Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
QCFLIDKNFVNKAVESANLTKDDVVLEIGLGKGILTEELAKNAKKVYVIEIDKSLEPYANKLKELYNNIEIIWGDALKVD
LNKLDFNKVVANLPYQISSPITFKLIKRGFDLAVLMYQYEFAKRMVAAAGTKDYGRLSVAVQSRADVEIVAKVPPSAFYP
KPKVYSAIVKIKPNKGKYHIENENFFDDFLRAIFQHRNKSVRKALIDSSKELNYNKDEMKKILEDFLNTNSEIKNLINEK
VFKLSVKDIVNLSNEFYRFLQNR

The query sequence (length=263) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3grr:A 263 263 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 3gru:A, 3grv:A, 3gry:A
2 8x3w:A 270 241 0.4525 0.4407 0.4938 2.05e-69 8x3w:B, 8x41:A, 8x41:B, 8x44:A, 8x44:B, 8x45:A, 8x45:B, 8x46:A, 8x46:B, 8x47:A, 8x4i:A, 8x4l:A, 8x4l:B, 8x4o:A, 8x4o:B, 8x4p:A, 8x4p:B
3 6ift:A 292 271 0.3840 0.3459 0.3727 2.07e-45 7v2l:W, 7v2m:U, 7v2m:W, 7v2n:U, 7v2o:U, 7v2p:U, 7v2q:U, 7v2q:W
4 7mqa:NL 278 243 0.3308 0.3129 0.3580 3.77e-36 7wts:3, 1zq9:A, 1zq9:B
5 7aju:JL 283 225 0.2852 0.2650 0.3333 2.53e-30 8cbj:y, 6rbd:y, 7wtl:JL, 7wtm:JL, 6zqd:JL, 6zqe:JL, 6zqf:JL, 6zqg:JL
6 8eyt:W 254 213 0.2700 0.2795 0.3333 7.32e-28 4adv:V, 7afo:Y, 7o5h:V
7 3fux:C 265 227 0.2738 0.2717 0.3172 1.16e-25 3fuu:A, 3fuw:A, 3fux:A, 3fux:B
8 1qan:A 236 179 0.2129 0.2373 0.3128 3.68e-20 1qao:A, 1qaq:A
9 3ftf:A 246 234 0.3270 0.3496 0.3675 7.34e-20 3fte:A, 3r9x:B
10 4gc9:A 318 230 0.2395 0.1981 0.2739 3.79e-18 7pnt:c
11 8csp:5 319 231 0.2281 0.1881 0.2597 3.10e-15 6aax:A, 6aax:C, 6ajk:A, 8csq:5, 8csr:5, 8csu:5
12 7f8b:A 245 176 0.1749 0.1878 0.2614 1.40e-10 7f8c:A
13 3lbf:A 207 125 0.1293 0.1643 0.2720 0.005 3lbf:B, 3lbf:C, 3lbf:D
14 6erp:F 288 228 0.1939 0.1771 0.2237 0.009 6erp:J, 6erq:F, 6erq:J
15 5dst:C 317 78 0.1103 0.0915 0.3718 0.032 5dst:A, 5dst:B, 5dst:D, 5dst:E, 5dst:F, 5dst:G, 5dst:H, 5dst:I, 5dst:J, 5dst:K, 5dst:L, 5dst:M, 5dst:N, 5dst:O, 4x41:A
16 1l3i:A 186 65 0.0798 0.1129 0.3231 0.037 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
17 4l7v:A 186 62 0.0989 0.1398 0.4194 0.062
18 6nt2:A 330 78 0.1103 0.0879 0.3718 0.11 6nt2:D, 6nt2:B, 6nt2:C, 1or8:A, 1orh:A, 1ori:A, 3q7e:A
19 6cu5:A 314 44 0.0798 0.0669 0.4773 0.19 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
