Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PPHGELQYLGQIQHILRCGVRKDDRTGTGTLSVFGMQARYSLRDEFPLLTTKRVFWKGVLEELLWFIKGSTNAKELSSKG
VKIWDANGSRDFLDSLGFSTREEGDLGPVYGFQWRHFGAEYRDMESDYSGQGVDQLQRVIDTIKTNPDDRRIIMCAWNPR
DLPLMALPPCHALCQFYVVNSELSCQLYQRSGDMGLGVPFNIASYALLTYMIAHITGLKPGDFIHTLGDAHIYLNHIEPL
KIQLQREPRPFPKLRILRKVEKIDDFKAEDFQIEGYNPHPTIK

The query sequence (length=283) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4eb4:B 301 283 0.9293 0.8738 0.9293 0.0 4e5o:A, 4e5o:B, 4e5o:C, 4e5o:D, 4e5o:E, 4e5o:F, 4eb4:A, 4eb4:C, 4eb4:D, 4ein:A, 4ein:B, 3ejl:C, 3ejl:D, 4ez8:A, 6f6z:A, 6f6z:B, 5fct:A, 5fct:B, 4fgt:A, 4g2o:X, 4g6w:X, 4gd7:A, 6gko:A, 6gko:B, 6gyj:A, 3h9k:A, 3h9k:B, 3h9k:D, 3h9k:E, 3hb8:A, 3hb8:B, 3hb8:C, 3hb8:D, 3hb8:E, 5hs3:A, 5hs3:B, 5hs3:C, 5hs3:D, 5hs3:E, 5hs3:F, 1hvy:A, 1hvy:B, 1hvy:C, 1hvy:D, 1i00:A, 1i00:B, 1ju6:A, 1ju6:B, 1ju6:C, 1ju6:D, 1juj:A, 1juj:B, 1juj:C, 1juj:D, 3ob7:A, 3ob7:B, 3ob7:D, 3ob7:E, 6oju:B, 6oju:A, 6oju:C, 6oju:D, 6ojv:B, 6ojv:A, 6ojv:D, 6ojv:C, 6pf3:A, 6pf3:B, 6pf3:C, 6pf3:D, 6pf4:B, 6pf4:D, 6pf4:A, 6pf4:C, 6pf5:A, 6pf5:B, 6pf5:C, 6pf5:D, 6pf6:B, 6pf6:A, 6pf6:C, 6pf6:D, 6qxg:A, 6qxg:B, 6qxg:C, 6qxh:A, 6qxh:B, 6qxh:C, 6qyq:B, 6qyq:D, 6r2e:A, 6r2e:C, 6r2e:D, 6r2e:B, 6r2e:F, 6r2e:H, 6r2e:E, 6r2e:G, 2rd8:B, 2rda:C, 2rda:D, 2rda:E, 1rts:A, 1rts:B, 2tsr:A, 2tsr:B, 2tsr:C, 2tsr:D, 4up1:A, 4up1:B, 4up1:D, 4up1:C, 5wrn:B, 5wrn:A, 5wrn:C, 5wrn:D, 5wrn:E, 5wrn:F, 5x5d:A, 5x5d:D, 5x5d:B, 5x5d:E, 5x5d:C, 5x5d:F, 5x5q:A, 5x5q:D, 5x5q:B, 5x5q:E, 5x5q:C, 5x5q:F, 5x66:A, 5x66:D, 5x66:B, 5x66:E, 5x66:C, 5x66:F, 5x67:A, 5x67:B, 5x69:A, 5x69:D, 5x69:B, 5x69:E, 5x69:C, 5x69:F, 6y08:A, 6y08:B, 6zxo:A, 6zxo:B, 6zxo:C, 6zxo:D, 6zxo:E, 6zxo:F
2 2onb:A 264 283 0.9258 0.9924 0.9258 0.0 4e28:A, 3n5e:A, 3n5e:B
3 6k7s:B 286 282 0.7456 0.7378 0.7482 2.72e-161 6k7r:A, 6k7r:B, 6k7s:A
4 4xsc:B 284 279 0.7032 0.7007 0.7133 1.00e-157 4xsc:A, 4xsc:C, 4xsc:D, 4xsd:A, 4xsd:B, 4xsd:C, 4xsd:D
5 5h39:A 285 282 0.7138 0.7088 0.7163 2.64e-157 5h38:B, 5h39:B, 5h3a:A, 5h3a:B
