Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PRVIHINDSLANSSFGYSDNHISTTKYNFATFLPKFLFQEFSKYANLFFLCTSAIQQVPHVSPTNRYTTIGTLLVVLIVS
AMKECIEDIKRANSDKELNNSTAEIFSEAHDDFVEKRWIDIRVGDIIRVKSEEPIPADTIILSSSEPEGLCYIETANLDG
ETNLKIKQSRVETAKFIDVKTLKNMNGKVVSEQPNSSLYTYEGTMTLNDRQIPLSPDQMILRGATLRNTAWIFGLVIFTG
HETKLLRNATATPIKRTAVEKIINRQIIALFTVLIVLILISSIGNVIMSTADAKHLSYLYLEGTNKAGLFFKDFLTFWIL
FSNLVPISLFVTVELIKYYQAFMIGSDLDLYYEKTDTPTVVRTSSLVEELGQIEYIFSDKTGTLTRNIMEFKSCSIAGHC
YIDKIPEDKTATVEDGIEVGYRKFDDLKKKLNDPSDEDSPIINDFLTLLATCHTVIPEFQSDGSIKYQAASPDEGALVQG
GADLGYKFIIRKPNSVTVLLEETGEEKEYQLLNICEFNSTRKRMSAIFRFPDGSIKLFCKGADTVILERLDDEANQYVEA
TMRHLEDYASEGLRTLCLAMRDISEGEYEEWNSIYNEAATTLDNRAEKLDEAANLIEKNLILIGATAIEDKLQDGVPETI
HTLQEAGIKIWVLTGDRQETAINIGMSCRLLSEDMNLLIINEETRDDTERNLLEKINALNEHQLSTHDMNTLALVIDGKS
LGFALEPELEDYLLTVAKLCKAVICCRVSPLQKALVVKMVKRKSSSLLLAIGDGANDVSMIQAAHVGVGISGMEGMQAAR
SADIAVGQFKFLKKLLLVHGSWSYQRISVAILYSFYKNTALYMTQFWYVFANAFSGQSIMESWTMSFYNLFFTVWPPFVI
GVFDQFVSSRLLERYPQLYKLGQKGQFFSVYIFWGWIINGFFHSAIVFIGTILIYRYGFALNMHGELADHWSWGVTVYTT
SVIIVLGKAALVTNQWTKFTLIAIPGSLLFWLIFFPIYASIFPHANISREYYGVVKHTYGSGVFWLTLIVLPIFALVRDF
LWKYYKRMYEPETYHVIQEMQKYNVQRMKKQRGFAFSQAEEGGQEKIVRMYDTTQKRGKYGELQDASA

The query sequence (length=1108) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6roh:A 1112 1113 0.9946 0.9910 0.9901 0.0 7oh4:A, 7oh5:A, 7oh6:A, 7oh7:A, 7pem:A, 6roi:A, 6roj:A
2 6k7l:A 992 1075 0.4540 0.5071 0.4679 0.0 6k7i:A, 6k7j:A, 6k7k:A, 6k7m:A, 6k7n:A
3 8oxa:A 1035 1057 0.4025 0.4309 0.4219 0.0 8ox5:A, 8oxb:A, 8oxc:A
4 8ox8:A 1125 1134 0.4125 0.4062 0.4030 0.0 8ox7:A, 8ox9:A, 7py4:A, 7vgj:A
5 7vgh:B 1183 1152 0.4134 0.3872 0.3976 0.0 7vgi:B
6 7kyc:A 1178 1152 0.3899 0.3667 0.3750 0.0 7drx:A, 7dsh:A, 7dsi:A, 7f7f:A, 7ky6:A, 7kyb:A, 7whv:A, 7whw:A
7 7kya:A 1174 1144 0.3890 0.3671 0.3767 0.0 7ky5:A, 7ky7:A, 7ky8:A, 7ky9:A
