Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QELGNANFENFIGATEGFSEIAYQFTSHILTLGYAVMLAGLLYFILTIKNVDKKFQMSNILSAVVMVSAFLLLYAQAQNW
TSSFTFNEEVGRYFLDPSGDLFNNGYRYLNWLIDVPMLLFQILFVVSLTTSKFSSVRNQFWFSGAMMIITGYIGQFYEVS
NLTAFLVWGAISSAFFFHILWVMKKVINEGKEGISPAGQKILSNIWILFLISWTLYPGAYLMPYLTGVDGFLYSEDGVMA
RQLVYTIADVSSKVIYGVLLGNLAITLSK

The query sequence (length=269) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6rf0:C 275 268 0.9963 0.9745 1.0000 0.0 8cl7:A, 8cl8:A, 7q36:A, 6rex:A, 6rex:B, 6rex:C, 6rex:D, 6rex:E, 6rez:A, 6rez:B, 6rez:C, 6rez:D, 6rez:E, 6rf0:A, 6rf0:E, 6rf0:B, 6rf0:D, 6rf1:A, 6rf1:E, 6rf1:B, 6rf1:C, 6rf1:D, 6rf3:A, 6rf3:B, 6rf3:C, 6rf3:D, 6rf3:E, 6rf4:A, 6rf4:B, 6rf4:C, 6rf4:D, 6rf4:E, 6rf5:A, 6rf6:A, 6rf7:A, 6rf9:A, 6rfa:A, 6rfb:A, 6rfc:A, 6tk1:A, 6tk2:A, 6tk3:A, 6tk4:A, 6tk5:A, 6tk6:A, 6tk7:A, 3x3b:A, 3x3c:A, 4xtl:A, 4xtn:A, 4xtn:B, 4xtn:C, 4xtn:D, 4xtn:E, 4xtn:F, 4xtn:G, 4xtn:H, 4xtn:I, 4xtn:J, 4xto:A, 4xto:B, 4xto:C, 4xto:D, 4xto:E, 6xyt:A, 6xyt:B, 6xyt:C, 6xyt:D, 6xyt:E, 6yby:A, 6ybz:A, 6ybz:B, 6ybz:C, 6ybz:D, 6ybz:E, 6yc0:A, 6yc0:B, 6yc0:C, 6yc0:D, 6yc0:E, 6yc1:A, 6yc1:B, 6yc1:C, 6yc1:D, 6yc1:E, 6yc2:A, 6yc2:B, 6yc2:C, 6yc2:D, 6yc2:E, 6yc3:A, 6yc3:B, 6yc3:C, 6yc3:D, 6yc3:E, 6yc4:A, 6yc4:B, 6yc4:C, 6yc4:D, 6yc4:E, 6yt4:A, 6yt4:B, 6yt4:D, 6yt4:E, 6yt4:C
2 8jh0:B 265 265 0.6877 0.6981 0.6981 2.85e-132 8jh0:A
3 5fjg:A 269 252 0.3606 0.3606 0.3849 8.29e-49 6ab9:A, 6aba:A, 5b2n:A, 7cri:A, 7crj:A, 7crk:A, 7crl:A, 7crs:A, 7crt:A, 7crx:A, 7cry:A, 5g28:A, 5g2a:A, 5g2c:A, 5g2d:A, 5g54:A, 6jy6:A, 6jy7:A, 6jy8:A, 6jy9:A, 6jya:A, 6jyb:A, 6jyc:A, 6jyd:A, 6jye:A, 6jyf:A, 7o8f:A, 7o8g:A, 7o8h:A, 7o8i:A, 7o8j:A, 7o8k:A, 7o8l:A, 7o8m:A, 7o8n:A, 7o8o:A, 7o8p:A, 7o8q:A, 7o8r:A, 7o8s:A, 7o8t:A, 7o8u:A, 7o8v:A, 7o8y:A, 7o8z:A, 7vgt:A, 7vgu:A, 7vgv:A, 7vgv:B, 7vgv:C, 5ztk:A, 5ztl:A
4 7ytb:B 255 250 0.2937 0.3098 0.3160 1.74e-28 8i2z:A, 7ytb:A
5 3ddl:A 252 248 0.2788 0.2976 0.3024 3.74e-27 3ddl:B
6 6nwd:A 246 235 0.2639 0.2886 0.3021 4.59e-27
7 7q37:A 217 241 0.2230 0.2765 0.2490 7.72e-15
8 8cqd:A 242 167 0.1487 0.1653 0.2395 4.20e-11 7b03:A, 7b03:B, 7b03:C, 7b03:D, 7b03:E, 8cqc:A, 8cqc:B, 8cqc:C, 8cqc:D, 8cqc:E, 8cqd:B, 8cqd:C, 8cqd:E, 8cqd:F, 8cqd:D, 2l6x:A
