BioLiP

>protein
PVASEYLGGPGGDAFDDKALAQNGDITRIEMQCTDVATYIKLRYGKVDSRQWGWANENCIQWSKKGVKVVHELSSGEYIT
SAIVTYGKYVQSITFKTNKRTLPRCGTSATEKSVTVLIPGGLKYISGRWGCRIDGLRFHAKC

The query sequence (length=142) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5yrf:B	142	141	0.9718	0.9718	0.9787	2.07e-101	5yrf:A, 5yrg:A, 5yrg:B, 5yri:B, 5yri:A, 5yrj:A, 5yrj:B, 5yrl:A, 5yrl:B, 5yrm:B
2	1xxr:B	154	144	0.2606	0.2403	0.2569	0.001	1xxr:C, 1xxr:D
3	3ll2:A	123	45	0.0986	0.1138	0.3111	0.069	2guc:A, 2guc:B, 2gud:A, 2gud:B, 2hyq:A, 2hyq:B, 2hyr:A, 2hyr:B, 2nuo:A, 2nuo:B, 7ria:A, 7ria:B, 7rib:A, 7rib:B, 7rib:C, 7rkg:A, 7rkg:B, 7rki:A, 7rki:B
4	2d5f:B	385	52	0.1056	0.0390	0.2885	0.072	2d5f:A, 2d5h:A, 2d5h:C, 2d5h:D, 2d5h:E, 2d5h:F, 1od5:A, 1od5:B
5	6fly:A	144	127	0.1972	0.1944	0.2205	1.0	6fly:B, 6flz:A, 6flz:B
6	1zgs:A	442	82	0.1690	0.0543	0.2927	1.4	4mq0:A, 1zgs:B
7	6zu5:LB0	363	95	0.1620	0.0634	0.2421	1.8
8	1c3m:A	145	65	0.1479	0.1448	0.3231	2.0	1c3n:A
9	4mwz:B	265	77	0.1408	0.0755	0.2597	3.1	4iv0:A, 4iv0:B, 4mwz:A
10	8gdl:A	355	31	0.0845	0.0338	0.3871	4.0	8gdl:B
11	4ak4:A	133	28	0.0986	0.1053	0.5000	8.0	4ak4:C, 4ak4:E, 4ak4:G, 4ak4:I, 4ak4:K, 4ak4:M, 4ak4:O, 4akb:A, 4akb:C, 4akb:E, 4akb:G, 4akc:A, 4akc:C, 4akc:E, 4akc:G, 5bn6:E, 5bn6:F, 5bn6:H, 5bn6:G, 5j4t:A, 5j4t:C, 5j4t:E, 5j4t:G, 5j4x:A, 5j4x:C, 5j4x:E, 5j4x:G, 5j50:A, 5j50:C, 5j50:E, 5j50:G, 5j51:A, 5j51:C, 5j51:E, 5j51:G, 1jac:A, 1jac:C, 1jac:E, 1jac:G, 5jm1:A, 5jm1:C, 5jm1:E, 5jm1:G, 1ku8:A, 1ku8:C, 1ku8:E, 1ku8:G, 1kuj:A, 1kuj:C, 1kuj:E, 1kuj:G, 1m26:A, 1m26:C, 1m26:E, 1m26:G, 1pxd:A, 4r6n:A, 4r6n:C, 4r6n:E, 4r6n:G, 4r6o:A, 4r6o:C, 4r6o:E, 4r6o:G, 4r6p:A, 4r6p:C, 4r6p:E, 4r6p:G, 4r6q:A, 4r6q:C, 4r6q:E, 4r6q:G, 4r6r:A, 4r6r:C, 4r6r:E, 4r6r:G, 1toq:A, 1toq:C, 1toq:E, 1toq:G, 1tp8:A, 1tp8:C, 1tp8:E, 1tp8:G, 1ugw:A, 1ugw:C, 1ugw:E, 1ugw:G, 1ugx:A, 1ugy:A, 1ugy:C, 1ugy:E, 1ugy:G, 1uh0:A, 1uh0:C, 1uh0:E, 1uh0:G, 1uh1:A, 1uh1:C, 1uh1:E, 1uh1:G, 1ws4:A, 1ws4:C, 1ws4:E, 1ws4:G, 1ws5:A, 1ws5:C, 1ws5:E, 1ws5:G
12	1j4u:A	149	66	0.1549	0.1477	0.3333	8.2	1j4u:B, 1j4u:C, 1j4u:D, 1vbo:A, 1vbo:B, 1vbo:C, 1vbo:E, 1vbo:G, 1vbo:H, 1vbo:D, 1vbo:F, 1vbp:A, 1vbp:B
13	5ntt:A	277	54	0.0915	0.0469	0.2407	8.8	5ap0:A, 5ap1:A, 5ap2:A, 5ap3:A, 5ap4:A, 5ap5:A, 5ap6:A, 5ap7:A, 6b4w:A, 4bhz:A, 4bi0:A, 4bi1:A, 4bi2:A, 4c4e:A, 4c4f:A, 4c4g:A, 4c4i:A, 4c4j:A, 7chm:A, 7chn:A, 7cht:A, 7cil:A, 7cja:A, 7clh:A, 4cv8:A, 4cv9:A, 4cva:A, 5eh0:A, 5ehl:A, 5eho:A, 5ehy:A, 5ei2:A, 5ei6:A, 5ei8:A, 3gfw:A, 6h3k:A, 3h9f:A, 3hmn:A, 3hmo:A, 3hmp:A, 4js8:A, 4jt3:A, 5ljj:A, 7lqd:A, 5mrb:A, 6n6o:A, 5n7v:A, 5n84:A, 5n87:A, 5n93:A, 5n9s:A, 5na0:A, 5nad:A, 4o6l:A, 4o6l:B, 5o91:A, 6tn9:A, 6tnb:A, 6tnc:A, 6tnd:A, 3vqu:A, 3w1f:A, 3wyx:A, 3wyy:A, 3wzj:A, 3wzk:A, 2x9e:A, 4zeg:A, 2zmd:A
14	8dcl:A	185	23	0.0704	0.0541	0.4348	9.0	7anj:A, 7anj:B, 8dak:A, 8dak:B, 8dcl:B
15	4pe6:B	324	24	0.0704	0.0309	0.4167	9.2	4pe6:A
16	7nvm:e	540	47	0.0986	0.0259	0.2979	9.3	8i1u:E, 8i1u:M, 7nvl:E, 7nvl:e, 7nvm:E, 7nvn:E, 7nvn:e, 8sfe:e, 8sfe:E, 8sff:E, 8sff:e, 8sg8:E, 8sg8:e, 8sg9:E, 8sg9:e, 8sgc:E, 8sgc:e, 8sgl:E, 8sgl:e, 8sgq:E, 8sgq:e, 8sh9:E, 8sh9:e, 8sha:E, 8sha:e, 8shd:E, 8shd:e, 8she:E, 8she:e, 8shf:E, 8shf:e, 8shg:E, 8shg:e, 8shl:E, 8shl:e, 8shn:E, 8shn:e, 8sho:E, 8sho:e, 8shp:E, 8shp:e, 8shq:E, 8shq:e, 8sht:E, 8sht:e, 7trg:D, 7ttn:D, 7ttt:D, 7tub:D, 5uyx:A, 5uyx:C, 5uyz:A, 5uyz:B, 5uyz:C, 7x0s:E, 7x0s:e, 7x0v:E, 7x0v:e, 7x3j:E, 7x3j:e, 7x3u:E, 7x3u:e

[Back]