8 6lcp:A 1140 1110 0.3944 0.3833 0.3937 0.0 6lcr:A
9 6lkn:A 1064 1066 0.3475 0.3618 0.3612 0.0 6lkn:E, 6lkn:I, 6lkn:M
10 7bsp:A 1028 1057 0.3439 0.3706 0.3605 0.0 7bsq:A, 7vsh:A
11 8ox4:A 870 806 0.3060 0.3897 0.4206 0.0
12 8ox4:A 870 75 0.0298 0.0379 0.4400 1.94e-06
13 7rd6:A 929 1061 0.2861 0.3412 0.2988 1.31e-124 7rd7:A, 7rd8:A
14 7bss:A 816 384 0.1273 0.1728 0.3672 2.47e-66 7bsu:A, 7bsv:A, 7bsw:A, 7vsg:A
15 7bss:A 816 432 0.1426 0.1936 0.3657 7.57e-64 7bsu:A, 7bsv:A, 7bsw:A, 7vsg:A
16 8ox6:A 575 419 0.1300 0.2504 0.3437 1.38e-59
17 8ox6:A 575 168 0.0569 0.1096 0.3750 1.34e-22
18 8ox6:A 575 80 0.0325 0.0626 0.4500 3.25e-08
19 7x20:A 986 844 0.1760 0.1978 0.2310 6.70e-16 8ijl:A, 8ijm:A, 7x21:A, 7x22:A, 7x23:A, 7x24:A
20 7efl:A 987 702 0.1534 0.1722 0.2422 6.96e-15 7efm:A, 7efn:A, 7et1:A, 8ijv:A, 8ijw:A, 8ijx:A, 8jmn:A, 6jxh:A, 6jxi:A, 6jxj:A, 6jxk:A, 6jxk:E, 7w47:A, 7w48:A, 7w49:A, 7w4a:A, 8wa5:A, 5ylu:A, 5ylv:A
21 7wyu:A 993 793 0.1597 0.1782 0.2232 3.52e-13 3a3y:A, 5avq:A, 5avr:A, 5avs:A, 5avt:A, 5avu:A, 5avv:A, 5avw:A, 5avx:A, 5avy:A, 5avz:A, 5aw0:A, 5aw1:A, 5aw2:A, 5aw3:A, 5aw4:A, 5aw5:A, 5aw6:A, 5aw7:A, 5aw8:A, 5aw9:A, 8jfz:C, 8jfz:A, 7wyu:C, 7wyv:A, 7wyv:C, 7wyw:A, 7wyw:C, 7wyx:A, 7wyx:C, 7wyy:A, 7wyy:C, 7wyz:A, 7wyz:C, 7wz0:A, 7wz0:C, 7y45:C, 7y45:A, 7y46:C, 7y46:A, 2zxe:A
22 8k1l:A 979 452 0.0975 0.1103 0.2389 5.13e-13
23 3b8e:A 998 857 0.1733 0.1924 0.2240 6.96e-13 3b8e:C, 7d91:A, 7d92:A, 7d93:A, 7d93:C, 7d94:A, 7d94:C, 7ddf:A, 7ddf:C, 7ddh:A, 7ddh:C, 7ddi:A, 7ddi:C, 7ddk:A, 7ddk:C, 7ddl:A, 7ddl:C, 7e1z:A, 7e20:A, 7e21:A, 4hqj:A, 4hqj:C, 4hyt:A, 4hyt:C, 8jbk:A, 8jbk:C, 8jbl:A, 8jbl:C, 8jbm:A, 8jbm:C, 3kdp:A, 3kdp:C, 1mo8:A, 3n23:A, 3n23:C, 7qtv:A, 7qtv:C, 4res:A, 4res:C, 4ret:A, 4ret:C, 3wgu:A, 3wgu:C, 3wgv:A, 3wgv:C, 7wys:A, 7wys:C, 7wyt:A, 7wyt:C, 4xe5:A, 7yzr:A, 7yzr:C, 7z04:A, 7z04:C
