F, 7qwt:G, 7qwt:H, 7qwt:I
23	1z01:A	427	75	0.1776	0.0445	0.2533	0.018	1z01:B, 1z01:C, 1z01:D, 1z01:E, 1z01:F, 1z02:A, 1z02:B, 1z02:C, 1z02:D, 1z02:E, 1z02:F, 1z03:A, 1z03:B, 1z03:C, 1z03:D, 1z03:E, 1z03:F
24	7fhr:A	437	88	0.2430	0.0595	0.2955	0.078
25	3kvg:B	382	52	0.1495	0.0419	0.3077	2.0	3kvg:A, 3l4i:A, 3l4i:B
26	3fou:A	156	59	0.1402	0.0962	0.2542	3.7	3fou:B, 1nyk:A, 1nyk:B
27	3mm5:B	363	32	0.0935	0.0275	0.3125	4.3	3mm5:E, 3mm6:B, 3mm6:E, 3mm7:B, 3mm7:E, 3mm8:B, 3mm8:E, 3mm9:B, 3mm9:E, 3mma:B, 3mma:E, 3mmb:B, 3mmb:E, 3mmc:B, 3mmc:E
28	6ldk:A	813	23	0.1028	0.0135	0.4783	4.3
29	8cmk:A	913	18	0.0841	0.0099	0.5000	5.2	8cmk:B, 6gx9:A, 6gx9:B
30	4dqd:A	361	38	0.1589	0.0471	0.4474	5.4	3sg0:A
31	3jze:A	344	38	0.1215	0.0378	0.3421	5.8	3jze:B, 3jze:C, 3jze:D
32	8ioy:A	816	66	0.1869	0.0245	0.3030	6.8
33	3qfu:A	379	37	0.1215	0.0343	0.3514	8.1
34	4j8f:A	551	37	0.1215	0.0236	0.3514	9.4	5aqw:A, 5aqx:A, 5aqy:A, 5aqz:A, 5ar0:A, 3atu:A, 3atv:A, 3ay9:A, 5bn8:A, 5bn9:A, 5bpl:A, 5bpm:A, 3d2f:B, 3d2f:D, 2e88:A, 2e8a:A, 7f4x:A, 7f4z:A, 7f50:A, 7fgm:A, 6fhk:A, 6fhk:B, 6g3r:A, 6g3s:A, 3gdq:A, 1hjo:A, 4io8:A, 3jxu:A, 7kw7:D, 5mkr:A, 5mks:A, 7q4r:A, 1s3x:A, 1xqs:C, 1xqs:D, 6zyi:A
35	7kw7:C	511	37	0.1215	0.0254	0.3514	9.7
36	8ro0:M	196	52	0.1682	0.0918	0.3462	9.8	8ro1:M

[Back]