Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PSLAATVRQDFPILNQEINGHPLVYLDNAATSQKPRAVLEKLMHYYENDNANVGAHQLSVRATDAYEAVRNKVAKFINAR
SPREIVYTRNATEAINLVAYSWGMNNLKAGDEIITTVMEHHSNLVPWQMVAAKTGAVLKFVQLDEQESFDLEHFKTLLSE
KTKLVTVVHISNTLGCVNPAEEIAQLAHQAGAKVLVDACQSAPHYPLDVQLIDCDWLVASGHKMCAPTGIGFLYGKEEIL
EAMPPFFGGGEMIAEVFFDHFTTGELPHKFEAGTPAIAEAIALGAAVDYLTDLGMENIHNYEVELTHYLWQGLGQIPQLR
LYGPNPKHGDRAALASFNVAGLHASDVATMVDQDGIAIRSGHHCTQPLHRLFDASGSARASLYFYNTKEEIDLFLQSLQA
TIRFFS

The query sequence (length=406) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1t3i:A 406 406 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 1t3i:B
2 7cep:A 414 402 0.5000 0.4903 0.5050 6.80e-148 7ceo:A, 7cer:A, 7ces:A, 7e6b:A, 7e6c:A, 7e6e:A, 7e6f:A, 5j8q:A, 6kfz:A, 7xej:A, 7xek:A, 7xen:A, 7xep:A, 7xet:A, 5xt5:A, 5xt5:B, 5xt6:A, 5xt6:B, 5zsk:A, 5zso:A
3 6ndn:A 406 402 0.4803 0.4803 0.4851 1.18e-134 1c0n:A, 5db5:A, 5db5:B, 1i29:A, 1jf9:A, 1kmj:A, 1kmk:A, 6mr2:A, 6mr6:A, 6mre:A, 6mrh:A, 6mri:A, 6o10:A, 6o11:A, 6o12:A, 6o13:A, 7rrn:A, 7ruj:A, 7rw3:A, 6uy5:A, 6uy5:B
4 8odq:D 410 409 0.4286 0.4244 0.4254 4.97e-113 8odq:B
5 7tlm:A 415 404 0.4261 0.4169 0.4282 7.08e-107 7tlp:B, 7tlp:C, 7tlp:D, 7tlp:E, 7tlp:F, 7tlq:A, 7tlq:B, 7tlr:A, 7tlr:B
6 7tlp:A 391 403 0.4089 0.4246 0.4119 1.55e-100
7 5ft8:A 401 404 0.4064 0.4115 0.4084 3.62e-98 5ft4:A, 5ft4:B, 5ft5:A, 5ft5:B, 5ft6:A, 5ft6:B, 5ft8:C, 5ft8:E, 5ft8:G, 5ft8:I, 5ft8:K, 5ft8:M, 5ft8:O, 4lw2:A, 4lw2:B, 4lw2:C, 4lw4:A, 4lw4:B
8 5b7u:A 402 403 0.4089 0.4129 0.4119 5.02e-95 5b7u:B, 5b87:A, 5b87:B, 5b89:A, 5b89:B
9 6a6e:A 422 419 0.4113 0.3957 0.3986 1.48e-94 6a6e:B, 6a6e:C, 6a6e:D, 6a6g:A, 6a6g:B
10 1ecx:B 365 391 0.2660 0.2959 0.2762 1.42e-32 1ecx:A, 1eg5:A, 1eg5:B
11 3lvm:B 394 394 0.2562 0.2640 0.2640 3.10e-28 3lvj:A, 3lvj:B, 3lvk:A, 3lvl:B, 3lvm:A, 1p3w:B, 1p3w:A
12 5wt6:A 366 389 0.2635 0.2923 0.2751 1.07e-26 7cet:A, 7ceu:A, 6kg0:A, 6kg1:A, 5wt2:A, 5wt4:A, 7xeq:A, 7xes:A
