Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
PQQIDALRTLIRLGSLHTPMVVRTAATLRLVDHILAGARTVKALAARTDTRPEALLRLIRHLVAIGLLEEDAPGEFVPTE
VGELLADDHPAAQRAWHDLTQAVARADISFTRLPDAIRTGRPTYESIYGKPFYEDLAGRPDLRASFDSLLACDQDVAFDA
PAAAYDWTNVRHVLDVGGGKGGFAAAIARRAPHVSATVLEMAGTVDTARSYLKDEGLSDRVDVVEGDFFEPLPRKADAII
LSFVLLNWPDHDAVRILTRCAEALEPGGRILIHERDDLHENSFNEQFTELDLRMLVFLGGALRTREKWDGLAASAGLVVE
EVRQLPSPTIPYDLSLLVLAPA

The query sequence (length=342) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1tw2:B 350 342 1.0000 0.9771 1.0000 0.0 5eeg:A, 5eeg:B, 5eeh:A, 5eeh:B, 5eeh:C, 5jr3:A, 5jr3:B, 5jr3:C, 7owb:A, 7oy1:A, 7oy1:B, 7pga:A, 7pga:B, 7pga:C, 7pga:D, 7pgj:A, 7phd:A, 7phd:B, 7phe:A, 7phe:B, 7phf:A, 7phf:D, 7phf:C, 1tw2:A, 1tw3:A, 1tw3:B, 4wxh:A, 4wxh:B
2 7phf:B 270 342 0.7281 0.9222 0.7281 8.96e-148
3 1qzz:A 340 337 0.5497 0.5529 0.5579 2.03e-122 1r00:A, 1xds:A, 1xds:B, 1xdu:A
4 7pg7:D 329 342 0.5234 0.5441 0.5234 3.02e-100
5 3i58:A 328 318 0.4123 0.4299 0.4434 8.16e-68 3i53:A, 3i53:B, 3i58:B, 3i5u:A, 3i5u:B, 3i64:A, 3i64:B
6 6clx:B 342 324 0.3713 0.3713 0.3920 1.58e-59 6clx:A
7 6c5b:A 332 304 0.2690 0.2771 0.3026 2.52e-34 6c5b:B
8 3gwz:A 339 311 0.2836 0.2861 0.3119 1.25e-27 3gwz:D, 3gwz:C, 3gwz:B, 3gxo:A, 3gxo:D, 3gxo:C, 3gxo:B
9 8bir:A 321 319 0.2398 0.2555 0.2571 8.04e-26 8big:A, 8big:B, 8big:C, 8big:D, 8big:E, 8big:F, 8big:G, 8big:H, 8bii:A, 8bii:B, 8bii:C, 8bii:D, 8bii:E, 8bii:F, 8bii:G, 8bii:H, 8bir:B
10 8bgt:A 319 215 0.1784 0.1912 0.2837 3.25e-24 8bgt:B, 8bgx:A, 8bgx:B, 8bgx:C, 8bgx:D, 8bgy:A, 8bgy:B, 8bgy:C, 8bgy:D, 8bgz:A, 8bgz:B, 8bgz:C, 8bgz:D, 8bh0:A, 8bh0:B, 8bh0:C, 8bh0:D, 8bh0:E, 8bh0:F, 8bh0:G, 8bh0:H, 8bib:A, 8bib:B, 8bib:C, 8bib:D, 8bid:A, 8bid:B, 8bid:C, 8bid:D, 8bih:A, 8bih:B, 8bih:C, 8bih:D, 8bih:E, 8bih:F, 8bih:G, 8bih:H, 8bih:I, 8bih:J, 8bih:K, 8bih:L
11 8bif:A 318 208 0.1813 0.1950 0.2981 7.57e-24 8bif:B, 8bif:C, 8bif:D
12 3lst:A 333 291 0.2719 0.2793 0.3196 1.41e-23 3lst:B
13 8bie:A 318 324 0.2251 0.2421 0.2377 3.04e-23 8bie:B, 8bij:A, 8bij:B
14 8bic:B 323 328 0.2339 0.2477 0.2439 1.89e-21 8bic:A
15 5icc:A 352 325 0.2310 0.2244 0.2431 6.91e-21 5ice:A, 5icf:A
16 8tjj:C 330 265 0.2310 0.2394 0.2981 1.40e-19 8tjj:A, 8tjj:B, 8tjj:D, 8tjk:A, 8tjk:B
