BioLiP

>protein
QATNSDVTPVQAANQYGYAGLSAAYEPTSAVNVSQTGQLLYQYNIDTKWNPASMTKLMTMYLTLEAVNKGQLSLDDTVTM
TNKEYIMSTLPELSNTKLYPGQVWTIADLLQITVSNSSNAAALILAKKVSKNTSDFVDLMNNKAKAIGMKNTHFVNPTGA
ENSRLRTFAPTKYKDQELTVTTARDYAILDLHVIKETPKILDFTKQLAPTTHAVTYYTFNFSLEGAKMSLPGTDGLKTGS
SDTANYNHTITTKRGKFRINQVIMGAGDYKNLGGEKQRNMMGNALMERSFDQYKYVKILSKGEQRINGKKYYVENDLYDV
LPSDFSKKDYKLVVEDGKVHADYPREFINKDYGPPTVEVHQ

The query sequence (length=361) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7kcv:A	362	361	1.0000	0.9972	1.0000	0.0	6c39:A, 6dz8:A, 6dz8:B, 3hum:A, 3hum:B, 3hun:A, 3hun:B, 7kcw:A, 7kcx:A, 7kcy:A, 5tw4:A, 5tw4:B, 5tw8:A, 5tw8:B, 5tx9:A, 5tx9:B, 5txi:A, 5txi:B, 5ty2:A, 5ty2:B, 5ty7:A, 5ty7:B
2	5tr7:A	251	231	0.1967	0.2829	0.3074	2.25e-27
3	5zqa:A	248	243	0.2105	0.3065	0.3128	5.66e-23	5zqb:A, 5zqb:B, 5zqb:C, 5zqb:D, 5zqc:A, 5zqc:B, 5zqc:C, 5zqc:D, 5zqd:A, 5zqd:B, 5zqd:C, 5zqd:D, 5zqd:E, 5zqd:F, 5zqd:G, 5zqd:H, 5zqe:A, 5zqe:B, 5zqe:C, 5zqe:D, 5zqe:E, 5zqe:F, 5zqe:G, 5zqe:H
4	3itb:D	351	234	0.1967	0.2023	0.3034	2.54e-22	3it9:A, 3it9:B, 3ita:A, 3ita:D, 3itb:C
5	6ntz:A	367	320	0.2244	0.2207	0.2531	1.21e-21	3beb:A, 3bec:A, 5j8x:A, 3mzd:A, 3mze:A, 3mzf:A, 1z6f:A
6	8isq:A	261	85	0.0748	0.1034	0.3176	0.090	8isp:A, 8isr:A, 8isr:B
7	5izd:A	494	83	0.0637	0.0466	0.2771	0.17	5izd:B, 5izd:C, 5izd:D, 5izd:G, 5izd:H
8	5l9w:b	649	143	0.1053	0.0586	0.2657	0.69
9	3hlf:A	425	58	0.0499	0.0424	0.3103	0.73	3hld:A, 3hle:A, 3hlg:A
10	8fgw:C	1342	92	0.0609	0.0164	0.2391	1.2	8fh3:C
11	8bp6:B	370	46	0.0388	0.0378	0.3043	2.7	8bp6:A, 5d5m:A, 5d5m:C, 5d7i:A, 5d7i:C, 5d7j:C, 5d7j:E, 5d7l:A, 4gup:A, 4gup:C, 4l4t:A, 4l4t:C, 4l4v:A, 4l4v:C, 4lcw:A, 4lcw:C, 7lli:C, 7lli:A, 7llj:C, 7llj:E, 6mwr:A, 4nqc:A, 4nqc:C, 4nqd:A, 4nqd:C, 4nqe:A, 4nqe:C, 4pj5:A, 4pj5:C, 4pj7:A, 4pj7:C, 4pj8:A, 4pj9:A, 4pja:A, 4pja:C, 4pjb:A, 4pjb:C, 4pjc:A, 4pjc:C, 4pjd:A, 4pjd:C, 4pje:A, 4pje:C, 4pjf:A, 4pjf:C, 4pjg:A, 4pjg:C, 4pjh:A, 4pjh:C, 4pji:A, 4pji:C, 4pjx:A, 4pjx:C, 6puc:A, 6puc:C, 6pud:A, 6pud:C, 6pue:A, 6pue:C, 6puf:A, 6puf:C, 6pug:A, 6pug:C, 6puh:A, 6puh:C, 6pui:A, 6pui:C, 6puj:A, 6puj:C, 6puk:A, 6puk:C, 6pul:A, 6pul:C, 6pum:A, 6pum:C, 6pvc:A, 6pvc:C, 6pvd:A, 6pvd:C, 7rno:A, 5u16:A, 5u16:C, 5u17:A, 5u17:C, 5u1r:C, 5u1r:A, 5u2v:A, 5u2v:C, 5u6q:C, 5u6q:A, 5u72:C, 7ufj:A, 7ufj:C, 7umg:A, 6w9u:A, 6w9u:C, 6xqp:A, 6xqp:C, 7zt2:A, 7zt4:A, 7zt5:A, 7zt7:A, 7zt8:A, 7zt9:A
12	6gaw:Ap	190	87	0.0609	0.1158	0.2529	3.6	5aj3:p, 5aj4:Ap, 6gaz:Ap, 7nqh:Ap, 7nql:Ap, 7nsi:Ap, 7nsj:Ap, 8oin:AO, 8oip:AO, 6ydp:Ap, 6ydw:Ap
13	5na1:A	398	99	0.0748	0.0678	0.2727	5.5	5na4:A
14	6klb:A	1118	67	0.0609	0.0197	0.3284	5.7	6klb:D
15	1ci9:A	377	66	0.0526	0.0504	0.2879	5.9	1ci9:B
16	4pxl:A	486	110	0.0693	0.0514	0.2273	6.5	4pxl:B
17	8tfo:A	390	88	0.0693	0.0641	0.2841	8.7	8tfo:B
18	4pz2:B	494	114	0.0637	0.0466	0.2018	9.1	4pz2:A, 4pz2:C, 4pz2:D

[Back]