9 4kly:B 232 167 0.1561 0.1810 0.2515 7.48e-11 4kly:A, 4kly:C, 4kly:D, 4kly:E, 4knf:A, 4knf:B, 4knf:C, 4knf:D, 4knf:E
10 7zoy:A 226 163 0.1599 0.1903 0.2638 3.23e-08 7zou:A, 7zov:A
11 4hyj:A 236 237 0.1933 0.2203 0.2194 2.01e-07 4hyj:B
12 6xl3:A 223 127 0.1152 0.1390 0.2441 1.29e-04 6k6i:A, 6k6j:A, 6k6k:A, 6wp8:A, 6xl3:B
13 7w74:A 226 161 0.1450 0.1726 0.2422 1.53e-04 7w74:B
14 4jq6:B 203 228 0.1933 0.2562 0.2281 4.67e-04 4jq6:A, 4jq6:C
15 6lm0:C 242 228 0.1896 0.2107 0.2237 0.002 6lm0:A, 6lm0:B
16 8h79:A 236 168 0.1784 0.2034 0.2857 0.002
17 1cwq:A 238 246 0.2342 0.2647 0.2561 0.008 5a44:A, 5a45:A, 1ap9:A, 1at9:A, 2at9:A, 5b34:A, 5b35:A, 5b6v:A, 5b6w:A, 5b6x:A, 5b6y:A, 5b6z:A, 1bm1:A, 1brr:B, 1brr:A, 1brr:C, 1brx:A, 2brd:A, 5br2:A, 5br5:A, 1c3w:A, 1c8r:A, 3coc:A, 3coc:B, 3cod:A, 3cod:B, 1cwq:B, 1dze:A, 1e0p:A, 1f4z:A, 1f50:A, 1fbb:A, 1fbk:A, 4fpd:A, 6g7h:A, 6g7i:A, 6g7j:A, 6g7k:A, 6g7l:A, 6ga1:A, 6ga2:A, 6ga3:A, 6ga4:A, 6ga5:A, 6ga6:A, 6ga7:A, 6ga8:A, 6ga9:A, 6gaa:A, 6gab:A, 6gac:A, 6gad:A, 6gae:A, 6gaf:A, 6gag:A, 6gah:A, 6gai:A, 5h2h:A, 5h2i:A, 5h2j:A, 5h2k:A, 5h2l:A, 5h2m:A, 5h2n:A, 5h2o:A, 5h2p:A, 3han:A, 3hao:A, 3hao:B, 3hap:A, 3haq:A, 3har:A, 3has:A, 4hwl:A, 4hwl:B, 4hyx:A, 4hyx:B, 2i1x:A, 2i20:A, 2i21:A, 1iw6:A, 1iw9:A, 1ixf:A, 5j7a:A, 1jv6:A, 1jv7:A, 1kg8:A, 1kg9:A, 1kgb:A, 1kme:A, 1kme:B, 1m0k:A, 1m0l:A, 1m0m:A, 3mbv:A, 4md1:A, 4md2:A, 1mgy:A, 3ns0:A, 3nsb:A, 2ntu:A, 2ntw:A, 1o0a:A, 4ov0:A, 1p8h:A, 1p8i:A, 1p8u:A, 1pxr:A, 1pxr:B, 1pxs:A, 1pxs:B, 1py6:A, 1py6:B, 7q35:A, 7q38:A, 1q5i:A, 1q5i:B, 1q5j:A, 1q5j:B, 1qhj:A, 1qko:A, 1qkp:A, 1qm8:A, 1r2n:A, 1r84:A, 6rmk:A, 6rnj:A, 6rph:A, 6rqo:A, 6rqp:A, 1s51:A, 1s51:B, 1s52:A, 1s52:B, 1s53:A, 1s53:B, 1s54:A, 1s54:B, 1s8j:A, 1s8l:A, 3t45:A, 3t45:B, 3t45:C, 1tn0:A, 1tn0:B, 1tn5:A, 1tn5:B, 1ucq:A, 3utv:A, 3utw:A, 3utx:A, 3utx:B, 3uty:A, 3uty:B, 3vhz:A, 3vi0:A, 1vjm:A, 7vso:A, 2wjk:A, 2wjl:A, 1x0i:1, 1x0k:1, 1x0s:A, 4x31:A, 4x32:A, 1xji:A, 7xjc:A, 7xjd:A, 7xje:A, 4xxj:A, 4xxj:C, 4xxj:B, 4y9h:A, 7z0e:P, 2zfe:A, 5zil:A, 5zim:A, 5zin:A, 2zzl:A
18 8wew:A 233 158 0.1338 0.1545 0.2278 0.009 8wew:B
19 6kfq:A 229 230 0.1859 0.2183 0.2174 0.013
