BioLiP

>protein
PVGNLLHTAPCSFVVTDAVEPDQPIIYVNTVFEMVTGYRAEEVLGRNCRFLQCRGPFAKRRHPLVDSMVVSEIRKCIDEG
IEFQGELLNFRKDGSPLMNRLRLTPIYGDDDTITHIIGIQFFIETDIDLG

The query sequence (length=130) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5svu:B	135	130	0.9923	0.9556	0.9923	3.63e-93	5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
2	7wa4:B	107	115	0.6077	0.7383	0.6870	2.22e-54
3	2z6d:A	118	115	0.3692	0.4068	0.4174	1.72e-27	2z6d:B
4	2z6c:A	121	117	0.3385	0.3636	0.3761	5.14e-24	2z6c:B
5	8qi8:A	110	109	0.3538	0.4182	0.4220	1.82e-23	1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
6	8pm1:A	109	110	0.3308	0.3945	0.3909	6.06e-23	7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
7	6gb3:A	120	112	0.3615	0.3917	0.4196	6.49e-23	6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
8	6hmj:A	359	115	0.3538	0.1281	0.4000	1.76e-22	6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
9	6i21:A	135	121	0.3462	0.3333	0.3719	2.12e-22	6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
10	8a5r:AAA	206	125	0.3385	0.2136	0.3520	1.11e-21	8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
11	6t74:B	141	115	0.3385	0.3121	0.3826	2.27e-21	5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
12	8j68:A	129	118	0.3462	0.3488	0.3814	3.81e-21	8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
13	3hjk:A	150	114	0.3308	0.2867	0.3772	3.92e-21	6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
14	3ue6:E	138	121	0.3308	0.3116	0.3554	7.38e-21	3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
15	7r5n:B	151	116	0.3308	0.2848	0.3707	1.03e-19	7r5n:A
16	7oo9:A	106	110	0.3308	0.4057	0.3909	8.94e-19	7oo9:B
17	8c05:A	305	107	0.3308	0.1410	0.4019	9.73e-19
18	4hhd:A	152	120	0.3231	0.2763	0.3500	1.02e-18	4hhd:B
19	7r56:A	137	126	0.3385	0.3212	0.3492	2.78e-18	8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
20	4wuj:C	145	109	0.2923	0.2621	0.3486	6.53e-18	4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
21	2wkp:A	320	110	0.3154	0.1281	0.3727	7.95e-18	6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
22	7yx0:A	166	116	0.3077	0.2410	0.3448	1.28e-17	7yx0:C
23	7qf2:AAA	117	110	0.3154	0.3504	0.3727	2.05e-17	8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
24	4r3a:A	318	111	0.3000	0.1226	0.3514	3.55e-17	4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
25	4eeu:A	109	110	0.3077	0.3670	0.3636	5.12e-17	7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
26	7tbq:A	375	110	0.3077	0.1067	0.3636	8.38e-17	7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
27	5hzi:A	476	110	0.3077	0.0840	0.3636	1.06e-16	5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
28	5hzh:A	320	110	0.3077	0.1250	0.3636	1.08e-16
29	7tcd:A	436	110	0.3077	0.0917	0.3636	1.13e-16	4wf0:A, 4wf0:B
30	1g28:A	104	109	0.3077	0.3846	0.3670	1.74e-16	1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
31	6ph4:B	460	114	0.2692	0.0761	0.3070	2.10e-16	5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
32	2mwg:A	261	107	0.3000	0.1494	0.3645	8.83e-16	2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
33	7a6p:A	149	108	0.3154	0.2752	0.3796	9.68e-16	7a6p:B
34	4gcz:B	378	107	0.3000	0.1032	0.3645	2.54e-15	4gcz:A
35	8a6x:B	368	108	0.3154	0.1114	0.3796	1.16e-14	8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
36	4r3a:B	278	119	0.2846	0.1331	0.3109	5.59e-14
37	4hj6:B	178	111	0.2846	0.2079	0.3333	1.11e-12	4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
38	2gj3:A	119	112	0.2154	0.2353	0.2500	1.45e-06	2gj3:B
39	7yid:A	660	108	0.1769	0.0348	0.2130	0.001	7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
40	3ewk:A	227	102	0.1923	0.1101	0.2451	0.003
41	3ewk:A	227	71	0.1692	0.0969	0.3099	0.011
42	8dik:A	127	82	0.1615	0.1654	0.2561	0.006	8dik:B
43	1s66:L	119	92	0.1769	0.1933	0.2500	1.3	1s66:U, 1s67:L, 1s67:U, 1v9y:A, 1v9y:B, 1v9z:A, 1v9z:B, 1vb6:A, 1vb6:B
44	1d06:A	130	48	0.1308	0.1308	0.3542	1.3	1ew0:A
45	6vly:A	293	43	0.0846	0.0375	0.2558	9.6	6vly:B, 6vly:C, 6vly:D

[Back]