Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PSSGELWGIHLMPPRILVECLLPNGMIVTLECLREATLITIKHELFKEARKYPLHQLLQDESSYIFVSVTQEAEREEFFD
ETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGFAIGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAM
YVYPPNVESSPELPKHIYNKLDKGQIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKINHDCVPEQVIAEAIRKKTRSMLLSSEQLKLCVL
EYQGKYILKVCGCDEYFLEKYPLSQYKYIRSCIMLGRMPNLMLMAKESLYSQLPMDCFTMPSYSRRISSTKSLWVINSAL
RIKILCATYVNVNIRDIDKIYVRTGIYHGGEPLCDNVNTQRVPCSNPRWNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSICSVKGRKG
AKEEHCPLAWGNINLFDYTDTLVSGKMALNLWPVPHGLEDLLNPIGVTGSNPNKETPCLELEFDWFSSVVKFPDMSVIEE
HANWSVSRLRENDKEQLKAISTRDPLSEITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIK
PEQAMELLDCNYPDPMVRGFAVRCLEKYLTDDKLSQYLIQLVQVLKYEQYLDNLLVRFLLKKALTNQRIGHFFFWHLKSE
MHNKTVSQRFGLLLESYCRACGMYLKHLNRQVEAMEKLINLTDILKQEKKDETQKVQMKFLVEQMRRPDFMDALQGFLSP
LNPAHQLGNLRLEECRIMSSAKRPLWLNWENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQDMLTLQIIRIMENIWQNQGLDLRML
PYGCLSIGDCVGLIEVVRNSHTIMQIQCKGGLKGALQFNSHTLHQWLKDKNKGEIYDAAIDLFTRSCAGYCVATFILGIG
DRHNSNIMVKDDGQLFHIDFGHFLDHKKRVPFVLTQDFLIVISKGAQECTKTREFERFQEMCYKAYLAIRQHANLFINLF
SMMLGSGMPELQSFDDIAYIRKTLALDKTEQEALEYFMKQMNDARHGG

The query sequence (length=1008) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4ykn:A 1205 1007 0.9861 0.8249 0.9871 0.0 4a55:A, 8am0:A, 8exl:A, 8exo:A, 8exu:A, 8exv:A, 5fi4:A, 8gub:A, 6gvf:A, 6gvg:A, 6gvi:A, 3hhm:A, 7jiu:A, 4jps:A, 4l23:A, 4l2y:A, 7mlk:A, 7myo:A, 4ovv:A, 8ow2:A, 7pg6:A, 6pys:A, 5sx9:A, 5sxj:A, 8tdu:A, 8tdu:C, 8tgd:A, 8tgd:C, 8ts9:A, 8tsa:A, 8tsb:A, 8tsc:A, 8tsd:A, 4tv3:A, 5uk8:A, 5ukj:A, 5ul1:A, 8v8h:A, 8v8h:C, 8v8i:A, 8v8i:C, 8v8j:A, 8v8j:C, 8v8v:A, 8v8v:C, 8w9a:A, 8w9b:A, 4waf:A, 5xgh:A, 5xgi:A, 3zim:A, 4zop:A
2 5swp:A 1060 1036 0.9881 0.9396 0.9614 0.0 6gvh:A, 5swt:A, 8v8u:A, 8v8u:C