20 3ay0:B 314 160 0.1521 0.1274 0.2500 0.36 2yx1:B
21 2zzn:A 336 160 0.1521 0.1190 0.2500 0.40 3ay0:A, 2yx1:A, 2zzm:A, 2zzn:B
22 7qrd:C 364 31 0.0532 0.0385 0.4516 0.40 6arj:A, 6arj:B, 6arj:C, 6arj:D, 6arv:A, 6arv:B, 6arv:C, 6arv:D, 3b3f:A, 3b3f:B, 3b3f:C, 3b3f:D, 6d2l:A, 6d2l:B, 6d2l:C, 6d2l:D, 6d2l:E, 6d2l:F, 6dvr:A, 6dvr:B, 5dwq:B, 5dwq:D, 5dwq:A, 5dwq:C, 5dx0:A, 5dx0:B, 5dx0:C, 5dx0:D, 5dx1:A, 5dx1:B, 5dx1:C, 5dx1:D, 5dx8:A, 5dx8:B, 5dx8:C, 5dx8:D, 5dxa:A, 5dxa:B, 5dxa:D, 5dxa:C, 5dxj:A, 5dxj:B, 5dxj:C, 5dxj:D, 7fai:A, 7fai:B, 7fai:C, 7fai:D, 7faj:A, 7faj:B, 7faj:C, 7faj:D, 8g2h:A, 8g2i:A, 5ih3:A, 5ih3:B, 5ih3:C, 5ih3:D, 4ikp:A, 4ikp:B, 4ikp:C, 4ikp:D, 5is6:A, 5is6:B, 5is6:C, 5is6:D, 5is7:A, 5is7:B, 5is7:C, 5is7:D, 5is8:A, 5is8:B, 5is8:D, 5is8:C, 5is9:A, 5is9:B, 5is9:C, 5is9:D, 5isa:C, 5isa:D, 5isa:A, 5isa:B, 5isb:A, 5isb:B, 5isb:C, 5isb:D, 5isc:A, 5isc:B, 5isc:C, 5isc:D, 5isd:A, 5isd:B, 5isd:C, 5isd:D, 5ise:A, 5ise:B, 5ise:C, 5ise:D, 5isf:A, 5isf:B, 5isf:C, 5isf:D, 5isg:A, 5isg:B, 5isg:C, 5isg:D, 5ish:A, 5ish:B, 5ish:C, 5ish:D, 5isi:A, 5isi:B, 5isi:C, 5isi:D, 6izq:A, 5k8v:A, 5k8v:B, 5k8v:C, 5k8v:D, 5k8w:A, 5k8w:B, 5k8w:C, 5k8w:D, 5k8x:A, 5k8x:B, 5k8x:C, 5k8x:D, 5lgp:A, 5lgp:B, 5lgp:C, 5lgp:D, 5lgq:B, 5lgq:A, 5lgq:C, 5lgq:D, 5lgr:A, 5lgr:B, 5lgr:C, 5lgr:D, 5lgs:A, 5lgs:B, 5lgs:C, 5lgs:D, 5lkj:A, 5lkj:B, 5lkj:C, 5lkj:D, 5lv2:A, 5lv2:B, 5lv2:C, 5lv2:D, 5lv2:E, 5lv2:F, 5lv2:G, 5lv2:H, 5lv3:A, 5lv3:B, 5lv3:C, 5lv3:D, 5ntc:A, 5ntc:B, 5ntc:C, 5ntc:D, 7okp:A, 7okp:B, 7okp:C, 7okp:D, 7os4:A, 7os4:B, 7os4:C, 7os4:D, 7ppq:A, 7ppq:B, 7ppq:C, 7ppq:D, 7ppy:A, 7ppy:B, 7ppy:C, 7ppy:D, 7pu8:A, 7pu8:B, 7pu8:C, 7pu8:D, 7puc:A, 7puc:B, 7puc:C, 7puc:D, 7puq:A, 7puq:B, 7puq:C, 7puq:D, 7pv6:A, 7pv6:B, 7pv6:C, 7pv6:D, 7qph:A, 7qph:D, 7qph:C, 7qph:B, 7qrd:A, 7qrd:B, 7qrd:D, 6s70:A, 6s70:B, 6s70:C, 6s70:D, 6s71:A, 6s71:B, 6s71:C, 6s71:D, 6s74:A, 6s74:B, 6s74:C, 6s74:D, 6s77:A, 6s77:B, 6s77:C, 6s77:D, 6s79:A, 6s79:B, 6s79:C, 6s79:D, 6s7a:A, 6s7a:B, 6s7a:C, 6s7a:D, 6s7b:A, 6s7b:B, 6s7b:C, 6s7b:D, 6s7c:A, 6s7c:B, 6s7c:C, 6s7c:D, 8sig:A, 8sih:A, 5tbh:A, 5tbh:B, 5tbh:C, 5tbh:D, 5tbi:A, 5tbi:B, 5tbi:C, 5tbi:D, 5tbj:A, 5tbj:B, 5tbj:C, 5tbj:D, 5u4x:A, 5u4x:B, 5u4x:C, 5u4x:D, 7u9i:A, 7u9i:B, 2v74:B, 2v74:D, 2v74:F, 2v74:H, 2y1w:A, 2y1w:B, 2y1w:C, 2y1w:D, 2y1x:A, 2y1x:D, 2y1x:B, 2y1x:C
