Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PPYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYG
KDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYVSLIYTNYEVGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLL
IHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ

The query sequence (length=209) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6llx:B 215 209 0.9904 0.9628 0.9904 4.61e-155 10gs:A, 10gs:B, 20gs:A, 20gs:B, 11gs:A, 11gs:B, 12gs:A, 12gs:B, 13gs:A, 13gs:B, 17gs:A, 17gs:B, 18gs:A, 18gs:B, 19gs:A, 19gs:B, 2a2r:A, 2a2r:B, 2a2s:A, 2a2s:B, 6ap9:A, 6ap9:B, 1aqv:A, 1aqv:B, 1aqw:A, 1aqw:B, 1aqw:C, 1aqw:D, 1aqx:A, 1aqx:B, 1aqx:C, 1aqx:D, 7bia:A, 7bia:B, 3csh:A, 3csh:B, 3csi:A, 3csi:B, 3csi:C, 3csi:D, 3csj:B, 5dal:A, 5dal:B, 5dcg:B, 3dd3:A, 3dd3:B, 5ddl:A, 5ddl:B, 3dgq:A, 3dgq:B, 5djl:A, 5djl:B, 1gss:A, 1gss:B, 2gss:A, 2gss:B, 3gss:A, 3gss:B, 4gss:A, 4gss:B, 5gss:A, 5gss:B, 6gss:A, 6gss:B, 7gss:A, 7gss:B, 8gss:A, 8gss:B, 8gss:C, 9gss:A, 9gss:B, 3gus:A, 3gus:B, 3hjm:A, 3hjm:B, 3hjm:C, 3hjm:D, 3hjo:A, 3hjo:B, 3hkr:A, 3hkr:B, 3ie3:A, 3ie3:B, 5j41:A, 5j41:B, 2j9h:A, 2j9h:B, 5jcw:A, 5jcw:B, 1kbn:A, 1kbn:B, 3km6:A, 3km6:B, 3kmn:A, 3kmn:B, 3kmo:A, 3kmo:B, 5l6x:A, 5l6x:B, 1lbk:A, 1lbk:B, 6llx:A, 1md3:A, 1md3:B, 1md4:A, 1md4:B, 3n9j:A, 3n9j:B, 1pgt:A, 1pgt:B, 2pgt:A, 2pgt:B, 3pgt:A, 3pgt:B, 4pgt:A, 4pgt:B, 1px6:A, 1px6:B, 1px7:A, 1px7:B, 5x79:A, 5x79:B, 7xba:A, 7xba:B, 6y1e:A, 6y1e:B, 6y1e:C, 6y1e:D, 1zgn:A, 1zgn:B
2 8c5d:A 209 209 0.8565 0.8565 0.8565 4.85e-136 8c5d:B, 1glp:A, 1glp:B, 1glq:A, 1glq:B, 2glr:A, 2glr:B, 1gsy:A, 1gsy:B, 1gti:A, 1gti:B, 1gti:C, 1gti:D, 1gti:E, 1gti:F, 3o76:A, 3o76:B, 2oa7:A, 2oa7:B, 2oac:A, 2oac:B, 2oad:A, 2oad:B
3 2gsr:A 207 209 0.8230 0.8309 0.8230 5.23e-129 2gsr:B
4 5d73:A 207 208 0.4258 0.4300 0.4279 1.23e-57 5d73:B
5 1tu7:A 208 208 0.4163 0.4183 0.4183 4.90e-57 1tu7:B, 1tu8:A, 1tu8:B, 1tu8:C, 1tu8:D
6 2ab6:A 217 211 0.3110 0.2995 0.3081 2.61e-29 2ab6:B, 2ab6:C, 2ab6:D, 2c4j:A, 2c4j:B, 2c4j:C, 2c4j:D, 3gur:A, 3gur:B, 3gur:C, 3gur:D, 1hna:A, 1hnb:A, 1hnb:B, 1hnc:A, 1hnc:B, 1hnc:C, 1hnc:D, 5hwl:A, 5hwl:B, 1xw5:A, 1xw5:B, 1ykc:A, 1ykc:B
