BioLiP

>protein
PNMKIIGNRIERIRSEHAETWFFDENHPYRTWAYHGSYEAPLINGVVRLLSKPWDVVTGVTGIAGQQRVFKEKVDTRVPD
PQEGTRQVMSMVSSWLWKELGKHKRPRVCTKEEFINKVRSVNDPRFWALVDKEREHHLRGECQSCVYNMMGKRRAIWYMW
LGARFLEFEALGFLNEDHWMGRENSGGGVEGLGLQRLGYVLEEMSRIPGGRMYADDGWDTRISRFDLENEALITNQMEKG
HRALALAIIKYTYQNKVVKVLRPAEKGKTVMDIISRQDQRGSGQVVTYALNTFTNLVVQLIRNMEAEEVLEMQDLWLLRR
SEKVTNWLQSNGWDRLKRMAVSGDDCVVKPIDDRFAHALRFLNDMGKVRKQEWKPSTGWDNWEEVPFCSHHFNKLHLKDG
RSIVVPCRHQDELIGRARVSPGASIRETACLAKSYAQMWQLLYFHRRDLRLMANAICSSVPVDWVPTGRTTWSIHGKGEW
MTTEDMLVVWNRVWIEENDHMEDKTPVTKWTDIPYLGKREDLWCGSLIGHRPRTTWAENIKNTVNMVRRIIGDEEKYMDY
LS

The query sequence (length=562) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ld3:A	578	578	1.0000	0.9723	0.9723	0.0	6ld1:A, 6ld2:A, 6ld4:A, 6ld5:A, 5wz3:A
2	6i7p:A	883	615	1.0000	0.6365	0.9138	0.0	5goz:A, 5goz:B, 5goz:C, 5gp1:A, 5gp1:B, 5gp1:C, 6i7p:B, 6i7p:C, 6i7p:D, 6i7p:E, 6i7p:F, 5kqr:A, 5kqs:A, 5m2x:A, 5m2x:B, 5m2x:C, 5m2x:D, 5m2x:E, 5m2x:F, 5m2z:A, 5m2z:C, 5m2z:B, 5m2z:D, 5m2z:E, 5m2z:F, 5m5b:A, 5m5b:B, 5mrk:A, 5mrk:B, 5nju:A, 5nju:B, 5njv:A, 5njv:B, 5njv:C, 5njv:D, 8pem:A, 5tfr:A, 5tfr:B, 5tmh:A, 5tmh:B, 5u0b:A, 5u0b:B, 5u0c:A, 5u0c:B, 5u0c:C, 5u0c:D, 5u0c:E, 5u0c:F, 5u0c:G, 5u0c:H, 5ulp:A, 5ulp:B, 6ux2:B, 5vim:A, 5vim:B, 6wcz:B, 5wxb:A, 5wz1:A, 5wz1:B, 5wz1:C, 5wz1:D, 5wz1:E, 5wz1:F, 5wz1:G, 5wz1:H, 5wz2:A, 5wz2:B, 5wz2:C
3	5u04:A	478	535	0.7829	0.9205	0.8224	0.0
4	2hfz:A	608	594	0.7135	0.6595	0.6751	0.0
5	7ziu:B	606	593	0.6833	0.6337	0.6476	0.0	7ziu:A
6	4mtp:C	585	583	0.6904	0.6632	0.6655	0.0
7	8gzp:A	854	590	0.6922	0.4555	0.6593	0.0	4c11:A, 5ccv:B, 5ccv:C, 5ccv:D, 5ccv:F, 5ccv:G, 5dto:A, 5f3t:A, 5f3z:A, 5f41:A, 8gzq:A, 4hhj:A, 5hmw:A, 5hmx:A, 5hmy:A, 5hmz:A, 5hn0:A, 5i3p:A, 5i3q:A, 5iq6:A, 6j00:A, 2j7u:A, 2j7w:A, 5jjr:A, 5jjs:A, 4v0q:A, 4v0r:A, 6xd0:A
8	8gzr:A	880	617	0.6957	0.4443	0.6337	0.0	8bcr:A, 8bcr:B, 4c11:B, 5ccv:E, 4ctj:A, 4ctj:C, 4ctk:A, 4ctk:C, 5cuq:A, 5cuq:B, 5e9q:A, 5e9q:C, 5ec8:A, 5ec8:C, 5ehg:A, 5ehg:C, 5ehi:A, 5ehi:C, 5eif:A, 5eif:C, 5eiw:A, 5eiw:C, 5ekx:A, 5ekx:B, 3p8z:A, 3p8z:C, 3p97:A, 3p97:C, 4r8s:A, 4r8s:B, 3vws:A, 2xbm:B, 2xbm:A, 2xbm:C, 2xbm:D, 6xd1:A
9	8t13:B	877	614	0.6851	0.4390	0.6270	0.0	3evg:A, 1l9k:A, 2p1d:A, 2p3l:A, 2p3o:A, 2p3q:A, 2p40:A, 2p41:A, 1r6a:A, 8t12:B, 7xd8:A, 7xd8:D, 7xd8:G, 7xd8:J, 7xd8:M, 7xd8:P, 7xd9:A, 7xd9:D, 7xd9:G, 7xd9:J, 7xd9:M, 7xd9:P, 5zqk:A, 5zqk:B
10	4k6m:A	888	616	0.6922	0.4381	0.6315	0.0	4hdg:A, 4hdg:B, 4hdh:A, 4hdh:B, 4k6m:B, 4mtp:A, 4mtp:B
11	6kr3:B	836	582	0.6726	0.4522	0.6495	0.0	5k5m:A
12	6kr2:A	857	599	0.6744	0.4422	0.6327	0.0	6izx:A, 6izy:A, 6kr2:B, 6kr3:A
13	5ccv:A	849	587	0.6690	0.4429	0.6405	0.0	6h80:A, 6h9r:A, 6izz:A
14	6qsn:B	884	607	0.6459	0.4106	0.5980	0.0	3eva:A, 3evb:A, 3evc:A, 3evd:A, 3eve:A, 3evf:A, 6qsn:A
15	4mtp:D	546	576	0.6441	0.6630	0.6285	0.0
16	2hcs:A	487	538	0.5979	0.6899	0.6245	0.0	2hcn:A
17	5ccv:H	767	560	0.6121	0.4485	0.6143	0.0
18	7d6n:D	589	590	0.5943	0.5671	0.5661	0.0	7d6n:A, 7d6n:B, 7d6n:E, 7d6n:C, 7d6n:F, 7d6n:G, 7d6n:J, 7d6n:I, 7d6n:H
19	8wil:A	574	348	0.1708	0.1672	0.2759	1.26e-07	8wim:A
20	1s49:A	588	282	0.1103	0.1054	0.2199	0.008
21	8d8p:A	420	47	0.0285	0.0381	0.3404	2.3	8d8p:B
22	7lhz:B	631	60	0.0374	0.0333	0.3500	5.2
23	2bgu:A	328	61	0.0391	0.0671	0.3607	6.0
24	1ixy:A	351	53	0.0356	0.0570	0.3774	8.3	1c3j:A, 1ixy:B, 1j39:A, 1jg6:A, 1jg7:A, 1jiu:A, 1jiv:A, 1jix:A, 1m5r:A, 1m5r:B, 1nvk:A, 1nzd:A, 1nzf:A, 1qkj:A, 1sxp:A, 1sxp:B, 1sxq:A, 1sxq:B
25	7dlm:A	280	58	0.0285	0.0571	0.2759	9.8	7dlm:B, 7dn1:A, 7vyq:A, 7vyq:B, 7vyq:F, 7vyq:G

[Back]