BioLiP

>protein
PWELTILHTNDVHSRLEQTSEDSSKCVDASRCMGGVARLFTKVQQIRRAEPNVLLLDAGDQYQGTIWFTVYKGAEVAHFM
NALRYDAMALGNHEFDNGVEGLIEPLLKEAKFPILSANIKAKGPLASQISGLYLPYKVLPVGDEVVGIVGYTSKETPFLS
NPGTNLVFEDEITALQPEVDKLKTLNVNKIIALGHSGFEMDKLIAQKVRGVDVVVGGHSNTFLYTGNPPSKEVPAGKYPF
IVTSDDGRKVPVVQAYAFGKYLGYLKIEFDERGNVISSHGNPILLDSSIPEDPSIKADINKWRIKLDDYSTQELGKTIVY
LDGSSQSCRFRECNMGNLICDAMINNNLRHADEMFWNHVSMCILNGGGIRSPIDERNDGTITWENLAAVLPFGGTFDLVQ
LKGSTLKKAFEHSVHRYGQSTGEFLQVGGIHVVYDLSRKPGDRVVKLDVLCTACAVPSYDPLKMDEVYKVILPNFLANGG
DGFQMIKDELLRHDSGDQDINVVSTYISKMKVIYPAVEGRIKFS

The query sequence (length=524) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7jv8:C	529	523	0.9905	0.9811	0.9924	0.0	7bbj:A, 7bbj:B, 4h1s:A, 4h1s:B, 4h1y:P, 4h2b:A, 4h2f:A, 4h2g:A, 4h2i:A, 6hxw:A, 6hxw:B, 7jv8:A, 7jv8:B, 7jv8:D, 7jv9:A, 7jv9:B, 7p9n:A, 7p9r:A, 7p9t:A, 7pa4:A, 7pb5:A, 7pba:A, 7pbb:A, 7pby:A, 7pcp:A, 7pd9:A, 7qga:A, 7qgl:A, 7qgm:A, 7qgo:A, 6s7f:A, 6s7h:A, 6tve:P, 6tvg:A, 6tvx:A, 6tw0:A, 6twa:A, 6twf:A, 6vc9:A, 6xue:A, 6xue:B, 6xug:A, 6xug:B, 6xuq:A, 6ye1:A, 6ye1:B, 6ye2:A, 6ye2:B, 6z9b:A, 6z9d:A
2	5h7w:B	529	524	0.6870	0.6805	0.6870	0.0	7d0v:A, 7d0v:B, 5h7w:A
3	2z1a:A	507	524	0.3874	0.4004	0.3874	4.00e-103
4	3ztv:A	565	529	0.3015	0.2796	0.2987	1.20e-48	3zu0:A
5	3zu0:B	505	506	0.2805	0.2911	0.2905	2.70e-45
6	3ivd:A	499	516	0.2595	0.2725	0.2636	4.22e-33	3ivd:B, 3ive:A
7	1ho5:A	525	545	0.2557	0.2552	0.2459	9.15e-28	1ho5:B, 1hp1:A, 1hpu:A, 1hpu:B, 1hpu:C, 1hpu:D, 1oi8:A, 1oi8:B, 1ush:A, 2ush:A, 2ush:B, 4wwl:A
8	3gve:A	334	321	0.1775	0.2784	0.2897	2.26e-23	3gve:B
9	4q7f:A	510	479	0.2042	0.2098	0.2234	3.65e-15	3qfk:A
10	5eqv:A	336	292	0.1450	0.2262	0.2603	3.10e-10
11	3jyf:A	336	252	0.1202	0.1875	0.2500	4.70e-10	3jyf:B
12	4uwq:A	548	206	0.1031	0.0985	0.2621	5.39e-09	4uwq:D, 4uwq:G, 4uwq:J, 2wdc:A, 2wdd:A, 2wde:A, 2wdf:A
13	5cot:A	340	85	0.0515	0.0794	0.3176	1.6	5cou:A, 6vt1:A, 6vt1:B, 6vt1:C, 6vt1:D, 6vt6:A, 6vt8:A, 6vt9:A, 6vtb:A, 6vtd:A, 6vte:A, 6vtf:A, 6vtf:B, 6vtf:C, 6vtf:D
14	6g90:T	462	81	0.0324	0.0368	0.2099	3.7	7dco:u, 4dgw:A, 5nrl:T, 5zwm:u
15	6clx:B	342	103	0.0534	0.0819	0.2718	4.0	6clx:A
16	6tj7:A	134	20	0.0210	0.0821	0.5500	5.1
17	7eap:A	755	67	0.0382	0.0265	0.2985	6.2	5yot:A, 5yot:B, 5yqs:A, 5yqs:B
18	8aaf:a	848	45	0.0210	0.0130	0.2444	7.0	8agt:a, 8agu:a, 8agv:a, 8agw:a, 8agx:a, 8agz:a

[Back]