PPAQLSVHTVSWNSGHERAPTNLEELLGLNSGETPDVIAVAVQGFGFQTDKPQQGPACVKNFQSLLTSKGYTKLKNTITE
TMGLTVYCLEKHLDQNTLKNETIIVTVDDQKKSGGIVTSFTIYNKRFSFTTSRMSDEDVTSTNTKYAYDTRLDYSKKDDP
SDFLFWIGDLNVRVETNATHAKSLVDQNNIDGLMAFDQLKKAKEQKLFDGWTEPQVTFKPTYKFKPNTDEYDLSATPSWT
DRALYKSGTGKTIQPLSYNSLTNYKQTEHRPVLAKFRVTL
The query sequence (length=280) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # | Hit | Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
E-value | Homologs to hit |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2imq:X | 280 | 280 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 0.0 | 4l1y:A, 4l1z:A, 4l20:A, 4l21:A, 1ntf:A, 1si6:X, 1y21:A, 1yjh:A |
| 2 | 5a7i:A | 313 | 286 | 0.2821 | 0.2524 | 0.2762 | 1.65e-24 | 5a7j:A, 5a7j:B, 4cml:A, 3mtc:A, 3n9v:A, 3n9v:B |
| 3 | 4cmn:A | 339 | 292 | 0.2679 | 0.2212 | 0.2568 | 1.95e-21 | |
| 4 | 1i9z:A | 336 | 291 | 0.2714 | 0.2262 | 0.2612 | 2.36e-20 | |
| 5 | 7a17:A | 336 | 132 | 0.1750 | 0.1458 | 0.3712 | 9.32e-18 | 7a0v:A, 7a0v:E, 7a17:C |
| 6 | 8pdg:AAA | 462 | 127 | 0.1607 | 0.0974 | 0.3543 | 4.12e-14 | 8pdh:AAA, 8pdi:A, 8pdj:AAA, 5rw2:A, 5rw4:A, 5rw5:A, 5rw6:A, 5rw7:A, 5rw8:A, 5rw9:A, 5rwa:A, 5rwb:A, 5rwc:A, 5rwd:A, 5rwe:A, 5rwf:A, 5rwg:A, 5rwh:A, 5rwj:A, 5rwk:A, 5rwl:A, 5rwn:A, 5rwp:A, 5rwq:A, 5rwr:A, 5rws:A, 5rwt:A, 5rwu:A, 5rwv:A, 5rww:A, 5rwx:A, 5rwy:A, 5rwz:A, 5rx0:A, 5rx1:A, 5rx2:A, 5rx3:A, 5rx4:A, 5rx5:A, 5rx6:A, 5rx7:A, 5rx8:A, 5rx9:A, 5rxa:A, 5rxb:A, 5rxc:A, 5rxd:A, 5rxe:A, 5rxf:A, 5rxg:A, 5rxh:A, 5rxi:A, 5rxj:A, 5rxk:A, 5rxl:A, 5rxo:A, 5rxp:A, 5rxq:A, 5rxr:A, 5rxs:A, 5rxt:A, 5rxu:A, 5rxv:A, 5rxw:A, 5rxy:A, 5rxz:A, 5ry0:A, 5ry1:A, 5ry2:A, 5ry3:A, 5ry4:A, 5ry5:A, 5ry6:A, 5ry7:A, 5ry8:A, 5ry9:A, 5rya:A, 5ryb:A, 5ryc:A, 5ryd:A, 5rye:A, 5ryg:A, 5ryh:A, 5ryi:A, 5ryj:A, 5ryk:A, 5ryl:A, 6xy7:AAA |
| 7 | 5okn:G | 402 | 304 | 0.2500 | 0.1741 | 0.2303 | 5.65e-13 | 6squ:A |
| 8 | 5okn:D | 433 | 185 | 0.1714 | 0.1109 | 0.2595 | 4.17e-12 | 4a9c:B, 5okn:C, 5okn:E, 5okn:F, 5okn:H, 6squ:B |
| 9 | 5cgz:A | 240 | 80 | 0.0857 | 0.1000 | 0.3000 | 0.52 | 5cgz:B |
| 10 | 1mdc:A | 131 | 68 | 0.0821 | 0.1756 | 0.3382 | 0.90 | |
| 11 | 2rem:C | 191 | 112 | 0.1036 | 0.1518 | 0.2589 | 5.4 | |
| 12 | 3l41:A | 214 | 37 | 0.0357 | 0.0467 | 0.2703 | 8.7 | |
| 13 | 4ru5:C | 602 | 51 | 0.0643 | 0.0299 | 0.3529 | 9.0 | 4ru5:A, 4ru5:B |
| 14 | 2adb:A | 127 | 40 | 0.0571 | 0.1260 | 0.4000 | 9.1 | 3zzy:A, 3zzy:B, 3zzz:A, 3zzz:B |
| 15 | 3m93:A | 180 | 76 | 0.0679 | 0.1056 | 0.2500 | 9.5 | 3m94:A |
umich.edu