6 5by6:B 288 279 0.6784 0.6667 0.6882 5.97e-147 5by6:A, 5by6:C, 5by6:D, 5m4z:A, 5m4z:B
7 4irr:A 290 279 0.6714 0.6552 0.6810 2.27e-144 4irr:B, 4isw:A, 4isw:B, 5noo:A, 5noo:B, 5noo:C, 5noo:D, 4psg:A, 4psg:B
8 7xyk:A 290 277 0.6714 0.6552 0.6859 2.55e-143 7cca:A, 7cca:B, 7xyj:A, 7xyj:B, 7xyj:C, 7xyj:D, 7xyk:B, 7xyk:C, 7xyk:D
9 7dp4:A 287 280 0.6466 0.6376 0.6536 2.13e-140 7dp5:A, 7dp6:A
10 6aog:A 511 284 0.6431 0.3562 0.6408 6.68e-132 6aog:B, 6aoh:A, 6aoh:B, 6aoi:A, 6aoi:B, 4eck:A, 4eck:B, 4eil:A, 4eil:B, 4eil:C, 4eil:D, 4eil:E, 4eil:F, 4eil:G, 4eil:H, 4ky4:A, 4ky4:B, 4ky4:C, 4ky4:D, 4ky4:E, 4ky4:F, 4ky4:G, 4ky4:H, 4kya:A, 4kya:B, 4kya:C, 4kya:D, 4kya:E, 4kya:F, 4kya:G, 4kya:H, 6n1s:A, 6n1s:B, 6n1t:A, 6n1t:B, 5t0l:A, 5t0l:B
11 7fgx:D 563 284 0.6431 0.3233 0.6408 3.64e-131 7fgw:A, 7fgw:B, 7fgw:C, 7fgw:D, 7fgx:A, 7fgx:B, 7fgx:C, 7fgy:A, 7fgy:B, 7fgy:C, 7fgy:D
12 1f28:A 295 287 0.6290 0.6034 0.6202 2.65e-129 1ci7:A, 1ci7:B, 1f28:B, 1f28:C, 1f28:D
13 2aaz:A 305 292 0.6431 0.5967 0.6233 3.23e-128 2aaz:B, 2aaz:C, 2aaz:D, 2aaz:E, 2aaz:F, 2aaz:G, 2aaz:H, 2aaz:I, 2aaz:J, 2aaz:K, 2aaz:L, 2aaz:M, 2aaz:N, 2aaz:O, 2aaz:P
14 3irm:A 520 280 0.6219 0.3385 0.6286 4.00e-128 3cl9:A, 3clb:A, 3clb:B, 3clb:C, 3clb:D, 2h2q:A, 2h2q:B, 3hbb:A, 3hbb:B, 3hbb:C, 3hbb:D, 3inv:A, 3inv:B, 3irm:B, 3irm:C, 3irm:D, 3irn:A, 3irn:B, 3irn:C, 3irn:D, 3iro:A, 3iro:B, 3iro:C, 3iro:D, 3kjs:A, 3kjs:B, 3kjs:C, 3kjs:D, 5t7o:A, 5t7o:B, 5t7o:C, 5t7o:D
15 3k2h:A 503 280 0.5583 0.3141 0.5643 2.47e-119 3k2h:B, 3kjr:A, 3kjr:B, 3nrr:A, 3nrr:B
16 6a2l:B 521 280 0.5512 0.2994 0.5571 2.63e-118 6kp2:A, 8yq8:B
17 6a2p:B 551 280 0.5512 0.2831 0.5571 6.81e-118 6a2k:A, 6a2k:B, 6a2l:A, 6a2m:A, 6a2m:B, 6a2n:A, 6a2n:B, 6a2o:A, 6a2o:B, 6a2p:A, 7ctw:A, 7ctw:B, 7cty:A, 7cty:B, 7ctz:A, 7ctz:B, 3dg8:A, 3dg8:B, 3dg8:C, 3dg8:D, 3dga:A, 3dga:B, 3dga:C, 3dga:D, 4dp3:A, 4dp3:B, 4dpd:A, 4dpd:B, 4dph:A, 4dph:B, 7f3y:A, 7f3y:B, 7f3z:A, 7f3z:B, 1j3i:A, 1j3i:B, 1j3i:C, 1j3i:D, 1j3j:A, 1j3j:B, 1j3j:C, 1j3j:D, 1j3k:A, 1j3k:B, 1j3k:C, 1j3k:D, 8jfb:A, 8jfb:B, 8jfc:A, 8jfc:B, 8jfd:A, 8jfd:B, 3jsu:A, 3jsu:B, 6kot:A, 6kot:B, 6kp2:B, 6kp7:A, 6kp7:B, 6kpr:A, 6kpr:B, 6leu:A, 6leu:B, 6lev:A, 6lev:B, 6lez:A, 6lez:B, 6lh9:A, 6lh9:B, 6lhi:A, 6lhi:B, 6lhj:A, 6lhj:B, 3qg2:A, 3qg2:B, 3qgt:A, 3qgt:B, 3um5:A, 3um5:B, 3um6:A, 3um6:B, 3um8:A, 3um8:B, 8wgm:A, 8wgm:B, 8yq8:A, 8yq9:A, 8yq9:B