3 5itd:A 995 1016 0.9663 0.9789 0.9587 0.0 5dxh:A, 8ilr:A, 8ils:A, 8ilv:A, 7k6m:A, 7k6o:A, 7r9v:A, 7r9y:A, 8sbc:A, 8sbj:A, 8twy:A, 7tz7:A, 5xgj:A
4 5dxh:D 981 1005 0.9613 0.9878 0.9642 0.0 8gua:A, 6oac:A
5 5ubr:A 887 928 0.8571 0.9741 0.9310 0.0 5dxt:A, 7k6n:A
6 7k71:A 843 898 0.8363 1.0000 0.9388 0.0 8gud:A
7 2y3a:A 976 1019 0.4067 0.4201 0.4024 0.0
8 7lq1:A 950 1000 0.4087 0.4337 0.4120 0.0 5ae8:A, 5ae9:A, 6eyz:A, 6ez6:A, 6g6w:A, 6hi1:A, 6hi2:A, 6hi9:A, 5l72:A, 7lm2:A, 6oco:A, 7pop:A, 7por:A, 7pos:A, 7pot:A, 6pyr:A, 6q6y:A, 6q73:A, 6q74:A, 6tnr:A, 6tns:A, 5vlr:A, 6zaa:A, 6zac:A, 6zad:A
9 6pyu:A 930 998 0.4058 0.4398 0.4098 0.0 8bcy:A, 5dxu:A, 6ftn:A, 7jis:A, 5m6u:A, 6mum:A, 5ncy:A, 5ncz:A, 6ocu:A, 7oi4:AAA, 7oij:AAA, 7oil:AAA, 7ois:AAA, 8s3r:A, 5t2l:A, 5t8f:A, 5ubt:A, 2wxg:A, 2wxk:A
10 2wxl:A 823 902 0.3601 0.4411 0.4024 0.0 6gy0:A, 5i4u:A, 5i6u:A, 6mul:A, 6mul:B, 6mum:B, 5ngb:A, 7r26:A, 5t27:A, 5t28:A, 5t2b:A, 5t2d:A, 5t2g:A, 5t2i:A, 5t2m:A, 5t7f:A, 5t7f:B, 5t8i:A, 2wxf:A, 2wxh:A, 2wxi:A, 2wxj:A, 2wxm:A, 2wxn:A, 2wxo:A, 2wxp:A, 2wxq:A, 2x38:A, 4xe0:A
11 4bfr:A 855 916 0.3591 0.4234 0.3952 0.0 4bfr:B
12 5o83:A 794 900 0.3492 0.4433 0.3911 0.0 4ajw:B, 6dgt:A, 5is5:A, 7r2b:A, 4v0i:B
13 4ajw:A 765 900 0.3433 0.4523 0.3844 0.0 4v0i:A
14 1e7u:A 872 925 0.3393 0.3922 0.3697 5.87e-171 4anv:A, 3ibe:A
15 8sob:A 1005 938 0.3373 0.3383 0.3625 7.23e-169 8soa:A, 8soc:A
16 3zw3:A 831 917 0.3234 0.3923 0.3555 8.19e-169 2a4z:A, 4fhj:A, 4fhk:A, 6fh5:A, 6gq7:A, 4hvb:A, 5jha:A, 5jhb:A, 7jwe:A, 4kzc:A, 3lj3:A, 3mjw:A, 3nzu:A, 3p2b:A, 3qk0:A, 3sd5:A, 5t23:A, 6t3b:A, 6t3c:A, 4wwo:A, 4wwp:A, 6xrm:A, 6xrn:A, 3zvv:A
17 1e8w:A 851 925 0.3353 0.3972 0.3654 8.30e-167 2a5u:A, 4anu:A, 4anw:A, 4anx:A, 4aof:A, 3apc:A, 3apd:A, 3apf:A, 6aud:A, 6c1s:A, 2chw:A, 2chx:A, 2chz:A, 3csf:A, 3cst:A, 3dbs:A, 4dk5:A, 3dpd:A, 1e7v:A, 1e8x:A, 1e8z:A, 1e90:A, 5eds:A, 3ene:A, 4ezj:A, 4ezk:A, 4ezl:A, 4f1s:A, 4fa6:A, 4fad:A, 4fjy:A, 4fjz:A, 4flh:A, 4ful:A, 