13 4eb5:A 379 389 0.2463 0.2639 0.2571 5.21e-26 4eb5:B, 4eb7:A, 4eb7:B, 4hvk:A, 4r5f:A
14 6nzu:A 402 392 0.2562 0.2587 0.2653 1.27e-22 6nzu:E, 8pk8:A, 8pk9:A, 8pka:A, 7rtk:A, 8tvt:A, 6uxe:A, 6w1d:A, 6wi2:A, 6wih:A, 5wkp:A, 5wkp:E, 5wlw:A, 5wlw:E
15 3vax:A 358 235 0.1700 0.1927 0.2936 1.56e-22 3vax:B
16 5zss:A 388 397 0.2365 0.2474 0.2418 3.46e-20
17 6m4j:A 347 268 0.1798 0.2104 0.2724 1.22e-19 6m4j:B
18 5wgb:A 291 249 0.1650 0.2302 0.2691 1.39e-18
19 3gzc:A 403 417 0.2611 0.2630 0.2542 1.17e-16 3gzc:B, 3gzd:A, 3gzd:B, 3gzd:C, 3gzd:D
20 3a9y:A 403 423 0.2635 0.2655 0.2530 1.01e-15 3a9x:A, 3a9x:B, 3a9y:B, 3a9z:A, 3a9z:B
21 1n31:A 386 407 0.2562 0.2694 0.2555 1.36e-15 1elq:A, 1elq:B, 1elu:A, 1elu:B, 1n2t:A, 1n2t:B, 1n31:B
22 8irk:A 379 224 0.1502 0.1609 0.2723 7.78e-10 8irk:B, 8irk:C, 8irk:D, 8iry:A, 8iry:B, 8iry:C, 8iry:D, 8irz:A, 8irz:B, 8is0:A, 8is0:B
23 5hh9:A 390 336 0.1847 0.1923 0.2232 1.96e-08 5hh9:B, 5i90:A, 5i90:B
24 1m32:B 362 79 0.0640 0.0718 0.3291 4.06e-07 1m32:A, 1m32:C, 1m32:D, 1m32:E, 1m32:F
25 5x6b:J 377 172 0.1084 0.1167 0.2558 4.83e-06 5x6b:I
26 2yri:A 352 77 0.0567 0.0653 0.2987 1.37e-05 2yri:B, 2yrr:A, 2yrr:B
27 1vjo:A 377 138 0.0813 0.0875 0.2391 2.37e-04
28 2ch1:A 388 208 0.1084 0.1134 0.2115 3.14e-04 2ch1:D, 2ch1:B, 2ch1:C, 2ch2:A, 2ch2:D, 2ch2:B, 2ch2:C
29 1qz9:A 404 348 0.1700 0.1708 0.1983 3.31e-04
30 6pk3:B 400 207 0.1281 0.1300 0.2512 0.001 6pk1:A, 6pk1:B, 6pk3:A
31 3kgw:B 388 173 0.1010 0.1057 0.2370 0.003 3kgw:A, 3kgx:A
32 6mfb:D 386 103 0.0640 0.0674 0.2524 0.005 6mfb:A, 6mfb:B, 6mfb:C
33 3uwc:A 371 104 0.0690 0.0755 0.2692 0.007
34 6pd2:C 616 98 0.0665 0.0438 0.2755 0.007 6pd1:A, 6pd1:B, 6pd1:D, 6pd2:A, 6pd2:B, 6pd2:D
35 8ovh:A 400 96 0.0665 0.0675 0.2812 0.010 8ovh:B, 8ovh:C, 8ovh:D
36 2z9v:A 392 163 0.0936 0.0969 0.2331 0.011 2z9v:B, 2z9w:A, 2z9w:B, 2z9x:A, 2z9x:B
37 9azb:A 396 237 0.1232 0.1263 0.2110 0.018 9aza:A
38 5k8b:A 394 100 0.0665 0.0685 0.2700 0.018 5k8b:B, 5k8b:C, 5k8b:D
