Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
QEARTPQQQVTADEVGDWYDKFGEVYHLTLGESVHCGLWFPPDAPVPQDMELVTMSSQAQDRYTDYLIETLDPKAGQHLL
DIGCGTGRTALKAARQRGIAVSKEQIAAANRLAAGHGLTERLTVADAMRLPYEDESFDCAWAIESLCHMDRAKALGEAWR
VLKPGGDLLVLESVVTEELTEPETALFETLYAANVPPRLGEFFDIVSGAGFHTLSLKDLSANLAMTMNVFALGVYSRRAE
LAGLGSAQETLIRKTRFFMATLRKPAV

The query sequence (length=267) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5gm2:K 267 267 1.0000 1.0000 1.0000 0.0
2 5gm2:B 282 281 0.9775 0.9255 0.9288 0.0 5gm1:A, 5gm1:B, 5gm1:C, 5gm1:D, 5gm1:E, 5gm1:F, 5gm1:G, 5gm1:H, 5gm1:I, 5gm1:J, 5gm1:K, 5gm1:L, 5gm1:M, 5gm1:N, 5gm1:O, 5gm1:P, 5gm1:Q, 5gm1:R, 5gm2:A, 5gm2:C, 5gm2:D, 5gm2:E, 5gm2:F, 5gm2:G, 5gm2:H, 5gm2:I, 5gm2:J, 5gm2:L, 5gm2:M, 5gm2:N, 5gm2:O, 5gm2:P, 5gm2:Q, 5gm2:R
3 3bus:A 251 153 0.2509 0.2669 0.4379 4.12e-31 3bus:B
4 6uv6:C 264 221 0.2959 0.2992 0.3575 2.45e-27 6uv6:A, 6uv6:B
5 4pne:B 272 232 0.3071 0.3015 0.3534 3.28e-25 4pne:A
6 7v6h:A 267 228 0.2772 0.2772 0.3246 2.36e-22 7v6h:B
7 5wp5:A 463 130 0.1498 0.0864 0.3077 2.31e-10 5wp5:B
8 4ine:A 431 158 0.1723 0.1067 0.2911 1.79e-09 4ine:B
9 1ve3:B 226 116 0.1273 0.1504 0.2931 3.94e-09 1ve3:A
10 5wp4:A 485 113 0.1348 0.0742 0.3186 4.53e-09
11 6uak:A 297 100 0.1311 0.1178 0.3500 6.31e-08
12 2glu:A 234 120 0.1461 0.1667 0.3250 6.83e-08 2glu:B
13 7fbo:A 282 151 0.1685 0.1596 0.2980 1.03e-07 7fbh:B, 7fbh:C, 7fbo:B, 7fbo:C
14 4krh:A 430 104 0.1311 0.0814 0.3365 1.85e-07 4krh:B, 4kri:A, 4kri:B, 4kri:C
15 4f86:A 275 165 0.1461 0.1418 0.2364 3.10e-06 4f84:A, 4f86:B, 4f86:C, 4f86:E, 4f86:F, 4f86:H, 4f86:I, 4f86:J, 4f86:K, 4f86:L
16 5fcd:A 228 120 0.1461 0.1711 0.3250 7.26e-06 5fcd:B
17 2zfu:A 212 140 0.1648 0.2075 0.3143 1.89e-05 2zfu:B
18 7wdq:A 336 140 0.1461 0.1161 0.2786 2.93e-05 7wdq:B, 7wdq:C, 7wdw:A, 7wdw:B, 7wdw:C, 7wdw:D
19 3kkz:A 256 108 0.1311 0.1367 0.3241 4.14e-05 3kkz:B
20 3uj7:A 259 202 0.1498 0.1544 0.1980 4.90e-05 4fgz:A, 4fgz:B, 4r6w:A, 4r6w:B, 4r6x:A, 4r6x:B, 3uj6:A, 3uj7:B, 3uj8:A, 3uj9:A, 3uja:A, 3ujb:A, 3ujb:B, 3ujc:A, 3ujd:A
21 5z9o:A 373 193 0.1573 0.1126 0.2176 7.58e-05 5z9o:B
22 5f8f:B 361 121 0.1311 0.0970 0.2893 9.76e-05 5f8e:A, 5f8e:B, 5f8f:A, 5f8f:C
23 7qos:A 352 166 0.1573 0.1193 0.2530 1.46e-04 7qos:B