4g11:A, 5g2n:A, 5g55:A, 4gb9:A, 4hle:A, 4j6i:A, 7jwz:A, 5kae:A, 7kke:A, 4kz0:A, 3l08:A, 3l13:A, 3l16:A, 3l17:A, 3l54:A, 3ml8:A, 3ml9:A, 3nzs:A, 3oaw:A, 5oq4:A, 3pre:A, 3prz:A, 3ps6:A, 4ps3:A, 4ps7:A, 4ps8:A, 3qaq:A, 3qar:A, 3r7q:A, 3r7r:A, 3s2a:A, 8sc8:A, 3t8m:A, 3tjp:A, 3tl5:A, 4urk:A, 2v4l:A, 4wwn:A, 6xrl:A, 4xx5:A, 4xz4:A, 7z61:A
18 7jx0:A 801 918 0.3244 0.4082 0.3562 3.68e-163 3qjz:A
19 8sod:A 941 932 0.3244 0.3475 0.3509 6.26e-151 8soe:A
20 7bi6:A 829 774 0.2530 0.3076 0.3295 2.26e-116 8a9i:A, 7bi9:A, 7z74:A, 7z75:A
21 7bi2:A 1021 727 0.2351 0.2321 0.3260 6.72e-106
22 7bi2:A 1021 29 0.0119 0.0118 0.4138 8.8
23 6ykg:AAA 559 553 0.1508 0.2719 0.2749 1.28e-62 5anl:A, 5enn:A, 5enn:B, 6i3u:A, 3ls8:A, 3ls8:B, 4oys:A, 4ph4:B, 7rsj:A, 7rsp:A, 7rsp:B, 7rsv:A, 7rsv:B, 8rxr:A, 8rxr:B, 4uwf:A, 4uwg:A, 4uwh:A, 4uwk:A, 4uwl:A
24 2x6k:A 550 543 0.1567 0.2873 0.2910 1.20e-58 2x6f:A, 2x6f:B, 2x6i:A, 2x6i:B, 2x6j:A, 2x6j:B, 2x6k:B
25 6bq1:E 1510 485 0.1349 0.0901 0.2804 2.97e-39 6bq1:A
26 4d0l:E 479 249 0.0714 0.1503 0.2892 3.21e-25 5c4g:E, 4d0l:A, 4d0l:C, 4d0m:A, 4d0m:C, 4d0m:G, 4d0m:I, 4d0m:M, 4d0m:O, 4d0m:Q, 4d0m:S, 4d0m:W, 4d0m:Y, 4d0m:c, 4d0m:g, 5euq:E, 5fbl:A, 5fbq:A, 5fbr:A, 5fbv:A, 5fbw:A, 6gl3:A, 8q6f:A, 8q6g:A, 8q6h:A, 8vof:A, 4wae:A, 4wag:A
27 6s8f:F 2571 221 0.0605 0.0237 0.2760 7.91e-13 7mq8:NR, 7mq9:NR, 7mqa:NR, 6s8f:H
28 7nfe:A 3585 242 0.0605 0.0170 0.2521 1.30e-07
29 8rch:A 2036 257 0.0605 0.0300 0.2374 2.30e-07 8rch:B, 8rck:B, 8rcn:B
30 6bcu:A 2204 257 0.0605 0.0277 0.2374 2.38e-07 6bcu:B, 6bcx:A, 6bcx:B, 4drh:B, 4drh:E, 4dri:B, 4drj:B, 8er6:B, 8er6:D, 8er6:F, 8er7:B, 8er7:D, 8er7:F, 8era:A, 9f44:A, 9f44:B, 9f45:A, 9f45:B, 1fap:B, 2fap:B, 3fap:B, 4fap:B, 5flc:B, 5flc:F, 5gpg:B, 4jsp:B, 4jsp:A, 4jsv:B, 4jsv:A, 4jsx:B, 4jsx:A, 4jt5:B, 4jt5:A, 4jt6:B, 4jt6:A, 6m4u:B, 6m4u:F, 6m4w:G, 6m4w:H, 6m4w:I, 1nsg:B, 7pe7:B, 7pe7:A, 7pe8:A, 7pe9:A, 7pea:B, 7pea:A, 7peb:A, 7pec:A, 8ppz:B, 7uxc:A, 7uxh:A, 7uxh:C, 5wbh:C, 5wbh:D, 5wbu:B, 5wbu:A, 6zwo:B
