Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
PPYTITYFPVRGRCEAMRMLLADQDQSWKEEVVTMETWPPLKPSCLFRQLPKFQDGDLTLYQSNAILRHLGRSFGLYGKD
QKEAALVDMVNDGVEDLRCKYATLIYTNYEAGKEKYVKELPEHLKPFETLLSQNQGGQAFVVGSQISFADYNLLDLLRIH
QVLNPSCLDAFPLLSAYVARLSARPKIKAFLASPEHVNRPINGNGKQ

The query sequence (length=207) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2gsr:A 207 207 1.0000 1.0000 1.0000 2.72e-157 2gsr:B
2 8c5d:A 209 209 0.8551 0.8469 0.8469 3.23e-131 8c5d:B, 1glp:A, 1glp:B, 1glq:A, 1glq:B, 2glr:A, 2glr:B, 1gsy:A, 1gsy:B, 1gti:A, 1gti:B, 1gti:C, 1gti:D, 1gti:E, 1gti:F, 3o76:A, 3o76:B, 2oa7:A, 2oa7:B, 2oac:A, 2oac:B, 2oad:A, 2oad:B
3 6llx:B 215 209 0.8357 0.8047 0.8278 1.68e-129 10gs:A, 10gs:B, 20gs:A, 20gs:B, 11gs:A, 11gs:B, 12gs:A, 12gs:B, 13gs:A, 13gs:B, 17gs:A, 17gs:B, 18gs:A, 18gs:B, 19gs:A, 19gs:B, 2a2r:A, 2a2r:B, 2a2s:A, 2a2s:B, 6ap9:A, 6ap9:B, 1aqv:A, 1aqv:B, 1aqw:A, 1aqw:B, 1aqw:C, 1aqw:D, 1aqx:A, 1aqx:B, 1aqx:C, 1aqx:D, 7bia:A, 7bia:B, 3csh:A, 3csh:B, 3csi:A, 3csi:B, 3csi:C, 3csi:D, 3csj:B, 5dal:A, 5dal:B, 5dcg:B, 3dd3:A, 3dd3:B, 5ddl:A, 5ddl:B, 3dgq:A, 3dgq:B, 5djl:A, 5djl:B, 1gss:A, 1gss:B, 2gss:A, 2gss:B, 3gss:A, 3gss:B, 4gss:A, 4gss:B, 5gss:A, 5gss:B, 6gss:A, 6gss:B, 7gss:A, 7gss:B, 8gss:A, 8gss:B, 8gss:C, 9gss:A, 9gss:B, 3gus:A, 3gus:B, 3hjm:A, 3hjm:B, 3hjm:C, 3hjm:D, 3hjo:A, 3hjo:B, 3hkr:A, 3hkr:B, 3ie3:A, 3ie3:B, 5j41:A, 5j41:B, 2j9h:A, 2j9h:B, 5jcw:A, 5jcw:B, 1kbn:A, 1kbn:B, 3km6:A, 3km6:B, 3kmn:A, 3kmn:B, 3kmo:A, 3kmo:B, 5l6x:A, 5l6x:B, 1lbk:A, 1lbk:B, 6llx:A, 1md3:A, 1md3:B, 1md4:A, 1md4:B, 3n9j:A, 3n9j:B, 1pgt:A, 1pgt:B, 2pgt:A, 2pgt:B, 3pgt:A, 3pgt:B, 4pgt:A, 4pgt:B, 1px6:A, 1px6:B, 1px7:A, 1px7:B, 5x79:A, 5x79:B, 7xba:A, 7xba:B, 6y1e:A, 6y1e:B, 6y1e:C, 6y1e:D, 1zgn:A, 1zgn:B
4 5d73:A 207 206 0.4251 0.4251 0.4272 7.30e-59 5d73:B
5 1tu7:A 208 206 0.4155 0.4135 0.4175 2.06e-57 1tu7:B, 1tu8:A, 1tu8:B, 1tu8:C, 1tu8:D
6 2ab6:A 217 211 0.3623 0.3456 0.3555 1.49e-34 2ab6:B, 2ab6:C, 2ab6:D, 2c4j:A, 2c4j:B, 2c4j:C, 2c4j:D, 3gur:A, 3gur:B, 3gur:C, 3gur:D, 1hna:A, 1hnb:A, 1hnb:B, 1hnc:A, 1hnc:B, 1hnc:C, 1hnc:D, 5hwl:A, 5hwl:B, 1xw5:A, 1xw5:B, 1ykc:A, 1ykc:B