23 1jg1:A 215 133 0.1445 0.1767 0.2857 0.57 1jg2:A, 1jg3:A, 1jg3:B, 1jg4:A
24 5xj2:A 454 39 0.0570 0.0330 0.3846 0.57 5xj2:B, 5xj2:C, 5xj2:D, 5zq0:A, 5zq1:A, 5zq8:B, 5zq8:A, 5zth:A
25 4kdr:A 208 48 0.0646 0.0817 0.3542 0.60 5dpm:A
26 1f3l:A 321 72 0.1027 0.0841 0.3750 0.66 2fyt:A, 8g2f:A, 8g2g:A, 8g2g:B, 4hsg:A, 4qqn:A, 4ryl:A, 8shb:A, 8shr:A, 8sio:A, 8sio:B, 3smq:A
27 5fad:A 160 85 0.0913 0.1500 0.2824 0.83 5fa8:A
28 3ofk:A 204 26 0.0456 0.0588 0.4615 0.91 3ofk:B, 3ofk:C, 3ofk:D
29 5wp5:A 463 57 0.0722 0.0410 0.3333 0.98 5wp5:B
30 6uak:A 297 95 0.1141 0.1010 0.3158 1.1
31 4mmo:A 437 126 0.1331 0.0801 0.2778 1.1
32 5w1j:A 584 69 0.0798 0.0360 0.3043 1.1 5w1j:B, 5w1l:A, 5w1l:B
33 6dnz:A 317 39 0.0760 0.0631 0.5128 1.3 6dnz:C
34 4lwp:B 342 44 0.0608 0.0468 0.3636 1.3 4lwp:A
35 8pjd:A 347 32 0.0532 0.0403 0.4375 1.7 8bva:A, 8c1j:A, 5ful:A, 5fwa:A, 5fwd:A, 5jmq:A
36 7rbq:A 614 46 0.0646 0.0277 0.3696 2.5 7t39:A
37 8wiv:D 602 95 0.1103 0.0482 0.3053 3.6 8wk0:D
38 7cfe:A 214 80 0.0913 0.1121 0.3000 4.3
39 4hh4:C 256 73 0.0875 0.0898 0.3151 4.5 4hh4:A, 4hh4:B, 4hh4:D, 4hh4:E, 4hh4:F
40 8wiv:O 657 95 0.1103 0.0441 0.3053 4.6 8wiv:M, 8wiv:L, 8wj3:M, 8wj3:O, 8wj3:L, 8wk0:M, 8wk0:O, 8wk0:L
41 5hcc:A 982 33 0.0494 0.0132 0.3939 4.6 7ad6:A, 8ayh:A, 1cfa:A, 5hcd:A, 5hce:A
42 1a8h:A 500 111 0.1179 0.0620 0.2793 4.6 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
43 1wzn:A 244 56 0.0722 0.0779 0.3393 5.2 1wzn:B, 1wzn:C
44 3v0s:A 287 42 0.0532 0.0488 0.3333 7.6 3v0t:A
45 5wp4:A 485 61 0.0646 0.0351 0.2787 8.3
46 3r0q:G 353 31 0.0532 0.0397 0.4516 8.4 3r0q:C, 3r0q:A, 3r0q:E
47 2yvl:A 247 33 0.0532 0.0567 0.4242 9.1 2yvl:B, 2yvl:C, 2yvl:D
48 4ifu:A 330 38 0.0494 0.0394 0.3421 9.4 4ifw:A, 4ifx:A, 4ifz:A, 4ig1:A, 7mgt:A, 4xdr:A, 4xdt:A, 4xdu:A
49 5eku:B 347 39 0.0570 0.0432 0.3846 9.7 5eku:A, 4m37:A, 4m38:A, 4m38:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218