BioLiP

>protein
PPGPLENSSAKLVNDEAHPWKPLRPGDIRGPCPGLNTLASHGYLPRNGVATPVQIINAVQEGLNFDNQAAVFATYAAHLV
DGNLITDLLSIGRKTRLTGPDPPPPASVGGLNEHGTFEGDASMTRGDAFFGNNHDFNETLFEQLVDYSNRFGGGKYNLTV
AGELRFKRIQDSIATNPNFSFVDFRFFTAYGETTFPANLFVDGRRDDGQLDMDAARSFFQFSRMPDDFFRAPSPRSGTGV
EVVIQAHPMQPGRNVGKINSYTVDPTSSDFSTPCLMYEKFVNITVKSLYPNPTVQLRKALNTNLDFFFQGVAAGCTQVFP
YGRD

The query sequence (length=324) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5oxt:A	327	323	0.9815	0.9725	0.9845	0.0	8av5:A, 6ekw:A, 6ekx:A, 6eky:A, 6ekz:A, 6el0:A, 6el4:A, 5oxt:B, 5oxt:C, 5oxu:A, 5oy1:A, 5oy2:A, 7pn4:A, 7pn5:A, 7pn6:A, 7pn7:A, 7pn8:A, 7pn9:A, 7pna:A, 2yor:B, 2yor:A, 2yp1:A, 2yp1:B, 2yp1:C, 2yp1:D
2	7zbp:A	239	253	0.2593	0.3515	0.3320	1.04e-30	5fuj:A, 5fuj:B, 5fuk:A, 5fuk:B, 7zbp:B, 7zbp:C, 7zbp:D
3	7znw:C	235	209	0.2346	0.3234	0.3636	4.21e-29	7znm:A, 7znm:B, 7znv:A, 7znw:A
4	7o2d:A	228	219	0.2006	0.2851	0.2968	3.49e-20	7o1r:A, 7o1x:A, 7o1z:A, 7o2g:A
5	8iag:B	223	211	0.2037	0.2960	0.3128	3.72e-20	8iag:A
6	7zcl:B	227	178	0.1636	0.2335	0.2978	8.41e-19	7zcl:A
7	2civ:A	299	154	0.1296	0.1405	0.2727	1.31e-04	2ciw:A, 2cix:A, 2ciy:A, 2ciz:A, 2cj0:A, 2cj1:A, 2cj2:A, 1cpo:A, 2cpo:A, 2j18:A, 2j19:A, 2j5m:A, 7rst:A
8	7sc6:A	349	91	0.0833	0.0774	0.2967	0.16	7scq:A, 7scq:B
9	4mgq:A	159	68	0.0617	0.1258	0.2941	0.68
10	2ctz:A	421	37	0.0432	0.0333	0.3784	2.1	2ctz:B
11	6bbn:E	378	27	0.0463	0.0397	0.5556	5.4	2gry:A
12	7wf3:C	328	58	0.0556	0.0549	0.3103	8.2	2a79:A, 3eau:A, 3eb3:A, 3eb4:A, 6ebk:A, 6ebk:C, 6ebk:E, 6ebk:G, 6ebl:A, 6ebl:C, 6ebl:E, 6ebl:G, 7ej1:A, 7ej1:C, 7ej1:E, 7ej1:G, 7ej2:A, 7ej2:C, 7ej2:E, 7ej2:G, 1exb:A, 4jta:A, 4jta:P, 4jtc:A, 4jtc:G, 4jtd:A, 4jtd:G, 3lnm:A, 3lnm:C, 3lut:A, 1qrq:A, 1qrq:B, 1qrq:C, 1qrq:D, 2r9r:A, 2r9r:G, 7sit:A, 7sit:C, 7siz:A, 7siz:C, 7wf3:G, 7wf3:I, 7wf3:M, 7wf4:G, 7wf4:I, 7wf4:M, 7wf4:o, 5wie:A, 5wie:G, 1zsx:A
13	1px8:A	500	59	0.0525	0.0340	0.2881	8.7	1px8:B, 1uhv:A, 1uhv:B, 1uhv:C, 1uhv:D

[Back]