BioLiP

>protein
QIKRQKMIYHCKFGEFGVMEGQFTEPSGVAVNAQNDIIVADTNNHRIQIFDKEGRFKFQFGECGKRDQLLYPNRVAVVRN
SGDIIVTERSPTHQIQIYNQYGQFVRKFGATILQHPRGVTVDNKGRIIVVECKVMRVIIFDQNGNVLHKFGCSKHLEFPN
GVVVNDKQEIFISDNRAHCVKVFNYEGQYLRQIGGEGITNYPIGVGINSNGEILIADNHNNFNLTIFTQDGQLISALESK
VKHAQCFDVALMDDGSVVLASKDYRLYIYRYVQLAPVG

The query sequence (length=278) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4zlr:A	278	278	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	5ex7:A, 4zlr:B
2	8j72:B	277	227	0.2950	0.2960	0.3612	4.71e-35	8j72:A
3	8j72:B	277	266	0.3058	0.3069	0.3195	4.61e-30	8j72:A
4	8j72:B	277	185	0.2014	0.2022	0.3027	1.91e-13	8j72:A
5	6fq3:A	390	235	0.2950	0.2103	0.3489	3.36e-32	6fql:A
6	6fq3:A	390	267	0.2914	0.2077	0.3034	1.03e-26	6fql:A
7	6fq3:A	390	42	0.0647	0.0462	0.4286	0.008	6fql:A
8	8suc:A	282	258	0.2626	0.2589	0.2829	7.62e-27
9	7zqg:A	247	205	0.2014	0.2267	0.2732	6.80e-07	6qsh:A, 7zq2:A
10	7zqg:A	247	154	0.1547	0.1741	0.2792	1.31e-04	6qsh:A, 7zq2:A
11	7zqg:A	247	122	0.1295	0.1457	0.2951	7.45e-04	6qsh:A, 7zq2:A
12	7zqg:A	247	115	0.1187	0.1336	0.2870	0.076	6qsh:A, 7zq2:A
13	6qse:A	251	204	0.2014	0.2231	0.2745	1.19e-06	5chb:B, 5chb:C, 5f53:A, 5i1y:B, 7ov7:A, 7ov7:B, 6qsf:A, 6qsf:B, 6qsg:A, 6rej:A, 6rek:A, 6ren:A, 6ren:B, 7zcj:A, 7zpw:A, 7zpw:D, 7zpz:A
14	6qse:A	251	154	0.1547	0.1713	0.2792	2.73e-04	5chb:B, 5chb:C, 5f53:A, 5i1y:B, 7ov7:A, 7ov7:B, 6qsf:A, 6qsf:B, 6qsg:A, 6rej:A, 6rek:A, 6ren:A, 6ren:B, 7zcj:A, 7zpw:A, 7zpw:D, 7zpz:A
15	6qse:A	251	125	0.1331	0.1474	0.2960	0.004	5chb:B, 5chb:C, 5f53:A, 5i1y:B, 7ov7:A, 7ov7:B, 6qsf:A, 6qsf:B, 6qsg:A, 6rej:A, 6rek:A, 6ren:A, 6ren:B, 7zcj:A, 7zpw:A, 7zpw:D, 7zpz:A
16	6qse:A	251	115	0.1187	0.1315	0.2870	0.11	5chb:B, 5chb:C, 5f53:A, 5i1y:B, 7ov7:A, 7ov7:B, 6qsf:A, 6qsf:B, 6qsg:A, 6rej:A, 6rek:A, 6ren:A, 6ren:B, 7zcj:A, 7zpw:A, 7zpw:D, 7zpz:A
17	9fgp:A	140	114	0.1187	0.2357	0.2895	0.003	9fgp:B
18	7bam:A	1904	80	0.0935	0.0137	0.3250	0.004	7bam:B, 7ban:A, 7ban:B, 7bao:A, 7plp:A, 7plp:B
19	3v64:C	338	115	0.1079	0.0888	0.2609	0.026	3v64:D
20	3fvz:A	329	185	0.1511	0.1277	0.2270	0.041	3fw0:A
21	3fvz:A	329	95	0.0827	0.0699	0.2421	5.2	3fw0:A
22	2z2p:A	293	83	0.0683	0.0648	0.2289	1.4	2z2p:B
23	2z2p:A	293	124	0.0863	0.0819	0.1935	2.3	2z2p:B
24	7m8q:A	515	77	0.0827	0.0447	0.2987	1.6	6d7k:A, 6d7k:E, 7m8q:E, 7m8r:A, 7m8r:E, 1mhy:D, 1mhz:D, 7s6q:A, 7s6q:E, 7s6r:A, 7s6r:E, 7s6s:A, 7s6s:E, 7s6t:A, 7s6t:E, 7s7h:A, 7s7h:E, 6vk4:A, 6vk4:E, 6vk5:A, 6vk5:E, 6vk6:A, 6vk7:A, 6vk8:A, 6vk8:E, 6yd0:D, 6ydi:D, 6ydu:D, 6yy3:D
25	1pbq:B	266	48	0.0612	0.0639	0.3542	1.6	5i58:A, 5jty:A, 1y1m:B
26	1j5p:A	235	96	0.0791	0.0936	0.2292	6.0	1h2h:A
27	6pe2:A	456	54	0.0612	0.0373	0.3148	6.2	6p5a:A, 6p5a:G, 6pe2:G
28	8ro0:W	496	66	0.0540	0.0302	0.2273	6.4	8ro1:W
29	7nhk:g	97	27	0.0396	0.1134	0.4074	6.9	6o8w:f, 6o8x:f, 6o8y:f, 6o8z:f, 6o90:f, 7p7q:g, 7p7r:g, 7p7s:g, 7p7t:g, 7p7u:g, 6w6p:f, 6wub:f
30	6jt5:A	409	19	0.0360	0.0244	0.5263	7.1	6jwf:A, 6jwf:B
31	7rhp:A	215	60	0.0576	0.0744	0.2667	7.8
32	2gwh:B	288	57	0.0683	0.0660	0.3333	8.0	2gwh:A
33	6klr:A	297	149	0.1223	0.1145	0.2282	8.6
34	8ssl:A	1072	65	0.0755	0.0196	0.3231	9.0	5cjt:A, 5cjt:B, 5cju:A, 5cju:B, 5cjv:A, 5cjv:B, 5cjw:A, 5cjw:B, 8ssl:B, 8ssl:C, 4xc6:A, 4xc6:B, 4xc7:A, 4xc8:A, 4xc8:B

[Back]