17 5xoh:A 348 326 0.2368 0.2328 0.2485 7.85e-19
18 6nej:B 346 315 0.2456 0.2428 0.2667 8.56e-19 6neg:A, 6neg:B, 6neh:A, 6neh:B, 6nej:A
19 6cig:A 349 240 0.1784 0.1748 0.2542 4.31e-18 1fp2:A
20 6i6m:B 357 211 0.1842 0.1765 0.2986 7.82e-18 6i5z:A, 6i5z:B, 6i5z:D, 6i6k:A, 6i6k:B, 6i6l:A, 6i6l:B, 6i6m:A, 6i6n:A, 6i6n:B
21 2qyo:A 353 302 0.2251 0.2181 0.2550 5.87e-17 2qyo:B
22 4a6d:A 345 210 0.1988 0.1971 0.3238 7.69e-16 4a6e:A
23 4evi:A 360 299 0.2251 0.2139 0.2575 1.62e-15 4e70:A, 4e70:B, 4evi:B
24 4u1q:A 341 142 0.1345 0.1349 0.3239 2.17e-14 4u1q:B, 4u1q:C, 4u1q:D, 4x3q:A, 4x3q:B, 4x3q:C, 4x3q:D
25 7wdq:A 336 110 0.1082 0.1101 0.3364 5.24e-14 7wdq:B, 7wdq:C, 7wdw:A, 7wdw:B, 7wdw:C, 7wdw:D
26 7v6l:B 347 315 0.2105 0.2075 0.2286 9.67e-14 7v6j:A, 7v6j:B, 7v6l:A
27 1kyw:C 361 214 0.1550 0.1468 0.2477 1.04e-13 1kyw:F, 1kyz:A, 1kyz:C, 1kyz:E
28 7clf:A 335 275 0.2222 0.2269 0.2764 3.49e-13 7clf:B
29 1x1a:A 337 258 0.1871 0.1899 0.2481 4.22e-13 1x1b:A, 1x1c:A, 1x1d:A
30 7waq:D 365 214 0.1667 0.1562 0.2664 1.43e-12 7vb8:B, 7vb8:A, 7waq:B, 7waq:A, 7waq:C, 7war:B, 7war:A, 7was:A, 7was:B
31 1fp1:D 340 154 0.1199 0.1206 0.2662 3.92e-12 1fpq:A
32 5cvj:D 361 210 0.1404 0.1330 0.2286 7.47e-12 5cvj:A, 5cvj:B, 5cvj:C, 5cvu:A, 5cvu:B, 5cvu:C, 5cvu:D, 5cvv:A, 5cvv:B, 3reo:A, 3reo:B, 3reo:C, 3reo:D, 3tky:A, 3tky:B, 3tky:C, 3tky:D
33 6i71:A 353 214 0.1433 0.1388 0.2290 3.75e-11 6i71:B, 6i72:A, 6i72:B, 6i73:A, 6i73:B, 6yjw:A, 6yjw:B
34 7wh9:A 476 377 0.2749 0.1975 0.2493 7.57e-11 7wh9:B, 7wh9:C
35 8pha:A 450 108 0.0994 0.0756 0.3148 2.29e-10 8pha:B
36 8har:A 357 291 0.2164 0.2073 0.2543 7.90e-10 8har:B
37 6inw:B 390 360 0.2368 0.2077 0.2250 8.51e-10 6inw:A, 6iv7:A, 6iv7:B, 6ix3:A, 6ix3:B, 6ix5:A, 6ix5:B, 6ix7:A, 6ix7:B, 6ix8:A, 6ix8:B, 6ix9:A, 6ix9:B, 6j1o:A, 6j1o:B, 6j24:B, 6j24:A, 6j46:A, 6j46:B, 5zzd:A, 5zzd:B
38 1zg3:A 358 134 0.1228 0.1173 0.3134 1.65e-09 1zga:A, 1zgj:A, 1zhf:A
39 3p9i:A 357 335 0.2281 0.2185 0.2328 2.61e-09 3p9c:A, 3p9i:B, 3p9i:C, 3p9i:D, 3p9k:A, 3p9k:B, 3p9k:C, 3p9k:D
40 5i2h:A 335 105 0.0965 0.0985 0.3143 3.02e-09 5i2h:B
41 4pgh:D 358 281 0.2018 0.1927 0.2456 2.04e-08 4pgh:A, 4pgh:B, 4pgh:C
