Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PSYTLHYFNHRGRAEICRMLFAAAGVQYNDRRIESSEWDSMRNKMPCHMMPMLELDNRTQIPQSMAMARYLAREFGFHGR
NNMEMARVDFISDCFYDILDDYMRMYFDGNCRMMFSSEKRMRFQETCRRILPFMERTLEMYSGGSQYFMGDQMTMADMMC
YCALENPLMEEPSMLSSYPKLMALRNRVMNHSKMSSYLQRRCRTEF

The query sequence (length=206) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5b7c:A 206 206 1.0000 1.0000 1.0000 9.75e-155
2 1gsq:A 202 206 0.3981 0.4059 0.3981 6.55e-56 2gsq:A
3 6n69:B 199 210 0.3301 0.3417 0.3238 6.37e-38 6n69:A, 1pd2:1, 1pd2:2, 5y9z:A, 5y9z:B
4 4ec0:B 200 206 0.3350 0.3450 0.3350 1.34e-37 5ais:A, 5ais:B, 5ais:C, 5ais:D, 5aiv:A, 5aiv:B, 5aiv:C, 5aiv:D, 5aix:B, 5aix:C, 2cvd:A, 2cvd:B, 2cvd:C, 2cvd:D, 4ec0:A, 4edy:A, 4edy:B, 4edz:A, 4edz:B, 4edz:C, 4edz:D, 3ee2:A, 4ee0:A, 4ee0:B, 1iyh:A, 1iyh:B, 1iyh:C, 1iyh:D, 1iyi:A, 1iyi:B, 1iyi:C, 1iyi:D, 7jr6:A, 7jr6:B, 7jr8:A, 7jr8:B, 3kxo:A, 3kxo:B, 6n4e:A, 1v40:A, 1v40:B, 1v40:C, 1v40:D, 2vcq:A, 2vcq:B, 2vcq:C, 2vcq:D, 2vcw:A, 2vcw:B, 2vcw:D, 2vcx:A, 2vcx:B, 2vcx:C, 2vcx:D, 2vcz:A, 2vcz:B, 2vcz:D, 2vd0:A, 2vd0:B, 2vd0:D, 2vd1:A, 2vd1:B, 2vd1:C, 2vd1:D, 3vi5:A, 3vi5:B, 3vi5:C, 3vi5:D, 3vi7:A, 3vi7:B, 3vi7:C, 3vi7:D, 6w58:A, 6w58:B, 6w8h:A, 6w8h:C, 5ywe:A, 5ywe:B, 5ywe:C, 5ywe:D, 5ywx:A, 5ywx:B, 5ywx:C, 5ywx:D, 5yx1:A, 5yx1:B, 5yx1:C, 5yx1:D, 6ztc:A, 6ztc:B
5 2vcz:C 177 206 0.3204 0.3729 0.3204 8.29e-35
6 3w8s:A 205 211 0.3252 0.3268 0.3175 1.18e-32
7 2on5:A 206 210 0.3204 0.3204 0.3143 1.48e-30 2on5:B, 2on5:C, 2on5:D, 2on5:E, 2on5:F, 2on5:G, 2on5:H
8 4q5f:D 206 213 0.3204 0.3204 0.3099 3.00e-28 4q5f:A
9 1zl9:A 207 214 0.3010 0.2995 0.2897 1.13e-26 1zl9:B
10 5d73:A 207 205 0.2670 0.2657 0.2683 3.76e-24 5d73:B
11 4q5r:A 202 209 0.2476 0.2525 0.2440 1.77e-23 4q5r:C, 4q5r:D, 4q5r:B, 4q5r:F, 4q5r:E
12 4ofm:B 206 210 0.2621 0.2621 0.2571 2.72e-23 4ofm:A, 4ofm:C, 4ofm:D, 4ofn:A, 4ofn:B
13 5h5l:B 199 203 0.2476 0.2563 0.2512 1.70e-22 5h5l:A
14 1tu7:A 208 200 0.2670 0.2644 0.2750 3.02e-22 1tu7:B, 1tu8:A, 1tu8:B, 1tu8:C, 1tu8:D