7 7opy:F 217 211 0.2775 0.2673 0.2749 1.86e-28 7opy:A, 7opy:B, 7opy:C, 7opz:C, 7opz:A, 7opz:B, 7opz:D
8 5fwg:A 217 211 0.2919 0.2811 0.2891 3.52e-28 5fwg:B, 3fyg:A, 3fyg:B, 2gst:A, 2gst:B, 3gst:A, 3gst:B, 4gst:A, 4gst:B, 5gst:A, 5gst:B, 6gst:A, 6gst:B, 6gsu:A, 6gsu:B, 6gsv:A, 6gsv:B, 6gsw:A, 6gsw:B, 6gsx:A, 6gsx:B, 6gsy:A, 6gsy:B, 1mtc:A, 1mtc:B
9 1b48:A 221 192 0.3110 0.2941 0.3385 9.27e-27 1b48:B
10 1b4p:A 217 211 0.2871 0.2765 0.2844 1.29e-26
11 2f3m:A 218 211 0.2871 0.2752 0.2844 7.31e-26 2f3m:B, 2f3m:C, 2f3m:D, 2f3m:E, 2f3m:F, 1xw6:A, 1xw6:B, 1xw6:C, 1xw6:D, 1xwk:A, 1xwk:B, 1xwk:C, 1yj6:A, 1yj6:B, 1yj6:C
12 5an1:A 219 211 0.2775 0.2648 0.2749 7.47e-26 5an1:B, 5an1:C, 5an1:D, 5an1:E, 5an1:F, 5an1:G, 5an1:H, 7so8:A, 7so8:C, 7so8:E, 7so8:G, 7so8:H, 7so8:F, 7so8:B, 7so8:D
13 6zj9:A 220 193 0.3158 0.3000 0.3420 1.17e-24 6zjc:B, 6zjc:A, 6zjc:D, 6zjc:C
14 2fhe:A 216 212 0.2919 0.2824 0.2877 1.49e-24 2fhe:B
15 1c72:A 217 209 0.2919 0.2811 0.2919 1.71e-24 1c72:B, 1c72:C, 1c72:D, 1gsu:A, 1gsu:B
16 3iso:A 218 203 0.2823 0.2706 0.2906 1.81e-24 3iso:B, 4l5l:A, 4l5l:B, 4l5o:A, 4l5o:C, 4l5o:B
17 1vf1:A 226 193 0.3062 0.2832 0.3316 2.18e-23 1vf2:A, 1vf2:B, 1vf3:A, 1vf3:B
18 4q5q:A 218 209 0.2823 0.2706 0.2823 1.65e-22 4q5q:B
19 4ai6:A 2650 171 0.2536 0.0200 0.3099 9.85e-22 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
20 1gsq:A 202 200 0.3110 0.3218 0.3250 1.26e-21 2gsq:A
21 1f3b:A 222 211 0.2919 0.2748 0.2891 1.66e-21 1ev4:A, 1ev4:C, 1ev4:D, 1ev9:A, 1ev9:C, 1ev9:D, 1f3a:A, 1f3a:B, 1f3b:B, 5lcz:A, 5lcz:B, 1ml6:A, 1ml6:B
22 6ato:A 221 193 0.2871 0.2715 0.3109 1.39e-20 4acs:A, 4acs:B, 4acs:C, 4acs:D, 6ato:B, 6atr:A, 6atr:B, 7bib:A, 7bib:B, 1gse:A, 1gse:B, 1gsf:A, 1gsf:B, 1gsf:C, 1gsf:D, 1guh:A, 1guh:B, 1guh:C, 1guh:D, 4hj2:A, 4hj2:B, 3i69:A, 3i69:B, 3i69:C, 3i69:D, 3i6a:A, 3i6a:B, 3i6a:C, 3i6a:D, 3i6a:E, 3i6a:F, 3i6a:G, 3i6a:H, 3ik9:A, 3ik9:B, 3ik9:C, 3ik9:D, 3ik9:E, 3ik9:F, 3ik9:G, 3ik9:H, 5jcu:A, 5jcu:B, 5jcu:C, 5jcu:D, 1k3l:A, 1k3l:B, 