24 1p91:A 268 106 0.1498 0.1493 0.3774 1.58e-04 1p91:B
25 2yqz:A 261 104 0.1461 0.1494 0.3750 1.84e-04 2yqz:B
26 3t7s:A 246 103 0.1199 0.1301 0.3107 1.99e-04 3t7s:B, 3t7s:C, 3t7s:D, 3t7t:A, 3t7t:B, 3t7t:C, 3t7t:D
27 2gs9:A 211 125 0.1573 0.1991 0.3360 5.79e-04 2gs9:B
28 6wlf:B 434 131 0.1461 0.0899 0.2977 0.001 6wlf:A
29 3sxj:A 245 102 0.1049 0.1143 0.2745 0.002 3sxj:B, 3t0i:A, 3t0i:B
30 3vc1:D 288 111 0.1049 0.0972 0.2523 0.002 4f86:D, 4f86:G, 3vc1:A, 3vc1:B, 3vc1:C, 3vc1:E, 3vc1:F, 3vc1:G, 3vc1:H, 3vc1:I, 3vc1:J, 3vc1:K, 3vc1:L, 3vc2:A, 3vc2:B, 3vc2:C, 3vc2:D, 3vc2:E, 3vc2:F, 3vc2:G, 3vc2:H, 3vc2:I, 3vc2:J, 3vc2:K, 3vc2:L
31 4iv8:A 245 161 0.1311 0.1429 0.2174 0.002 4iv8:B
32 4mwz:B 265 156 0.1236 0.1245 0.2115 0.003 4iv0:A, 4iv0:B, 4mwz:A
33 1qzz:A 340 112 0.1386 0.1088 0.3304 0.003 1r00:A, 1xds:A, 1xds:B, 1xdu:A
34 3dlc:A 219 114 0.1199 0.1461 0.2807 0.004
35 5h02:A 252 131 0.1461 0.1548 0.2977 0.006 5gwx:A, 5hik:A, 5hil:A, 5him:A
36 4nec:B 244 96 0.1348 0.1475 0.3750 0.011 4nec:A, 4nec:C, 4nec:D
37 7q2d:A 286 85 0.0974 0.0909 0.3059 0.013 2fk8:A, 3ha3:A, 3ha5:A, 3ha7:A, 7q2b:A, 7q2c:A, 7q2e:A, 7q2f:A, 7q2g:A, 7q2h:A
38 3e23:A 198 100 0.1273 0.1717 0.3400 0.014
39 1tpy:A 285 233 0.1985 0.1860 0.2275 0.025
40 1kpg:A 285 214 0.1723 0.1614 0.2150 0.032 1kpg:B, 1kpg:C, 1kpg:D, 1kph:A, 1kph:B, 1kph:C, 1kph:D
41 1wzn:A 244 97 0.0861 0.0943 0.2371 0.045 1wzn:B, 1wzn:C
42 6cx6:B 333 132 0.1236 0.0991 0.2500 0.14 6cx6:A, 5eg5:A, 4fr0:A, 4fsd:A, 4kw7:A, 4rsr:A
43 6mro:A 194 116 0.1236 0.1701 0.2845 0.16 8gdu:A
44 6cu5:A 314 104 0.1161 0.0987 0.2981 0.16 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
45 1l1e:A 272 213 0.1573 0.1544 0.1972 0.19 1l1e:B
46 4kdr:A 208 111 0.1049 0.1346 0.2523 0.30 5dpm:A
47 3hem:A 291 262 0.2022 0.1856 0.2061 0.30 1kpi:A
48 3jwh:A 191 109 0.1199 0.1675 0.2936 0.31 3jwh:B
49 6p3o:A 341 156 0.1311 0.1026 0.2244 0.57 6p3m:A, 6p3n:A
50 5kok:A 348 39 0.0599 0.0460 0.4103 0.65 5koc:A, 5koc:B, 5kok:B, 5kpc:A, 5kpc:B, 5kpg:A, 5kpg:B
51 7lxi:A 279 221 0.1985 0.1900 0.2398 0.81 7mcj:A, 7mcj:B
52 6bqc:A 348 66 0.0824 0.0632 0.3333 0.97
53 5u1e:A 321 60 0.0749 0.0623 0.3333 1.1 5tyq:A, 5u0n:A, 5u0t:A, 5u18:A, 5u19:A, 5u1i:A, 5u4t:A