18 1qzf:A 519 282 0.5583 0.3044 0.5603 5.01e-117 3dl5:A, 3dl5:B, 3dl5:C, 3dl5:D, 3dl5:E, 3dl6:A, 3dl6:B, 3dl6:C, 3dl6:D, 3dl6:E, 3hj3:A, 3hj3:B, 3hj3:C, 3hj3:D, 4ky8:A, 4ky8:B, 4ky8:C, 4ky8:D, 4ky8:E, 2oip:A, 2oip:B, 2oip:C, 2oip:D, 2oip:E, 6ojs:A, 6ojs:C, 6ojs:B, 6ojs:E, 6ojs:D, 6pf7:A, 6pf7:B, 6pf7:C, 6pf7:D, 6pf7:E, 6pf8:A, 6pf8:B, 6pf8:C, 6pf8:D, 6pf8:E, 6pf9:A, 6pf9:B, 6pf9:C, 6pf9:D, 6pf9:E, 6pfa:A, 6pfa:B, 6pfa:C, 6pfa:D, 6pfa:E, 6pfb:A, 6pfb:B, 6pfb:C, 6pfb:D, 6pfb:E, 6pfc:A, 6pfc:B, 6pfc:D, 6pfc:C, 6pfc:E, 6pfd:A, 6pfd:B, 6pfd:C, 6pfd:D, 6pfd:E, 6pfe:A, 6pfe:B, 6pfe:C, 6pfe:E, 6pfe:D, 6pff:A, 6pff:B, 6pff:C, 6pff:D, 6pff:E, 6pfg:A, 6pfg:B, 6pfg:C, 6pfg:D, 6pfg:E, 6pfh:A, 6pfh:B, 6pfh:C, 6pfh:D, 6pfh:E, 6pfi:A, 6pfi:B, 6pfi:C, 6pfi:D, 6pfi:E, 4q0d:E, 4q0d:A, 4q0d:B, 4q0d:C, 4q0d:D, 4q0e:A, 4q0e:C, 4q0e:B, 4q0e:D, 4q0e:E, 1qzf:B, 1qzf:C, 1qzf:D, 1qzf:E, 1sej:A, 1sej:B, 1sej:C, 1sej:D, 1sej:E, 6wep:A, 6wep:B
19 6qxs:A 292 296 0.5336 0.5171 0.5101 3.77e-98 6qxs:C, 6qya:A, 6qya:C
20 2a9w:A 264 277 0.5053 0.5417 0.5162 1.21e-95 2a9w:B, 2a9w:C, 2a9w:D, 1aiq:A, 1aiq:B, 1aob:A, 1axw:A, 1axw:B, 3b5b:A, 3b5b:B, 3b9h:A, 2bbq:A, 2bbq:B, 1bdu:A, 3bfi:A, 3bgx:A, 3bhl:A, 3bhl:B, 3bhr:A, 1bid:A, 1bjg:A, 1bq1:A, 1bq1:B, 6cdz:A, 6cdz:B, 1ddu:A, 1ddu:B, 1dna:A, 1dna:B, 1f4c:A, 1f4c:B, 1f4d:A, 1f4d:B, 1f4e:A, 1f4f:A, 1f4f:B, 1f4g:A, 1f4g:B, 2fto:X, 1fwm:A, 1fwm:B, 2g8x:A, 2g8x:B, 4gev:A, 4gev:B, 4isk:A, 4isk:B, 4isk:C, 4isk:F, 4isk:D, 4isk:E, 4isk:G, 4isk:H, 1jg0:A, 1jg0:B, 1jtq:A, 1jtq:B, 1jtu:A, 1jtu:B, 1jut:A, 1jut:B, 7jx1:A, 7jx1:B, 7jxf:A, 7jxf:B, 1kce:A, 1kce:B, 2kce:A, 2kce:B, 1kzi:A, 1kzi:B, 1kzj:A, 1kzj:B, 1kzj:C, 1kzj:D, 1kzj:E, 1kzj:F, 4lrr:A, 1nce:A, 1nce:B, 6nnr:A, 6nnr:B, 1syn:A, 1syn:B, 1tdu:A, 1tdu:B, 1tlc:A, 1tlc:B, 1tls:A, 1tls:B, 1trg:A, 1tsd:A, 1tsd:B, 1tsn:A, 2tsc:A, 2tsc:B, 1tys:A, 2vet:A, 2vf0:A, 2vf0:B, 1zpr:A, 1zpr:B