1k3y:A, 1k3y:B, 3ktl:A, 3ktl:B, 3l0h:A, 3l0h:B, 1pkw:A, 1pkw:B, 1pl1:A, 1pl1:B, 1pl2:A, 1pl2:B, 2r3x:A, 2r3x:B, 2r6k:A, 2r6k:B, 1tdi:A, 1tdi:B, 1usb:A, 1usb:B, 2vct:A, 2vct:B, 2vct:C, 2vct:D, 2vcv:A, 2vcv:B, 2vcv:C, 2vcv:D, 2vcv:E, 2vcv:F, 2vcv:G, 2vcv:H, 2vcv:I, 2vcv:J, 2vcv:K, 2vcv:L, 2vcv:M, 2vcv:N, 2vcv:O, 2vcv:P, 2wju:A, 2wju:B, 2wju:C, 2wju:D, 2wju:E, 2wju:F, 2wju:G, 2wju:H, 6yaw:A, 6yaw:B, 1ydk:A, 1ydk:B
23 1fhe:A 214 171 0.2584 0.2523 0.3158 6.26e-20
24 3ik7:A 221 191 0.2823 0.2670 0.3089 1.76e-19 1gul:A, 1gul:B, 1gul:C, 1gul:D, 1gul:E, 1gul:F, 1gul:G, 1gul:H, 3ik7:B, 3ik7:C, 3ik7:D
25 5b7c:A 206 203 0.2679 0.2718 0.2759 3.99e-18
26 4q5f:D 206 203 0.2775 0.2816 0.2857 8.79e-18 4q5f:A
27 2aaw:C 211 200 0.2536 0.2512 0.2650 5.44e-16 2aaw:A, 3fr3:A, 3fr3:B, 3fr9:A, 3fr9:B, 3frc:A, 3frc:B, 1q4j:A, 1q4j:B
28 2on5:A 206 204 0.2775 0.2816 0.2843 7.78e-16 2on5:B, 2on5:C, 2on5:D, 2on5:E, 2on5:F, 2on5:G, 2on5:H
29 3vpq:A 203 206 0.2823 0.2906 0.2864 6.28e-15 3vur:A
30 3w8s:A 205 204 0.2584 0.2634 0.2647 9.12e-15
31 4ofm:B 206 206 0.2823 0.2864 0.2864 1.86e-14 4ofm:A, 4ofm:C, 4ofm:D, 4ofn:A, 4ofn:B
32 6n69:B 199 202 0.2584 0.2714 0.2673 1.35e-13 6n69:A, 1pd2:1, 1pd2:2, 5y9z:A, 5y9z:B
33 1zl9:A 207 206 0.2775 0.2802 0.2816 2.66e-13 1zl9:B
34 5h5l:B 199 197 0.2153 0.2261 0.2284 3.60e-13 5h5l:A
35 4q5r:A 202 204 0.2775 0.2871 0.2843 4.81e-13 4q5r:C, 4q5r:D, 4q5r:B, 4q5r:F, 4q5r:E
36 4q5n:A 220 208 0.2201 0.2091 0.2212 5.21e-13 4q5n:B
37 2vcz:C 177 193 0.2201 0.2599 0.2383 7.43e-13
38 4ec0:B 200 197 0.2249 0.2350 0.2386 1.13e-12 5ais:A, 5ais:B, 5ais:C, 5ais:D, 5aiv:A, 5aiv:B, 5aiv:C, 5aiv:D, 5aix:B, 5aix:C, 2cvd:A, 2cvd:B, 2cvd:C, 2cvd:D, 4ec0:A, 4edy:A, 4edy:B, 4edz:A, 4edz:B, 4edz:C, 4edz:D, 3ee2:A, 4ee0:A, 4ee0:B, 1iyh:A, 1iyh:B, 1iyh:C, 1iyh:D, 1iyi:A, 1iyi:B, 1iyi:C, 1iyi:D, 7jr6:A, 7jr6:B, 7jr8:A, 7jr8:B, 3kxo:A, 3kxo:B, 6n4e:A, 1v40:A, 1v40:B, 1v40:C, 1v40:D, 2vcq:A, 2vcq:B, 2vcq:C, 2vcq:D, 2vcw:A, 2vcw:B, 2vcw:D, 2vcx:A, 2vcx:B, 2vcx:C, 2vcx:D, 2vcz:A, 2vcz:B, 2vcz:D, 2vd0:A, 2vd0:B, 2vd0:D, 2vd1:A, 2vd1:B, 2vd1:C, 2vd1:D, 3vi5:A, 3vi5:B, 3vi5:C, 3vi5:D, 3vi7:A, 3vi7:B, 3vi7:C, 3vi7:D, 6w58:A, 6w58:B, 6w8h:A, 6w8h:C, 5ywe:A, 5ywe:B, 5ywe:C, 5ywe:D, 5ywx:A, 5ywx:B, 5ywx:C, 5ywx:D, 5yx1:A, 5yx1:B, 5yx1:C, 5yx1:D, 6ztc:A, 6ztc:B