54 7qrd:C 364 103 0.1049 0.0769 0.2718 1.3 6arj:A, 6arj:B, 6arj:C, 6arj:D, 6arv:A, 6arv:B, 6arv:C, 6arv:D, 3b3f:A, 3b3f:B, 3b3f:C, 3b3f:D, 6d2l:A, 6d2l:B, 6d2l:C, 6d2l:D, 6d2l:E, 6d2l:F, 6dvr:A, 6dvr:B, 5dwq:B, 5dwq:D, 5dwq:A, 5dwq:C, 5dx0:A, 5dx0:B, 5dx0:C, 5dx0:D, 5dx1:A, 5dx1:B, 5dx1:C, 5dx1:D, 5dx8:A, 5dx8:B, 5dx8:C, 5dx8:D, 5dxa:A, 5dxa:B, 5dxa:D, 5dxa:C, 5dxj:A, 5dxj:B, 5dxj:C, 5dxj:D, 7fai:A, 7fai:B, 7fai:C, 7fai:D, 7faj:A, 7faj:B, 7faj:C, 7faj:D, 8g2h:A, 8g2i:A, 5ih3:A, 5ih3:B, 5ih3:C, 5ih3:D, 4ikp:A, 4ikp:B, 4ikp:C, 4ikp:D, 5is6:A, 5is6:B, 5is6:C, 5is6:D, 5is7:A, 5is7:B, 5is7:C, 5is7:D, 5is8:A, 5is8:B, 5is8:D, 5is8:C, 5is9:A, 5is9:B, 5is9:C, 5is9:D, 5isa:C, 5isa:D, 5isa:A, 5isa:B, 5isb:A, 5isb:B, 5isb:C, 5isb:D, 5isc:A, 5isc:B, 5isc:C, 5isc:D, 5isd:A, 5isd:B, 5isd:C, 5isd:D, 5ise:A, 5ise:B, 5ise:C, 5ise:D, 5isf:A, 5isf:B, 5isf:C, 5isf:D, 5isg:A, 5isg:B, 5isg:C, 5isg:D, 5ish:A, 5ish:B, 5ish:C, 5ish:D, 5isi:A, 5isi:B, 5isi:C, 5isi:D, 6izq:A, 5k8v:A, 5k8v:B, 5k8v:C, 5k8v:D, 5k8w:A, 5k8w:B, 5k8w:C, 5k8w:D, 5k8x:A, 5k8x:B, 5k8x:C, 5k8x:D, 5lgp:A, 5lgp:B, 5lgp:C, 5lgp:D, 5lgq:B, 5lgq:A, 5lgq:C, 5lgq:D, 5lgr:A, 5lgr:B, 5lgr:C, 5lgr:D, 5lgs:A, 5lgs:B, 5lgs:C, 5lgs:D, 5lkj:A, 5lkj:B, 5lkj:C, 5lkj:D, 5lv2:A, 5lv2:B, 5lv2:C, 5lv2:D, 5lv2:E, 5lv2:F, 5lv2:G, 5lv2:H, 5lv3:A, 5lv3:B, 5lv3:C, 5lv3:D, 5ntc:A, 5ntc:B, 5ntc:C, 5ntc:D, 7okp:A, 7okp:B, 7okp:C, 7okp:D, 7os4:A, 7os4:B, 7os4:C, 7os4:D, 7ppq:A, 7ppq:B, 7ppq:C, 7ppq:D, 7ppy:A, 7ppy:B, 7ppy:C, 7ppy:D, 7pu8:A, 7pu8:B, 7pu8:C, 7pu8:D, 7puc:A, 7puc:B, 7puc:C, 7puc:D, 7puq:A, 7puq:B, 7puq:C, 7puq:D, 7pv6:A, 7pv6:B, 7pv6:C, 7pv6:D, 7qph:A, 7qph:D, 7qph:C, 7qph:B, 7qrd:A, 7qrd:B, 7qrd:D, 6s70:A, 6s70:B, 6s70:C, 6s70:D, 6s71:A, 6s71:B, 6s71:C, 6s71:D, 6s74:A, 6s74:B, 6s74:C, 6s74:D, 6s77:A, 6s77:B, 6s77:C, 6s77:D, 6s79:A, 6s79:B, 6s79:C, 6s79:D, 6s7a:A, 6s7a:B, 6s7a:C, 6s7a:D, 6s7b:A, 6s7b:B, 6s7b:C, 6s7b:D, 6s7c:A, 6s7c:B, 6s7c:C, 6s7c:D, 8sig:A, 8sih:A, 5tbh:A, 5tbh:B, 5tbh:C, 5tbh:D, 5tbi:A, 5tbi:B, 5tbi:C, 5tbi:D, 5tbj:A, 5tbj:B, 5tbj:C, 5tbj:D, 5u4x:A, 5u4x:B, 5u4x:C, 5u4x:D, 7u9i:A, 7u9i:B, 2v74:B, 2v74:D, 2v74:F, 2v74:H, 2y1w:A, 2y1w:B, 2y1w:C, 2y1w:D, 2y1x:A, 2y1x:D, 2y1x:B, 2y1x:C
55 5dm2:A 258 40 0.0599 0.0620 0.4000 1.4 5dm1:A, 5dm4:A, 4kwc:A