7 2f3m:A 218 211 0.3333 0.3165 0.3270 3.34e-32 2f3m:B, 2f3m:C, 2f3m:D, 2f3m:E, 2f3m:F, 1xw6:A, 1xw6:B, 1xw6:C, 1xw6:D, 1xwk:A, 1xwk:B, 1xwk:C, 1yj6:A, 1yj6:B, 1yj6:C
8 1b4p:A 217 211 0.3333 0.3180 0.3270 2.19e-31
9 7opy:F 217 211 0.2995 0.2857 0.2938 1.85e-29 7opy:A, 7opy:B, 7opy:C, 7opz:C, 7opz:A, 7opz:B, 7opz:D
10 5fwg:A 217 211 0.3188 0.3041 0.3128 2.77e-29 5fwg:B, 3fyg:A, 3fyg:B, 2gst:A, 2gst:B, 3gst:A, 3gst:B, 4gst:A, 4gst:B, 5gst:A, 5gst:B, 6gst:A, 6gst:B, 6gsu:A, 6gsu:B, 6gsv:A, 6gsv:B, 6gsw:A, 6gsw:B, 6gsx:A, 6gsx:B, 6gsy:A, 6gsy:B, 1mtc:A, 1mtc:B
11 1b48:A 221 204 0.3382 0.3167 0.3431 9.01e-28 1b48:B
12 6zj9:A 220 194 0.3478 0.3273 0.3711 5.72e-27 6zjc:B, 6zjc:A, 6zjc:D, 6zjc:C
13 1gsq:A 202 195 0.3140 0.3218 0.3333 2.08e-26 2gsq:A
14 4q5f:D 206 201 0.3188 0.3204 0.3284 2.86e-26 4q5f:A
15 2fhe:A 216 208 0.2995 0.2870 0.2981 1.77e-25 2fhe:B
16 1f3b:A 222 211 0.3188 0.2973 0.3128 3.03e-25 1ev4:A, 1ev4:C, 1ev4:D, 1ev9:A, 1ev9:C, 1ev9:D, 1f3a:A, 1f3a:B, 1f3b:B, 5lcz:A, 5lcz:B, 1ml6:A, 1ml6:B
17 3iso:A 218 206 0.2947 0.2798 0.2961 3.97e-25 3iso:B, 4l5l:A, 4l5l:B, 4l5o:A, 4l5o:C, 4l5o:B
18 1vf1:A 226 208 0.3237 0.2965 0.3221 5.72e-25 1vf2:A, 1vf2:B, 1vf3:A, 1vf3:B
19 1c72:A 217 209 0.3092 0.2949 0.3062 1.18e-24 1c72:B, 1c72:C, 1c72:D, 1gsu:A, 1gsu:B
20 5an1:A 219 208 0.2754 0.2603 0.2740 3.26e-24 5an1:B, 5an1:C, 5an1:D, 5an1:E, 5an1:F, 5an1:G, 5an1:H, 7so8:A, 7so8:C, 7so8:E, 7so8:G, 7so8:H, 7so8:F, 7so8:B, 7so8:D
21 6ato:A 221 195 0.3140 0.2941 0.3333 6.02e-24 4acs:A, 4acs:B, 4acs:C, 4acs:D, 6ato:B, 6atr:A, 6atr:B, 7bib:A, 7bib:B, 1gse:A, 1gse:B, 1gsf:A, 1gsf:B, 1gsf:C, 1gsf:D, 1guh:A, 1guh:B, 1guh:C, 1guh:D, 4hj2:A, 4hj2:B, 3i69:A, 3i69:B, 3i69:C, 3i69:D, 3i6a:A, 3i6a:B, 3i6a:C, 3i6a:D, 3i6a:E, 3i6a:F, 3i6a:G, 3i6a:H, 3ik9:A, 3ik9:B, 3ik9:C, 3ik9:D, 3ik9:E, 3ik9:F, 3ik9:G, 3ik9:H, 5jcu:A, 5jcu:B, 5jcu:C, 5jcu:D, 1k3l:A, 1k3l:B, 1k3y:A, 1k3y:B, 3ktl:A, 3ktl:B, 3l0h:A, 3l0h:B, 1pkw:A, 1pkw:B, 1pl1:A, 1pl1:B, 1pl2:A, 1pl2:B, 2r3x:A, 2r3x:B, 2r6k:A, 2r6k:B, 1tdi:A, 1tdi:B, 1usb:A, 1usb:B, 2vct:A, 2vct:B, 2vct:C, 2vct:D, 2vcv:A, 2vcv:B, 2vcv:C, 2vcv:D, 2vcv:E, 2vcv:F, 2vcv:G, 2vcv:H, 2vcv:I, 2vcv:J, 2vcv:K, 2vcv:L, 2vcv:M, 2vcv:N, 2vcv:O, 2vcv:P, 2wju:A, 2wju:B, 2wju:C, 2wju:D, 2wju:E, 2wju:F, 2wju:G, 2wju:H, 6yaw:A, 6yaw:B, 1ydk:A, 1ydk:B
