Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
PRLWEGQDVLARWTDGLLYLGTIKKVDSAREVCLVQFEDDSQFLVLWKDISPAALPGEELLCCVCRSETVVPGNRLVSCE
KCRHAYHQDCHVPRAPAPSWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDWDAGHLSNRQQSYCYCGGP
GEWNLKMLQCRSCLQWFHEACTQCLSKPLLYGDRFYEFECCVCRGGPEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFD
REILPFTSENWDSLLLGELSDTPKGERSSRLLSALNSHKDRFISGREIKKRKCLFGLHARMPPPVE

The query sequence (length=306) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5xfo:A 315 312 1.0000 0.9714 0.9808 0.0 8h43:A, 8h43:B, 8h43:C, 4hcz:A, 4hcz:B, 7lky:B, 7lky:H, 7lky:A, 7lky:C, 7lky:D, 7lky:E, 7lky:F, 7lky:G, 6wat:AA, 6wat:AC, 6wat:BA, 6wat:BC, 6wat:CA, 6wat:CC, 6wat:DA, 6wat:DC, 6wat:EC, 6wat:EA, 6wat:FA, 6wat:FC, 6wat:GA, 6wat:GC, 6wat:HA, 6wat:HC, 6wat:IA, 6wat:IC, 6wat:JA, 6wat:JC, 6wat:KA, 6wat:KC, 6wat:OC, 6wat:LA, 6wat:LC, 6wat:MA, 6wat:MC, 6wat:NA, 6wat:NC, 6wat:OA, 6wav:A, 6wav:C, 6wav:B, 6wav:D, 5xfn:A, 5xfp:B, 5xfp:A, 5xfp:E, 5xfq:A, 5xfq:B
2 5xfr:A 309 305 0.5752 0.5696 0.5770 1.89e-127 5xfr:B
3 5oqd:C 192 165 0.2222 0.3542 0.4121 3.79e-35 5oqd:B, 5oqd:A, 5oqd:D, 5oqd:E, 5oqd:F
4 2m0o:A 79 55 0.1797 0.6962 1.0000 2.05e-32
5 4bd3:A 58 58 0.1176 0.6207 0.6207 9.83e-19 6wau:A, 6wau:F, 6wau:B, 6wau:D, 6wau:C, 6wau:E
6 2yt5:A 66 63 0.0850 0.3939 0.4127 3.36e-10
7 1wev:A 88 71 0.0882 0.3068 0.3803 3.78e-09
8 8ge0:A 188 68 0.0817 0.1330 0.3676 1.97e-06 8gdx:A, 8ge0:B, 8ge0:C
9 2l43:A 80 53 0.0588 0.2250 0.3396 7.25e-04 2ku3:A
10 6u04:A 168 68 0.0719 0.1310 0.3235 0.003 5erc:A
11 3o36:A 184 47 0.0588 0.0978 0.3830 0.011 7b9x:A, 5h1t:A, 5h1t:B, 5h1t:C, 5h1t:D, 5h1u:B, 5h1u:A, 5h1u:C, 5h1u:D, 5h1v:A, 5h1v:B, 3o33:A, 3o33:B, 3o33:C, 3o33:D, 3o34:A, 3o35:B, 3o35:A, 3o36:B, 3o37:A, 3o37:B, 3o37:C, 3o37:D, 4yab:A, 4yab:B, 4yad:A, 4yad:B, 4yat:A, 4yat:B, 4yax:A, 4yax:B, 4ybm:A, 4ybm:B, 4ybs:A, 4ybt:A, 4yc9:A, 4zql:A, 4zql:B
12 3u5m:E 173 47 0.0588 0.1040 0.3830 0.024
13 5znp:B 186 48 0.0523 0.0860 0.3333 0.025 5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