15 6ato:A 221 202 0.2864 0.2670 0.2921 1.07e-21 4acs:A, 4acs:B, 4acs:C, 4acs:D, 6ato:B, 6atr:A, 6atr:B, 7bib:A, 7bib:B, 1gse:A, 1gse:B, 1gsf:A, 1gsf:B, 1gsf:C, 1gsf:D, 1guh:A, 1guh:B, 1guh:C, 1guh:D, 4hj2:A, 4hj2:B, 3i69:A, 3i69:B, 3i69:C, 3i69:D, 3i6a:A, 3i6a:B, 3i6a:C, 3i6a:D, 3i6a:E, 3i6a:F, 3i6a:G, 3i6a:H, 3ik9:A, 3ik9:B, 3ik9:C, 3ik9:D, 3ik9:E, 3ik9:F, 3ik9:G, 3ik9:H, 5jcu:A, 5jcu:B, 5jcu:C, 5jcu:D, 1k3l:A, 1k3l:B, 1k3y:A, 1k3y:B, 3ktl:A, 3ktl:B, 3l0h:A, 3l0h:B, 1pkw:A, 1pkw:B, 1pl1:A, 1pl1:B, 1pl2:A, 1pl2:B, 2r3x:A, 2r3x:B, 2r6k:A, 2r6k:B, 1tdi:A, 1tdi:B, 1usb:A, 1usb:B, 2vct:A, 2vct:B, 2vct:C, 2vct:D, 2vcv:A, 2vcv:B, 2vcv:C, 2vcv:D, 2vcv:E, 2vcv:F, 2vcv:G, 2vcv:H, 2vcv:I, 2vcv:J, 2vcv:K, 2vcv:L, 2vcv:M, 2vcv:N, 2vcv:O, 2vcv:P, 2wju:A, 2wju:B, 2wju:C, 2wju:D, 2wju:E, 2wju:F, 2wju:G, 2wju:H, 6yaw:A, 6yaw:B, 1ydk:A, 1ydk:B
16 6zj9:A 220 204 0.2961 0.2773 0.2990 1.08e-21 6zjc:B, 6zjc:A, 6zjc:D, 6zjc:C
17 1m0u:A 203 207 0.2621 0.2660 0.2609 3.48e-21
18 3vpq:A 203 209 0.2621 0.2660 0.2584 1.95e-20 3vur:A
19 2wb9:A 210 212 0.2864 0.2810 0.2783 3.08e-20 2wb9:B, 2wdu:A, 2wdu:B
20 2c80:A 208 208 0.2573 0.2548 0.2548 1.03e-19 2c80:B, 2ca8:A, 2caq:A, 2f8f:A, 2f8f:B, 1oe7:A, 1oe7:B, 1oe8:A, 1oe8:B
21 1f3b:A 222 201 0.2864 0.2658 0.2935 2.07e-19 1ev4:A, 1ev4:C, 1ev4:D, 1ev9:A, 1ev9:C, 1ev9:D, 1f3a:A, 1f3a:B, 1f3b:B, 5lcz:A, 5lcz:B, 1ml6:A, 1ml6:B
22 2gsr:A 207 198 0.2621 0.2609 0.2727 2.43e-19 2gsr:B
23 2hnl:A 202 209 0.2718 0.2772 0.2679 7.25e-19 2hnl:B
24 8c5d:A 209 203 0.2816 0.2775 0.2857 8.06e-19 8c5d:B, 1glp:A, 1glp:B, 1glq:A, 1glq:B, 2glr:A, 2glr:B, 1gsy:A, 1gsy:B, 1gti:A, 1gti:B, 1gti:C, 1gti:D, 1gti:E, 1gti:F, 3o76:A, 3o76:B, 2oa7:A, 2oa7:B, 2oac:A, 2oac:B, 2oad:A, 2oad:B
25 6llx:B 215 203 0.2718 0.2605 0.2759 1.89e-18 10gs:A, 10gs:B, 20gs:A, 20gs:B, 11gs:A, 11gs:B, 12gs:A, 12gs:B, 13gs:A, 13gs:B, 17gs:A, 17gs:B, 18gs:A, 18gs:B, 19gs:A, 19gs:B, 2a2r:A, 2a2r:B, 2a2s:A, 2a2s:B, 6ap9:A, 6ap9:B, 1aqv:A, 1aqv:B, 1aqw:A, 1aqw:B, 1aqw:C, 1aqw:D, 1aqx:A, 1aqx:B, 1aqx:C, 1aqx:D, 7bia:A, 7bia:B, 3csh:A, 3csh:B, 3csi:A, 3csi:B, 3csi:C, 3csi:D, 3csj:B, 5dal:A, 5dal:B, 5dcg:B, 3dd3:A, 3dd3:B, 5ddl:A, 5ddl:B, 3dgq:A, 3dgq:B, 5djl:A, 5djl:B, 1gss:A, 1gss:B, 2gss:A, 2gss:B, 3gss:A, 3gss:B, 4gss:A, 4gss:B, 5gss:A, 5gss:B, 6gss:A, 6gss:B, 7gss:A, 7gss:B, 8gss:A, 8gss:B, 8gss:C, 9gss:A, 9gss:B, 3gus:A, 3gus:B, 3hjm:A, 3hjm:B, 3hjm:C, 3hjm:D, 3hjo:A, 3hjo:B, 3hkr:A, 3hkr:B, 3ie3:A, 3ie3:B, 5j41:A, 5j41:B, 2j9h:A, 2j9h:B, 