BioLiP

>protein
PVSNAQLTQMFEHVLKLSRVDETQSVAVLKSHYSDPRTVNAAMEAAQRLKAKVYAVELPAFNHPTAMGNDMTAYCGDTAL
TGNLAAQRALEAADLVVDTMMLLHSPEQEQILKTGTRILLAVEPPEVLARMLPTEDDKRRVLAAETLLKQARSLHVRSKA
GSDFHAPLGQYPAVTEYGYADEPGRWDHWPSGFLFTWPNEDSAEGTLVLDVGDIILPFKNYCRERITLEIEKGFITGIHG
GFEAEYLRDYMKYFNDPEVYGISHIGWGLQPRAQWTAMGLHDRNDGMCMDARAFYGNFLFSTGPNTEVGGKRKTPCHLDI
PLRNCDIYLDDKAVVLAGDVVAPEESRAR

The query sequence (length=349) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7cn3:C	349	349	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7cn3:A, 7cn3:B, 7cn3:D, 7cn3:E, 7cn3:F, 7cnt:A, 7cnt:B, 7cnt:C, 7cnt:D, 7cnt:E, 7cnt:F, 7cup:A, 7cup:B, 7cup:C, 7cup:D, 7cup:E, 7cup:F
2	8bp8:e	397	36	0.0401	0.0353	0.3889	2.0	3gzu:J, 1qhd:A
3	4cg4:C	376	114	0.0860	0.0798	0.2632	5.6	4cg4:D, 4cg4:E, 4cg4:F
4	4jap:C	353	32	0.0401	0.0397	0.4375	5.9	4jao:C, 4jao:B, 4jap:B, 4jap:A, 4jaq:D, 4jaq:A, 4jaq:C, 4jaq:B, 4jd3:C, 4jd3:B
5	5anb:K	1120	76	0.0630	0.0196	0.2895	6.0	5anc:K
6	7myv:B	239	35	0.0372	0.0544	0.3714	7.3	7myv:A
7	8azw:h	288	45	0.0458	0.0556	0.3556	7.6	8b2l:h3, 7qiw:G, 7qiz:G
8	9gpj:A	184	84	0.0630	0.1196	0.2619	9.6	6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A

[Back]