14 3u5o:C 195 47 0.0588 0.0923 0.3830 0.029 8bd8:A, 8bd9:A, 8bdy:A, 5mr8:A, 3u5m:A, 3u5m:B, 3u5m:C, 3u5m:D, 3u5m:F, 3u5m:G, 3u5m:H, 3u5m:I, 3u5m:K, 3u5m:J, 3u5m:L, 3u5n:A, 3u5n:B, 3u5o:A, 3u5o:B, 3u5o:D, 3u5o:E, 3u5o:F, 3u5o:G, 3u5o:H, 3u5p:A, 3u5p:B, 3u5p:C, 3u5p:D, 3u5p:E, 3u5p:F, 3u5p:G, 3u5p:H, 7zdd:A
15 7ebk:A 183 51 0.0621 0.1038 0.3725 0.039 7ebj:A
16 1fp0:A 88 56 0.0621 0.2159 0.3393 0.066
17 1wep:A 79 28 0.0392 0.1519 0.4286 0.11
18 2yql:A 56 52 0.0588 0.3214 0.3462 0.12
19 2ro1:A 189 48 0.0588 0.0952 0.3750 0.12
20 3kv6:D 448 53 0.0523 0.0357 0.3019 0.14 3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
21 8jwu:C 412 85 0.0784 0.0583 0.2824 0.14 8jwj:A, 8jwj:C, 8jws:A, 8jws:B, 8jws:C, 8jwu:A, 8jwu:B
22 6ieu:A 170 51 0.0588 0.1059 0.3529 0.15 6iet:A
23 5z8l:A 204 52 0.0556 0.0833 0.3269 0.17 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
24 6g8r:B 164 46 0.0556 0.1037 0.3696 0.23 2md7:B, 2md8:C
25 2gfa:B 110 46 0.0588 0.1636 0.3913 0.34 5d6y:A, 5d6y:D, 5d6y:B, 5d6y:C, 2gfa:A, 2qqs:A, 2qqs:B, 5var:A
26 6j2p:A 98 56 0.0588 0.1837 0.3214 0.37 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
27 4ptb:A 178 62 0.0588 0.1011 0.2903 0.48 5fb0:A, 5fb0:C, 5fb1:A, 6g5n:A, 6g5n:B, 6g5p:A, 6g5p:B, 4ptb:B, 5pwc:A, 5pwc:B, 5pwd:A, 5pwd:B, 5pwe:A, 5pwe:B, 5pwf:A, 5pwf:B, 5pwg:A, 5pwg:B, 5pwh:A, 5pwh:B, 5pwi:A, 5pwi:B, 5pwj:A, 5pwj:B, 5pwk:A, 5pwk:B, 5pwl:A, 5pwl:B, 5pwm:A, 5pwm:B, 5pwn:A, 5pwn:B, 5pwo:A, 5pwo:B, 5pwp:A, 5pwp:B, 5pwq:A, 5pwq:B, 5pwr:A, 5pwr:B, 5pws:A, 5pws:B, 5pwt:A, 5pwt:B, 5pwu:A, 5pwu:B, 5pwv:A, 5pwv:B, 5pww:A, 5pww:B, 5pwx:A, 5pwx:B, 5pwy:A, 5pwy:B, 5pwz:A, 5pwz:B, 5px0:A, 5px0:B, 5px1:A, 5px1:B, 5px2:A, 5px2:B, 5px3:A, 5px3:B, 5px4:A, 5px4:B, 5px5:A, 5px5:B, 5px6:A, 5px6:B, 5px7:A, 5px7:B, 5px8:A, 5px8:B, 5px9:A, 5px9:B, 5pxa:A, 5pxa:B, 5pxb:A, 5pxb:B, 5pxc:A, 5pxc:B, 5pxd:A, 5pxd:B, 5pxe:A, 5pxe:B, 5pxf:A, 5pxf:B, 5pxg:A, 5pxg:B, 5pxh:A, 5pxh:B, 5pxi:A, 5pxi:B, 5pxj:A, 5pxj:B, 5pxk:A, 5pxk:B, 5pxl:A, 5pxl:B, 5pxm:A, 5pxm:B, 5pxn:A, 5pxn:B, 5pxo:A, 5pxo:B, 5pxp:A, 5pxp:B, 5pxq:A, 5pxq:B, 5pxr:A, 5pxr:B, 5pxs:A, 5pxs:B, 5pxt:A, 5pxt:B, 5pxu:A, 5pxu:B, 5pxv:A, 5pxv:B, 5pxw:A, 5pxw:B, 5pxx:A, 5pxx:B, 5pxy:A, 5pxy:B, 5pxz:A, 5pxz:B, 5py0:A, 5py0:B, 5py1:A, 5py1:B, 5py2:A, 5py2:B, 