5jcw:A, 5jcw:B, 1kbn:A, 1kbn:B, 3km6:A, 3km6:B, 3kmn:A, 3kmn:B, 3kmo:A, 3kmo:B, 5l6x:A, 5l6x:B, 1lbk:A, 1lbk:B, 6llx:A, 1md3:A, 1md3:B, 1md4:A, 1md4:B, 3n9j:A, 3n9j:B, 1pgt:A, 1pgt:B, 2pgt:A, 2pgt:B, 3pgt:A, 3pgt:B, 4pgt:A, 4pgt:B, 1px6:A, 1px6:B, 1px7:A, 1px7:B, 5x79:A, 5x79:B, 7xba:A, 7xba:B, 6y1e:A, 6y1e:B, 6y1e:C, 6y1e:D, 1zgn:A, 1zgn:B
26 1u3i:A 208 208 0.2573 0.2548 0.2548 6.69e-18
27 1b48:A 221 205 0.2864 0.2670 0.2878 1.54e-17 1b48:B
28 2aaw:C 211 209 0.2330 0.2275 0.2297 9.26e-17 2aaw:A, 3fr3:A, 3fr3:B, 3fr9:A, 3fr9:B, 3frc:A, 3frc:B, 1q4j:A, 1q4j:B
29 2ab6:A 217 206 0.2573 0.2442 0.2573 4.58e-16 2ab6:B, 2ab6:C, 2ab6:D, 2c4j:A, 2c4j:B, 2c4j:C, 2c4j:D, 3gur:A, 3gur:B, 3gur:C, 3gur:D, 1hna:A, 1hnb:A, 1hnb:B, 1hnc:A, 1hnc:B, 1hnc:C, 1hnc:D, 5hwl:A, 5hwl:B, 1xw5:A, 1xw5:B, 1ykc:A, 1ykc:B
30 3ik7:A 221 206 0.2573 0.2398 0.2573 2.23e-14 1gul:A, 1gul:B, 1gul:C, 1gul:D, 1gul:E, 1gul:F, 1gul:G, 1gul:H, 3ik7:B, 3ik7:C, 3ik7:D
31 1c72:A 217 206 0.2621 0.2488 0.2621 3.49e-14 1c72:B, 1c72:C, 1c72:D, 1gsu:A, 1gsu:B
32 1vf1:A 226 203 0.2330 0.2124 0.2365 4.63e-14 1vf2:A, 1vf2:B, 1vf3:A, 1vf3:B
33 7opy:F 217 206 0.2524 0.2396 0.2524 1.27e-12 7opy:A, 7opy:B, 7opy:C, 7opz:C, 7opz:A, 7opz:B, 7opz:D
34 2fhe:A 216 203 0.2379 0.2269 0.2414 1.02e-11 2fhe:B
35 5fwg:A 217 209 0.2476 0.2350 0.2440 1.94e-11 5fwg:B, 3fyg:A, 3fyg:B, 2gst:A, 2gst:B, 3gst:A, 3gst:B, 4gst:A, 4gst:B, 5gst:A, 5gst:B, 6gst:A, 6gst:B, 6gsu:A, 6gsu:B, 6gsv:A, 6gsv:B, 6gsw:A, 6gsw:B, 6gsx:A, 6gsx:B, 6gsy:A, 6gsy:B, 1mtc:A, 1mtc:B
36 3iso:A 218 208 0.2282 0.2156 0.2260 1.07e-10 3iso:B, 4l5l:A, 4l5l:B, 4l5o:A, 4l5o:C, 4l5o:B
37 2f3m:A 218 209 0.2427 0.2294 0.2392 1.16e-10 2f3m:B, 2f3m:C, 2f3m:D, 2f3m:E, 2f3m:F, 1xw6:A, 1xw6:B, 1xw6:C, 1xw6:D, 1xwk:A, 1xwk:B, 1xwk:C, 1yj6:A, 1yj6:B, 1yj6:C
38 1b4p:A 217 206 0.2524 0.2396 0.2524 1.57e-10
39 4w66:A 236 168 0.2136 0.1864 0.2619 2.11e-10 4w66:B
40 5an1:A 219 205 0.2184 0.2055 0.2195 1.01e-09 5an1:B, 5an1:C, 5an1:D, 5an1:E, 5an1:F, 5an1:G, 5an1:H, 7so8:A, 7so8:C, 7so8:E, 7so8:G, 7so8:H, 7so8:F, 7so8:B, 7so8:D
41 4q5q:A 218 213 0.2184 0.2064 0.2113 1.21e-09 4q5q:B
42 1fhe:A 214 205 0.2427 0.2336 0.2439 3.54e-09
43 4ai6:A 2650 171 0.2136 0.0166 0.2573 6.71e-08 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