22 3vpq:A 203 200 0.2995 0.3054 0.3100 1.20e-22 3vur:A
23 4q5r:A 202 198 0.2802 0.2871 0.2929 4.20e-22 4q5r:C, 4q5r:D, 4q5r:B, 4q5r:F, 4q5r:E
24 4q5q:A 218 214 0.2995 0.2844 0.2897 6.54e-22 4q5q:B
25 4ai6:A 2650 158 0.2512 0.0196 0.3291 2.08e-21 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
26 1fhe:A 214 216 0.3237 0.3131 0.3102 2.49e-21
27 2on5:A 206 199 0.2947 0.2961 0.3065 1.78e-20 2on5:B, 2on5:C, 2on5:D, 2on5:E, 2on5:F, 2on5:G, 2on5:H
28 3ik7:A 221 188 0.2947 0.2760 0.3245 7.41e-20 1gul:A, 1gul:B, 1gul:C, 1gul:D, 1gul:E, 1gul:F, 1gul:G, 1gul:H, 3ik7:B, 3ik7:C, 3ik7:D
29 6n69:B 199 196 0.2754 0.2864 0.2908 1.44e-19 6n69:A, 1pd2:1, 1pd2:2, 5y9z:A, 5y9z:B
30 5h5l:B 199 196 0.2415 0.2513 0.2551 2.03e-19 5h5l:A
31 5b7c:A 206 198 0.2609 0.2621 0.2727 2.44e-19
32 4ec0:B 200 196 0.2560 0.2650 0.2704 8.44e-19 5ais:A, 5ais:B, 5ais:C, 5ais:D, 5aiv:A, 5aiv:B, 5aiv:C, 5aiv:D, 5aix:B, 5aix:C, 2cvd:A, 2cvd:B, 2cvd:C, 2cvd:D, 4ec0:A, 4edy:A, 4edy:B, 4edz:A, 4edz:B, 4edz:C, 4edz:D, 3ee2:A, 4ee0:A, 4ee0:B, 1iyh:A, 1iyh:B, 1iyh:C, 1iyh:D, 1iyi:A, 1iyi:B, 1iyi:C, 1iyi:D, 7jr6:A, 7jr6:B, 7jr8:A, 7jr8:B, 3kxo:A, 3kxo:B, 6n4e:A, 1v40:A, 1v40:B, 1v40:C, 1v40:D, 2vcq:A, 2vcq:B, 2vcq:C, 2vcq:D, 2vcw:A, 2vcw:B, 2vcw:D, 2vcx:A, 2vcx:B, 2vcx:C, 2vcx:D, 2vcz:A, 2vcz:B, 2vcz:D, 2vd0:A, 2vd0:B, 2vd0:D, 2vd1:A, 2vd1:B, 2vd1:C, 2vd1:D, 3vi5:A, 3vi5:B, 3vi5:C, 3vi5:D, 3vi7:A, 3vi7:B, 3vi7:C, 3vi7:D, 6w58:A, 6w58:B, 6w8h:A, 6w8h:C, 5ywe:A, 5ywe:B, 5ywe:C, 5ywe:D, 5ywx:A, 5ywx:B, 5ywx:C, 5ywx:D, 5yx1:A, 5yx1:B, 5yx1:C, 5yx1:D, 6ztc:A, 6ztc:B
33 4ofm:B 206 199 0.2802 0.2816 0.2915 1.02e-18 4ofm:A, 4ofm:C, 4ofm:D, 4ofn:A, 4ofn:B
34 2aaw:C 211 204 0.2754 0.2701 0.2794 1.21e-18 2aaw:A, 3fr3:A, 3fr3:B, 3fr9:A, 3fr9:B, 3frc:A, 3frc:B, 1q4j:A, 1q4j:B
35 2vcz:C 177 191 0.2464 0.2881 0.2670 1.80e-18
36 1m0u:A 203 195 0.2657 0.2709 0.2821 3.78e-18