39 1m0u:A 203 194 0.2344 0.2414 0.2526 2.58e-12
40 6to3:AAA 190 154 0.2153 0.2368 0.2922 1.66e-11
41 2hnl:A 202 198 0.2488 0.2574 0.2626 1.11e-09 2hnl:B
42 2wb9:A 210 189 0.2488 0.2476 0.2751 2.56e-08 2wb9:B, 2wdu:A, 2wdu:B
43 4w66:A 236 208 0.2679 0.2373 0.2692 2.75e-08 4w66:B
44 1u3i:A 208 200 0.2153 0.2163 0.2250 3.82e-08
45 6zb6:C 227 167 0.2201 0.2026 0.2754 5.52e-08 7obo:AAA, 7odm:AAA, 6riv:B, 6riv:A, 6tk8:AAA, 6zb6:A, 6zb6:E, 6zb6:B, 6zb6:F, 6zb6:D
46 8ai8:A 183 148 0.1722 0.1967 0.2432 2.38e-07 8ai8:B, 8ai9:A, 8ai9:B, 8aib:A, 8aib:B, 7pka:A, 7pka:B
47 2ycd:A 213 185 0.2201 0.2160 0.2486 2.60e-07
48 2c80:A 208 162 0.1770 0.1779 0.2284 3.18e-07 2c80:B, 2ca8:A, 2caq:A, 2f8f:A, 2f8f:B, 1oe7:A, 1oe7:B, 1oe8:A, 1oe8:B
49 4kdx:A 207 152 0.1914 0.1932 0.2632 3.40e-06 4kdx:B
50 1bye:A 213 164 0.2010 0.1972 0.2561 5.89e-06 1axd:A, 1axd:B, 1bye:B, 1bye:C, 1bye:D
51 4iel:B 206 155 0.2010 0.2039 0.2710 6.34e-06 4iel:A
52 8agq:A 213 160 0.1866 0.1831 0.2437 1.59e-04 5f07:A
53 3lsz:A 223 154 0.1818 0.1704 0.2468 0.002 3lsz:B, 3lsz:C, 3lsz:D
54 4hi7:A 220 192 0.2249 0.2136 0.2448 0.004 4hi7:B
55 5f06:A 213 160 0.1818 0.1784 0.2375 0.004 5f06:B
56 4ri6:A 214 126 0.1675 0.1636 0.2778 0.004 4ri6:B, 4ri7:A, 4ri7:B
57 5a4u:A 211 66 0.1005 0.0995 0.3182 0.007 5a4u:B, 5a4u:C, 5a4u:D, 5a4u:E, 5a4u:F, 5a4v:A, 5a4v:B, 5a4v:C, 5a4v:D, 5a4v:E, 5a4v:F, 5a4w:A, 5a4w:B, 5a4w:C, 5a4w:D, 5a4w:E, 5a4w:F, 5a5k:A, 5a5k:B, 5a5k:C, 5a5k:D, 5a5k:E, 5a5k:F, 5a5k:G, 5a5k:H, 5a5k:I, 5a5k:J, 5a5k:K, 5a5k:L, 5a5k:M, 5a5k:N, 5a5k:O, 5a5k:P, 5a5k:Q, 5a5k:R, 5a5k:S, 5a5k:T, 5a5k:U, 5a5k:V, 5a5k:W, 5a5k:X, 1bx9:A, 1gnw:A, 1gnw:B
58 4nhw:D 217 147 0.1483 0.1429 0.2109 0.009 4nhw:A, 4nhw:B, 4nhw:C
59 4png:B 223 160 0.1770 0.1659 0.2313 0.012 4png:A
60 4mpg:B 252 148 0.1675 0.1389 0.2365 0.024 1ljr:A, 1ljr:B, 3ljr:A, 3ljr:B, 4mpg:A