39 7kb1:A 428 95 0.0714 0.0678 0.3053 0.028 7kb1:B, 7kb1:C, 7kb1:D
40 8erb:K 429 98 0.0665 0.0629 0.2755 0.032 8erb:A, 8erb:C, 8erb:B, 8erb:D, 8erb:G, 8erb:H, 8erb:F, 8erb:P, 8erb:I, 8erb:J, 8erb:M, 8erb:E, 8erb:Q, 8erb:N, 8erb:L, 8erj:A, 8erj:B, 8erj:C, 8erj:D, 8erj:E, 8erj:F, 8erj:H, 8erj:G
41 4k2m:A 442 187 0.1108 0.1018 0.2406 0.037 4k2i:A, 4k2i:B, 4k2m:B
42 2ctz:A 421 90 0.0591 0.0570 0.2667 0.065 2ctz:B
43 3bb8:A 420 148 0.0862 0.0833 0.2365 0.14 3bb8:B
44 3aej:A 387 71 0.0493 0.0517 0.2817 0.16 3aej:D, 3aej:B, 3aej:C, 3ael:A, 3ael:D, 3ael:B, 3ael:C, 3aem:A, 3aem:D, 3aem:B, 3aem:C, 3aen:A, 3aen:D, 3aen:B, 3aen:C, 3aeo:A, 3aeo:D, 3aeo:B, 3aeo:C, 3aep:A, 3aep:D, 3aep:B, 3aep:C
45 1u08:A 382 136 0.0936 0.0995 0.2794 0.19 1u08:B
46 1cs1:D 384 144 0.1010 0.1068 0.2847 0.40
47 3frk:A 365 113 0.0690 0.0767 0.2478 0.42 3frk:B
48 8wko:A 425 101 0.0640 0.0612 0.2574 0.62 8wko:B, 8wkr:A, 8wkr:B, 8wkr:C, 8wkr:D
49 1ibj:A 380 152 0.0813 0.0868 0.2171 0.76 1ibj:C
50 2l51:A 102 87 0.0567 0.2255 0.2644 0.88 2l51:B
51 2huf:A 385 103 0.0591 0.0623 0.2330 0.92 2huf:B, 2hui:A, 2hui:B, 2huu:A, 2huu:B
52 6hrh:A 429 60 0.0443 0.0420 0.3000 1.0 6hrh:B, 5qqq:B, 5qqq:A, 5qqr:B, 5qqr:A, 5qqs:B, 5qqs:A, 5qqt:B, 5qqt:A, 5qqu:B, 5qqu:A, 5qqv:B, 5qqv:A, 5qqw:B, 5qqw:A, 5qqx:B, 5qqx:A, 5qqy:B, 5qqy:A, 5qqz:B, 5qqz:A, 5qr0:B, 5qr0:A, 5qr1:B, 5qr1:A, 5qr2:B, 5qr2:A, 5qr3:B, 5qr3:A, 5qr4:B, 5qr4:A, 5qr5:B, 5qr5:A, 5qr6:B, 5qr6:A, 5qr7:B, 5qr7:A, 5qr8:B, 5qr8:A, 5qr9:B, 5qr9:A, 5qra:B, 5qra:A, 5qrb:B, 5qrb:A, 5qrc:B, 5qrc:A, 5qrd:B, 5qrd:A, 5qre:B, 5qre:A, 5qt3:B, 5qt3:A
53 8ppl:Ix 455 72 0.0493 0.0440 0.2778 1.3 9bln:x, 8pj1:x, 8pj2:x, 8pj3:x, 8pj4:x, 8pj5:x, 8pj6:x, 7qp6:x, 8rg0:x, 8xxn:3N, 6zon:D
54 3qhx:A 377 54 0.0443 0.0477 0.3333 1.3 3qhx:B
55 8s38:B 414 93 0.0591 0.0580 0.2581 1.3 8s38:A, 8s38:C, 8s39:A, 8s39:B, 8s39:C, 8s3a:A, 8s3a:B, 8s3a:C, 8s3a:D, 8s3a:E, 8s3a:F, 8s3b:A, 8s3b:B, 8s3b:C, 8s3b:D, 8s3b:E, 8s3b:F, 8s3b:G, 8s3b:H, 8s3b:I, 8s3b:J, 8s3b:K, 8s3b:L, 8s3c:B, 8s3d:A, 8s3d:B, 8s3d:C, 8s3d:D, 8s3d:E, 8s3d:F
