Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PPPRKVVFWLPHQRKVFDFYASQGVQYFTAFLIVSNFIFNCAEKEWDPYTDQLYQGLWRWGEFAFNTMFLIELLINFYGI
AFCFWRYNWAWNTFDLVVVAIGTLTMAEAIGGNFMPPSMALIRNLRAFRIFRLFKRIKSLNKIIVSLGKAIPGVANAFVI
MVIIMCIYAILGVEFYHMTGSYTYGEEYYGTFFRALYTLFQVLTGESWSEAVARPAVFESHYDSFGPVLFYVSFIIICQI
VLINVVVAVLLDKMVEE

The query sequence (length=257) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8j7m:A 257 257 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 8j7m:C, 8j7m:D, 8j7m:B
2 8j7h:B 290 288 0.9689 0.8586 0.8646 1.84e-178 8j7f:A, 8j7f:B, 8j7f:C, 8j7f:D, 8j7h:C, 8j7h:D, 7x5v:A, 7x5v:B, 7x5v:C
3 5ek0:A 250 233 0.2840 0.2920 0.3133 5.29e-26 5ek0:B, 5ek0:C, 5ek0:D
4 6n4i:C 226 230 0.2685 0.3053 0.3000 1.97e-24 6n4i:A, 6n4i:D, 6n4i:B
5 6sxc:A 271 245 0.2568 0.2435 0.2694 2.53e-22 5bzb:B, 5bzb:C, 5bzb:D, 4cbc:A, 4cbc:B, 4cbc:C, 4cbc:D, 4oxs:A, 4oxs:B, 4oxs:C, 4oxs:D, 4p2z:B, 4p30:A, 4p30:B, 4p30:C, 4p30:D, 4p9o:A, 4p9o:B, 4p9o:C, 4p9o:D, 4p9p:B, 4p9p:D, 4pa3:A, 4pa3:B, 4pa3:C, 4pa3:D, 4pa4:A, 4pa4:B, 4pa4:C, 4pa4:D, 4pa6:A, 4pa6:B, 4pa6:C, 4pa6:D, 4pa7:A, 4pa7:B, 4pa7:C, 4pa7:D, 4pa9:A, 4pa9:B, 4pa9:C, 4pa9:D, 8s6j:A, 6sx5:A, 6sx7:A, 6sxe:A, 6sxf:A, 6sxf:B, 6sxg:A, 4x88:A, 4x88:B, 4x88:C, 4x88:D, 4x89:B, 4x8a:B, 4x8a:C, 4x8a:D, 6yz0:A, 6yz2:A, 6z8c:A, 3zjz:A, 3zjz:B, 3zjz:C, 3zjz:D
6 5klb:A 267 191 0.2257 0.2172 0.3037 7.82e-20 6c1e:A, 6c1e:B, 6c1k:A, 6c1k:B, 6c1m:A, 6c1m:B, 8h9w:A, 6juh:C, 6ke5:A, 6ke5:B, 6ke5:C, 6ke5:D, 6keb:C, 6keb:D, 5klb:B, 5klb:C, 5klb:D, 5klg:D, 5klg:C, 5kls:C, 5kmf:A, 5kmh:A
7 7wli:A 1135 271 0.2802 0.0634 0.2657 9.09e-18 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
8 7wli:A 1135 153 0.1440 0.0326 0.2418 2.06e-07 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
9 4dxw:A 210 240 0.2802 0.3429 0.3000 1.13e-16
10 6j8e:A 1139 275 0.2840 0.0641 0.2655 1.49e-15 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
11 6j8e:A 1139 150 0.1712 0.0386 0.2933 4.36e-09 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
12 6j8e:A 1139 189 0.1673 0.0378 0.2275 1.96e-08 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
13 6j8e:A 1139 121 0.1012 0.0228 0.2149 0.002 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
14 6kzp:A 1014 219 0.2412 0.0611 0.2831 1.05e-14
15 6kzp:A 1014 210 0.1790 0.0454 0.2190 1.37e-08
16 7xm9:A 1230 269 0.2802 0.0585 0.2677 3.80e-14 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
17 7xm9:A 1230 215 0.1946 0.0407 0.2326 2.48e-09 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
18 7xm9:A 1230 119 0.1284 0.0268 0.2773 6.30e-07 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
19 7xm9:A 1230 121 0.1051 0.0220 0.2231 3.22e-04 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
20 8gz2:B 1174 274 0.2724 0.0596 0.2555 3.95e-14 8gz1:B
21 8gz2:B 1174 191 0.1751 0.0383 0.2356 1.97e-08 8gz1:B
22 8gz2:B 1174 164 0.1634 0.0358 0.2561 3.53e-08 8gz1:B
23 8gz2:B 1174 123 0.1051 0.0230 0.2195 0.006 8gz1:B
24 8xmn:A 1277 269 0.2802 0.0564 0.2677 3.97e-14 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
