BioLiP

>protein
PSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFL
LVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFG

The query sequence (length=119) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7elg:A	122	118	0.9916	0.9672	1.0000	2.56e-84	5d94:A, 7ga8:A, 7ga9:A, 7gaa:A, 7gab:A, 7gac:A, 7gad:A, 7gae:A, 7gaf:A, 7gag:A, 7gah:A, 7gai:A, 7gaj:A, 7gak:A, 7gal:A, 7gam:A, 7gan:A, 7gao:A, 7gaq:A, 7gar:A, 7gas:A, 5gmv:B, 5gmv:A, 2k6q:A, 2lue:A, 2n9x:A, 8q7k:A, 8q7k:B, 5wrd:A, 5wrd:B, 5xad:A, 5xad:B, 5yiq:A, 5yis:B, 5yis:A, 2zjd:A, 2zjd:C
2	5cx3:A	119	118	0.8151	0.8151	0.8220	1.65e-70	5cx3:B, 5cx3:C, 5cx3:D, 7r9w:A, 7r9z:A, 7ra0:A, 6tbe:A
3	5e6o:A	117	115	0.5630	0.5726	0.5826	5.55e-42	5e6o:B, 5e6o:C, 5e6o:D
4	5dpw:A	115	115	0.5294	0.5478	0.5478	2.03e-41	5dpw:C, 5dpw:E, 5dpw:G, 5dpw:I, 5dpw:K, 5dpw:M, 5dpw:O
5	3h9d:B	116	117	0.3613	0.3707	0.3675	1.33e-26
6	6h8c:A	116	114	0.3782	0.3879	0.3947	4.19e-26
7	5l83:B	112	111	0.3361	0.3571	0.3604	1.66e-22	5l83:A
8	7brn:A	133	115	0.3613	0.3233	0.3739	1.76e-21	3vxw:A, 6wy6:A, 6wy6:B, 2zpn:A, 2zpn:D, 2zpn:B, 2zpn:C
9	6aaf:A	112	110	0.3109	0.3304	0.3364	5.86e-20
10	5yip:A	123	114	0.3109	0.3008	0.3246	2.56e-19	7aa7:A, 7aa7:B, 7aa9:A, 7aa9:E, 7aa9:C, 7aa9:I, 7aa9:G, 7aa9:K, 7cdb:A, 7cdb:B, 6hoi:B, 6hoi:A, 6hol:A, 6hol:B, 7jhx:A, 7jhx:B, 2l8j:A, 5lxh:A, 5lxh:B, 5lxh:C, 5lxi:D, 5lxi:B, 8x8a:A, 6yoo:A
11	5azf:A	119	115	0.3277	0.3277	0.3391	2.33e-18	5azf:B, 5azg:A, 5azg:B, 8tgf:A
12	3dow:A	119	115	0.3025	0.3025	0.3130	4.22e-18	6a9x:D, 8afi:E, 8afi:G, 8afi:A, 8afi:I, 8afi:M, 8afi:O, 8afi:C, 8afi:K, 7bv4:A, 7bv4:E, 7bv4:B, 7bv4:G, 3d32:A, 3d32:B, 7ea7:B, 7fb5:A, 8t2n:A, 8t2n:C, 8t31:A, 8t31:C, 8t31:E, 8t31:G, 8t31:I, 8t32:A, 8t33:A, 7vec:A, 7vec:B, 7vec:C, 7vec:D, 7vec:E, 7vec:F, 7vec:G, 7vec:H, 7vec:I, 7vec:J, 7vec:L, 8w6a:A, 8w6a:G, 8w6a:B, 8w6a:D, 3wim:A, 4xc2:A, 4xc2:B, 4xc2:C, 4xc2:D, 5yir:D, 5yir:A, 5yir:B, 7zkr:A, 7zl7:C, 7zl7:A
13	4eoy:A	124	123	0.3361	0.3226	0.3252	7.23e-16	4eoy:B, 4eoy:C
14	7eu4:C	94	98	0.1765	0.2234	0.2143	0.34	7eu4:A, 7eu4:E, 7eu4:G
15	4zb8:A	220	62	0.1765	0.0955	0.3387	0.62	4zbd:A, 4zbd:B
16	2gie:A	257	33	0.1092	0.0506	0.3939	1.0	3e3y:A, 3e3y:B, 3e40:A, 3e40:B, 3e41:A, 3e41:B, 3e42:A, 3e42:B, 3e43:A, 3e43:B, 3e44:A, 3e44:B, 3e45:A, 3e45:B, 3ebc:A, 3ebc:B, 2gie:B, 2gie:C, 2gie:D, 2gig:A, 2gig:B, 2gih:A, 2gih:B, 2gii:A, 2gii:B, 2gij:A, 2gij:B, 1kc6:A, 1kc6:B, 1kc6:C, 1kc6:D, 1tw8:A, 1tw8:B, 1tw8:C, 1tw8:D, 1tx3:A, 1tx3:B, 1tx3:C, 1tx3:D, 1xhu:A, 1xhu:B, 1xhu:C, 1xhu:D, 1xhv:A, 1xhv:B, 1xhv:C, 1xhv:D
17	4zb6:D	220	26	0.1176	0.0636	0.5385	2.2	4zb6:A, 4zb6:B, 4zb6:C
18	4kd5:C	229	26	0.1092	0.0568	0.5000	3.6
19	7sze:B	329	28	0.0924	0.0334	0.3929	4.2	7sze:A, 7sze:C, 7szf:A, 7szf:B, 7szf:C, 7szg:A, 7szg:B, 7szg:C, 6wnc:A, 6wnc:B, 6wnc:C, 6wnd:A, 6wnd:B, 6wnd:C
20	3ea1:A	296	25	0.0756	0.0304	0.3600	7.2	3ea1:B, 3ea2:A, 3ea2:B, 3ea3:A, 3ea3:B, 1gym:A, 1ptg:A, 6s2a:A, 6s2a:B, 6s2a:C, 1t6m:A, 1t6m:B
21	4cc9:A	307	34	0.1008	0.0391	0.3529	8.5	9bhr:A, 9bhr:B, 9bhs:A, 9bhs:B, 9c1q:A, 8f8e:A, 8f8e:B, 8og5:A, 8og6:A, 8og7:A, 8og8:A, 8og9:A, 8oga:P, 8ogb:A, 8ogc:A, 8oo5:P, 8ood:A, 7sse:A, 7ufv:A, 7ufv:B
22	4yan:A	252	48	0.1261	0.0595	0.3125	9.3	4yan:B, 4yan:C, 4yan:D
23	5el0:A	223	58	0.1429	0.0762	0.2931	9.8

[Back]