56 1b5o:A 382 112 0.0788 0.0838 0.2857 1.4 1b5o:B, 1b5p:A, 1b5p:B, 1bjw:A, 1bjw:B, 5bj3:A, 5bj3:B, 5bj3:C, 5bj3:D, 5bj4:A, 5bj4:B, 1bkg:A, 1bkg:B, 1bkg:C, 1bkg:D, 1gc3:A, 1gc3:B, 1gc3:C, 1gc3:D, 1gc3:E, 1gc3:F, 1gc3:G, 1gc3:H, 1gc4:A, 1gc4:B, 1gc4:C, 1gc4:D, 1gck:A, 1gck:B
57 4bmk:A 398 50 0.0419 0.0427 0.3400 1.5 4bmk:B, 2jg2:A, 2w8j:A, 2w8t:A, 2w8u:A, 2w8v:A, 2w8w:A, 2xbn:A
58 5v1x:D 447 76 0.0443 0.0403 0.2368 1.6 5v12:F, 5v12:B, 5v1x:C, 5v1x:A, 5v1x:B
59 5dx5:A 399 155 0.0911 0.0927 0.2387 1.9 5dx5:B
60 2cb1:A 404 90 0.0567 0.0569 0.2556 2.0
61 6egr:A 396 94 0.0714 0.0732 0.3085 2.4 5d5s:A, 5e4z:A, 4hf8:A, 3jw9:A, 3jwa:A, 3jwb:A, 5k30:A, 5m3z:A, 3mkj:A, 4oma:A, 6s0c:A
62 2wk8:B 364 87 0.0591 0.0659 0.2759 2.6
63 3hqt:B 386 87 0.0591 0.0622 0.2759 2.7 3hqt:A, 3kki:A, 3kki:B, 2wk8:A, 2wk9:A, 2wk9:B, 2wka:A, 2wka:B
64 2dr1:A 381 84 0.0567 0.0604 0.2738 2.7 2dr1:B
65 3isl:A 387 116 0.0591 0.0620 0.2069 2.9 3isl:B
66 1j04:A 387 106 0.0591 0.0620 0.2264 4.6 4cbr:A, 4cbs:A, 5f9s:A, 5f9s:B, 1h0c:A, 5hhy:A, 5hhy:B, 5luc:A, 5luc:B, 5luc:E, 5luc:G, 5luc:M, 5luc:N, 5luc:S, 5luc:T, 5ofy:A, 5og0:A, 6rv0:A, 6rv1:A, 2yob:A, 2yob:B
67 7ba4:A 377 119 0.0739 0.0796 0.2521 4.8 7ba4:B, 7ba4:C, 7ba4:D
68 5eud:A 454 64 0.0493 0.0441 0.3125 5.0 5eud:B, 5eue:A, 5eue:B, 3mad:A, 3mad:B, 3mau:A, 3mau:B, 3mau:C, 3mau:D, 3mbb:A, 3mbb:B
69 4p0g:A 429 75 0.0517 0.0490 0.2800 6.0 5aa1:A, 5aa2:A, 5aa3:A, 5aa4:A, 4owd:A, 4oxv:A, 4oyv:A, 4oz9:A
70 6nyy:C 491 33 0.0345 0.0285 0.4242 7.3 6nyy:B, 6nyy:D, 6nyy:E, 6nyy:A, 6nyy:F
71 4l0o:H 373 200 0.1059 0.1153 0.2150 8.5 4l0o:A, 4l0o:C, 4l0o:E, 4l0o:G, 4l0o:M, 4l0o:O
72 8d49:A 1072 124 0.0862 0.0326 0.2823 9.7
73 1b87:A 181 71 0.0493 0.1105 0.2817 9.8 2a4n:A, 2a4n:B, 1n71:A, 1n71:B, 1n71:C, 1n71:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218