BioLiP

>protein
QGILSLALKDKAALYSAYMPFVKSGGIFVPTPKRYMLGDEVFLLLTLPDSSERLPVAGKVVWTTPAGANRAAGIGVQFPD
GPEGEAVRNKIETLLAG

The query sequence (length=97) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4f48:B	97	97	1.0000	1.0000	1.0000	1.12e-66
2	8kie:y	363	72	0.2371	0.0634	0.3194	0.19
3	3jx7:A	232	58	0.1443	0.0603	0.2414	0.37	5cl3:A, 5cl4:A, 5cl5:A, 5cl6:A, 5cl7:A, 5cl8:A, 5cl9:A, 5cla:A, 5clb:A, 5clc:A, 5cld:A, 5cle:A, 3jxy:A, 3jxz:A, 3jy1:A, 5kub:A, 7lxh:A, 7lxj:A, 5uuf:A, 5uug:A, 5uuh:A
4	3vsu:A	638	79	0.2577	0.0392	0.3165	0.41	3vsu:B, 3vsu:C, 3vsu:D, 3vsv:A, 3vsv:B, 3vsv:D, 3vsv:C
5	1eax:A	241	31	0.1340	0.0539	0.4194	1.1	8g1v:A, 8g1w:A, 2gv6:A, 2gv7:A, 4is5:A, 4isl:A, 4isn:A, 4iso:A, 4jyt:A, 4jz1:A, 4jzi:A, 6n4t:A, 3ncl:A, 4o97:A, 4o9v:A, 3p8f:A, 3p8g:A, 4r0i:A, 6t9t:A
6	5hog:B	432	35	0.1340	0.0301	0.3714	1.6	4c93:A, 4c93:B, 4c95:A, 4c95:B, 5hog:A, 5hoi:A, 5hoi:B, 5hoi:C, 5nxq:A, 5nxq:B
7	8c0z:A	616	76	0.2268	0.0357	0.2895	2.5	8c0z:B
8	8rqh:B	382	29	0.1340	0.0340	0.4483	2.9	8rqh:A
9	4gnr:A	348	70	0.2371	0.0661	0.3286	3.9
10	4m9d:B	431	32	0.1340	0.0302	0.4062	4.2	4m9d:A
11	6vs7:A	409	63	0.1959	0.0465	0.3016	5.1	6vs7:E, 6vt2:A, 6vt2:E, 6vu6:A, 6vu6:E
12	8a0h:A	324	49	0.1959	0.0586	0.3878	5.8
13	2io9:B	603	30	0.1134	0.0182	0.3667	6.6	3a2y:A, 2io7:A, 2io7:B, 2io8:A, 2io8:B, 2io9:A, 2ioa:A, 2ioa:B, 3o98:A, 3o98:B
14	6tnm:A	719	51	0.1546	0.0209	0.2941	8.1
15	9fa6:A	501	35	0.1546	0.0299	0.4286	8.5	8awk:AAA, 8awr:AAA, 8ax3:A, 8ax3:B, 9f9z:A, 9fa3:A, 9fad:A, 9fal:A, 9fay:A, 9faz:A, 9fb2:A, 9fdi:A, 3gxf:B, 3gxf:D, 5lvx:C, 5lvx:B, 5lvx:A, 5lvx:D, 6moz:A, 2nsx:A, 2nsx:B, 2nsx:C, 2nsx:D, 2nt0:A, 2nt0:B, 2nt0:C, 2nt0:D, 7nwv:AAA, 7nwv:BBB, 8p3e:B, 8p41:A, 8p41:B, 6q1n:A, 6q1n:B, 6q1p:A, 6q1p:B, 6q6k:A, 6q6k:B, 6q6l:A, 6q6l:B, 6q6n:A, 6q6n:B, 3rik:B, 3rik:D, 3ril:A, 3ril:B, 3ril:C, 3ril:D, 6t13:B, 6t13:C, 6t13:A, 6t13:D, 6tjq:BBB, 6tn1:AAA, 2v3d:A, 2v3d:B, 2v3e:A, 2v3e:B, 2vt0:A, 2vt0:B, 2wcg:A, 2wcg:B, 2xwd:A, 2xwd:B, 2xwe:A, 2xwe:B, 1y7v:A, 1y7v:B, 6ytp:AAA, 6ytp:BBB, 6ytr:AAA, 6ytr:BBB, 6yut:AAA, 6yut:BBB, 6yv3:AAA, 6yv3:BBB, 6z39:AAA, 6z39:BBB, 6z3i:BBB
16	8bgw:A	750	40	0.1237	0.0160	0.3000	9.0	8bgw:B, 6qq5:A, 6qq5:B, 6qq6:A, 6qq6:B, 6t6v:A

[Back]