BioLiP

>protein
QGQWIAARDLSITWVDNPQYWTWKTVDPNIEVAELRRVAWLDIYGKIETKNLIRKTSYAVYLVFKLTDNPRELERATASL
RFVNEVAEGAGIEGTTVFISKKKKLPGELGRFPHLRSDGWLEIKLGEFFNNLGEDGEVEMRLMEINDKTWKSGIIVKGFD
IRPN

The query sequence (length=164) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8ad2:A	165	164	1.0000	0.9939	1.0000	3.04e-119	8ad2:B, 8ad2:C, 8ad2:D, 8ad2:F, 8ad2:G, 8qmg:A, 8qmg:B, 8qmg:C, 8qmg:D, 8qmg:F, 8qmg:G
2	8jmr:B	167	165	0.2195	0.2156	0.2182	0.11
3	2w27:A	401	53	0.0915	0.0374	0.2830	0.77	2w27:B
4	6yw5:WW	353	69	0.1220	0.0567	0.2899	1.4	6ywe:WW, 6ywx:WW, 6ywy:WW
5	3wpn:A	309	42	0.0915	0.0485	0.3571	1.5
6	5zo8:A	331	42	0.0915	0.0453	0.3571	1.5	4a51:G, 4a51:E, 4a51:F, 4a5y:B, 4ap0:D, 4ap0:B, 2gm1:B, 2gm1:D, 6hky:C, 6trl:A, 8yhh:B, 5zo8:B, 5zo9:A, 5zo9:B
7	7twk:B	392	84	0.1402	0.0587	0.2738	1.9	7twk:A, 7twk:C, 7twk:D, 7twl:A, 7twl:B, 7twl:C, 7twl:D, 7twm:A, 7twm:B, 7twm:C, 7twm:D
8	6ta3:K	334	42	0.0915	0.0449	0.3571	2.1	4a1z:A, 4a1z:B, 4a28:B, 4a51:A, 4a51:B, 4a51:C, 4a51:D, 4ap0:A, 2fme:A, 6g6y:A, 2gm1:A, 2gm1:E, 6hkx:A, 6hky:A, 6hky:B, 3k5e:B, 6tiw:K, 2x2r:B, 2xae:A, 2xae:B, 6y1i:A, 6y1i:B, 6y1i:C, 8yhh:A, 3zcw:A, 4zca:B
9	4aqv:C	361	42	0.0915	0.0416	0.3571	2.1	4a28:A, 4a50:A, 4a5y:A, 4a5y:C, 4as7:A, 4b7b:A, 4bbg:A, 4bxn:A, 4bxn:B, 3cjo:A, 3cjo:B, 4ck6:C, 4ck7:C, 2fky:A, 2fky:B, 2fl2:A, 2fl2:B, 2fl6:A, 2fl6:B, 2fme:B, 2g1q:A, 2g1q:B, 6g6z:A, 6hkx:B, 3hqd:A, 3hqd:B, 2ieh:A, 2ieh:B, 1ii6:A, 1ii6:B, 3k3b:A, 3k3b:B, 3k5e:A, 3ken:A, 3l9h:A, 3l9h:B, 2pg2:A, 2pg2:B, 1q0b:A, 1q0b:B, 2q2y:A, 2q2y:B, 2q2z:A, 2q2z:B, 6ta4:K, 6tle:A, 6tle:B, 6trl:B, 2uyi:A, 2uyi:B, 2uym:A, 2uym:B, 2wog:A, 2wog:B, 2wog:C, 2x2r:A, 2x2r:C, 2x7c:A, 2x7c:B, 2x7d:A, 2x7d:B, 2x7e:A, 2x7e:B, 1x88:A, 1x88:B, 2xae:C, 1yrs:A, 1yrs:B, 4zca:A, 4zhi:A, 4zhi:B, 5zo7:A, 5zo7:B
10	8hai:K	533	41	0.0915	0.0281	0.3659	2.5	8hag:K, 8hah:K, 8hak:N
11	4bhw:A	563	41	0.0915	0.0266	0.3659	2.6	4bhw:B, 3biy:A, 8gzc:A, 8gzc:B, 8haj:K, 5kj2:A, 7lje:A, 7lje:B, 7lje:C, 7lje:D, 5lkt:A, 5lku:A, 5lkx:A, 5lkz:A, 6pf1:A, 6pf1:B, 6pgu:A, 6pgu:B, 7szq:A, 6v8b:A, 6v8k:A, 7vhy:A, 7vhy:B, 7vhz:A, 7vhz:B, 7vi0:A, 7vi0:B
12	6gyr:A	588	41	0.0915	0.0255	0.3659	2.7	5bt3:A, 8fvf:A, 8fvf:B, 6gyr:B, 6gyr:C, 6gyr:D, 5i8b:A, 5i8g:A, 5lpk:A, 5lpk:B, 5lpk:C, 5lpk:D, 5lpk:E, 5lpk:G, 5lpk:F, 5lpm:A, 5lpm:B, 5nu5:A, 5nu5:B, 4pzr:A, 4pzs:A, 4pzt:A, 7ugi:A, 7ugi:B, 6v8n:A, 6v90:A
13	7ss8:A	484	41	0.0915	0.0310	0.3659	3.3	6gyt:A, 6gyt:B, 7ssk:A
14	6gfm:A	440	44	0.1098	0.0409	0.4091	5.1
15	3t33:A	407	91	0.1524	0.0614	0.2747	5.4

[Back]