21 5j7w:C 315 317 0.5371 0.4825 0.4795 3.12e-94 5j7w:D, 4o7u:B, 4o7u:D, 6qxs:B, 6qxs:D, 6qya:B, 6qya:D, 3uwl:B, 3uwl:D
22 4fog:D 263 276 0.4912 0.5285 0.5036 6.74e-92 4foa:A, 4foa:B, 4foa:C, 4foa:D, 4fog:A, 4fog:B, 4fog:C, 4fox:A, 4fox:B, 4fox:C, 4fox:D, 4fox:E, 4fox:F, 4fox:G, 4fox:H, 4fqs:A, 4fqs:B, 3qj7:A, 3qj7:C, 3qj7:B, 3qj7:D
23 3c0a:A 289 274 0.4594 0.4498 0.4745 7.30e-81
24 4dq1:A 312 314 0.4841 0.4391 0.4363 1.06e-80 4dq1:B
25 4h0u:A 260 271 0.4452 0.4846 0.4649 1.10e-80 4h0u:B, 4h0u:C, 4h0u:D
26 1bo7:A 316 317 0.4876 0.4367 0.4353 9.03e-80 3bnz:A, 1bo8:A, 1bp0:A, 1bp6:A, 1bpj:A, 3byx:A, 3bz0:A, 3c06:A, 2g86:A, 2g89:A, 2g8a:A, 2g8d:A, 3ijz:A, 3ik0:A, 3ik1:A, 1jmf:A, 1jmg:A, 1jmh:A, 1jmi:A, 1lca:A, 1lcb:A, 1lce:A, 1nja:A, 1njb:A, 1njc:A, 1njd:A, 1nje:A, 1tdb:A, 1tdc:A, 2tdd:A, 2tdm:A, 1thy:A, 1tsl:A, 1tsm:A, 1tsv:A, 1tsx:A, 1tsy:A, 1tsz:A, 1tvu:A, 1tvv:A, 1tvw:A, 1vza:A, 1vzb:A, 1vzc:A, 1vzd:A, 1vze:A
27 1b02:A 279 281 0.3675 0.3728 0.3701 4.52e-54
28 5b6e:A 319 104 0.1060 0.0940 0.2885 2.69e-08 5b6d:A, 5b6d:B, 5b6e:B, 5jp9:A, 5jp9:B
29 6a9a:A 246 228 0.1625 0.1870 0.2018 0.10 1b49:A, 1b49:C, 1b5d:A, 1b5d:B, 1b5e:A, 1b5e:B, 6l18:A
30 6agg:Z 420 122 0.0954 0.0643 0.2213 0.15 3amt:A, 3amu:A, 3au7:A, 4rvz:Z, 5xob:Z
31 6h2j:B 990 67 0.0742 0.0212 0.3134 1.6 4be7:B, 4be7:D, 4beb:A, 4beb:B, 4beb:C, 4beb:D, 4bec:A, 4bec:B, 6h2j:A, 2w00:A, 2w00:B, 4xjx:A, 4xjx:B
32 1bs4:A 168 72 0.0777 0.1310 0.3056 1.8 2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
33 2zb3:A 345 44 0.0530 0.0435 0.3409 2.1
34 8qwt:A 331 71 0.0707 0.0604 0.2817 2.7
35 8izl:A 2067 64 0.0636 0.0087 0.2812 3.0 8izm:A, 8x01:A, 8yxm:A, 8yxp:A
36 4nwv:A 355 66 0.0636 0.0507 0.2727 4.1 4nwv:C, 4nwv:B, 4nww:A, 4nww:B, 4nww:C
37 4ngf:A 260 92 0.0813 0.0885 0.2500 6.8 4ngf:B, 4ngf:C, 4ngf:D, 4nha:A
38 6h8s:A 291 38 0.0424 0.0412 0.3158 8.9 2cjz:A, 6h8r:A, 5ovr:A, 5ovx:A, 5ow1:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218