42 8xte:A 395 339 0.2661 0.2304 0.2684 2.11e-08 8xte:B, 8xte:C, 8xte:D, 8xte:E, 8xte:F, 8xtf:A, 8xtg:A, 8xtg:B, 8xtg:C, 8xtg:D, 8xtg:E, 8xtg:F
43 7bqk:A 459 185 0.1491 0.1111 0.2757 1.07e-05 7bqk:B, 7bql:A, 7bql:B
44 6wlf:B 434 103 0.0789 0.0622 0.2621 5.91e-05 6wlf:A
45 7wuy:A 393 167 0.1374 0.1196 0.2814 1.55e-04 7wuy:B, 7wvs:A, 7wvs:B, 7ww0:A, 7ww0:B
46 1l3i:A 186 128 0.1023 0.1882 0.2734 4.14e-04 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
47 7y3h:A 396 320 0.2339 0.2020 0.2500 5.00e-04 8gx4:A, 8gzi:A
48 7bqo:A 451 180 0.1433 0.1086 0.2722 6.52e-04
49 1wzn:A 244 102 0.0877 0.1230 0.2941 0.003 1wzn:B, 1wzn:C
50 1sg9:A 274 81 0.0673 0.0839 0.2840 0.004 1nv8:A, 1nv8:B, 1nv9:A, 1sg9:B, 1sg9:C, 1vq1:A, 1vq1:B
51 9fce:B 209 97 0.0994 0.1627 0.3505 0.004 9fce:A
52 7d8f:A 234 116 0.0819 0.1197 0.2414 0.009 7d8d:A
53 4gek:G 231 107 0.0673 0.0996 0.2150 0.010 4gek:A, 4iwn:A, 4iwn:B
54 1im8:A 225 123 0.0877 0.1333 0.2439 0.011 1im8:B
55 9fcx:A 214 133 0.1111 0.1776 0.2857 0.020 9fcd:A, 9fcl:A, 9fcq:A, 9fcs:A, 9fcs:B, 9fcu:A, 9fcu:B, 9fcu:C, 9fcu:D, 9fcx:B, 9fcy:A, 9fcy:B, 9fcy:C, 9fcy:D, 9fd3:A, 9g0k:A, 9g0k:B
56 6dtn:B 233 68 0.0643 0.0944 0.3235 0.040 5cvd:A, 5cvd:B, 5cve:A, 5cve:B, 5e1b:A, 5e1b:B, 5e1d:A, 5e1d:B, 5e1m:A, 5e1m:B, 5e1o:A, 5e1o:B, 5e2a:A, 5e2a:B, 5e2b:A, 5e2b:B, 2ex4:A, 2ex4:B, 7k3d:B, 7k3d:A, 6kdq:A, 6kdq:B, 6pva:B, 6pvb:B, 7ss1:A, 7ss1:B, 7u1m:A, 7u1m:B, 6wh8:B, 6wh8:A, 6wj7:B
57 4iv8:A 245 102 0.0819 0.1143 0.2745 0.049 4iv8:B
58 7ux7:A 378 223 0.1667 0.1508 0.2556 0.050 7ux6:A, 7ux6:B, 7ux7:B, 7ux8:A, 7ux8:B
59 6dub:A 222 110 0.0906 0.1396 0.2818 0.062 6dub:B, 6kdr:A, 6kdr:B, 6kds:A, 5ubb:A
60 8joz:A 257 99 0.0906 0.1206 0.3131 0.13 4htf:A, 4htf:B
61 8r4z:A 341 83 0.0819 0.0821 0.3373 0.13 8r4z:B, 8rvc:A, 8rvc:B, 8rvs:A, 8rvs:B, 8rwm:A, 8rwm:B
62 5fad:A 160 103 0.0760 0.1625 0.2524 0.21 5fa8:A
63 7nzi:A 207 148 0.1228 0.2029 0.2838 0.21 2fca:A, 2fca:B, 7nyb:A, 7nyb:B, 7nzi:B
64 4kif:B 339 255 0.1754 0.1770 0.2353 0.30 4kib:A, 4kib:B, 4kic:A, 4kic:B, 4kif:A, 4kig:A, 4kig:B, 4m6x:A, 4m6x:B, 4m6y:A, 4m6y:B, 4m71:A, 4m71:B, 4m72:A, 4m72:B, 4m73:A, 4m73:B, 4m74:A, 4m74:B
65 8rpr:A 338 148 0.1082 0.1095 0.2500 0.33 8ftr:A, 8fts:A, 8ftv:A, 8rww:A, 8rxf:A, 8rxg:A
