BioLiP

>protein
PQVLRGSGHCKWFNVRMGFGFISMTSREGSPLENPVDVFVHQSKLYMEGFRSLKEGEPVEFTFKKSSKGFESLRVTGPGG
NPCLGN

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4a75:A	89	86	1.0000	0.9663	1.0000	1.12e-59	4a75:C, 4a75:E, 4a75:G, 4a76:A, 4a76:G, 4a76:C, 4a76:E, 4alp:A, 4alp:D
2	5udz:A	139	86	0.7674	0.4748	0.7674	2.42e-44	8ops:B, 8opt:B, 8ost:B, 3trz:A, 3trz:B, 3trz:C, 3trz:D, 3trz:E, 3trz:F, 3ts0:A, 3ts0:B, 3ts2:A, 3ts2:B, 5udz:B
3	6a6j:A	90	82	0.4070	0.3889	0.4268	1.14e-14	6a6j:C, 6a6l:A, 6ktc:A, 6kug:A, 6lmr:A, 5yts:A, 5ytt:A, 5ytv:A, 5ytx:A
4	7f3i:A	93	82	0.4070	0.3763	0.4268	2.63e-14	7f3i:C, 7f3i:E, 7f3j:A, 7f3j:C, 7f3j:E, 7f3j:G, 7f3k:A, 7f3l:A
5	2es2:A	67	69	0.3140	0.4030	0.3913	2.13e-10	3pf4:B, 3pf5:B, 3pf5:A
6	7ot5:B	66	70	0.3140	0.4091	0.3857	5.80e-10
7	1c9o:A	66	69	0.2907	0.3788	0.3623	1.26e-08	1c9o:B, 2hax:A, 2hax:B
8	7oii:B	39	46	0.2209	0.4872	0.4130	7.54e-06
9	6jzy:A	342	29	0.1163	0.0292	0.3448	0.14	6jzu:A, 6jzz:A
10	1g8s:A	230	48	0.1512	0.0565	0.2708	0.20
11	8khq:A	700	50	0.1628	0.0200	0.2800	0.60	8khq:B, 8khq:C, 8khq:D
12	2o1u:A	578	43	0.1628	0.0242	0.3256	1.4	2o1u:B, 2o1v:A, 2o1v:B, 1tbw:B, 1tc0:B, 1tc6:B, 1yt0:A
13	5uls:A	650	43	0.1628	0.0215	0.3256	1.4	6aol:A, 6aom:A, 6aom:B, 6asp:A, 6asp:B, 6asq:A, 6asq:B, 6baw:B, 6baw:A, 6baw:C, 6baw:D, 6c91:C, 6c91:B, 6cyi:A, 6d1x:A, 6d28:A, 2esa:A, 2exl:A, 2exl:B, 2fyp:A, 2fyp:B, 2gfd:A, 2gfd:B, 2gqp:A, 2gqp:B, 2h8m:A, 2h8m:B, 2hch:A, 2hch:B, 2hg1:A, 2hg1:B, 5in9:A, 5in9:B, 4nh9:A, 3o2f:A, 3o2f:B, 1qy8:A, 1qye:A, 1tbw:A, 1tc0:A, 1tc6:A, 5ttz:A, 5ttz:B, 1u0z:A, 1u0z:B, 1u2o:A, 1u2o:B, 5uls:B, 7ull:A, 7ull:B, 5wmt:A, 5wmt:B, 5wmt:C, 5wmt:D, 1ysz:A
14	5w21:A	922	51	0.1628	0.0152	0.2745	3.0	7ysh:A, 7ysu:A, 7ysw:A
15	6rey:c	1773	39	0.1512	0.0073	0.3333	4.3	6rey:d
16	6kwy:c	1811	39	0.1512	0.0072	0.3333	4.3	8cvs:c, 6kwx:A, 7naq:c
17	1ykd:A	383	40	0.1279	0.0287	0.2750	5.7	1ykd:B
18	8rol:A	411	45	0.1628	0.0341	0.3111	6.1	8roi:A, 8roj:A, 8rok:C
19	6wg3:B	693	45	0.1628	0.0202	0.3111	6.1
20	7w1m:B	528	45	0.1628	0.0265	0.3111	6.4
21	8q7x:A	1914	45	0.1512	0.0068	0.2889	6.5
22	8qp8:A	1918	45	0.1512	0.0068	0.2889	6.5
23	8i0p:A	2149	45	0.1512	0.0060	0.2889	6.5	8q7q:A, 8q7v:A, 8q7w:A
24	7abg:A	2174	45	0.1512	0.0060	0.2889	6.5	7abi:A, 8q91:A, 8rc0:A
25	8y6o:C	2227	45	0.1512	0.0058	0.2889	6.5	8h6e:5B, 8h6j:5B, 8qp9:A, 6qw6:5A, 6qx9:5A, 8qxd:A, 8r08:A
26	5z56:A	2232	45	0.1512	0.0058	0.2889	6.5	7aav:A, 7abf:A, 8ch6:a, 7dvq:A, 8i0s:A, 5z58:A
27	8h6k:5B	2253	45	0.1512	0.0058	0.2889	6.5	8h6l:5B, 8i0u:A, 8i0v:A, 8q7n:A, 8qo9:A, 8qpe:A, 7qtt:a, 8qzs:A
28	8c6j:A	2261	45	0.1512	0.0057	0.2889	6.5	6ah0:A, 6ahd:A, 8bc8:J, 6ff4:A, 6ff7:A, 9fmd:A, 8i0r:A, 8i0t:A, 8i0w:A, 6icz:A, 6id0:A, 6id1:A, 4jk9:A, 4jk9:B, 4jka:A, 4jka:B, 5mqf:A, 5o9z:A, 6qdv:A, 8qoz:A, 8qpa:A, 8qpb:A, 8qpk:A, 8r09:A, 8r0a:A, 8r0b:A, 8rm5:A, 8ro2:A, 7w59:A, 7w5a:A, 7w5b:A, 5xjc:A, 5yzg:A, 6zym:A
29	8rok:A	381	45	0.1628	0.0367	0.3111	6.5	8pq5:B
30	6wge:B	490	45	0.1628	0.0286	0.3111	6.5
31	5z57:A	1978	45	0.1512	0.0066	0.2889	6.7
32	3c8v:C	465	28	0.1512	0.0280	0.4643	6.7
33	8b6g:CA	599	28	0.1163	0.0167	0.3571	8.1	8bqs:CA, 8gym:sa, 8gym:SA, 8gzu:sa, 8gzu:SA
34	8ro0:A	2231	45	0.1512	0.0058	0.2889	9.4	8ro1:A
35	3mwf:A	292	60	0.2093	0.0616	0.3000	9.7

[Back]