Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKL
WSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPMSLKPVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMIL
NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPVLCALAKKHKRTPALIAL
RYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLDRNLHYFNSDSFASHPNYPYS

The query sequence (length=303) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4zfc:B 320 315 1.0000 0.9469 0.9619 0.0 6a7b:A, 6a7b:B, 8bbs:B, 8bbs:A, 7c7f:A, 7c7f:B, 7c7g:A, 7c7g:B, 7c7h:A, 7c7h:B, 4dbs:A, 4dbs:B, 4dbu:A, 4dbu:B, 4dbw:A, 4dbw:B, 4dz5:A, 6f2u:A, 6f2u:B, 2f38:A, 6f78:A, 6f78:B, 4fa3:A, 4fal:A, 4fam:A, 4fam:B, 9ffd:A, 9ffd:B, 2fgb:A, 6gxk:A, 6gxk:B, 4h7c:A, 4hmn:A, 5hnt:A, 5hnt:C, 5hnu:A, 5hnu:C, 8i0c:A, 8i0c:B, 8jp1:A, 8jp1:B, 3r43:A, 3r58:A, 3r6i:A, 3r7m:A, 3r8g:A, 3r8h:A, 3r94:A, 8rb6:A, 8rb6:B, 1ry0:A, 1ry0:B, 1ry8:A, 1ry8:B, 1s1p:A, 1s1r:A, 1s2a:A, 1s2c:A, 3ufy:A, 3ug8:A, 3ugr:A, 3uwe:A, 4wdt:A, 4wdu:A, 4wdw:A, 4wdw:B, 4wdx:A, 4wdx:B, 7wqm:A, 7wqm:B, 7wqr:A, 7wqr:B, 7wqs:A, 7wqs:B, 4wrh:A, 7x3l:A, 7x3l:B, 7x3m:A, 7x3m:B, 7x3o:A, 7x3o:B, 1xf0:A, 4xvd:A, 4xvd:B, 4xve:A, 4yvv:A, 4yvv:B, 4yvx:A, 4yvx:B, 4zfc:A, 1zq5:A
2 4l1w:A 325 315 0.8746 0.8154 0.8413 0.0 6a7a:A, 3c3u:A, 3gug:A, 2hdj:A, 2hdj:B, 1ihi:A, 1ihi:B, 6ijx:A, 2ipj:A, 2ipj:B, 1j96:A, 1j96:B, 8jp2:A, 4jq1:A, 4jq1:B, 4jq2:A, 4jq2:B, 4jq3:A, 4jq3:B, 4jq4:A, 4jq4:B, 4jqa:A, 4jqa:B, 4jtq:A, 4jtq:B, 4jtr:A, 4jtr:B, 4l1w:B, 4l1x:A, 4l1x:B, 1mrq:A, 3nty:A, 1xjb:A, 1xjb:B, 4xo6:A, 4xo6:B, 4xo7:A, 4xo7:B, 4yvp:A, 4yvp:B
3 2fvl:A 323 315 0.8515 0.7988 0.8190 0.0 2fvl:B, 2fvl:C
4 1q13:A 322 315 0.7756 0.7298 0.7460 1.16e-179 1q13:B, 1q5m:A, 1q5m:B
5 1afs:A 319 312 0.7063 0.6708 0.6859 1.29e-162 1afs:B, 1lwi:A, 1lwi:B
6 3cv6:A 323 314 0.7228 0.6780 0.6975 2.34e-162 3cv6:B, 2he5:A, 2he5:B, 2he5:C, 2he5:D, 2hej:A, 2hej:B, 2ipf:A, 2ipf:B, 2ipg:A, 2ipg:B, 2p5n:A, 2p5n:B
