BioLiP

>protein
PQLPPAPDDYPTFPDTSTWPVVFPELPAAPYGGPCRPPQHTSKAAAPRIPADRLPNHVAIVMDGNGRWATQRGLARTEGH
KMGEAVVIDIACGAIELGIKWLSLYAFSTENWKRSPEEVRFLMGFNRDVVRRRRDTLKKLGVRIRWVGSRPRLWRSVINE
LAVAEEMTKSNDVITINYCVNYGGRTEITEATREIAREVAAGRLNPERITESTIARHLQRPDIPDVDLFLRTSGEQRSSN
FMLWQAAYAEYIFQDKLWPDYDRRDLWAACEEYASRTRRFGSA

The query sequence (length=283) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ime:A	285	283	1.0000	0.9930	1.0000	0.0	6ime:B, 4onc:A, 4onc:B, 2vg2:A, 2vg2:C, 2vg2:B, 2vg2:D, 2vg3:A, 2vg3:C, 2vg3:B, 2vg3:D
2	4u82:A	236	233	0.3286	0.3941	0.3991	1.41e-63	4h8e:A, 3wyi:A
3	4q9o:A	240	239	0.3463	0.4083	0.4100	1.98e-59	5kh4:A, 5kh4:B, 5kh5:B, 4q9m:A, 4q9m:B, 4q9o:B
4	7jlr:A	237	233	0.3498	0.4177	0.4249	2.43e-58	7jlj:A, 7jlm:A, 7jlm:B
5	1x07:A	231	220	0.3216	0.3939	0.4136	4.15e-55	5cqj:A, 2e98:A, 2e98:B, 2e99:A, 2e99:B, 2e9a:A, 2e9a:B, 2e9c:A, 2e9c:B, 2e9d:A, 2e9d:B, 4h2j:A, 4h2j:B, 4h2m:A, 4h2m:B, 4h2o:B, 4h2o:A, 4h38:A, 4h3a:A, 4h3a:B, 4h3c:A, 4h3c:B, 1jp3:A, 3sgt:B, 3sgv:B, 3sgv:A, 3sgx:A, 3sh0:B, 3sh0:A, 3th8:B, 1ueh:A, 1ueh:B, 1v7u:A, 3wyj:A, 1x06:A, 1x08:A, 1x09:A
6	8kgb:C	245	228	0.3216	0.3714	0.3991	1.76e-54	8kgb:A, 8kgb:B, 8kgb:D, 8x35:A, 8x35:B, 8x36:A, 8x36:B, 8x37:A, 8x37:B
7	6szg:A	222	209	0.2721	0.3468	0.3684	3.63e-52	6szg:B, 6szh:B
8	5hxq:C	227	226	0.3004	0.3744	0.3761	5.25e-49	5hxp:A, 5hxp:C, 5hxq:A, 5hxt:A, 5hxt:B
9	5hc8:A	236	231	0.3180	0.3814	0.3896	7.76e-49	5hc7:A
10	5zhe:B	200	219	0.2898	0.4100	0.3744	1.00e-42
11	7pay:A	329	232	0.3039	0.2614	0.3707	8.89e-41	7pax:A, 7pb0:A, 7pb1:A, 6w2l:A, 6z1n:A
12	3ugs:B	208	227	0.2792	0.3798	0.3480	2.98e-36	3ugs:A
13	2vg1:A	228	228	0.2862	0.3553	0.3553	9.29e-33	2vg0:A, 2vg0:B, 2vg1:B
14	7vqb:A	207	225	0.2155	0.2947	0.2711	1.79e-19	7vq9:A, 7vq9:B, 7vqa:A, 7vqa:B, 7vqb:B, 7vqc:B, 7vqd:A, 7vqd:B
15	7cav:B	222	230	0.2085	0.2658	0.2565	4.33e-18	7caq:A, 7caq:B, 7car:A, 7car:B, 7cas:B, 7cav:A, 7cav:C, 7cav:D, 7cav:E, 7cav:F, 7cav:G, 7cav:H, 7cc3:A, 7cc3:B, 7cc3:C, 7cc3:D, 7cc3:E, 7cc3:F, 7cc3:G, 7cc3:H
16	5ygk:C	217	219	0.2120	0.2765	0.2740	2.02e-15	5gul:A, 5gul:B, 5gul:C, 5gul:D, 5ygk:A, 5ygk:B, 5ygk:H, 5ygk:D, 5ygk:E, 5ygk:F, 5ygk:G
17	5xk6:A	218	228	0.1873	0.2431	0.2325	6.72e-11	5xk6:B, 5xk6:C, 5xk6:D, 5xk7:A, 5xk7:B, 5xk7:C, 5xk7:D, 5xk8:A, 5xk8:B, 5xk8:C, 5xk8:D, 5xk9:A, 5xk9:B, 5xk9:C, 5xk9:D, 5xk9:E, 5xk9:F, 5xk9:G, 5xk9:H
18	6w2l:B	195	130	0.1025	0.1487	0.2231	0.002	7pb1:B
19	5kr6:B	460	24	0.0530	0.0326	0.6250	1.4	5kr6:A
20	5w6y:A	244	87	0.0813	0.0943	0.2644	2.3	5w6y:B
21	5kqu:C	459	38	0.0565	0.0349	0.4211	4.9	5kqt:A, 5kqu:A, 5kqu:D, 5kqu:B, 5kqu:E, 5kqu:F
22	8p94:A	414	32	0.0389	0.0266	0.3438	6.2	6dec:A, 6dec:H, 3dxk:A, 3dxm:A, 4jd2:A, 7jpn:A, 2p9i:A, 2p9k:A, 2p9n:A, 2p9p:A, 2p9s:A, 2p9u:A, 3rse:A, 7t5q:A, 8tah:A, 7tpt:A, 1tyq:A, 1u2v:A, 6uhc:A, 3ukr:A, 3uku:A, 3ule:A, 6yw6:A, 6yw7:A
23	2dm6:B	333	95	0.0883	0.0751	0.2632	7.6	2dm6:A, 1v3t:A, 1v3t:B, 1v3v:A, 1v3v:B

[Back]