BioLiP

>protein
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQ
QMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVL
NIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFFNLPWLQEHLARH
PALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWL
AHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPAG

The query sequence (length=351) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8c0u:A	363	362	0.9972	0.9642	0.9669	0.0	8c0u:B, 8cp9:A, 8cp9:B, 8cpb:A, 8cpb:B, 4mo4:A, 4mo4:B, 4mo4:C, 4mo4:D, 4mo5:B, 4mo5:C, 4mo5:D, 3qbw:A, 3qbw:B, 3qbx:A, 3qbx:B
2	4mo5:A	345	351	0.9772	0.9942	0.9772	0.0
3	4zfv:A	436	352	0.3048	0.2454	0.3040	3.66e-39	5bsb:A, 5bvc:A, 5tkr:A, 4yh5:A, 4yh5:B, 4zfv:B, 4zlu:A, 4zlu:B
4	2acv:A	461	220	0.1396	0.1063	0.2227	0.21	2acv:B, 2acw:A, 2acw:B
5	7t6b:R	264	34	0.0370	0.0492	0.3824	1.2
6	1dvj:A	239	25	0.0370	0.0544	0.5200	1.4	1dvj:B, 1dvj:C, 1dvj:D, 2e6y:A, 2e6y:B, 4fx6:M, 4fx6:N, 4fx8:A, 4fx8:B, 4fxr:A, 4fxr:B, 3g1a:A, 3g1a:B, 3g1d:A, 3g1d:B, 3g1f:A, 3g1f:B, 3g1f:C, 3g1f:D, 3g1f:E, 3g1f:F, 3g1f:G, 3g1f:H, 3g1f:I, 3g1f:J, 3g1f:K, 3g1f:L, 3g1f:M, 3g1h:A, 3g1h:B, 3g1h:C, 3g1h:D, 3g1h:E, 3g1h:F, 3g1h:G, 3g1h:H, 3g1h:I, 3g1h:J, 3g1h:K, 3g1h:L, 3g1h:M, 3g1v:A, 3g1v:B, 3g1x:A, 3g1x:B, 3g22:A, 3g22:B, 3g24:A, 3g24:B, 4gc4:A, 4gc4:B, 1kly:A, 1klz:A, 1km0:A, 1km0:B, 1km0:C, 1km0:D, 1km1:A, 1km1:B, 1km2:A, 1km3:A, 1km4:A, 1km5:A, 1km6:A, 4lc6:A, 4lc6:B, 4lc8:A, 4lc8:B, 3lht:A, 3lht:B, 3lhu:A, 3lhu:B, 3lhv:A, 3lhv:B, 3lhv:C, 3lhv:D, 3lhw:A, 3lhw:B, 3lhy:A, 3lhy:B, 3lhz:A, 3lhz:B, 3li0:A, 3li0:B, 3li1:A, 3li1:B, 3lld:A, 3lld:B, 3llf:A, 3llf:B, 1lol:A, 1lol:B, 1loq:A, 1lor:A, 1los:A, 1los:B, 1los:C, 1los:D, 1lp6:A, 1lp6:B, 3ltp:A, 3ltp:B, 3lts:A, 3lts:B, 3lty:A, 3lty:B, 3lv5:A, 3lv5:B, 3lv6:A, 3lv6:B, 4lw7:A, 4lw7:B, 3m1z:A, 3m1z:B, 3nq6:A, 3nq6:B, 3nq7:A, 3nq7:B, 3nqa:A, 3nqa:B, 3nqc:A, 3nqc:B, 3nqd:A, 3nqd:B, 3nqe:A, 3nqe:B, 3nqf:A, 3nqf:B, 3nqg:A, 3nqg:B, 3nqm:A, 3nqm:B, 4nt0:A, 4nt0:B, 4nuw:A, 4nuw:B, 4nx5:A, 4nx5:B, 4o11:A, 4o11:B, 4o8r:A, 4o8r:B, 4o8r:C, 4o8r:D, 4o8r:E, 4o8r:F, 4o8r:G, 4o8r:H, 4o8r:I, 4o8r:J, 4o8r:K, 4o8r:L, 4o8r:M, 3p5y:A, 3p5y:B, 3p5z:A, 3p5z:B, 3p60:A, 3p60:B, 3p61:A, 3p61:B, 3pbu:A, 3pbu:B, 3pbv:A, 3pbv:B, 3pbw:A, 3pbw:B, 3pby:A, 3pby:B, 3pc0:A, 3pc0:B, 3qez:A, 3qez:B, 3qf0:A, 3qf0:B, 3qmr:A, 3qmr:B, 3qms:A, 3qms:B, 3qmt:A, 3qmt:B, 3rlu:A, 3rlu:B, 3rlv:A, 3rlv:B, 3sec:A, 3sgu:A, 3siz:A, 3siz:B, 3sj3:A, 3sj3:B, 3ssj:A, 3sw6:A, 3sy5:A, 3sy5:B, 3thq:A, 3thq:B, 3v1p:A, 3v1p:B, 3w07:A, 3wjw:A, 3wjx:A, 3wjy:A, 3wjz:A, 3wk0:A, 3wk1:A, 3wk2:A, 3wk3:A, 1x1z:A, 1x1z:B, 2zz1:A, 2zz1:B, 2zz2:A, 2zz2:B, 2zz3:A, 2zz3:B, 2zz4:A, 2zz4:B, 2zz5:A, 2zz5:B, 2zz6:A, 2zz6:B, 2zz7:A
7	7pny:a	211	110	0.0912	0.1517	0.2909	1.8	8csr:6, 8css:6, 8cst:6, 8csu:6, 7pnx:a, 7pnz:a
8	8w1o:K	1290	69	0.0484	0.0132	0.2464	2.6
9	3e9s:A	317	56	0.0541	0.0599	0.3393	4.7	2fe8:A, 2fe8:B, 2fe8:C, 7lfu:D, 7lfv:A, 7lfv:B, 4m0w:A, 3mj5:A, 3mj5:B, 4mm3:B, 4ovz:A, 4ovz:B, 4ow0:A, 4ow0:B, 7skq:A, 7skq:B, 7skr:A, 5tl6:B, 5tl6:D, 5tl7:B, 5tl7:D, 5y3e:A, 5y3q:A
10	7po0:a	184	51	0.0598	0.1141	0.4118	8.2

[Back]