7 3ln3:A 319 314 0.6634 0.6301 0.6401 2.12e-150 6m7k:A, 5uxf:A
8 3bur:A 325 313 0.5512 0.5138 0.5335 2.88e-124 3bur:B, 3buv:B, 3buv:A, 3bv7:A, 3bv7:B, 3caq:A, 3caq:B, 3cas:A, 3cas:B, 3cav:A, 3cav:B, 3cmf:A, 3cmf:B, 3cot:A, 3cot:B, 3dop:A, 3dop:B, 3g1r:A, 3g1r:B, 3uzw:A, 3uzw:B, 3uzx:A, 3uzx:B, 3uzy:A, 3uzy:B, 3uzz:A, 3uzz:B
9 4gq0:A 318 312 0.4719 0.4497 0.4583 3.78e-93 4ga8:A, 4gab:A, 4gqg:A, 4i5x:A, 4icc:X, 4jih:A, 4jii:X, 5lik:X, 5liu:X, 5liw:X, 5lix:X, 5liy:X, 5m2f:X, 4wev:X, 4xzl:X, 4xzm:X, 4xzn:X, 5y7n:A, 1zua:X
10 8b34:A 318 312 0.4752 0.4528 0.4615 8.87e-92 8a4n:A, 1abn:A, 2acq:A, 2acr:A, 2acs:A, 2acu:A, 1ads:A, 8ae9:A, 2agt:A, 8aqg:A, 8aqp:A, 8auu:A, 1az1:A, 1az2:A, 8b3n:A, 8b3r:A, 8b66:A, 3bcj:A, 8bjl:A, 8cnf:A, 8cnp:A, 3dn5:A, 2dux:A, 2duz:A, 2dv0:A, 1ef3:A, 1ef3:B, 1el3:A, 2f2k:A, 6f7r:A, 6f81:A, 6f82:A, 6f84:A, 6f8o:A, 8fh5:A, 8fh6:A, 8fh7:A, 8fh8:A, 8fh9:A, 2fz8:A, 2fz9:A, 2fzb:A, 2fzd:A, 3g5e:A, 4gca:A, 3ghr:A, 3ghs:A, 3ght:A, 3ghu:A, 5ha7:A, 5ha7:B, 2hv5:A, 2hvn:A, 2hvo:A, 2i16:A, 2i17:A, 1iei:A, 4igs:A, 2ikg:A, 2ikh:A, 2iki:A, 2ikj:A, 2ine:A, 2inz:A, 2ipw:A, 2iq0:A, 2iqd:A, 2is7:A, 2isf:A, 2j8t:A, 4jir:A, 4lau:A, 4laz:A, 3lbo:A, 4lb3:A, 4lb4:A, 4lbr:A, 4lbs:A, 3ld5:A, 3len:A, 3lep:A, 3lqg:A, 3lql:A, 3lz3:A, 3lz5:A, 3m0i:A, 3m4h:A, 3m64:A, 1mar:A, 3mb9:A, 3mc5:A, 4nkc:A, 2nvc:A, 2nvd:A, 3onb:A, 3onc:A, 5ou0:A, 5ouj:A, 5ouk:A, 8oz2:A, 3p2v:A, 8p2r:A, 2pd5:A, 2pd9:A, 2pdb:A, 2pdc:A, 2pdf:A, 2pdg:A, 2pdh:A, 2pdi:A, 2pdj:A, 2pdk:A, 2pdl:A, 2pdm:A, 2pdn:A, 2pdp:A, 2pdq:A, 2pdu:A, 2pdw:A, 2pdx:A, 2pdy:A, 2pev:A, 2pf8:A, 2pfh:A, 4pr4:A, 4prr:A, 4prt:A, 4puu:A, 4puw:A, 1pwl:A, 1pwm:A, 2pzn:A, 3q65:A, 3q65:B, 3q67:A, 3q67:B, 4q7b:A, 4qbx:A, 4qr6:A, 2qxw:A, 4qx4:A, 4qxi:A, 2r24:A, 4rpq:A, 3rx2:A, 3rx3:A, 3rx4:A, 3s3g:A, 6syw:A, 6t27:A, 6t3p:A, 1t40:A, 1t41:A, 3t42:A, 6t5g:A, 6t7q:A, 6td8:A, 6tuc:A, 6tuf:A, 6txp:A, 3u2c:A, 1us0:A, 3v35:A, 3v36:A, 1x96:A, 1x97:A, 1x98:A, 6xum:A, 4xzh:A, 4xzh:B, 4xzi:A, 6y03:A, 6y1p:A, 4ys1:A, 4yu1:A, 1z3n:A, 1z89:A, 1z8a:A
