BioLiP

>protein
PSGKNPVMILNELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALATVFNLHL

The query sequence (length=71) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2l3j:A	236	71	1.0000	0.3008	1.0000	8.66e-46	2l3c:A
2	2l3j:A	236	60	0.5070	0.1525	0.6000	8.93e-17	2l3c:A
3	8e0f:B	454	67	0.9155	0.1432	0.9701	5.81e-40	6d06:A, 6d06:D, 8e0f:A, 8e4x:A, 8e4x:B, 5ed1:A, 5ed1:D, 5ed2:A, 5ed2:D, 5hp2:A, 5hp2:D, 5hp3:A, 5hp3:D, 7kfn:A, 7kfn:D, 2l2k:B, 6vff:A, 6vff:B, 1zy7:A, 1zy7:B
4	5dv7:C	137	48	0.4507	0.2336	0.6667	3.13e-16
5	5dv7:C	137	59	0.4225	0.2190	0.5085	2.94e-13
6	6sdw:A	177	67	0.3521	0.1412	0.3731	5.03e-06	6htu:A, 6htu:B, 6htu:C, 6sdy:A
7	6sdw:A	177	52	0.2958	0.1186	0.4038	0.001	6htu:A, 6htu:B, 6htu:C, 6sdy:A
8	1ekz:A	76	72	0.3239	0.3026	0.3194	7.29e-06
9	7zpk:C	233	68	0.4225	0.1288	0.4412	1.41e-04	3adl:A, 5n8l:A, 5n8m:A
10	7zpk:C	233	65	0.3521	0.1073	0.3846	0.86	3adl:A, 5n8l:A, 5n8m:A
11	9asp:B	250	75	0.3662	0.1040	0.3467	0.001	9asm:B, 9asn:B, 9asq:B
12	6v5b:C	217	71	0.3662	0.1198	0.3662	0.003	6v5b:B, 6v5c:C, 6v5c:B
13	9asp:C	92	78	0.3803	0.2935	0.3462	0.005
14	1di2:A	69	64	0.3099	0.3188	0.3438	0.008
15	8dga:K	182	75	0.3662	0.1429	0.3467	0.10	8dg7:K
16	8dfv:K	253	73	0.3662	0.1028	0.3562	0.12	8dg5:K
17	8dfv:K	253	61	0.2535	0.0711	0.2951	1.2	8dg5:K
18	1yyk:A	221	47	0.2254	0.0724	0.3404	0.20	2ez6:A, 2ez6:B, 1jfz:A, 1jfz:B, 1jfz:C, 1jfz:D, 4m2z:A, 4m2z:B, 4m30:A, 4m30:B, 2nue:A, 2nuf:A, 2nuf:B, 2nug:A, 2nug:B, 1rc5:A, 1rc5:B, 1rc5:C, 1rc5:D, 1rc7:A, 1yyo:A, 1yyw:A, 1yyw:C, 1yz9:A
19	8dga:A	1629	61	0.2817	0.0123	0.3279	1.0
20	8dg5:A	1635	61	0.2817	0.0122	0.3279	1.0	8dg7:A
21	8dfv:A	1664	61	0.2817	0.0120	0.3279	1.0
22	5zal:A	1314	63	0.2676	0.0145	0.3016	1.1	2eb1:A, 2eb1:B, 2eb1:C, 4ngd:A, 5zam:A
23	7yym:A	1281	63	0.2676	0.0148	0.3016	1.1	4ngb:A, 4ngc:A, 4ngg:A, 4nh3:A, 4nh5:A, 4nh6:A, 7yyn:A, 7zpi:A, 7zpj:A, 7zpk:A
24	7xw2:A	725	63	0.2676	0.0262	0.3016	1.2
25	5t16:A	276	33	0.2254	0.0580	0.4848	5.4	2lbs:B, 2lup:B, 4oog:C, 5t16:B, 5t16:I, 5t16:J, 1t4l:B
26	1aox:A	201	30	0.1690	0.0597	0.4000	5.4	1aox:B, 4bj3:B, 4bj3:A, 1dzi:A, 5hj2:C, 5hj2:A, 5hj2:B, 5hj2:D, 5hj2:E, 6nd9:C, 6nd9:F, 6nd9:I, 6nd9:L, 6nd9:O, 6nd9:R, 6ndb:C, 6ndb:F, 6ndb:I, 6ndb:L, 6ndb:O, 6ndb:R, 6ndd:C, 6ndd:F, 6ndd:I, 6ndd:L, 6ndd:O, 6ndd:R, 6ndh:C, 6ndh:L, 6ndh:O, 6ndh:R, 5thp:C, 5thp:F, 5thp:I, 5thp:L, 5thp:O, 5thp:R, 1v7p:C
27	1iwp:A	555	52	0.2254	0.0288	0.3077	6.9	1iwp:L, 1mmf:A, 1mmf:L
28	5aor:A	1009	67	0.2958	0.0208	0.3134	7.3	5aor:B, 8b9i:A, 8b9j:A
29	8pjb:A	962	67	0.2958	0.0218	0.3134	7.5	8b9g:A, 8b9k:A, 8pjj:A
30	8fi3:B	308	26	0.1268	0.0292	0.3462	7.9	8fi3:A
31	4gaa:A	606	41	0.1549	0.0182	0.2683	9.1	4gaa:B
32	4br5:A	422	20	0.1268	0.0213	0.4500	9.4	4bqz:A, 4br0:A, 4br2:A, 4cd1:A, 4cd3:A, 3cj7:A, 3cj9:A, 3cja:A

[Back]