BioLiP

>protein
QENERNISRLWRAFRTVKEMVKDRGYFITQEEVELPLEDFKAKYCDSMGRPQRKMMSFQANPTEESISKFPDMGSLWVEF
CDEPSVGVKTMKTFVIHIQEKNFQTGIFVYQNNITPSAMKLVPSIPPATIETFNEAALVVNITHHELVPKHIRLSSDEKR
ELLKRYRLKESQLPRIQRADPVALYLGLKRGEVVKIIRKSETSGRYASYRICM

The query sequence (length=213) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8bws:E	215	213	1.0000	0.9907	1.0000	6.26e-162	5c44:E, 5c4a:E, 5c4x:E, 6cnb:E, 2e2i:E, 6eu1:E, 3gtj:E, 3gtk:E, 3gtl:E, 3gtm:E, 6i84:E, 7kef:E, 3m4o:E, 7nky:E, 2nvq:E, 2nvx:E, 5oqm:E, 1r9t:E, 7rim:E, 7rip:E, 7riq:E, 7riw:E, 7rix:E, 7riy:E, 8tug:E, 8tvp:E, 8tvw:E, 8tvx:E, 8tvy:E, 6upx:E, 6upy:E, 6uq0:E, 6uq1:E, 6uq2:E, 6uq3:E, 4y52:E, 4y7n:E, 7z1m:E, 7z1o:E
2	6a5p:E	213	213	0.7371	0.7371	0.7371	3.67e-123	8h0v:E, 8h0w:E, 8he5:E, 6inq:E, 6j4w:E, 6j4x:E, 6j4y:E, 6j4z:E, 6j50:E, 8jh4:E, 7wbv:E, 7wbw:E, 7wbx:E, 7xn7:E, 5xog:E, 7xsx:E, 7xsz:E, 7xt7:E, 7xtd:E, 7xti:E, 8yfq:E
3	7d58:E	210	218	0.4460	0.4524	0.4358	2.31e-59	8a3y:E, 8a40:E, 7ae1:E, 7ae3:E, 7aea:E, 7b0y:E, 8b3d:E, 8b3f:E, 7dn3:E, 6exv:E, 7fji:E, 7fjj:E, 6gmh:E, 6gml:E, 8gxq:PE, 8iue:E, 8iuh:E, 5iy7:E, 5iy8:E, 5iy9:E, 5iyc:E, 5iyd:E, 8oeu:E, 8oev:E, 8oew:E, 8of0:E, 5oik:E, 7okx:E, 7oky:E, 7ol0:E, 7oo3:E, 7oob:E, 7oop:E, 7opc:E, 7opd:E, 8p4a:E, 8p4b:E, 8p4f:E, 7pks:E, 8rbx:E, 8s51:E, 8s52:E, 8s54:E, 8s5n:E, 6ted:E, 8uhd:E, 7und:E, 8w8e:E, 8w8f:E, 8wak:s, 8wal:s, 8wan:s, 8wao:s, 8wap:s, 8waq:s, 8war:s, 8was:s, 8wat:s, 8wau:s, 8wav:s, 8waw:s, 8wax:s, 8way:s, 8waz:s, 8wb0:s
4	8xmc:E	198	209	0.4038	0.4343	0.4115	1.18e-47	8xmd:E, 8xme:E
5	8hyj:E	209	203	0.3099	0.3158	0.3251	4.30e-29
6	2ae8:B	172	53	0.0751	0.0930	0.3019	0.29	2ae8:A, 2ae8:C, 2ae8:D, 2ae8:E, 2ae8:F
7	1lc3:A	292	60	0.0845	0.0616	0.3000	3.1	1lc0:A
8	2h63:D	285	60	0.0845	0.0632	0.3000	4.9	2h63:A, 2h63:B, 2h63:C
9	3u3k:A	289	24	0.0516	0.0381	0.4583	5.7	2a3r:A, 2a3r:B, 2d06:A, 2d06:B, 4gra:A, 4gra:B, 1ls6:A, 3qvu:A, 3qvu:B, 3qvv:A, 3qvv:B, 3u3j:A, 3u3j:B, 3u3k:B, 3u3m:A, 3u3o:A, 3u3r:A, 1z28:A, 1z29:A
10	2gwh:B	288	26	0.0469	0.0347	0.3846	6.5	2gwh:A
11	4tx6:B	310	50	0.0610	0.0419	0.2600	7.5	4tx6:A, 2xtk:A, 2xtk:B, 2xuc:A, 2xuc:B, 2xuc:C, 2xvn:A, 2xvn:B
12	2isq:A	320	70	0.0704	0.0469	0.2143	7.6	1z7w:A, 1z7y:A
13	6q2m:A	544	49	0.0798	0.0312	0.3469	8.9	1ba3:A, 5dwv:A, 4e5d:A, 4g36:A, 4g36:B, 4g37:A, 4g37:B, 5gyz:A, 5gz2:A, 6hps:A, 6hps:B, 3ies:A, 5kyt:A, 5kyt:B, 5kyv:A, 5kyv:B, 6q2m:B, 6q2m:C, 3rix:A, 5wys:A
14	5ju6:A	835	55	0.0704	0.0180	0.2727	10.0	5ju6:B, 5ju6:C, 5ju6:D

[Back]