11 1ah0:A 315 310 0.4884 0.4698 0.4774 3.25e-90 1ah3:A, 1ah4:A, 1eko:A
12 1c9w:A 315 312 0.4620 0.4444 0.4487 7.33e-84 1frb:A
13 3o3r:A 315 295 0.4521 0.4349 0.4644 3.90e-82 3o3r:B, 3qkz:A, 3qkz:B
14 3fx4:A 325 324 0.4323 0.4031 0.4043 2.88e-80 1ae4:A, 3cv7:A, 1cwn:A, 3h4g:A, 1hqt:A
15 3wcz:A 307 304 0.4158 0.4104 0.4145 1.18e-76
16 3h7r:A 307 275 0.3894 0.3844 0.4291 2.76e-67
17 3h7u:A 312 276 0.3927 0.3814 0.4312 3.53e-67
18 1vbj:A 281 288 0.3828 0.4128 0.4028 1.52e-65 1vbj:B
19 5ket:A 328 329 0.3993 0.3689 0.3678 3.38e-65 5ket:B
20 5jh2:A 257 267 0.3597 0.4241 0.4082 1.59e-63
21 7f7k:B 310 274 0.4026 0.3935 0.4453 2.06e-63 7f7k:A, 7f7l:A, 7f7l:B, 7f7m:A, 7f7m:B, 7w1w:A, 7w1w:B, 7w1x:A, 7w1x:B
22 7s5f:B 309 302 0.3927 0.3851 0.3940 7.97e-63 7s5f:A, 7s5f:C, 7s5f:D
23 5az1:A 327 307 0.3531 0.3272 0.3485 9.11e-63 5az0:A
24 1k8c:B 319 307 0.3861 0.3668 0.3811 1.51e-62 1k8c:A, 1k8c:C, 1k8c:D, 1mi3:A, 1mi3:B, 1mi3:C, 1mi3:D, 1r38:A, 1r38:B, 1r38:C, 1r38:D, 1sm9:A, 1sm9:B, 1sm9:C, 1sm9:D, 1ye4:A, 1ye4:B, 1ye4:C, 1ye4:D, 1ye6:A, 1ye6:B, 1ye6:C, 1ye6:D, 1z9a:A, 1z9a:B, 1z9a:C, 1z9a:D
25 5zcm:A 329 311 0.3663 0.3374 0.3569 7.77e-62
26 4gie:A 288 284 0.3432 0.3611 0.3662 2.20e-59 4fzi:A, 4fzi:B
27 5z6t:A 317 310 0.3894 0.3722 0.3806 2.28e-59 5z6t:B
28 1vp5:A 284 290 0.3465 0.3697 0.3621 3.74e-59 1vp5:B
29 2bgs:A 308 283 0.3531 0.3474 0.3781 4.71e-58 2vdg:A
30 4g5d:A 283 290 0.3564 0.3816 0.3724 2.43e-57 4g5d:B
31 2wzm:A 274 288 0.3564 0.3942 0.3750 2.44e-55 2wzm:B
32 3wbw:A 271 291 0.3399 0.3801 0.3540 7.63e-55 3wbw:B, 3wby:A, 3wby:B
33 1zgd:A 308 286 0.3729 0.3669 0.3951 2.50e-52 1zgd:B
34 3d3f:A 275 284 0.3696 0.4073 0.3944 6.49e-52 3d3f:B
35 3krb:A 307 298 0.3531 0.3485 0.3591 4.02e-51 3krb:B