66 6dcb:A 225 125 0.0936 0.1422 0.2560 0.37 6dcc:A, 5una:C, 5una:A, 5una:B, 5una:D, 5una:E, 5una:F
67 3dlc:A 219 103 0.0848 0.1324 0.2816 0.50
68 6dnz:A 317 73 0.0789 0.0852 0.3699 0.50 6dnz:C
69 3dtn:A 220 98 0.0585 0.0909 0.2041 0.63 3dtn:B
70 1gws:A 503 42 0.0409 0.0278 0.3333 0.70 2cvc:A, 1h29:A, 1h29:B, 1h29:C, 1h29:D
71 7v6h:A 267 194 0.1433 0.1835 0.2526 0.71 7v6h:B
72 3hm2:G 171 70 0.0614 0.1228 0.3000 0.80
73 5gm2:B 282 104 0.0731 0.0887 0.2404 1.7 5gm1:A, 5gm1:B, 5gm1:C, 5gm1:D, 5gm1:E, 5gm1:F, 5gm1:G, 5gm1:H, 5gm1:I, 5gm1:J, 5gm1:K, 5gm1:L, 5gm1:M, 5gm1:N, 5gm1:O, 5gm1:P, 5gm1:Q, 5gm1:R, 5gm2:A, 5gm2:C, 5gm2:D, 5gm2:E, 5gm2:F, 5gm2:G, 5gm2:H, 5gm2:I, 5gm2:J, 5gm2:L, 5gm2:M, 5gm2:N, 5gm2:O, 5gm2:P, 5gm2:Q, 5gm2:R
74 6o65:B 294 63 0.0643 0.0748 0.3492 1.8 6o65:A, 6o65:C, 6o65:D, 6o65:E, 6o65:F, 6o65:G, 6o65:H
75 5bxy:A 155 114 0.0936 0.2065 0.2807 1.9 5bxy:B
76 1jg1:A 215 103 0.0877 0.1395 0.2913 1.9 1jg2:A, 1jg3:A, 1jg3:B, 1jg4:A
77 5wmm:A 870 106 0.0877 0.0345 0.2830 2.1
78 5epe:A 248 103 0.0819 0.1129 0.2718 2.4
79 1bbu:A 486 27 0.0439 0.0309 0.5556 2.9
80 7joz:R 446 77 0.0585 0.0448 0.2597 3.2 7ckw:R, 7ckx:R, 7cky:R, 7ckz:R, 7crh:R, 7f0t:F, 7f1o:F, 7f1z:F, 7f23:F, 7f24:F, 8irr:R, 7jv5:R, 7jvp:R, 7jvq:R, 8jxr:A, 8jxs:A, 7ljc:R, 7ljd:R, 7x2c:F, 7x2d:F, 7x2f:F
81 5yh8:A 510 61 0.0526 0.0353 0.2951 3.2 5yhe:A, 5yhe:B, 5yhg:A
82 7a7b:A 323 70 0.0497 0.0526 0.2429 3.6 7a7b:B, 7a7b:C, 7a7b:D, 7a7b:E, 7a7b:F, 7a7b:H, 7apr:A, 7apr:B, 7apr:C, 7apr:D, 7apr:E, 7apr:F, 7apr:H
83 7a7b:G 265 71 0.0497 0.0642 0.2394 3.7
84 7apr:G 293 70 0.0497 0.0580 0.2429 4.9
85 5gm2:K 267 105 0.0789 0.1011 0.2571 4.9
86 1jq3:A 295 80 0.0673 0.0780 0.2875 5.0 1jq3:C, 1jq3:D
87 8tua:A 1329 52 0.0526 0.0135 0.3462 5.1 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
88 8sfj:A 1001 78 0.0614 0.0210 0.2692 5.5
89 6ecx:A 283 156 0.0936 0.1131 0.2051 5.8 6ect:A
90 4dzr:A 163 31 0.0380 0.0798 0.4194 6.2
91 7slp:A 239 112 0.0994 0.1423 0.3036 7.0 7slq:A
92 5bp9:A 237 134 0.0994 0.1435 0.2537 8.7
93 2b3t:A 276 71 0.0526 0.0652 0.2535 9.1 1t43:A
94 6qxl:J 404 53 0.0526 0.0446 0.3396 10.0

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218