BioLiP

>protein
PQDLSEALKEATKEVHTQAENAEFMRNFQKGQVTRDGFKLVMASLYHIYVALEEEIERNKESPVFAPVYFPEELHRKAAL
EQDLAFWYGPRWQEVIPYTPAMQRYVKRLHEVGRTEPELLVAHAYTRYLGDLSGGQVLKKIAQKALDLPSSGEGLAFFTF
PNIASATKFKQLYESRMNSLEMTPAVRQRVIEEAKTAFLLNIQLFEELQELLTH

The query sequence (length=214) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1ni6:C	223	214	0.9953	0.9552	0.9953	8.02e-159	5btq:A, 5btq:B, 3czy:A, 3czy:B, 6eha:A, 6eha:B, 3hok:A, 3hok:B, 3k4f:A, 3k4f:B, 1n3u:A, 1n3u:B, 1n45:A, 1n45:B, 1oyk:A, 1oyk:B, 1oyl:A, 1oyl:B, 1oze:A, 1oze:B, 1ozl:A, 1ozl:B, 1ozr:A, 1ozr:B, 1ozw:A, 1ozw:B, 1s13:A, 1s13:B, 1s8c:A, 1t5p:A, 1t5p:B, 3tgm:A, 3tgm:B, 1twn:A, 1twn:B, 1twr:A, 1twr:B, 4wd4:A, 4wd4:B, 4wd4:C, 4wd4:D, 1xjz:A, 1xjz:B, 1xk0:A, 1xk0:B, 1xk1:A, 1xk1:B, 1xk2:A, 1xk2:B, 1xk3:A, 1xk3:B
2	6j79:A	816	211	0.8318	0.2181	0.8436	8.86e-126	1amo:A, 1amo:B, 1b1c:A, 1dve:A, 1dvg:A, 1dvg:B, 2dy5:A, 2e7e:A, 5emn:A, 5emn:B, 3es9:A, 3es9:B, 3es9:C, 5fa6:A, 5fa6:B, 4g7l:A, 4g7p:A, 4g7t:A, 4g7u:A, 4g8p:A, 4g8u:A, 4g8w:A, 4g98:A, 4g99:A, 3i9t:A, 3i9u:A, 1ivj:A, 1ix3:A, 1ix4:A, 1j02:A, 1j2c:A, 6j79:B, 6j7a:A, 6j7a:B, 6j7i:A, 6j7i:B, 1j9z:A, 1j9z:B, 1ja0:A, 1ja0:B, 1ja1:A, 1ja1:B, 7l18:AAA, 7l18:BBB, 4mec:A, 4mec:B, 4mec:C, 4mec:D, 4mec:E, 6njr:A, 6njr:B, 3ojw:A, 3ojx:A, 3qe2:A, 3qe2:B, 3qfc:A, 3qfc:B, 3qfr:A, 3qfr:B, 1ubb:A, 1ulx:A, 5urd:A, 5urd:B, 5ure:A, 5ure:B, 5urg:A, 5urg:B, 5urh:A, 5urh:B, 5uri:A, 5uri:B, 1vgi:A, 3wkt:A, 3wkt:B, 3wkt:C, 3wkt:D, 4y7c:A, 4y7c:B, 4y9r:A, 4y9r:B, 4y9u:A, 4y9u:B, 4yaf:A, 4yaf:B, 4yal:A, 4yal:B, 4yao:A, 4yao:B, 4yau:A, 4yau:B, 4yaw:A, 4yaw:B, 2zvu:A
3	2qpp:B	219	208	0.5421	0.5297	0.5577	6.50e-88	2q32:A, 2q32:B, 2qpp:A, 2rgz:A, 2rgz:B, 5uc9:A, 5uc9:B, 5uc9:C, 5uc9:D
4	1we1:A	222	207	0.4393	0.4234	0.4541	1.71e-65	1we1:B, 1we1:C, 1we1:D
5	1wow:A	245	213	0.4299	0.3755	0.4319	2.45e-60	1wov:A, 1wov:B, 1wow:B, 1wox:A, 1wox:B
6	5kzl:A	205	205	0.4206	0.4390	0.4390	1.69e-56
7	4gpc:A	212	207	0.3318	0.3349	0.3430	7.59e-32	4gpc:B, 4gpc:C, 4gpf:A, 4gpf:B, 4gpf:C, 4gph:A, 4gph:B, 4gph:C, 3i8r:A, 3i8r:B, 3i8r:C, 1iw0:B, 1iw0:A, 1iw0:C, 1iw1:A, 1iw1:B, 1iw1:C, 3moo:A, 3moo:B, 1v8x:A, 1v8x:B, 1v8x:C, 1wnv:A, 1wnv:B, 1wnv:C, 1wnw:A, 1wnw:B, 1wnw:C, 1wnx:A, 1wnx:B, 1wzd:A, 1wzd:B, 1wzf:A, 1wzf:B, 1wzg:A, 1wzg:B, 2z68:A, 2z68:B
8	7cka:A	211	136	0.1495	0.1517	0.2353	0.002
9	7eqh:A	212	193	0.2103	0.2123	0.2332	0.003	7eqh:B
10	7z1l:A	1436	33	0.0701	0.0104	0.4545	0.035	8bws:A, 6cnb:A, 6cnc:A, 6cnd:A, 6cnf:A, 6eu0:A, 6eu1:A, 5fj8:A, 7z0h:A, 7z1m:A, 7z1n:A, 7z1o:A, 7z2z:A, 7z30:A, 7z31:A
11	6eu2:A	1402	33	0.0701	0.0107	0.4545	0.035	6eu3:A
12	5fj9:A	1412	33	0.0701	0.0106	0.4545	0.035	6f40:A, 6f41:A, 6f42:A, 6f44:A, 5fja:A, 6tut:A
13	8w4g:A	876	146	0.1963	0.0479	0.2877	2.5	8w4i:A, 8w4n:A, 8x8g:A
14	6d7j:A	799	78	0.0888	0.0238	0.2436	3.4	6d7j:D
15	7aju:CL	808	154	0.1589	0.0421	0.2208	4.1	6zqd:CL, 6zqe:CL, 6zqf:CL, 6zqg:CL
16	8cie:A	280	37	0.0654	0.0500	0.3784	4.2	4bgq:A
17	4yi7:A	331	44	0.0654	0.0423	0.3182	6.6
18	5mrc:JJ	186	89	0.1121	0.1290	0.2697	6.9	5mre:JJ, 5mrf:JJ
19	1nd6:B	343	84	0.1308	0.0816	0.3333	8.1	1cvi:A, 1cvi:B, 1cvi:C, 1cvi:D, 2hpa:A, 2hpa:B, 2hpa:D, 1nd5:A, 1nd5:B, 1nd5:C, 1nd5:D, 1nd6:A, 1nd6:C, 1nd6:D
20	5esw:A	190	16	0.0467	0.0526	0.6250	8.4	5esx:A, 5esx:B

[Back]