61 4yan:A 252 57 0.0813 0.0675 0.2982 0.026 4yan:B, 4yan:C, 4yan:D
62 6nv6:B 207 47 0.0909 0.0918 0.4043 0.063
63 2c3q:A 239 153 0.1866 0.1632 0.2549 0.077 2c3q:B, 2c3q:C, 2c3q:D
64 5f05:C 211 171 0.1962 0.1943 0.2398 0.16 5f05:A, 5f05:B, 5f05:D
65 4pnf:B 221 147 0.1675 0.1584 0.2381 0.43 4pnf:A, 4pnf:C, 4pnf:D, 4pnf:E, 4pnf:F, 4pnf:G, 4pnf:H, 4yh2:A, 4yh2:B, 4yh2:C, 4yh2:D
66 8h41:B 357 56 0.0813 0.0476 0.3036 0.66 8h41:A, 6jqw:A, 6jqw:B, 6jqx:A, 6jqx:B
67 8ix7:B 221 183 0.2010 0.1900 0.2295 0.67 8ix7:A
68 4qq7:A 204 61 0.0909 0.0931 0.3115 0.67 4qq7:B
69 6sml:B 911 46 0.0813 0.0187 0.3696 1.2 6sli:B, 6sli:D, 6sli:G, 6sli:J, 6slj:B, 6slj:A, 6sln:B, 6sln:A, 6sm3:B, 6smq:B, 6smq:E
70 6ezy:B 212 165 0.1866 0.1840 0.2364 1.4 6f01:B, 6f05:A, 6f05:B, 6f05:C, 6f05:D, 6f05:E, 6f05:F, 6f05:G, 6f05:H, 6f05:I, 6f05:J
71 3qaw:A 219 190 0.1627 0.1553 0.1789 1.4
72 4f0b:A 220 162 0.1579 0.1500 0.2037 1.4 4f0b:B
73 6u9d:L 255 62 0.1005 0.0824 0.3387 1.7 6u9d:C, 6u9d:O, 6u9d:P, 6u9d:D, 6u9d:G, 6u9d:H, 6u9d:K, 6u9d:S, 6u9d:T, 6u9d:W, 6u9d:X, 6wo1:B
74 1bog:B 213 89 0.1148 0.1127 0.2697 2.1 1cfn:B, 1cfs:B, 1cft:B, 1hh6:B, 1hh9:B, 1hi6:B
75 4hoj:A 197 66 0.0861 0.0914 0.2727 2.8
76 5l6v:I 400 74 0.0909 0.0475 0.2568 2.9
77 1cf3:A 581 119 0.1388 0.0499 0.2437 3.2 1gal:A, 8jpz:A, 8jpz:B, 5nit:A, 5niw:A, 3qvp:A, 3qvr:A
78 5agy:A 219 67 0.0909 0.0868 0.2836 3.2 5agy:B, 4chs:A, 4chs:B, 4top:A, 4top:B, 2vo4:A, 2vo4:B
79 4i97:A 207 122 0.1340 0.1353 0.2295 3.6 4i97:B
80 3uar:A 203 59 0.0909 0.0936 0.3220 3.6
81 2eab:A 888 65 0.0957 0.0225 0.3077 3.8 2eab:B, 2eac:A, 2eac:B, 2ead:B, 2ead:A, 2eae:A
82 7sn8:D 399 44 0.0718 0.0376 0.3409 4.0
83 7pq3:BBB 269 110 0.1531 0.1190 0.2909 5.2 7pq3:AAA
84 2w41:B 507 57 0.0957 0.0394 0.3509 5.9 2w40:A, 2w40:B, 2w40:C, 2w40:D, 2w41:A
85 4ikh:A 227 69 0.0813 0.0749 0.2464 6.8
86 5hut:A 469 51 0.0861 0.0384 0.3529 7.2 5hut:B, 5huu:A, 5huu:B, 5huv:A, 5huv:B, 5hvl:A, 5hvl:B
87 7rka:A 211 131 0.1675 0.1659 0.2672 8.6
88 4v5z:Bp 159 43 0.0622 0.0818 0.3023 9.9

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218