Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QATDPFRAAVEFTLMPMLITNPHLPDNPIVFANPAFLKLTGYEADEVMGRNCRFLQGHGTDPAHVRAIKSAIAAEKPIDI
DIINYKKSGEAFWNRLHISPVHNANGRLQHFVSSQLDVTLELSRLVELEKERKTLSIETARSKDQLDYIVEVANIGFWTR
EFYSGKMTCSAECRRIYGFTPDEPVHFDTILDLVVLEDRMTVVQKAHQAVTGEPYSIEYRIVTRLGETRWLETRAKALTG
ENPLVLGIVQDVTERKKAEANKALVSREIAHRFKNSMAMVQSIANQTLRNTYDPEQANRLFSERLRALSQAHDMLLKENW
AGATIQQICATALAPFNSTFANRIHMSGPHLLVSDRVTVALSLAFYELATNAVKYGALSNEKGVINITWAIMEDKGEKKF
HMRWAESRGPEVMQPARRGFGQRLLHSVLAEELKAKCDVEFAASGLLIDVLAPITPEVFP

The query sequence (length=460) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6ph4:B 460 460 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
2 4hhd:A 152 101 0.1065 0.3224 0.4851 1.24e-32 4hhd:B
3 7qf2:AAA 117 100 0.1130 0.4444 0.5200 3.19e-32 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
4 2wkp:A 320 103 0.1130 0.1625 0.5049 3.84e-31 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
5 6hmj:A 359 106 0.1196 0.1532 0.5189 4.64e-31 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
6 4eeu:A 109 105 0.1130 0.4771 0.4952 1.79e-30 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
7 5hzh:A 320 146 0.1326 0.1906 0.4178 2.81e-30
8 7tbq:A 375 112 0.1174 0.1440 0.4821 4.16e-30 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
9 1g28:A 104 101 0.1000 0.4423 0.4554 8.40e-30 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
10 7tcd:A 436 113 0.1174 0.1239 0.4779 1.37e-29 4wf0:A, 4wf0:B
11 8qi8:A 110 102 0.1000 0.4182 0.4510 1.48e-29 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
12 2mwg:A 261 114 0.1087 0.1916 0.4386 2.87e-29 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
13 5hzi:A 476 103 0.1109 0.1071 0.4951 4.49e-29 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
14 4gcz:B 378 129 0.1196 0.1455 0.4264 9.42e-29 4gcz:A
15 6gb3:A 120 101 0.1043 0.4000 0.4752 2.39e-28 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
16 6t74:B 141 114 0.1043 0.3404 0.4211 2.68e-28 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
17 8pm1:A 109 103 0.1152 0.4862 0.5146 2.17e-27 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
18 3ue6:E 138 122 0.1000 0.3333 0.3770 4.90e-26 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
19 8c05:A 305 150 0.1174 0.1770 0.3600 6.57e-26
20 8a5r:AAA 206 185 0.1261 0.2816 0.3135 8.46e-26 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
21 2z6c:A 121 103 0.0913 0.3471 0.4078 1.02e-25 2z6c:B
22 6i21:A 135 107 0.0913 0.3111 0.3925 1.18e-25 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
23 7oo9:A 106 103 0.1130 0.4906 0.5049 6.14e-23 7oo9:B
24 7a6p:A 149 137 0.1043 0.3221 0.3504 6.98e-23 7a6p:B
25 7r5n:B 151 97 0.0870 0.2649 0.4124 4.84e-22 7r5n:A
26 4r3a:A 318 139 0.1065 0.1541 0.3525 3.59e-21 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
27 4r3a:A 318 220 0.1109 0.1604 0.2318 0.002 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
28 2z6d:A 118 100 0.0870 0.3390 0.4000 7.69e-21 2z6d:B