37 3w8s:A 205 199 0.2705 0.2732 0.2814 1.10e-17
38 1zl9:A 207 213 0.3092 0.3092 0.3005 3.37e-17 1zl9:B
39 4q5n:A 220 209 0.2754 0.2591 0.2727 2.07e-15 4q5n:B
40 2wb9:A 210 186 0.2802 0.2762 0.3118 6.22e-14 2wb9:B, 2wdu:A, 2wdu:B
41 2hnl:A 202 194 0.2657 0.2723 0.2835 1.24e-13 2hnl:B
42 1u3i:A 208 206 0.2415 0.2404 0.2427 1.37e-10
43 6to3:AAA 190 154 0.2126 0.2316 0.2857 3.29e-10
44 2c80:A 208 164 0.2174 0.2163 0.2744 2.32e-09 2c80:B, 2ca8:A, 2caq:A, 2f8f:A, 2f8f:B, 1oe7:A, 1oe7:B, 1oe8:A, 1oe8:B
45 6zb6:C 227 168 0.2415 0.2203 0.2976 2.05e-08 7obo:AAA, 7odm:AAA, 6riv:B, 6riv:A, 6tk8:AAA, 6zb6:A, 6zb6:E, 6zb6:B, 6zb6:F, 6zb6:D
46 4kdx:A 207 167 0.2126 0.2126 0.2635 1.47e-07 4kdx:B
47 8ai8:A 183 147 0.1932 0.2186 0.2721 2.00e-07 8ai8:B, 8ai9:A, 8ai9:B, 8aib:A, 8aib:B, 7pka:A, 7pka:B
48 4w66:A 236 93 0.1449 0.1271 0.3226 5.83e-07 4w66:B
49 1bye:A 213 157 0.2126 0.2066 0.2803 3.74e-06 1axd:A, 1axd:B, 1bye:B, 1bye:C, 1bye:D
50 2ycd:A 213 148 0.2029 0.1972 0.2838 2.90e-05
51 3lsz:A 223 151 0.1787 0.1659 0.2450 1.09e-04 3lsz:B, 3lsz:C, 3lsz:D
52 4hi7:A 220 146 0.1836 0.1727 0.2603 1.77e-04 4hi7:B
53 4png:B 223 147 0.1787 0.1659 0.2517 4.30e-04 4png:A
54 4iel:B 206 172 0.2077 0.2087 0.2500 0.001 4iel:A
55 8agq:A 213 165 0.2029 0.1972 0.2545 0.001 5f07:A
56 4ri6:A 214 126 0.1836 0.1776 0.3016 0.002 4ri6:B, 4ri7:A, 4ri7:B
57 4pnf:B 221 191 0.2029 0.1900 0.2199 0.006 4pnf:A, 4pnf:C, 4pnf:D, 4pnf:E, 4pnf:F, 4pnf:G, 4pnf:H, 4yh2:A, 4yh2:B, 4yh2:C, 4yh2:D
58 4nhw:D 217 144 0.1643 0.1567 0.2361 0.008 4nhw:A, 4nhw:B, 4nhw:C
59 6nv6:B 207 45 0.0918 0.0918 0.4222 0.012
60 4mpg:B 252 157 0.1739 0.1429 0.2293 0.021 1ljr:A, 1ljr:B, 3ljr:A, 3ljr:B, 4mpg:A
61 2c3q:A 239 164 0.2077 0.1799 0.2622 0.021 2c3q:B, 2c3q:C, 2c3q:D
62 5a4u:A 211 63 0.0918 0.0900 0.3016 0.031 5a4u:B, 5a4u:C, 5a4u:D, 5a4u:E, 5a4u:F, 5a4v:A, 5a4v:B, 5a4v:C, 5a4v:D, 5a4v:E, 5a4v:F, 5a4w:A, 5a4w:B, 5a4w:C, 5a4w:D, 5a4w:E, 5a4w:F, 5a5k:A, 5a5k:B, 5a5k:C, 5a5k:D, 5a5k:E, 5a5k:F, 5a5k:G, 5a5k:H, 5a5k:I, 5a5k:J, 5a5k:K, 5a5k:L, 5a5k:M, 5a5k:N, 5a5k:O, 5a5k:P, 5a5k:Q, 5a5k:R, 5a5k:S, 5a5k:T, 5a5k:U, 5a5k:V, 5a5k:W, 5a5k:X, 1bx9:A, 1gnw:A, 1gnw:B
