BioLiP

>protein
PVRFVKETNRAKSPTRQSPGAAGYDLYSAYDYTIPPGERQLIKTDISMSMPKFCYGRIAPRSGLSLKGIDIGGGVIDEDY
RGNIGVILINNGKCTFNVNTGDRIAQLIYQRIYYPELEEVQSL

The query sequence (length=123) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2ol1:C	125	123	1.0000	0.9840	1.0000	3.41e-88	2oke:A, 2oke:C, 2oke:B, 2ol1:A, 2ol1:B
2	6ljj:A	150	123	0.6179	0.5067	0.6179	2.52e-52	3ara:A, 3ara:C, 3ara:B, 3arn:A, 3arn:C, 3arn:B, 3ehw:A, 3ehw:B, 3ehw:C, 3ehw:X, 3ehw:Y, 3ehw:Z, 5h4j:A, 2hqu:A, 2hqu:B, 2hqu:C
3	6mjk:A	144	123	0.4878	0.4167	0.4878	1.16e-37
4	5f9k:B	130	119	0.4959	0.4692	0.5126	1.24e-37	5f9k:A, 5f9k:C
5	4oop:B	142	119	0.5122	0.4437	0.5294	3.79e-37	4oop:A, 4oop:C
6	3f4f:A	138	103	0.4146	0.3696	0.4951	1.57e-30	3f4f:B, 3f4f:C, 3p48:A, 3p48:C, 3p48:B
7	4gcy:A	163	114	0.4146	0.3129	0.4474	8.91e-23	8cga:A, 5ect:A, 5edd:A, 3h6d:A, 3hza:A, 3i93:A, 3loj:A, 2py4:A, 1six:A, 1sjn:A, 1sjn:C, 1sjn:B, 1sm8:A, 1sm8:B, 1sm8:C, 1smc:A, 1smc:B, 1smc:C, 1snf:A, 1snf:C, 1snf:B
8	1f7r:A	133	98	0.3333	0.3083	0.4184	1.53e-19	1f7k:A, 1f7k:B, 1f7n:A, 1f7n:B, 1f7p:A, 1f7p:C, 1f7p:B, 1f7q:A, 1f7q:C, 1f7q:B
9	4wrk:A	158	149	0.3902	0.3038	0.3221	2.37e-19	4gv8:A, 4gv8:C, 4gv8:B, 4gv8:D, 4gv8:F, 4gv8:E, 4wrk:B, 4wrk:C, 4wrk:D, 4wrk:E, 4wrk:F
10	7n6s:C	147	111	0.3821	0.3197	0.4234	2.51e-18	7n6s:A, 7n6s:B, 7n6s:F, 7n6s:D, 7n6s:E
11	5cct:A	169	144	0.3659	0.2663	0.3125	6.33e-17	5cco:A, 5nyz:A, 5nz2:A, 3zez:A, 3zf0:A, 3zf1:A, 3zf4:A, 3zf5:A, 3zf6:A
12	8hrv:B	145	113	0.3333	0.2828	0.3628	2.99e-16	8hrv:A, 8hrv:C
13	5y5p:D	171	114	0.3496	0.2515	0.3772	7.57e-14	5y5p:A, 5y5p:B, 5y5p:C, 5y5p:E, 5y5p:F, 5y5q:A, 5y5q:B, 5y5q:C
14	3tp1:A	114	98	0.3089	0.3333	0.3878	1.86e-12	2d4n:A, 3tpn:A, 3tps:A, 3tpw:A, 3tpy:A, 3tq3:A, 3tq4:A, 3tq5:A, 3trl:A, 3trn:A, 3ts6:A, 3tsl:A, 3tta:A
15	6hde:B	152	117	0.3089	0.2500	0.3248	3.46e-12	1eu5:A, 1euw:A, 6hde:A, 6hde:C, 2hrm:A, 1rn8:A, 1rnj:A, 1seh:A, 1syl:A
16	6mao:A	137	114	0.3333	0.2993	0.3596	8.16e-11
17	4aoo:A	143	128	0.2927	0.2517	0.2812	7.18e-05	4ao5:A, 4ao5:B, 4ao5:C, 4ao5:D, 4ao5:E, 4ao5:F, 4aoo:B, 4aoo:C, 4aoo:D, 4aoz:A, 4aoz:B, 4aoz:C, 4apz:1, 4apz:Y, 4apz:2, 4apz:3, 4apz:4, 4apz:5, 4apz:7, 4apz:6, 4apz:8, 4apz:9, 4apz:a, 4apz:A, 4apz:C, 4apz:B, 4apz:D, 4apz:E, 4apz:F, 4apz:G, 4apz:I, 4apz:H, 4apz:J, 4apz:K, 4apz:L, 4apz:M, 4apz:N, 4apz:O, 4apz:P, 4apz:R, 4apz:Q, 4apz:S, 4apz:U, 4apz:T, 4apz:V, 4apz:W, 4apz:X, 4apz:Z, 4apz:b, 4apz:d, 4apz:c, 4apz:e, 4apz:g, 4apz:f, 4apz:h, 4apz:j, 4apz:i, 4apz:k, 4apz:m, 4apz:l, 4b0h:A, 4b0h:B, 4b0h:C, 2xce:A, 2xce:B, 2xce:C, 2xce:D, 2xce:E, 2xce:F, 2xy3:A, 2xy3:B, 2xy3:C, 2xy3:D, 2xy3:E, 2xy3:F
18	2y8c:C	136	90	0.1870	0.1691	0.2556	0.001	2y8c:B
19	3t64:A	153	110	0.2195	0.1765	0.2455	0.003	3t60:A, 3t60:B, 3t60:C, 3t64:B, 3t64:C, 3t6y:A, 3t6y:B, 3t6y:C, 3t70:A, 3t70:B, 3t70:C, 1vyq:A, 1vyq:B, 1vyq:C, 2y8c:A
20	6lj3:A	164	101	0.2195	0.1646	0.2673	0.006	6ky9:A, 6ky9:B, 6ky9:C, 6kz6:C, 6kz6:B, 6kz6:A, 6lis:A, 6lis:B, 6lis:C, 6lis:D, 6lis:F, 6lis:E, 6lj3:C, 6lj3:B
21	2bt1:A	254	100	0.2276	0.1102	0.2800	0.015	2bsy:A, 2we0:A, 2we1:A, 2we2:A, 2we3:A
22	6gl0:A	331	105	0.2276	0.0846	0.2667	0.46	6gl0:B, 6gl0:C
23	2j68:A	680	64	0.1463	0.0265	0.2812	1.0	2w6d:A, 2w6d:B
24	8ro0:A	2231	112	0.2358	0.0130	0.2589	2.7	8ro1:A
25	7ste:A	468	34	0.1057	0.0278	0.3824	3.0	8fs4:A, 7sh2:A
26	8dqw:A	522	34	0.1057	0.0249	0.3824	3.4	8fs3:A, 8fs5:A, 8fs6:A, 8fs7:A, 8fs8:A, 7sgz:A, 7st9:A, 7stb:A
27	5hab:B	463	27	0.1057	0.0281	0.4815	7.3	5haa:A, 5haa:B, 5hab:A, 6llb:A, 6llb:B, 5ws2:A, 5ws2:B
28	1jkn:A	165	25	0.0894	0.0667	0.4400	7.4
29	8i0p:A	2149	106	0.2114	0.0121	0.2453	8.3	8q7q:A, 8q7v:A, 8q7w:A

[Back]