29 7yx0:A 166 121 0.0978 0.2711 0.3719 2.55e-20 7yx0:C
30 8a6x:B 368 106 0.0957 0.1196 0.4151 5.28e-20 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
31 7r56:A 137 115 0.0957 0.3212 0.3826 6.46e-20 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
32 8j68:A 129 94 0.0804 0.2868 0.3936 9.89e-19 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
33 4r3a:B 278 102 0.0848 0.1403 0.3824 4.74e-18
34 4wuj:C 145 103 0.0957 0.3034 0.4272 4.74e-18 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
35 4hj6:B 178 113 0.0891 0.2303 0.3628 5.48e-16 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
36 5svu:B 135 114 0.0761 0.2593 0.3070 8.42e-16 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
37 3hjk:A 150 103 0.0761 0.2333 0.3398 9.85e-15 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
38 7wa4:B 107 90 0.0674 0.2897 0.3444 1.87e-13
39 7yid:A 660 106 0.0630 0.0439 0.2736 5.27e-10 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
40 2gj3:A 119 115 0.0804 0.3109 0.3217 1.01e-08 2gj3:B
41 3ewk:A 227 95 0.0522 0.1057 0.2526 7.45e-06
42 3ewk:A 227 230 0.1043 0.2115 0.2087 3.01e-04
43 8js5:B 253 180 0.0978 0.1779 0.2500 3.52e-05 2cmn:A, 1dp6:A, 1dp8:A, 1dp9:A, 1drm:A, 8js5:A, 8js5:C, 8js5:D, 8js5:E, 8js5:F, 8js5:G, 8js5:H, 8js5:I, 8js5:J, 8js6:A, 8js6:B, 8js6:C, 8js6:D, 8js6:E, 8js6:F, 8js6:G, 8js6:H, 8js6:I, 8js6:J, 8js7:A, 8js7:B, 8js7:C, 8js7:D, 8js7:E, 8js7:F, 8js7:G, 8js7:H, 8js7:I, 8js7:J, 1lsv:A, 1lsw:A, 1lsx:A, 1lt0:A, 2owh:A, 2owj:A, 2vv6:A, 2vv6:D, 2vv6:B, 2vv6:C, 2vv7:A, 2vv7:B, 2vv7:C, 2vv7:D, 2vv8:A, 2vv8:D, 2vv8:B, 2vv8:C, 1xj2:A, 1xj3:A, 1xj4:A, 1xj4:B, 1xj6:A, 1xj6:B, 1y28:A
44 1s66:L 119 110 0.0696 0.2689 0.2909 5.51e-05 1s66:U, 1s67:L, 1s67:U, 1v9y:A, 1v9y:B, 1v9z:A, 1v9z:B, 1vb6:A, 1vb6:B
45 6pl0:B 608 84 0.0370 0.0280 0.2024 0.39 5akp:A, 5akp:B, 7l59:A, 6ndo:A, 6ndo:B, 6ndp:A, 6ndp:B, 6pl0:A, 5uyr:A, 5uyr:B
46 8dik:A 127 100 0.0543 0.1969 0.2500 0.56 8dik:B
47 7vnh:B 113 65 0.0478 0.1947 0.3385 0.94 7vnh:A
48 8jem:B 419 92 0.0500 0.0549 0.2500 1.1 8jem:A, 8jem:C, 8jem:D, 8jes:A, 8jes:B, 8jes:C, 8jes:D, 8jf2:A, 8jf2:B, 8jf2:C, 8jf2:D
49 6j7u:A 247 40 0.0348 0.0648 0.4000 1.2 6j7u:B, 6j7u:C, 6j7u:D
50 7v7w:B 288 97 0.0500 0.0799 0.2371 1.2
51 1d06:A 130 87 0.0500 0.1769 0.2644 1.7 1ew0:A
52 3vtf:A 432 46 0.0370 0.0394 0.3696 2.8
53 1fyk:A 88 41 0.0304 0.1591 0.3415 3.0 3hts:B
54 8ctl:D 401 39 0.0326 0.0374 0.3846 3.2 7utn:D, 7xht:A
55 8csz:D 494 39 0.0326 0.0304 0.3846 3.5
56 5awp:A 596 52 0.0370 0.0285 0.3269 3.5 5awq:A
57 4zpk:B 321 104 0.0609 0.0872 0.2692 6.2 8ck3:A, 8ck4:A, 8ck8:A, 6czw:A, 6d09:A, 6d0b:A, 6e3s:B, 6e3t:B, 6e3u:B, 3f1o:A, 4ghi:A, 4gs9:A, 3h7w:A, 3h82:A, 5tbm:A, 5ufp:A, 7w80:B, 6x21:A, 6x28:A, 6x2h:A, 6x37:A, 6x3d:A, 4xt2:C, 4zqd:B
58 3iv6:A 257 70 0.0435 0.0778 0.2857 6.6 3iv6:B, 3iv6:C, 3iv6:D
59 1x92:B 197 61 0.0370 0.0863 0.2787 9.2 1x92:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218