25 8xmn:A 1277 215 0.1946 0.0392 0.2326 6.34e-09 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
26 8xmn:A 1277 119 0.1284 0.0258 0.2773 6.05e-07 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
27 8xmn:A 1277 121 0.1051 0.0211 0.2231 0.002 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
28 7w9l:A 1420 269 0.2802 0.0507 0.2677 4.11e-14 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
29 7w9l:A 1420 215 0.1946 0.0352 0.2326 7.10e-10 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
30 7w9l:A 1420 119 0.1284 0.0232 0.2773 5.07e-07 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
31 7w9l:A 1420 121 0.1051 0.0190 0.2231 2.29e-04 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
32 8fhd:A 1294 262 0.2607 0.0518 0.2557 4.49e-14
33 8fhd:A 1294 191 0.1751 0.0348 0.2356 1.45e-08
34 8fhd:A 1294 164 0.1634 0.0325 0.2561 4.07e-08
35 8fhd:A 1294 123 0.1051 0.0209 0.2195 0.004
36 9ayh:A 1056 252 0.2490 0.0606 0.2540 4.81e-14 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
37 9ayh:A 1056 209 0.1907 0.0464 0.2344 4.47e-09 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
38 8f0p:A 1116 265 0.2996 0.0690 0.2906 1.83e-13 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
39 8f0p:A 1116 197 0.1712 0.0394 0.2234 4.25e-07 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
40 8f0p:A 1116 116 0.1051 0.0242 0.2328 1.08e-05 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
41 6a91:A 1323 262 0.2646 0.0514 0.2595 2.68e-13 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
42 6a91:A 1323 220 0.1946 0.0378 0.2273 1.40e-09 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
43 6a91:A 1323 116 0.1051 0.0204 0.2328 9.75e-06 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
44 7we4:A 1122 256 0.2412 0.0553 0.2422 1.84e-12 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
45 7we4:A 1122 149 0.1673 0.0383 0.2886 2.05e-07 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
46 7we4:A 1122 276 0.2490 0.0570 0.2319 2.58e-07 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
47 7we4:A 1122 252 0.1790 0.0410 0.1825 0.049 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
48 6kzo:A 967 178 0.2023 0.0538 0.2921 4.79e-12
49 6kzo:A 967 131 0.1167 0.0310 0.2290 2.45e-06
50 6kzo:A 967 235 0.1712 0.0455 0.1872 0.83
51 7mix:A 1326 272 0.2879 0.0558 0.2721 5.66e-12 7miy:A
52 7mix:A 1326 207 0.2023 0.0392 0.2512 2.27e-10 7miy:A
53 7mix:A 1326 278 0.2374 0.0460 0.2194 1.26e-06 7miy:A
54 7mix:A 1326 238 0.2257 0.0437 0.2437 5.05e-06 7miy:A
55 6jp5:A 1274 198 0.2218 0.0447 0.2879 8.15e-12 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
56 6jp5:A 1274 209 0.1868 0.0377 0.2297 2.39e-08 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
57 6jp5:A 1274 249 0.2062 0.0416 0.2129 2.99e-05 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
58 6jp5:A 1274 237 0.1790 0.0361 0.1941 3.45e-05 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
59 7vfs:A 1266 263 0.2840 0.0577 0.2776 8.85e-12 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