24 8d3x:A 989 836 0.1588 0.1780 0.2105 1.75e-12 8d3u:A, 8d3w:A
25 7m5x:A 1000 484 0.0875 0.0970 0.2004 7.79e-12 7fjp:B, 7fjq:A, 8ien:P, 7m5y:A
26 7vpk:A 1055 485 0.0921 0.0967 0.2103 1.36e-11 8iek:P, 8ies:P, 7m5v:A, 7n70:A, 7n72:A, 7n73:A, 7n74:A, 7n77:A, 7n78:A, 7vpi:A, 7vpj:A, 7vpl:A
27 8ieo:P 1031 448 0.0912 0.0980 0.2254 2.77e-11 8iem:P
28 6zhh:A 883 592 0.1200 0.1506 0.2247 2.77e-10 6zhf:A, 6zhg:A, 6zhh:B, 6zhh:C, 6zhh:D, 6zhh:E, 6zhh:F, 6zhh:G, 6zhh:H
29 6xmt:A 1092 691 0.1372 0.1392 0.2200 5.80e-10 6xmq:A, 6xms:A, 6xmu:A
30 5ztf:A 972 341 0.0749 0.0854 0.2434 4.82e-09
31 8iwp:A 896 450 0.0921 0.1138 0.2267 8.35e-09 8iwr:A, 8iws:A, 8iwt:A, 8iwu:A, 8iww:A, 7yag:A, 7yah:A, 7yai:A, 7yaj:A, 7yam:A
32 7w7t:A 1021 477 0.0948 0.1028 0.2201 2.14e-08 7bt2:A, 7e7s:A, 6hxb:A, 6jju:A, 6lle:A, 6lly:A, 6ln5:A, 6ln6:A, 6ln7:A, 6ln8:A, 6ln9:A, 5mpm:A, 2voy:B, 2voy:H, 2voy:E, 2voy:K, 7w7u:A, 7w7v:A, 7w7w:A
33 5zmw:A 1000 476 0.0957 0.1060 0.2227 5.90e-08 5a3q:A, 5a3r:A, 5a3s:A, 5a3s:B, 2agv:A, 2agv:B, 3ar2:A, 3ar3:A, 3ar4:A, 3ar5:A, 3ar6:A, 3ar7:A, 3ar8:A, 3ar9:A, 3b9b:A, 3b9r:A, 3b9r:B, 3ba6:A, 4bew:A, 4bew:B, 2by4:A, 2c88:A, 2c8k:A, 2c8l:A, 2c9m:A, 2c9m:B, 2dqs:A, 2ear:A, 2eat:A, 2eau:A, 3fgo:A, 3fgo:B, 3fpb:A, 3fps:A, 4h1w:A, 6hef:A, 1iwo:A, 1iwo:B, 4j2t:A, 3j7t:A, 4kyt:A, 3n5k:A, 3n5k:B, 3n8g:A, 3nal:A, 3nam:A, 3nan:A, 4nab:A, 5ncq:A, 2o9j:A, 2oa0:A, 8owa:A, 8owl:A, 6rb2:A, 1su4:A, 1t5s:A, 1t5t:A, 3tlm:A, 4uu0:A, 4uu1:A, 1vfp:A, 1vfp:B, 3w5a:A, 3w5a:B, 3w5b:A, 1wpg:A, 1wpg:B, 1wpg:C, 1wpg:D, 5xa7:A, 5xa8:A, 5xa9:A, 5xaa:A, 4xou:A, 1xp5:A, 6yaa:A, 4ycl:A, 4ycm:A, 4ycn:A, 2yfy:A, 6yso:A, 6yso:B, 2zbd:A, 2zbe:A, 2zbe:B, 2zbf:A, 2zbg:A
34 7op8:A 1118 229 0.0551 0.0546 0.2664 1.03e-07 7op1:A, 7op3:A, 7op5:A
35 7vh6:A 768 299 0.0569 0.0820 0.2107 1.72e-04 7vh6:B, 7vh6:C, 7vh6:D, 7vh6:E, 7vh6:F