36 3b3d:A 280 282 0.3531 0.3821 0.3794 5.48e-51 3b3d:B, 3b3d:C
37 1a80:A 277 298 0.3465 0.3791 0.3523 5.57e-50 1m9h:A
38 5jgw:A 314 307 0.3597 0.3471 0.3550 7.98e-49 5jgw:B, 5jgw:C, 5jgw:D, 5jgy:A, 5jgy:B
39 4ijr:A 328 300 0.3333 0.3079 0.3367 1.06e-40 4ijr:C
40 3wg6:A 299 306 0.3333 0.3378 0.3301 1.64e-40 3wg6:B, 3wg6:C, 3wg6:D
41 4h8n:A 303 255 0.2970 0.2970 0.3529 1.94e-38 4h8n:B
42 6kik:A 275 294 0.3432 0.3782 0.3537 2.81e-38 5dan:A, 6kiy:A, 6ky6:A, 6ky6:B
43 5c7h:A 281 291 0.2805 0.3025 0.2921 2.78e-22 4pmj:A
44 6cia:A 284 294 0.2541 0.2711 0.2619 3.53e-16 4wgh:A
45 1pz1:A 333 211 0.1947 0.1772 0.2796 2.61e-13 1pz1:B
46 3v0s:A 287 283 0.2508 0.2648 0.2686 7.19e-13 3v0t:A
47 8hnq:A 286 204 0.1749 0.1853 0.2598 2.53e-12
48 1pz0:A 311 172 0.1683 0.1640 0.2965 1.44e-10
49 1ynp:B 298 151 0.1452 0.1477 0.2914 4.42e-10 1ynp:A, 1ynq:A, 1ynq:B
50 6hg6:A 313 310 0.2607 0.2524 0.2548 4.13e-06
51 1lqa:A 346 235 0.1716 0.1503 0.2213 2.60e-05 1lqa:B
52 7bc1:A 295 119 0.1155 0.1186 0.2941 4.33e-05
53 7twz:A 298 115 0.1188 0.1208 0.3130 1.22e-04 7twz:B, 7twz:C, 7twz:D, 7twz:E, 7twz:F
54 4aub:B 335 317 0.2343 0.2119 0.2240 2.23e-04 4aub:A, 4aub:C, 4aub:G, 3n6q:D
55 1og6:C 298 124 0.1188 0.1208 0.2903 4.67e-04 1og6:A, 1og6:B
56 7svq:A 315 323 0.2475 0.2381 0.2322 5.88e-04 7svq:B
57 4aub:F 298 300 0.2178 0.2215 0.2200 0.001 4aub:E, 4aub:H
58 8hw0:A 329 164 0.1419 0.1307 0.2622 0.001
59 7ezi:A 323 286 0.2211 0.2074 0.2343 0.001 7ezl:A
60 6ow0:B 301 292 0.2112 0.2126 0.2192 0.002 6ovx:A, 6ovx:B
61 8jwo:L 311 154 0.1221 0.1190 0.2403 0.002 8jwk:H, 8jwo:A, 8jwo:C, 8jwo:D, 8jwo:E, 8jwo:G, 8jwo:I, 8jwo:K, 8jwo:M, 8jwo:O
62 8jwm:B 331 154 0.1221 0.1118 0.2403 0.002 8jwk:D, 8jwk:J, 8jwk:L, 8jwk:N, 8jwk:P, 8jwl:C, 8jwl:H, 8jwm:A, 8jwm:C, 8jwm:D, 8jwm:E, 8jwm:F, 8jwm:G, 8jwm:H, 8jwn:A, 8jwn:B, 8jwn:C, 8jwn:D, 8jwn:E, 8jwn:F, 8jwn:G, 8jwn:H, 8jwo:B, 8jwo:F, 8jwo:H, 8jwo:J, 8jwo:N, 8jwo:P, 8xr4:A, 8xr4:B, 8xr4:C, 8xr4:D, 8xr4:E, 8xr4:F, 8xr4:G, 8xr4:H