60 7vfs:A 1266 207 0.2023 0.0411 0.2512 2.02e-10 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
61 7vfs:A 1266 281 0.2374 0.0482 0.2171 7.59e-07 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
62 7vfs:A 1266 241 0.2257 0.0458 0.2407 3.90e-06 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
63 7jpx:A 1116 198 0.2218 0.0511 0.2879 9.00e-12 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
64 7jpx:A 1116 209 0.1868 0.0430 0.2297 2.26e-08 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
65 7jpx:A 1116 249 0.2062 0.0475 0.2129 2.24e-05 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
66 7jpx:A 1116 243 0.1790 0.0412 0.1893 3.68e-05 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
67 8x90:A 1377 261 0.2685 0.0501 0.2644 2.50e-11 8x91:A, 8x93:A
68 8x90:A 1377 228 0.2335 0.0436 0.2632 2.30e-10 8x91:A, 8x93:A
69 8x90:A 1377 207 0.2140 0.0399 0.2657 4.56e-09 8x91:A, 8x93:A
70 8x90:A 1377 279 0.2374 0.0443 0.2186 2.95e-06 8x91:A, 8x93:A
71 5hk7:A 139 103 0.1206 0.2230 0.3010 2.75e-11 5hk7:B, 5hk7:C, 7pgb:c, 7pgb:Z, 7pgb:d, 7pgb:o, 7pgb:l, 7pgb:h, 7pgb:e
72 7pgg:A 147 116 0.1323 0.2313 0.2931 2.67e-10 7pgg:B, 7pgi:E
73 7xlq:A 1319 279 0.2802 0.0546 0.2581 3.28e-10 8epl:A, 7yg5:A
74 7xlq:A 1319 189 0.1751 0.0341 0.2381 1.25e-07 8epl:A, 7yg5:A
75 7xlq:A 1319 214 0.2101 0.0409 0.2523 1.38e-07 8epl:A, 7yg5:A
76 7xlq:A 1319 281 0.2529 0.0493 0.2313 2.86e-06 8epl:A, 7yg5:A
77 6uz3:A 1126 275 0.2490 0.0568 0.2327 3.95e-10 7fbs:A
78 6uz3:A 1126 168 0.1362 0.0311 0.2083 2.09e-07 7fbs:A
79 6uz3:A 1126 163 0.1556 0.0355 0.2454 5.43e-07 7fbs:A
80 6uz3:A 1126 123 0.1323 0.0302 0.2764 1.16e-06 7fbs:A
81 8t6l:A 1237 275 0.2490 0.0517 0.2327 4.52e-10 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
82 8t6l:A 1237 168 0.1440 0.0299 0.2202 1.95e-09 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
83 8t6l:A 1237 123 0.1401 0.0291 0.2927 2.12e-07 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
84 8t6l:A 1237 163 0.1440 0.0299 0.2270 9.76e-06 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
85 6agf:A 1138 186 0.1673 0.0378 0.2312 1.06e-09
86 6agf:A 1138 190 0.1829 0.0413 0.2474 1.01e-07
87 6agf:A 1138 171 0.1712 0.0387 0.2573 2.45e-07
88 6agf:A 1138 123 0.1167 0.0264 0.2439 0.001
89 7xsu:A 1085 265 0.2374 0.0562 0.2302 1.10e-09
90 7xsu:A 1085 168 0.1362 0.0323 0.2083 2.57e-07
91 7xsu:A 1085 123 0.1401 0.0332 0.2927 3.11e-07
92 7xsu:A 1085 163 0.1556 0.0369 0.2454 6.78e-07
93 8epm:A 991 229 0.2412 0.0626 0.2707 2.24e-09
94 8epm:A 991 140 0.1323 0.0343 0.2429 5.32e-07
95 8epm:A 991 212 0.1984 0.0515 0.2406 1.27e-05
96 8epm:A 991 200 0.1751 0.0454 0.2250 5.12e-04
97 8fhs:A 1282 205 0.1946 0.0390 0.2439 2.88e-09 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
98 8fhs:A 1282 201 0.2023 0.0406 0.2587 3.23e-08 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
99 8fhs:A 1282 217 0.1829 0.0367 0.2166 1.56e-04 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
100 8fhs:A 1282 235 0.1907 0.0382 0.2085 0.043 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