36 7vh6:A 768 29 0.0126 0.0182 0.4828 2.2 7vh6:B, 7vh6:C, 7vh6:D, 7vh6:E, 7vh6:F
37 4bbj:A 664 34 0.0153 0.0256 0.5000 0.017 4bev:A, 4byg:A, 3rfu:A, 3rfu:B, 3rfu:C, 3rfu:D
38 8ioy:A 816 55 0.0162 0.0221 0.3273 0.063
39 5ksd:A 833 293 0.0542 0.0720 0.2048 0.12 5ksd:B
40 7nxf:A 829 85 0.0190 0.0253 0.2471 0.17 7ny1:A, 7ny1:B, 7ny1:C, 7ny1:D, 7ny1:E, 7ny1:F
41 7nxf:A 829 50 0.0181 0.0241 0.4000 2.2 7ny1:A, 7ny1:B, 7ny1:C, 7ny1:D, 7ny1:E, 7ny1:F
42 8q4s:A 295 52 0.0181 0.0678 0.3846 0.25 7qpl:A
43 3m1y:C 208 62 0.0162 0.0865 0.2903 0.31 3m1y:A, 3m1y:B, 3m1y:D
44 7r0h:A 654 106 0.0217 0.0367 0.2264 0.48 3a1c:A, 3a1c:B, 3a1d:A, 3a1d:B, 3a1e:A, 3a1e:B
45 7r0h:A 654 42 0.0126 0.0214 0.3333 8.1 3a1c:A, 3a1c:B, 3a1d:A, 3a1d:B, 3a1e:A, 3a1e:B
46 1mq0:A 130 79 0.0199 0.1692 0.2785 0.64 1mq0:B
47 7si6:A 873 55 0.0162 0.0206 0.3273 0.80 7si3:A, 7si7:A
48 7ajt:UJ 1116 93 0.0235 0.0233 0.2796 1.1 7aju:UJ, 6zqc:UJ, 6zqd:UJ
49 3r4c:A 268 30 0.0117 0.0485 0.4333 1.4
50 7d63:AE 1534 93 0.0235 0.0169 0.2796 1.5 7d5s:AE, 6ke6:AE, 6lqp:AE, 6lqq:AE, 6lqr:AE, 6lqs:AE, 6lqt:AE, 6lqu:AE, 6lqv:AE, 7suk:LM, 5wlc:LM
51 3sky:A 261 59 0.0199 0.0843 0.3729 1.7
52 3sky:A 261 68 0.0199 0.0843 0.3235 2.1
53 3j6b:N 118 43 0.0153 0.1441 0.3953 3.3 5mrc:N, 5mre:N, 5mrf:N
54 4dwo:A 268 24 0.0117 0.0485 0.5417 4.2 3niw:A
55 4ddn:A 154 26 0.0108 0.0779 0.4615 4.7 4ddn:B, 4ddn:C, 4ddn:D, 3r51:A, 3r52:A, 3r52:B, 3r52:C, 3r52:D
56 1rkq:A 271 23 0.0108 0.0443 0.5217 6.1 1rkq:B
57 8a1z:A 396 20 0.0099 0.0278 0.5500 6.8 8a21:A, 5is2:A, 5it0:A, 5it4:A, 5jjb:A, 5jlp:A, 5jlr:A, 5jma:A, 3p96:A, 5t41:A
58 3c1t:B 326 100 0.0190 0.0644 0.2100 8.6 3bxx:A, 3bxx:B, 3bxx:C, 3bxx:D, 3bxx:E, 3bxx:F, 3c1t:A, 3c1t:C, 3c1t:D, 2c29:D, 2c29:F, 2iod:A, 2iod:B, 2iod:C, 2iod:D, 2nnl:D, 2nnl:F

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218