63 5f06:A 213 57 0.0966 0.0939 0.3509 0.052 5f06:B
64 7cav:B 222 49 0.0918 0.0856 0.3878 0.11 7caq:A, 7caq:B, 7car:A, 7car:B, 7cas:B, 7cav:A, 7cav:C, 7cav:D, 7cav:E, 7cav:F, 7cav:G, 7cav:H, 7cc3:A, 7cc3:B, 7cc3:C, 7cc3:D, 7cc3:E, 7cc3:F, 7cc3:G, 7cc3:H
65 5f05:C 211 171 0.1932 0.1896 0.2339 0.37 5f05:A, 5f05:B, 5f05:D
66 4ivf:F 227 169 0.1932 0.1762 0.2367 0.45 4ivf:A, 4ivf:B, 4ivf:C, 4ivf:D, 4ivf:E, 4ivf:G, 4ivf:H
67 6sml:B 911 79 0.1159 0.0263 0.3038 0.47 6sli:B, 6sli:D, 6sli:G, 6sli:J, 6slj:B, 6slj:A, 6sln:B, 6sln:A, 6sm3:B, 6smq:B, 6smq:E
68 4yan:A 252 47 0.0725 0.0595 0.3191 0.51 4yan:B, 4yan:C, 4yan:D
69 3qaw:A 219 150 0.1739 0.1644 0.2400 1.0
70 6rie:A 1285 100 0.1014 0.0163 0.2100 1.1 7amv:A, 7aof:A, 7aoh:A, 7aoz:A, 7ap8:A, 7ap9:A, 8c8h:A, 8p0j:A, 8p0k:A, 8p0n:A, 6rfl:A, 6ric:A, 6rid:A
71 7qep:N5 93 46 0.0725 0.1613 0.3261 1.2
72 8ix7:B 221 78 0.1111 0.1041 0.2949 1.3 8ix7:A
73 4f0b:A 220 64 0.0870 0.0818 0.2812 1.4 4f0b:B
74 4g9h:A 202 56 0.0870 0.0891 0.3214 1.6 4g9h:B, 4gci:A, 4gci:B
75 7rka:A 211 45 0.0725 0.0711 0.3333 2.1
76 1fw1:A 208 115 0.1304 0.1298 0.2348 3.1
77 8w9z:G 218 104 0.1498 0.1422 0.2981 3.2 8wa0:G, 8wa1:G
78 6m1t:A 201 52 0.0870 0.0896 0.3462 3.3 6m1t:B
79 6ezy:B 212 34 0.0483 0.0472 0.2941 3.7 6f01:B, 6f05:A, 6f05:B, 6f05:C, 6f05:D, 6f05:E, 6f05:F, 6f05:G, 6f05:H, 6f05:I, 6f05:J
80 8h41:B 357 81 0.1014 0.0588 0.2593 4.9 8h41:A, 6jqw:A, 6jqw:B, 6jqx:A, 6jqx:B
81 3zmk:B 222 143 0.1546 0.1441 0.2238 5.4 4gsn:A, 4gsn:C, 4gsn:D, 2imi:A, 2imi:B, 2imk:A, 2imk:B, 3zmk:D, 3zml:A, 3zml:B
82 2pml:X 340 44 0.0676 0.0412 0.3182 5.9 2pmn:X, 2pmo:X
83 4kh7:B 212 26 0.0580 0.0566 0.4615 6.5 4kh7:A
84 5l6v:I 400 79 0.0821 0.0425 0.2152 8.2
85 6t2t:A 229 164 0.1594 0.1441 0.2012 8.8 7dax:A, 7dax:B, 7day:A, 7day:B, 7daz:A, 7daz:B, 7db0:A, 7db0:B, 7db1:A, 7db1:B, 7db2:A, 7db2:B, 7db3:A, 7db3:B, 7db4:A, 7db4:B, 6ken:AA, 6ken:BA, 6keo:AA, 6keo:BA, 6kep:AA, 6kep:BA, 6ker:AA, 6ker:BA
86 3uar:A 203 84 0.1159 0.1182 0.2857 9.4

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218