101 8e59:A 1230 271 0.2296 0.0480 0.2177 4.06e-09 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
102 8e59:A 1230 198 0.2023 0.0423 0.2626 2.43e-07 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
103 8e59:A 1230 215 0.1907 0.0398 0.2279 2.36e-04 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
104 8e59:A 1230 264 0.2062 0.0431 0.2008 0.38 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
105 8eoi:K 1116 209 0.1907 0.0439 0.2344 1.02e-08
106 8eoi:K 1116 201 0.2023 0.0466 0.2587 2.87e-08
107 8eoi:K 1116 245 0.2101 0.0484 0.2204 1.29e-04
108 8eoi:K 1116 129 0.1167 0.0269 0.2326 9.5
109 8wea:A 1206 202 0.1984 0.0423 0.2525 1.42e-08
110 8wea:A 1206 203 0.2062 0.0439 0.2611 1.37e-07
111 8wea:A 1206 220 0.1868 0.0398 0.2182 7.68e-05
112 8f6p:A 1091 263 0.2296 0.0541 0.2243 2.38e-08
113 8f6p:A 1091 168 0.1362 0.0321 0.2083 2.43e-07
114 8f6p:A 1091 123 0.1206 0.0284 0.2520 1.94e-05
115 8f6p:A 1091 163 0.1479 0.0348 0.2331 1.97e-05
116 7fhk:A 663 262 0.2412 0.0935 0.2366 1.23e-07 5dqq:A, 7fhk:C, 7fhl:A, 7fhl:C, 7fhn:A, 7fhn:C, 7fho:A, 7fho:C, 5tua:A
117 6e1p:A 646 260 0.2374 0.0944 0.2346 4.62e-07 6cx0:A, 5e1j:A, 6e1n:A, 6e1n:B, 6e1p:B
118 7tj9:A 1111 276 0.2568 0.0594 0.2391 9.45e-06
119 7tj9:A 1111 132 0.1284 0.0297 0.2500 4.59e-04
120 7tj9:A 1111 133 0.1206 0.0279 0.2331 0.029
121 6c9a:B 723 224 0.1946 0.0692 0.2232 5.06e-05 6c9a:A
122 7eeb:A 258 257 0.1984 0.1977 0.1984 2.49e-04
123 7cu3:A 1277 194 0.1518 0.0305 0.2010 0.004
124 7cu3:A 1277 214 0.1712 0.0345 0.2056 0.013
125 7cu3:A 1277 56 0.0506 0.0102 0.2321 3.9
126 6xiw:A 1256 194 0.1518 0.0311 0.2010 0.005
127 6xiw:A 1256 214 0.1712 0.0350 0.2056 0.015
128 6xiw:A 1256 56 0.0506 0.0104 0.2321 3.8
129 7sx3:A 1386 194 0.1518 0.0281 0.2010 0.005 7sx4:A
130 7sx3:A 1386 214 0.1712 0.0317 0.2056 0.016 7sx4:A
131 7sx3:A 1386 56 0.0506 0.0094 0.2321 4.5 7sx4:A
132 6v1q:A 538 119 0.1128 0.0539 0.2437 0.15 6v1q:B
133 6e1k:A 536 168 0.1362 0.0653 0.2083 1.4 6e1k:B, 6e1m:A, 6e1m:B
134 7u6j:B 248 33 0.0428 0.0444 0.3333 3.8 7u6i:A, 7u6j:A, 7u6j:C, 7u6j:D, 7u6j:E, 7u6j:F, 7u6j:G, 7u6j:H
135 2axn:A 451 77 0.0856 0.0488 0.2857 5.1 5ajv:B, 5ajw:A, 5ajx:A, 5ajy:A, 5ajz:A, 5ak0:A, 4d4j:A, 4d4k:A, 4d4l:A, 4d4m:A, 2dwo:A, 2dwp:A, 6etj:A, 6hvh:A, 6hvi:A, 6hvj:A, 2i1v:B, 6ibx:A, 6iby:A, 6ibz:A, 6ic0:A, 4ma4:A, 3qpu:A, 3qpv:A, 3qpw:A
136 6dr0:C 2193 64 0.0739 0.0087 0.2969 6.5 6dqj:A, 6dqj:B, 6dqj:C, 6dqj:D, 6dqn:A, 6dqn:B, 6dqn:C, 6dqn:D, 6dqs:A, 6dqs:B, 6dqs:C, 6dqs:D, 6dqv:A, 6dqv:B, 6dqv:C, 6dqv:D, 6dqz:A, 6dqz:B, 6dqz:D, 6dqz:C, 6dr0:A, 6dr0:B, 6dr0:D, 6dr2:A, 6dr2:B, 6dr2:C, 6dr2:D, 6dra:A, 6dra:B, 6dra:C, 6dra:D, 6drc:A, 6drc:B, 6drc:C, 6drc:D
137 8ouo:A 648 155 0.1245 0.0494 0.2065 6.5
138 8ouo:B 625 155 0.1245 0.0512 0.2065 6.7 6nq0:A, 6nq0:B, 6nq2:A, 6nq2:B
139 7e8e:D 459 80 0.0895 0.0501 0.2875 9.6 7e87:B, 7e87:A, 7e87:C, 7e87:D, 7e8e:B, 1nn7:A, 7ukg:A, 7ukg:B, 7ukg:C, 7ukg:D
140 6otu:A 517 38 0.0506 0.0251 0.3421 9.7
141 7ssy:A 346 106 0.1012 0.0751 0.2453 9.9 7ssy:B, 7ssy:C, 7ssy:D, 7wf3:B, 7wf3:D, 7wf3:F, 7wf3:H

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218