5py3:A, 5py3:B, 5py4:A, 5py4:B, 5py5:A, 5py5:B, 5py6:A, 5py6:B, 5py7:A, 5py7:B, 5py8:A, 5py8:B, 5py9:A, 5py9:B, 5pya:A, 5pya:B, 5pyb:A, 5pyb:B, 5pyc:A, 5pyc:B, 5pyd:A, 5pyd:B, 5pye:A, 5pye:B, 5pyf:A, 5pyf:B, 5pyg:A, 5pyg:B, 5pyh:A, 5pyh:B, 5pyi:A, 5pyi:B, 5pyj:A, 5pyj:B, 5pyk:A, 5pyk:B, 5pyl:A, 5pyl:B, 5pym:A, 5pym:B, 5pyn:A, 5pyn:B, 5pyo:A, 5pyo:B, 5pyp:A, 5pyp:B, 5pyq:A, 5pyq:B, 5pyr:A, 5pyr:B, 5pys:A, 5pys:B, 5pyt:A, 5pyt:B, 5pyu:A, 5pyu:B, 5pyv:A, 5pyv:B, 5pyw:A, 5pyw:B, 5pyx:A, 5pyx:B, 5pyy:A, 5pyy:B, 5pyz:A, 5pyz:B, 5pz0:A, 5pz0:B, 5pz1:A, 5pz1:B, 5pz2:A, 5pz2:B, 5pz3:A, 5pz3:B, 5pz4:A, 5pz4:B, 5pz5:A, 5pz5:B, 5pz6:A, 5pz6:B, 5pz7:A, 5pz7:B, 5pz8:A, 5pz8:B, 5pz9:A, 5pz9:B, 5pza:A, 5pza:B, 5pzb:A, 5pzb:B, 5pzc:A, 5pzc:B, 5pzd:A, 5pzd:B, 5pze:A, 5pze:B, 5pzf:A, 5pzf:B, 5pzg:A, 5pzg:B, 5pzh:A, 5pzh:B, 5pzi:A, 5pzi:B, 5pzj:A, 5pzj:B
28 3sxu:A 146 78 0.0817 0.1712 0.3205 0.67
29 7mju:A 184 47 0.0621 0.1033 0.4043 0.76 5dag:A, 5dah:B, 5dah:A
30 1weq:A 85 41 0.0458 0.1647 0.3415 0.83
31 2puy:B 60 51 0.0556 0.2833 0.3333 0.86 2puy:A
32 3kv4:A 432 85 0.0752 0.0532 0.2706 1.1 4do0:A, 3k3n:A, 3k3o:A, 2wwu:A
33 2ke1:A 66 54 0.0556 0.2576 0.3148 1.2 2kft:A, 1xwh:A
34 1mdc:A 131 61 0.0588 0.1374 0.2951 1.2
35 7nvw:2 390 58 0.0621 0.0487 0.3276 1.5 7nvv:2
36 8f8y:B 433 29 0.0359 0.0254 0.3793 1.6 8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
37 3rsn:A 165 92 0.0784 0.1455 0.2609 2.0 3s32:A
38 7klo:A 59 36 0.0392 0.2034 0.3333 2.0 7klr:A
39 6a3z:A 56 54 0.0556 0.3036 0.3148 2.0
40 2l5u:A 61 41 0.0458 0.2295 0.3415 2.2
41 5vab:A 54 35 0.0425 0.2407 0.3714 2.4
42 9atn:A 98 39 0.0523 0.1633 0.4103 3.4
43 7nql:BL 137 37 0.0359 0.0803 0.2973 3.5
44 3kou:B 238 158 0.1340 0.1723 0.2595 4.3 3ghh:B, 3kou:A, 3p5s:A, 3p5s:B
45 1zbd:B 124 59 0.0588 0.1452 0.3051 5.6
46 7d87:A 202 32 0.0294 0.0446 0.2812 5.8 7d86:A, 7d8a:A
47 4a4e:A 64 33 0.0425 0.2031 0.3939 5.9 4a4g:A, 4qq6:A, 7w2p:A, 7w30:A, 7w30:B, 7w30:C, 7w30:D
48 3vpp:B 122 68 0.0556 0.1393 0.2500 6.8 3vpp:A
49 5hh7:A 192 53 0.0458 0.0729 0.2642 7.3
50 2ysm:A 111 45 0.0392 0.1081 0.2667 7.8

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218