56 1f3l:A 321 49 0.0562 0.0467 0.3061 1.5 2fyt:A, 8g2f:A, 8g2g:A, 8g2g:B, 4hsg:A, 4qqn:A, 4ryl:A, 8shb:A, 8shr:A, 8sio:A, 8sio:B, 3smq:A
57 5bxy:A 155 62 0.0637 0.1097 0.2742 1.5 5bxy:B
58 7qcb:A 240 125 0.1273 0.1417 0.2720 1.7
59 8r4z:A 341 72 0.0749 0.0587 0.2778 1.8 8r4z:B, 8rvc:A, 8rvc:B, 8rvs:A, 8rvs:B, 8rwm:A, 8rwm:B
60 3gu3:A 276 122 0.1086 0.1051 0.2377 1.9 3gu3:B
61 4a6d:A 345 88 0.0899 0.0696 0.2727 1.9 4a6e:A
62 4obw:D 235 53 0.0749 0.0851 0.3774 2.4 4obw:A, 4obw:C, 4obw:B
63 7vru:A 497 21 0.0375 0.0201 0.4762 3.2 7vs4:A
64 6ote:A 409 56 0.0674 0.0440 0.3214 3.6
65 5fad:A 160 53 0.0562 0.0938 0.2830 3.6 5fa8:A
66 6i6m:B 357 147 0.1273 0.0952 0.2313 3.6 6i5z:A, 6i5z:B, 6i5z:D, 6i6k:A, 6i6k:B, 6i6l:A, 6i6l:B, 6i6m:A, 6i6n:A, 6i6n:B
67 6f5z:B 228 116 0.1311 0.1535 0.3017 3.6 6f5z:A
68 5m58:A 230 140 0.1199 0.1391 0.2286 4.0 5m58:B
69 3wst:I 644 52 0.0637 0.0264 0.3269 4.1 3wst:A, 3wst:D, 3wst:B, 3wst:C, 3wst:F, 3wst:E, 3wst:G, 3wst:H, 3wst:M, 3wst:N, 3wst:O, 3wst:P, 3wst:Q, 3wst:R, 3wst:J, 3wst:K, 3wst:L, 3x0d:A
70 3lcc:A 216 170 0.1348 0.1667 0.2118 4.3
71 8joz:A 257 108 0.1161 0.1206 0.2870 4.5 4htf:A, 4htf:B
72 6hp2:A 297 87 0.0824 0.0741 0.2529 4.8
73 1l3i:A 186 113 0.1124 0.1613 0.2655 4.9 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
74 1mwi:A 165 52 0.0674 0.1091 0.3462 5.1 1mtl:A, 1mtl:B, 1mwj:A
75 6dxp:A 206 105 0.1236 0.1602 0.3143 5.2 6dxp:C, 6dxp:B, 6dxp:D, 8h4j:A, 8h4j:B, 8h4j:C, 8h4j:D, 8h4j:E, 8h4j:F, 8h4j:G, 8h4j:H, 7n2w:A, 7n2w:B, 7n2w:C, 7n2w:D
76 8pjd:A 347 68 0.0674 0.0519 0.2647 5.5 8bva:A, 8c1j:A, 5ful:A, 5fwa:A, 5fwd:A, 5jmq:A
77 4qtu:B 191 105 0.1161 0.1623 0.2952 5.6 4qtu:D
78 8rpr:A 338 87 0.0899 0.0710 0.2759 5.7 8ftr:A, 8fts:A, 8ftv:A, 8rww:A, 8rxf:A, 8rxg:A
79 5w7m:A 273 93 0.0899 0.0879 0.2581 5.7
80 5e72:A 323 141 0.1386 0.1146 0.2624 5.8
81 3e8s:A 220 100 0.1161 0.1409 0.3100 5.8
82 6dnz:A 317 50 0.0562 0.0473 0.3000 6.9 6dnz:C
83 3en1:A 424 49 0.0487 0.0307 0.2653 8.2 3eqq:A
84 7pkt:k 210 81 0.0824 0.1048 0.2716 9.5
85 7wzg:B 243 106 0.1124 0.1235 0.2830 9.8 7wzg:A, 7wzg:C, 7wzg:D, 7wzg:E, 7wzg:F
86 6zxv:A 325 115 0.1086 0.0892 0.2522 9.8 6zxv:B, 6zxw:G
87 7bgg:A 216 101 0.1086 0.1343 0.2871 10.0 7ndm:A, 7nmk:A, 7noy:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218