31 6zwm:B 2185 257 0.0605 0.0279 0.2374 2.55e-07 6zwm:A
32 7nfc:A 3562 244 0.0615 0.0174 0.2541 2.70e-07 8bh3:S, 8bh3:A, 8bhv:A, 8bhv:F, 8bhy:A, 8bhy:S, 8bot:F, 8bot:S, 7nfc:F
33 8bot:A 3528 240 0.0605 0.0173 0.2542 3.09e-07
34 3jbz:A 960 216 0.0526 0.0552 0.2454 3.81e-07
35 7k0y:A 3669 74 0.0298 0.0082 0.4054 1.03e-05
36 7k0y:A 3669 95 0.0258 0.0071 0.2737 0.77
37 7k1k:A 3604 74 0.0298 0.0083 0.4054 1.05e-05 7k1b:A
38 7k1k:A 3604 95 0.0258 0.0072 0.2737 0.83 7k1b:A
39 7sud:A 3740 74 0.0298 0.0080 0.4054 1.06e-05
40 7sud:A 3740 95 0.0258 0.0070 0.2737 0.82
41 7z87:A 3689 74 0.0298 0.0081 0.4054 1.09e-05
42 7z87:A 3689 95 0.0258 0.0070 0.2737 0.76
43 7su3:A 3802 74 0.0298 0.0079 0.4054 1.09e-05
44 7su3:A 3802 95 0.0258 0.0068 0.2737 0.77
45 8eza:L 3720 74 0.0298 0.0081 0.4054 1.10e-05 8eza:C, 7lt3:C, 7lt3:L
46 8eza:L 3720 95 0.0258 0.0070 0.2737 0.75 8eza:C, 7lt3:C, 7lt3:L
47 8ezb:C 3724 74 0.0298 0.0081 0.4054 1.10e-05 8ezb:L
48 8ezb:C 3724 95 0.0258 0.0070 0.2737 0.81 8ezb:L
49 6zhe:A 3768 74 0.0298 0.0080 0.4054 1.10e-05
50 6zhe:A 3768 95 0.0258 0.0069 0.2737 0.77
51 7k1n:A 3634 74 0.0298 0.0083 0.4054 1.11e-05 7z88:A
52 7k1n:A 3634 95 0.0258 0.0072 0.2737 0.79 7z88:A
53 5y3r:C 3636 65 0.0278 0.0077 0.4308 1.11e-05
54 5y3r:C 3636 95 0.0258 0.0072 0.2737 0.75
55 7k1j:A 3584 74 0.0298 0.0084 0.4054 1.11e-05 7k19:A
56 7k1j:A 3584 95 0.0258 0.0073 0.2737 0.83 7k19:A
57 8ez9:L 3662 74 0.0298 0.0082 0.4054 1.12e-05 8ez9:C
58 8ez9:L 3662 95 0.0258 0.0071 0.2737 0.83 8ez9:C
59 6zhe:F 3731 74 0.0298 0.0080 0.4054 1.13e-05
60 6zhe:F 3731 95 0.0258 0.0070 0.2737 0.81
61 7sgl:A 3852 74 0.0298 0.0078 0.4054 1.15e-05
62 7sgl:A 3852 95 0.0258 0.0067 0.2737 0.82
63 7k17:B 3645 74 0.0298 0.0082 0.4054 1.15e-05 7k17:A
64 7k17:B 3645 95 0.0258 0.0071 0.2737 0.81 7k17:A