44 4gsn:B 220 199 0.2379 0.2227 0.2462 7.59e-05
45 9f7k:A 222 176 0.2087 0.1937 0.2443 1.20e-04 9f7k:B
46 3zmk:B 222 199 0.2330 0.2162 0.2412 1.72e-04 4gsn:A, 4gsn:C, 4gsn:D, 2imi:A, 2imi:B, 2imk:A, 2imk:B, 3zmk:D, 3zml:A, 3zml:B
47 4q5n:A 220 192 0.1942 0.1818 0.2083 4.23e-04 4q5n:B
48 4png:B 223 177 0.1893 0.1749 0.2203 0.002 4png:A
49 4hi7:A 220 162 0.1796 0.1682 0.2284 0.003 4hi7:B
50 2nto:A 201 153 0.1893 0.1940 0.2549 0.010 2pvq:A
51 5ft3:B 221 197 0.2039 0.1900 0.2132 0.057 5ft3:A
52 1jlv:A 207 184 0.2039 0.2029 0.2283 0.076 1jlv:B, 1jlv:C, 1jlv:D, 1jlv:E, 1jlv:F
53 2gdr:A 202 153 0.1505 0.1535 0.2026 0.093 2dsa:A, 2dsa:B, 2dsa:C, 2dsa:D, 2gdr:B, 2gdr:C, 2gdr:D, 2gdr:E, 2gdr:F
54 4e8h:B 216 130 0.1408 0.1343 0.2231 0.098 4e8h:A, 4e8h:C, 4e8h:D
55 3ubl:A 212 144 0.1650 0.1604 0.2361 0.14 3ubl:B
56 3m3m:A 201 159 0.1893 0.1940 0.2453 0.28
57 3vwx:C 220 153 0.1893 0.1773 0.2549 0.35 3vwx:A, 3vwx:B, 3vwx:D
58 4mf6:A 240 47 0.0680 0.0583 0.2979 0.40 4mf5:A
59 4mpg:B 252 48 0.0728 0.0595 0.3125 0.41 1ljr:A, 1ljr:B, 3ljr:A, 3ljr:B, 4mpg:A
60 3g5i:A 305 77 0.0971 0.0656 0.2597 0.43 3g5i:B, 3g5i:C, 3g5i:D, 1yoe:A
61 7rhp:A 215 118 0.1456 0.1395 0.2542 0.62
62 7ebt:B 222 152 0.1893 0.1757 0.2566 0.69 7ebt:A, 7ebt:C, 7ebt:D, 7ebu:A, 7ebu:B, 7ebu:C, 7ebu:D, 7ebv:A, 7ebv:B, 7ebv:C, 7ebv:D, 7ebw:A, 7ebw:B, 7ebw:C, 7ebw:D
63 8agq:A 213 128 0.1505 0.1455 0.2422 0.74 5f07:A
64 3ppu:A 314 79 0.0874 0.0573 0.2278 1.0
65 6gcb:A 293 81 0.0922 0.0648 0.2346 1.1 6gcb:B, 6gcc:A, 6gcc:B
66 2cz2:A 212 125 0.1408 0.1368 0.2320 1.6
67 3f63:A 218 168 0.1942 0.1835 0.2381 1.7 3f63:B, 3f6d:A, 3f6d:B, 3g7i:B, 3g7j:A, 3g7j:B
68 4ikh:A 227 45 0.0583 0.0529 0.2667 1.8
69 1i1d:D 161 100 0.1068 0.1366 0.2200 1.9 1i12:A, 1i12:B, 1i12:C, 1i12:D, 1i1d:A, 1i1d:B, 1i1d:C
70 3ia4:A 161 74 0.1068 0.1366 0.2973 3.3 3ia4:B, 3ia4:C, 3ia4:D, 2zza:A, 2zza:B
71 8vdw:B 332 25 0.0388 0.0241 0.3200 3.5 8vdw:A
72 8i54:A 1113 67 0.0922 0.0171 0.2836 4.2
73 8ix7:B 221 21 0.0437 0.0407 0.4286 4.4 8ix7:A
74 4g10:A 263 111 0.1068 0.0837 0.1982 8.5 4yav:A
75 5meh:A 438 58 0.0874 0.0411 0.3103 8.6 4ayp:A, 4ayq:A, 4ayr:A, 8b5m:A, 5ne5:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218