BioLiP

>protein
PSGIKVNDEITLLYPALKYAEELYLLINQNKINFIKSMAWPAFVNNISDSVSFIEQSMIDNQNEKALILFIKYKTKIAGV
VSFNIIDHANKTAYIGYWLGANFQGKGIVTNAINKLIQEYGDSGVIKRFVIKCIVDNKKSNATALRCGFTLEGVLQKAEI
LNGVSYDQNIYSKVI

The query sequence (length=175) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3r95:A	180	175	1.0000	0.9722	1.0000	2.52e-126	3r95:B, 3r96:A, 3r96:B, 3r9e:A, 3r9e:B, 3r9f:A, 3r9f:B, 3r9g:A, 3r9g:B
2	1s7n:B	179	172	0.3829	0.3743	0.3895	6.48e-41	1s7l:A, 1s7n:A, 1s7n:C, 1s7n:D
3	3wr7:A	170	126	0.2057	0.2118	0.2857	9.37e-06	4r9m:A, 3wr7:C, 3wr7:B, 3wr7:D
4	6c32:A	209	110	0.1486	0.1244	0.2364	7.11e-05	6c37:A
5	8gxk:B	188	119	0.1657	0.1543	0.2437	2.25e-04	8gxk:A, 8gxk:C, 8gxk:D
6	6d72:B	176	107	0.2000	0.1989	0.3271	2.25e-04	6d72:A
7	2vi7:C	165	125	0.1543	0.1636	0.2160	0.013
8	6vfn:A	167	99	0.1486	0.1557	0.2626	0.043	6vfn:F, 6vfn:B, 6vfn:C, 6vfn:D, 6vfn:E, 6vfn:H, 6vfn:I, 6vfn:J, 6vfn:G, 6vfn:L, 6vfn:K
9	6e1x:C	176	94	0.1257	0.1250	0.2340	0.067	5cnp:B, 5cnp:D, 5cnp:F, 6cx8:A, 6cx8:B, 6cx8:C, 6cx8:D, 6cx8:E, 6cx8:F, 6e1x:A, 6e1x:B, 6e1x:D, 4mhd:A, 4mhd:B, 4mhd:C, 4mi4:A, 4mi4:B, 4mi4:C, 4ncz:A, 4ncz:C, 4ncz:B, 4r57:A, 4r57:B, 4r57:C, 4r57:D, 4r57:E, 4r57:F, 4r57:G, 4r57:H, 4r57:I, 4r57:J, 4r57:K, 4r57:L, 4r87:A, 4r87:B, 4r87:C, 4r87:D, 4r87:E, 4r87:F, 4r87:G, 4r87:H, 4r87:I, 4r87:J, 4r87:K, 4r87:L, 5ug4:A, 5ug4:B, 5ug4:C, 4ygo:A, 4ygo:C, 4ygo:D, 4ygo:E
10	8dgt:A	431	35	0.0571	0.0232	0.2857	2.1	9axx:B, 9axy:A, 6b8u:A, 9bfb:A, 3c4c:A, 3c4c:B, 8c7x:A, 8c7x:B, 8c7y:A, 8c7y:B, 5c9c:A, 5csw:A, 5csx:A, 5ct7:A, 5ct7:B, 3d4q:A, 3d4q:B, 4dbn:A, 4dbn:B, 8dgs:A, 4e26:A, 4e26:B, 4e4x:A, 4e4x:B, 4ehe:A, 4ehe:B, 4ehg:A, 4ehg:B, 8f7o:A, 8f7o:B, 8f7p:A, 8f7p:B, 2fb8:A, 2fb8:B, 4fc0:B, 5fd2:A, 4g9c:A, 4g9c:B, 4g9r:A, 4g9r:B, 4h58:A, 5hid:A, 5hid:B, 5hie:A, 5hie:B, 3idp:B, 3idp:A, 3ii5:A, 3ii5:B, 5j18:A, 5j2r:A, 5jrq:A, 5jsm:A, 5jsm:B, 5jsm:C, 5jsm:D, 5jt2:A, 4jvg:B, 4jvg:A, 4jvg:C, 4jvg:D, 7k0v:A, 7k0v:B, 7k0v:C, 7k0v:D, 4ksp:A, 4ksp:B, 4ksq:A, 4ksq:B, 7m0t:A, 7m0u:A, 7m0v:A, 7m0w:A, 7m0x:A, 7m0y:A, 7m0z:A, 4mbj:A, 4mbj:B, 7mfd:A, 7mfe:A, 7mff:A, 7mff:B, 4mnf:A, 4mnf:B, 6n0p:A, 6n0p:B, 6n0q:A, 6nsq:A, 6nyb:A, 6p3d:A, 7p3v:A, 7p3v:B, 6p7g:A, 6p7g:B, 6p7g:C, 6p7g:D, 3ppj:A, 3ppj:B, 3ppk:A, 3ppk:B, 4pp7:A, 4pp7:B, 6pp9:A, 3prf:A, 3prf:B, 3pri:A, 3pri:B, 3psb:A, 3psb:B, 3psd:A, 3psd:B, 3q4c:A, 3q96:B, 8qqg:A, 8qqg:B, 8qqg:C, 4r5y:A, 4r5y:B, 4rzv:A, 4rzv:B, 7shv:A, 7shv:B, 3skc:A, 3skc:B, 3tv4:A, 3tv4:B, 3tv6:A, 3tv6:B, 6u2g:B, 6u2h:C, 6u2h:D, 6uuo:A, 1uwh:A, 1uwh:B, 1uwj:A, 1uwj:B, 6v2u:A, 6v2w:A, 6v34:A, 5vam:A, 5vam:B, 4wo5:A, 4wo5:B, 6xfp:A, 6xlo:A, 4xv9:A, 4yht:A, 4yht:B
11	5myv:A	352	45	0.0686	0.0341	0.2667	2.6	5myv:B, 5myv:C, 5myv:D, 2x7g:A, 7zkx:A
12	2i79:A	171	106	0.1371	0.1404	0.2264	3.8	2i79:B, 2i79:C, 2i79:D, 2i79:E, 2i79:F
13	6j17:A	254	44	0.0743	0.0512	0.2955	5.6
14	4oll:A	316	61	0.0971	0.0538	0.2787	5.7	4onu:A
15	4iug:A	957	44	0.0857	0.0157	0.3409	6.2
16	5yif:A	459	54	0.0914	0.0349	0.2963	10.0	5yif:B

[Back]