BioLiP

>protein
PPRKVLIISAGASHSVALLSGDIVCSWGRGEDGQLGHGDAEDRPSPTQLSALDGHQIVSVTCGADHTVAYSQSGMEVYSW
GWGDFGRLGHGNSSDLFTPLPIKALHGIRIKQIACGDSHCLAVTMEGEVQSWGRNQNGQLGLGDTEDSLVPQKIQAFEGI
RIKMVAAGAEHTAAVTEDGDLYGWGWGRYGNLGLGDRTDRLVPERVTSTGGEKMSMVACGWRHTISVSYSGALYTYGWSK
YGQLGHGDLEDHLIPHKLEALSNSFISQISGGWRHTMALTSDGKLYGWGWNKFGQVGVGNNLDQCSPVQVRFPDDQKVVQ
VSCGWRHTLAVTERNNVFAWGRGTNGQLGIGESVDRNFPKIIEALSVDG

The query sequence (length=369) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4nbm:C	369	369	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4nbm:D, 4nc4:A, 4nc4:C
2	4o2w:A	365	327	0.3144	0.3178	0.3547	5.66e-62	4o2w:B, 4o2w:D
3	4o2w:A	365	343	0.3252	0.3288	0.3499	5.58e-60	4o2w:B, 4o2w:D
4	4o2w:A	365	278	0.2764	0.2795	0.3669	4.82e-49	4o2w:B, 4o2w:D
5	4o2w:A	365	295	0.2304	0.2329	0.2881	4.77e-41	4o2w:B, 4o2w:D
6	4o2w:A	365	224	0.2222	0.2247	0.3661	9.20e-41	4o2w:B, 4o2w:D
7	7q41:A	369	348	0.3225	0.3225	0.3420	2.43e-53	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
8	7q41:A	369	331	0.2981	0.2981	0.3323	9.64e-53	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
9	7q41:A	369	280	0.2710	0.2710	0.3571	4.44e-50	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
10	7q41:A	369	295	0.2683	0.2683	0.3356	5.33e-48	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
11	7q41:A	369	226	0.2358	0.2358	0.3850	3.22e-41	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
12	7q41:A	369	247	0.2331	0.2331	0.3482	6.40e-35	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
13	7q41:A	369	69	0.0623	0.0623	0.3333	1.46e-06	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
14	3mvd:L	394	376	0.3035	0.2843	0.2979	6.11e-31	3mvd:K
15	3mvd:L	394	301	0.2412	0.2259	0.2957	7.88e-19	3mvd:K
16	4d4o:A	414	183	0.1328	0.1184	0.2678	6.68e-08	4d4o:C, 4d4p:A, 4d4p:C, 4d4p:G, 4d4p:H, 4x33:A, 4x33:B, 1yop:A, 1yws:A
17	4d4o:A	414	291	0.1789	0.1594	0.2268	1.25e-04	4d4o:C, 4d4p:A, 4d4p:C, 4d4p:G, 4d4p:H, 4x33:A, 4x33:B, 1yop:A, 1yws:A
18	4d4o:A	414	190	0.1301	0.1159	0.2526	0.071	4d4o:C, 4d4p:A, 4d4p:C, 4d4p:G, 4d4p:H, 4x33:A, 4x33:B, 1yop:A, 1yws:A
19	4d4o:A	414	336	0.2141	0.1908	0.2351	0.077	4d4o:C, 4d4p:A, 4d4p:C, 4d4p:G, 4d4p:H, 4x33:A, 4x33:B, 1yop:A, 1yws:A
20	1jtd:B	273	250	0.1734	0.2344	0.2560	2.71e-05
21	1jtd:B	273	242	0.1762	0.2381	0.2686	0.002
22	1jtd:B	273	182	0.1436	0.1941	0.2912	0.002
23	6gaw:Ae	388	43	0.0434	0.0412	0.3721	0.39	6gaz:Ae, 7nqh:Ae, 7nql:Ae, 7nsi:Ae, 7nsj:Ae, 8oin:AV, 8oip:AV, 6ydp:Ae, 6ydw:Ae
24	2z8g:A	549	69	0.0596	0.0401	0.3188	0.97	3wwg:B, 3wwg:C, 2z8g:B
25	8bja:A	1563	193	0.1165	0.0275	0.2228	1.3
26	8bja:A	1563	97	0.0732	0.0173	0.2784	8.9
27	8d4x:B	1669	102	0.0678	0.0150	0.2451	2.0	8c06:A, 8c06:D
28	8e0q:A	1689	102	0.0678	0.0148	0.2451	2.0	8d4x:A, 8e0q:B
29	3pqd:B	312	88	0.0650	0.0769	0.2727	3.8	3pqd:A, 3pqd:C, 3pqd:D, 3pqd:F, 3pqd:H, 3pqd:E, 3pqd:G, 3pqf:C, 3pqf:D
30	8ewi:A	1775	103	0.0650	0.0135	0.2330	4.0	8ewi:B, 8ewi:C, 8ewi:D
31	4efp:A	235	57	0.0461	0.0723	0.2982	4.8	4efp:B, 4efq:A, 4efq:B

[Back]