65 6zha:A 3707 74 0.0298 0.0081 0.4054 1.15e-05 6zh8:A
66 6zha:A 3707 95 0.0258 0.0070 0.2737 0.83 6zh8:A
67 7otm:A 3656 74 0.0298 0.0082 0.4054 1.17e-05 7otp:A, 7otv:A, 7otw:A, 7oty:A
68 7otm:A 3656 95 0.0258 0.0071 0.2737 0.84 7otp:A, 7otv:A, 7otw:A, 7oty:A
69 7sic:A 2773 88 0.0308 0.0112 0.3523 1.54e-05 8oxo:A, 8oxo:B, 8oxp:A, 8oxp:B, 7sic:B, 7sid:A, 7sid:C
70 8oxm:A 2748 88 0.0308 0.0113 0.3523 1.57e-05 8oxm:B
71 6z2w:E 2325 268 0.0675 0.0292 0.2537 1.59e-05 6z2w:F, 6z2x:E, 6z2x:F, 6z3a:F, 6z3a:E
72 7ni5:A 2791 88 0.0308 0.0111 0.3523 1.64e-05 7ni4:A, 7ni4:B, 7ni5:B, 7ni6:A, 7ni6:B, 8oxq:A, 8oxq:B
73 6sl1:A 2652 234 0.0556 0.0211 0.2393 3.03e-05 6sky:A, 6sky:B
74 6skz:A 2638 234 0.0556 0.0212 0.2393 3.38e-05 6sl0:A, 6sl0:B
75 7pw9:A 1952 63 0.0208 0.0108 0.3333 0.001 7pw4:A, 7pw5:A, 7pw6:A, 7pw7:A, 7pw8:A, 6z3r:A
76 6syt:A 1896 63 0.0198 0.0105 0.3175 0.008
77 4nc7:A 79 46 0.0169 0.2152 0.3696 2.0
78 5el7:59 74 55 0.0208 0.2838 0.3818 3.7 5e7k:59, 5e81:59, 5el4:59, 5el5:59, 5el6:59
79 3hxs:A 117 66 0.0208 0.1795 0.3182 5.6 3hyp:A
80 8jd5:2 785 91 0.0248 0.0318 0.2747 6.1 5cni:A, 5cni:B, 5cnj:A, 5cnj:B, 7e9g:R, 7e9g:S, 8jcu:2, 8jcv:2, 8jcw:2, 8jcx:2, 8jcy:2, 8jcz:2, 8jd0:2, 8jd1:2, 8jd2:2, 8jd3:2, 5kzn:A, 5kzq:A, 7mtr:B, 7mtr:A, 7mts:A, 7mts:B, 4xaq:A, 4xaq:B, 4xas:A, 4xas:B
81 3h0l:A 478 76 0.0198 0.0418 0.2632 8.9 3h0l:D, 3h0l:G, 3h0l:J, 3h0l:M, 3h0l:P, 3h0l:S, 3h0l:V, 3h0m:A, 3h0m:D, 3h0m:G, 3h0m:J, 3h0m:M, 3h0m:P, 3h0m:S, 3h0m:V, 3h0r:A, 3h0r:D, 3h0r:G, 3h0r:J, 3h0r:M, 3h0r:P, 3h0r:S, 3h0r:V
82 6pqp:A 615 194 0.0417 0.0683 0.2165 9.3 7or0:A, 7or0:B, 7or0:C, 7or0:D, 7or1:A, 7or1:B, 7or1:C, 7or1:D, 6pqo:D, 6pqo:A, 6pqo:B, 6pqo:C, 6pqp:B, 6pqp:D, 6pqp:C, 6pqq:A, 6pqq:D, 6pqq:B, 6pqq:C, 6v9v:A, 6v9v:B, 6v9v:D, 6v9v:C, 6v9w:A, 6v9w:B, 6v9w:D, 6v9w:C
83 7epb:A 779 91 0.0248 0.0321 0.2747 10.0 7epb:B, 7mtq:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218