20 5itc:A 228 235 0.2007 0.2368 0.2298 0.018 5itc:B, 5itc:C, 5ite:A, 5ite:B, 5ite:C, 5kkh:A, 5kkh:B, 5kkh:C, 4qi1:A, 4qi1:B, 4qi1:C, 4qid:A, 4qid:B, 4wav:A, 4wav:B
21 6lm1:A 226 163 0.1561 0.1858 0.2577 0.034 6lm1:B, 6lm1:C
22 5b0w:A 261 157 0.1413 0.1456 0.2420 0.042 3a7k:A, 3a7k:D, 3a7k:B, 3abw:A, 3abw:D, 3abw:B, 5b0w:E, 5b0w:B, 5b0w:F, 5b0w:D, 5b0w:G, 5etz:A, 5etz:B, 5etz:D, 3qbg:A, 3qbg:B, 3qbg:D, 3qbi:A, 3qbi:B, 3qbi:D, 3qbk:A, 3qbk:D, 3qbk:B, 3qbl:A, 3qbl:B, 3qbl:D, 4qry:A, 4qry:E, 4qry:B, 4qry:F, 4qry:C, 4qry:G, 3vvk:A, 3vvk:D, 3vvk:B, 3vvk:E, 3vvk:C, 3vvk:F
23 6eid:A 247 220 0.1970 0.2146 0.2409 0.079 8zam:A, 8zam:B, 8zan:A, 8zan:B
24 6gux:A 241 160 0.1413 0.1577 0.2375 0.18 6guy:A, 6guz:A, 6s63:A, 6s6c:A, 1uaz:A, 1uaz:B, 7zy3:A
25 8ifu:A 259 178 0.1413 0.1467 0.2135 0.27 8gi9:A, 8ifu:B, 8ifu:C
26 2z55:A 242 160 0.1450 0.1612 0.2437 0.40 2ei4:A, 1vgo:A, 1vgo:B, 3wqj:A, 2z55:B, 2z55:D, 2z55:E
27 7jro:b 239 65 0.0818 0.0921 0.3385 0.97 7jrp:b
28 7deo:A 241 45 0.0595 0.0664 0.3556 1.0 7deo:C
29 8zao:A 259 180 0.1375 0.1429 0.2056 2.5 8gi8:A, 8h86:A, 8iu0:A, 8zao:B, 8zao:C, 8zap:A, 8zap:B, 8zap:C, 8zaq:A, 8zaq:B, 8zaq:C
30 7sfj:A 284 186 0.1190 0.1127 0.1720 2.9 7sfj:B, 7sfj:C, 7sfk:A, 7sfk:B, 7sfk:C, 7w9w:A
31 4zcf:A 616 21 0.0409 0.0179 0.5238 3.4 4zcf:B
32 7c86:A 296 227 0.1933 0.1757 0.2291 3.4 6csn:A, 6cso:A, 7e6x:A, 7e6y:A, 7e6z:A, 7e70:A, 7e71:A, 3ug9:A, 4yzi:A
33 8h87:A 259 180 0.1301 0.1351 0.1944 3.8
34 2ajs:L 216 45 0.0558 0.0694 0.3333 4.0 2ajv:L, 2ajx:L, 2ajy:L, 2ajz:L, 2ajz:A, 2ak1:L, 6p8d:E, 6p8d:B, 8s4h:B, 8s4h:D, 8s4h:L, 8s4k:L
35 1jp5:A 232 45 0.0558 0.0647 0.3333 5.4 1jp5:B, 1svz:A, 1svz:B
36 5tbd:G 112 69 0.0781 0.1875 0.3043 6.1 5tbd:F, 5tbd:B, 5tbd:K
37 4fbz:A 238 159 0.1450 0.1639 0.2453 6.5
38 3s6i:D 207 25 0.0409 0.0531 0.4400 7.5 3s6i:A
39 1c8s:A 196 242 0.2156 0.2959 0.2397 7.5
40 1ta9:B 394 38 0.0446 0.0305 0.3158 7.6 1ta9:A
41 5ldt:A 403 34 0.0595 0.0397 0.4706 7.6 5ldt:B, 5ldt:C, 5ldv:A
42 8erb:K 429 55 0.0706 0.0443 0.3455 8.6 8erb:A, 8erb:C, 8erb:B, 8erb:D, 8erb:G, 8erb:H, 8erb:F, 8erb:P, 8erb:I, 8erb:J, 8erb:M, 8erb:E, 8erb:Q, 8erb:N, 8erb:L, 8erj:A, 8erj:B, 8erj:C, 8erj:D, 8erj:E, 8erj:F, 8erj:H, 8erj:G

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218