63 7wf3:C 328 194 0.1551 0.1433 0.2423 0.005 2a79:A, 3eau:A, 3eb3:A, 3eb4:A, 6ebk:A, 6ebk:C, 6ebk:E, 6ebk:G, 6ebl:A, 6ebl:C, 6ebl:E, 6ebl:G, 7ej1:A, 7ej1:C, 7ej1:E, 7ej1:G, 7ej2:A, 7ej2:C, 7ej2:E, 7ej2:G, 1exb:A, 4jta:A, 4jta:P, 4jtc:A, 4jtc:G, 4jtd:A, 4jtd:G, 3lnm:A, 3lnm:C, 3lut:A, 1qrq:A, 1qrq:B, 1qrq:C, 1qrq:D, 2r9r:A, 2r9r:G, 7sit:A, 7sit:C, 7siz:A, 7siz:C, 7wf3:G, 7wf3:I, 7wf3:M, 7wf4:G, 7wf4:I, 7wf4:M, 7wf4:o, 5wie:A, 5wie:G, 1zsx:A
64 6ow0:A 323 305 0.2079 0.1950 0.2066 0.007
65 8usu:A 316 214 0.1716 0.1646 0.2430 0.008 8usu:B
66 4exa:F 259 145 0.1254 0.1467 0.2621 0.008 4exa:A, 4exa:B, 4exa:C, 4exa:D, 4exa:E
67 5t79:A 315 126 0.1122 0.1079 0.2698 0.016 3erp:A, 3erp:B
68 2clp:A 323 131 0.1122 0.1053 0.2595 0.039 2clp:B, 2clp:C, 2clp:D, 2clp:E, 2clp:F, 2clp:G, 2clp:H, 2clp:I, 2clp:J, 2clp:K
69 1gve:A 324 117 0.0957 0.0895 0.2479 0.067
70 2c91:A 325 66 0.0726 0.0677 0.3333 0.067 2bp1:A, 2bp1:B, 2bp1:C, 2bp1:D, 2c91:B, 2c91:C, 2c91:D, 2c91:E, 2c91:F, 2c91:G, 2c91:H, 2c91:I, 2c91:J
71 8qp8:A 1918 96 0.0891 0.0141 0.2812 0.64
72 5diy:A 463 142 0.1221 0.0799 0.2606 0.64 5diy:B
73 4v4n:AM 194 58 0.0495 0.0773 0.2586 0.71 6skf:BP, 6skg:BP, 6th6:BP, 4v6u:BM
74 7vpp:A 904 113 0.0891 0.0299 0.2389 1.2 6buy:A, 6bv0:A, 6bv1:A, 6bv2:A, 6bv3:A, 6bv4:A, 4f5c:A, 4f5c:B, 4fke:A, 4fkh:A, 4fkk:A, 4hom:A, 5lds:D, 5lds:A, 5lds:B, 5lds:C, 5lg6:A, 5lg6:B, 4naq:A, 4nz8:A, 4ou3:A, 7vpp:C, 5z65:A
75 6gej:Y 447 51 0.0528 0.0358 0.3137 7.5 8ets:W, 8ets:U, 8ets:Y, 8etu:W, 8etu:U, 8etu:Y, 8etw:W, 8etw:U, 8etw:Y, 8eu9:W, 8eu9:U, 8eu9:Y, 8euf:W, 8euf:U, 8euf:Y, 6gej:U, 6gej:W, 6gen:U, 6gen:W, 6gen:Y
76 8x5v:A 892 141 0.0924 0.0314 0.1986 9.2
77 1v6c:B 436 50 0.0495 0.0344 0.3000 9.6 1v6c:A, 1wvm:A, 1wvm:B, 1y9z:A, 1y9z:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218